Schema 1. Självorganisering BTA-baserade discotics i citratbuffert till sfäriska aggregat som uppvisar en diameter på ca 5 nm, vid millimolära koncentrationer av byggblock. Att öka jonstyrkan genom tillsats av NaCl leder till bildandet av långsträckta stavar med en diameter på cirka 3 nm och längd> 25 nm. Klicka här för att visa en större bild . 1. Förbereda en BTA-Gd (III) DTPA Lösningar för CD spektroskopi och mätning av temperatur-beroende CD Spectra som en funktion av NaCl koncentration Framställa en 100-buffert mM citrat (pH 6,0). Framställa en 100-buffert mM citrat (pH 6,0) med 2 M NaCl. Lös 0,254 mg BTA-Gd (III) DTPA (MW = 3184 g • mol -1) i 10 ml 100 mM citratbuffert, tArget koncentration 8 • 10 -3 mM BTA-Gd (III) DTPA. Sonikera lösningen under 5 minuter. Fylla en 1 cm kyvett UV med lösningen och mäta en CD-spektrum från 230 till 350 nm och en CD-svalningskurva vid den högsta intensiteten CD-bandet (t.ex. X = 269 nm) från 363 till 283 K med en hastighet av 1 Kmin – 1. Tillsätt samma volym av 2 M NaCl buffrad lösning på citratbuffrad lösning av BTA-Gd (III) DTPA för att öka jonstyrkan till 1 M NaCl, späda discotics till halva koncentrationen målkoncentrationen 4 • 10 -3 mM av BTA-Gd (III) DTPA. Virvel av lösningen med en ökad jonstyrka under 5 minuter. Omvärdera en CD spektrum från 230 till 350 nm och en CD kylkurva på högsta intensitet CD-bandet 363 till 283 K med en hastighet av 1 K min -1. 2. Montering T-beroende CD data till en modell för T-beroendeent Self-montering De råa CD-data exporterades till Ursprung 8,5 och normaliserad. Detta uppnåddes genom att definiera CD effekt vid högsta uppmätta temperaturen lika med 0, och CD effekt vid lägsta uppmätta temperatur som är lika med 1. Eftersom storleken på CD-effekten är proportionell mot graden av aggregation 8, de normaliserade CD-kurvor är proportionell mot graden av aggregering. De normaliserade data monteras med hjälp av ickelinjära alternativet kurvan passform i OriginPro 8,5 med hjälp av en T-beroende självorganisering modellen härleds genom van der Schoot 8,9. I denna modell är en kärnbildning och en töjning regim särskiljas. Första graden av aggregering av töjningen regimen (T <Te) försågs med användning av följande ekvation: Ovanstående ekvation innehåller (bredvid variabel temperatur, T, och graden av aggregation och Φ n) tre parametrar, dvs entalpin av töjning H e, förlängningen temperaturen T e (den temperatur vid vilken självorganisering startar) och parametern Φ SAT, som införs för att säkerställa att Φ n / Φ Lör inte inte överstiga enhet, som följer den begränsningen att graden av aggregering inte kan överskrida ett. Montering gör entalpin för töjning h e (J / mol) och töjningen temperatur Te (K), vilka karaktäriserar det självsammansättning av molekylerna för en given koncentration. Vid montering ska man återhållsamhet följas vilket är att endast graden av aggregering vid temperaturer under T e ska monteras, eftersom ekvationen 2,1 endast är giltig i förlängningen regimen. Vidare gäller experimentellt funnit graden av aggregation ikärnbildning regim kan monteras med hjälp av följande ekvation: Ovanstående ekvation innehåller (intill variablerna T och Φ n) fyra parametrar som redan tre bestämdes med ekvation 2,1, dvs entalpin av töjning H e, förlängningen temperaturen T e och parametern Φ SAT. Den enda okända parametern är K en värdeskapande beskriver kooperativitet av kärnbildning fas-som finns genom att montera den experimentellt funnit graden av aggregering för temperaturer över T e. 3. Förbereda BTA-Gd (III) DTPA lösningar för transmissionselektronmikroskopi och visualisering av Supramolekylära Polymers via Kryogen TEM Framställa två buffertar: en 100 mM citratbuffert (pH 6,0) och en 100 mM citratbuffert (pH 6,0) wed 5 M NaCl. Lös 0,318 mg BTA-Gd (III) DTPA (MW = 3184 g • mol -1) i 0,1 ml av var och en av de preparerade buffertar, målkoncentration 1 mM av BTA-Gd (III) DTPA. Provet förglasning för kryogen TEM utförs med användning av en automatiserad förglasning roboten (FEI Vitrobot Mark III). CryoTEM galler (R2 / 2 Quantifoil Jena galler från Quantifoil Micro Verktyg GmbH) är ytan plasmabehandlad före förglasning förfarande med användning av en Cressington 208 kol bestrykare som arbetar vid 5 mA under 40 s. Den vattenhaltiga lösningen appliceras sedan på gallret under förglasning på en automatiserad FEI Vitrobot. Detta involverar applicering av provet på gallret, blotting av överskottsvätska att skapa en tunn film av den vattenhaltiga lösningen på gallret och efterföljande förglasning genom doppning av gallret mycket snabbt i flytande etan. Efter förglasning provet hålles i flytande kväve och överförs manuellt på autoladdare kassetten, även cooleD med flytande kväve. Kassetten införs sedan i den autoladdare av TEM. Allt detta sker manuellt. De cryoTEM experiment utförs på TU / e cryoTITAN (FEI), ( www.cryotem.nl ). TU / e cryoTITAN är försedd med en fältemitterande pistol (FEG) som arbetar vid 300 kV. Bilderna registrerades med användning av en 2k x 2k Gatan CCD-kamera utrustad med en efter-kolonn Gatan energi filter (GIF). 4. 1 H-NMR DOSY Mätningar av sfäriska self-assembled BTA-Gd (III) DTPA vid låg jonstyrka Framställ en 50 mM di 6-succinatbuffert i D2O ("pH 6,0); bufferten framställs genom upplösning av di 6-bärnstenssyra i D2O, följt av justering av pH till 6,0 med användning av 1 M ND 4 OD i D 2 O Den slutliga koncentrationen av 50 mM succinat justerades med ytterligare D 2 O Eftersom Gd (III) är i hög grad paramagnetiskoch 1 h signaler därigenom skulle vidgas avsevärt, (III) Gd ersatte Y (III). Lös 2,98 mg BTA-Y (III) DTPA (MW = 2979 g • mol -1) i 1 ml av en 50 mM di 6-succinatbuffert i D2O ("pH 6,0), målkoncentrationen 1 mM BTA- Y (III) DTPA. De 1 H-DOSY NMR-mätningar utförs på en Varian Unity Inöva 500 spektrometer utrustad med en 5 mm ID-PFG-sond från Varian. De DOSY experiment utfördes med användning av DOSY one-shot (Doneshot, Varian) pulssekvensen. De 90 graders puls und blandningstider anpassades därefter. Kemiska förskjutningar refererades användning av kemisk förskjutning av 3 – (trimetylsilyl) propionsyra-2, 2,3,3 – [D 4]-natriumsalt (TMSP). Själv-spridning av HDO användes för att kalibrera mätningarna, det är känt från litteraturen att den egna spridningen av HDO i D 2 O vid 298 K är 19,0 × 10-9 m 2 </sup> • S -1. Som referens, O själv-spridning av HDO i D 2 mättes i en VARIAN 2 Hz D 2 O standardprov och kalibrerade till sitt standardvärde. Den modell som användes för att beräkna den hydrodynamiska radien R H i aggregaten är Stokes-Einsteins förhållande för diffusion av en sfärisk partikel. 5. Representativa resultat 1 H-DOSY NMR och SAXS mätningar på BTA-M (III)-DTPA: sfäriska objekt i citratbuffert Den joniska karaktären hos de perifera Gd (III)-komplex införs frustration i den endimensionella tillväxt av discotic monomerer vars kärna är utformad för att polymerisera i långsträckta stav-liknande aggregat. Balansen mellan attraherande och repulsiva interaktioner styr storleken och formen av aggregaten (Schema 2). Schema 2. En kraftfull metod för att bestämma storleken och formen av partiklar i lösningen är synkrotronljus källan liten vinkel X-ray (SAXS). BTA-Gd (III)-DTPA löstes i en citrat-buffert lösning och SAXS profilerna registrerades och monteras i området 0,01 <q <0,1 Å -1. En lutning som närmar sig noll i låg-q-regionen (q <0,06 Ä -1) indikerar en brist på formanisotropa i aggregatet, vilket antyder närvaron av sfäriska objekt (figur 1). Uppgifterna som uppmäts vid olika koncentrationer monteras med en homogen monodispers sfärisk form faktor som leder till en beräknad radie, R, 3,2 nm. Den beräknade geometriska radie monomer discotic BTA-Gd (III)-DTPA är 3,0 nm, vilket tyder på förekomsten av aggregat med ett bildförhållande nära 1. <br /> Figur 1. För BTA-Gd (III)-DTPA i citratbuffert (100 mM, pH 6) vid 0,5 och 1,0 mM (topp) SAXS-profiler. DOSY NMR BTA-Y (III)-DTPA i 50 mM d 6-succinatbuffert vid 1,0 mm (botten). Klicka här för att visa en större bild . För att ge ytterligare bevis för den sfäriska formen och nanometer-storlek själv monterade föremål, utförde vi 1 H diffusion beställas NMR-spektroskopi (1 H-DOSY NMR) (Figur 1). DOSY-NMR kan man bestämma de diffusionskoefficienter av aggregat, från vilken den hydrodynamiska radien (R H) kan beräknas. Eftersom Gd (III) är i hög grad paramagnetisk och 1 h signaler därigenom skulle vidgas avsevärt ändrade vi Gd (III) för diamagnetisk Y (III). Diffusionskoefficienterna den aggregerade diamagnetiska discotic amfifil i en deutererad succinat-buffert (50 mM, PH 6,) c = 1 mM bestämdes vara 0.69×10-10 m 2 s -1. Via Stokes-Einsteins förhållande beräknar vi en hydrodynamisk radie R H i 2,9 nm för de diskreta objekt av sfäriska storleken (tabell 1). Denna storlek är i utmärkt överens med värdet från SAXS data för BTA-Gd (III)-DTPA. BTA-M (III)-DTPA [MM] D t en [10 -10 m 2 s -1] R är H en [Nm] Rb [Nm] 1 0,69 2,9 3,2 a från DOSY, b från SAXS Tabell 1. Resultat av SAXS och DOSY mätningar för BTA-M (III)-DTPA. Kryo-TEM på BTA-Gd (III)-DTPA: från sfäriska objekt till långsträckta nanostavar Ytterligare bevis för en framgångsrik kontroll över endimensionell stack längd erhölls från kryo-TEM micrographs. På grund av den förglasning av de vattenhaltiga lösningarna kryogen TEM bevarar den strukturella morfologin av self-assembled aggregat och undviker torkning påverkar relaterad till konventionella TEM provberedning. Figur 2 (vänstra) visar att BTA-Gd (III)-DTPA producerar den förväntade sfäriska objekt med diametrar nära 6 nm i en 1 mM koncentration, vilket bekräftar resultaten från SAXS och DOSY mätningar. Enligt dessa resultat har vi kunnat få egna sammansatta diskreta objekt som kan anses vara supramolekylär motsvarande dendritiska makromolekyler 10. . Figur 2 Cryo-TEM-bilder för BTA-Gd (III)-DTPA (vänster) 1 mM förglasat vid 298 K i citratbuffert (100 mM, pH 6), representerar skalan bar 50 nm;(Höger) 1 mM förglasas vid 298 K i citratbuffert (100 mM, pH 6) och en total NaCl-koncentration av 5 M representerar Skalstrecket 50 nm. Hittills har vi bara jobbat i buffrade lösningar med låg jonstyrka. Men om elektrostatiska repulsiva krafter i det perifera laddade M (III)-DTPA komplex på BTA-Gd (III)-DTPA är på ursprunget till frustrerade endimensionella tillväxt förväntas vi att öka jonstyrkan hos buffrade miljön, användning av en inert 1:1 salt med höggradigt hydratiserade motjoner, bör reducera de elektrostatiska interaktioner och således en annan typ av själv-sammansatta föremålet skall formas. I citratbuffert innefattande 5 M NaCl denna effekt verkligen observeras (Figur 2, höger). Bildningen av högt sidförhållande stavliknande supramolekylära polymerer är tydligt iakttas i kryo-TEM-mikrografer vid hög jonstyrka. Elektrostatisk screening är den mest sannolika förklaringen till detta fynd. De formförändringar från en sphegjutglas aggregat av omkring 6 nm i diameter för att långsträckta stavar med en diameter av 6 nm och en längd av upp till flera hundra nanometer. CD mätningar av BTA-Gd (III)-DTPA: slå på kooperativa självorganisering genom att öka jonstyrkan Cirkulär dikroism (CD) spektroskopi mäter skillnaden i absorption mellan vänsterhänt och högerhänt cirkulärt polariserat ljus. När en spiralformad objektet har en föredragen spiralformad mening vänster-och högerhänta cirkulärt polariserat ljus kommer att absorberas i olika utsträckning, och därför ger upphov till en CD-effekt. Eftersom intermolekylära vätebindningar bildas mellan varandra följande BTA-Gd (III)-DTPA inom aggregaten är uppradade i en spiralform och stereogena centrum vid L-fenylalanin delen gynnar en spiralformad sätt över den andra, förväntar vi oss en tydlig cd spektrumet från BTA-Gd (III)-DTPA baserade aggregat 11,12. Dessutom är temperaturberoende CD-spektroskopi ett kraftfulltverktyg för att utvärdera den självorganiserande mekanism för BTA-Gd (III)-DTPA-polymerisation och tillåter att härleda slutsatser på stabiliteten hos de bildade aggregaten 13. Som ett exempel är rumstemperaturen CD-spektra av BTA-Gd (III)-DTPA (8×10 -3 mM eller 4×10 -3 mM i en 100 mM citrat-buffert) med ökande saltkoncentration (0 M NaCl till 1,0 M NaCl) som ges i fig. 3A. Även en signifikant lägre koncentration appliceras för CD-mätningar indikerar klart Bomull effekten av närvaron av intakta aggregat, även vid mikromolära koncentrationer. Formen av de förändringar CD-spektrum vid ökning av saltkoncentrationen, vilket är en god indikation på reducerade växelverkningar vid periferin av staplarna och bättre packning av discotics. Dessutom CD svalningskurvor av samma lösningar (363 till 283 K, uppmätt vid λ = 269 eller 278 nm) visar tydliga skillnader i form (figur 3B). APförälder T e-den temperatur vid vilken aggregation börjar-skiftar till högre temperaturer vid högre saltkoncentration och en alltmer kooperativ mekanism, som kännetecknas av en mer abrupt ökning i CD-effekten blir uppenbar. Medan den svalningskurva vid 0 M NaCl beskrivs bäst genom en isodesmic självorganiserande processen, är den svalningskurva vid 1,0 M NaCl typisk för en samverkande självorganiserande processen 14. I det förra fallet är alla associationskonstanter antas vara lika, medan i det senare fallet självorganiserande förekommer i åtminstone två distinkta faser. I det första steget, måste en "kärna" som skall bildas, som är energimässigt mycket ogynnsam. Efter kylning under en kritisk polymerisationstemperatur, följer töjning och exponentiell tillväxt i supramolekylära polymerer med hög molekylvikt. Kvantifiera termodynamiska parametrarna för självorganisering av BTA-Gd (III)-DTPA vid 0 och 1 M NaCl med hjälp av en kooperativa modellen visar tydligt minskningen i K <sub> en, som är den dimensionslösa aktivering konstant 8. Lägre värden för K en indikerar en högre grad av kooperativitet i självorganisering process som uttrycks i bildandet av mycket avlånga supramolekylära polymerer som observerats i kryo-TEM. BTA-Gd (III)-DTPA C NaCl K en 8 x 10 -3 mM 0 M 5 10 -2 4 x10 -3 mM 1 M 1 10 -4 Tabell 2. Grad av kooperativitet uttrycks av K en i temperaturberoende självsammansättning av BTA-Gd (III)-DTPA som en funktion av NaCl-koncentration (C NaCl). Figur 3. BTA-Gd (III)-DTPA i en 100 mM citratbuffert (c = 8 x 10 -3 mM vid låg jonstyrka och 4 x 10 -3 mM vid hög jonstyrka) A] CD-spektra registrerades vid 293 K som en funktion av jonstyrka , c NaCl = 0 M – 1,0 M, den molära ellipticiteten Δε beräknas enligt följande: Δε = CD-effekt / (CXL) där c är koncentrationen av BTA i mol L -1 och L är den optiska våglängden i cm ; B] motsvarande CD svalningskurvor uppmätt på λ = 269 nm för 0 M NaCl och 278 nm för 1 M NaCl-lösningar, uttryckt som graden av aggregering Φ n som en funktion av NaCl-koncentration c NaCl = 0 M – 1,0 M, Φ n beräknas genom att dividera den uppmätta CD-effekten genom den maximala CD-effekt.