En snabb protokoll för direkt identifiering av Enterococcus faecalis och andra arter Enterococcus från en positiv blododling med hjälp av en peptid nukleinsyra fluorescent in situ hybridisering analys (PNA fisk).
Enterokocker är en vanlig orsak till bakteriemi med E. faecalis är den dominerande arten följt av E. faecium. Eftersom resistens mot ampicillin och vankomycin i E. faecalis fortfarande är ovanligt jämfört med motstånd i E. faecium, är utvecklingen av snabbtest tillåta differentiering mellan enterococcal arter viktig för lämplig behandling och motstånd övervakning. E. faecalis OE PNA FISH analys (AdvanDx, Boston, MA) använder artspecifika syra peptid nukleinsyra (PNA) sonder i en fluorescens in situ hybridisering format och ger en tid att resultat på 1,5 timmar och den potential att ge viktig information för artspecifika behandling. Multicenter studier utfördes för att utvärdera resultaten av den 1,5 timme E. faecalis / OE PNA FISH förfarande jämfört med den ursprungliga 2,5 timme analysprocedur och till standard bakteriologi metoder för identifiering av enterokocker direkt från en positiv blododling flaska.
E. faecalis / OE PNA FISH analys för Enterococcus kan ge identifiering 2-3 dagar tidigare än vanliga kulturen metoder. Den förkortade förfarande för analysen (1,5 hourr) ger snabb identifiering som kan användas för ett bättre förhållningssätt till antimikrobiell behandling och patientens resultat. En studie för att stödja detta utfördes av Forrest, et al. (6). Under två på varandra följande år med början år 2005 mikrobiologiska laboratoriet identifierat grampositiva kocker i par och kedjor växer i flaskor blododling med konventionella mikrobiologiska metoder och under 2006 lägga till E. faecalis / OE PNA FISH. Förutom en behandling algoritm som utvecklats av institutionerna antimikrobiella team (AMT) att effektivt använda PNA FISH data som genereras av laboratoriet i god tid. Primärt utfall bedöms var tiden från blododling dra till genomförandet av effektiva antimikrobiell behandling före och efter PNA FISH instiftades i laboratorier arbetsflöde. Svårighetsgraden av sjukdomen, patientens läge och empirisk antimikrobiell behandling mättes. Totalt 224 patienter med vårdrelaterade enterococcal bakteriemi utvärderades med 129 i före interventionsperioden och 95 PNA FISH period. PNA FISH identifierade E. faecalis 3 dagar tidigare än traditionella kulturer (1,1 vs 4,1 dagar, p <0,001). PNA FISH identifierade E. faecium en median 2,3 dagar tidigare (1,1 vs 3,4 dagar, p <0,001) och var förknippat med statistiskt signifikanta sänkningar i tid för att initiera effektiv terapi (1,3 vs 3,1 dagar, p <0,001) och minskade 30 dagar mortalitet (26% vs 45%, p = 0,04). Denna grupp slutsatsen att E. faecalis / OE PNA FISH-analys i kombination med en AMT behandling algoritm resulterade i tidigare insättande av lämplig empirisk antimikrobiell behandling för patienter med vårdrelaterade E. faecium bakteriemi.
The authors have nothing to disclose.
Studier sponsrade av AdvanDx.
Reagents
E. faecalis/OE PNA FISH is comprised of the following kit components: