ملاقط المغناطيسي، واحدة جزيء تقنية التلاعب قوية، يمكن تكييفها لقياسات مباشرة للتطور (باستخدام التكوين يسمى بحرية تدور-ملاقط المغناطيسي) وعزم الدوران (باستخدام التكوين يطلق ملاقط عزم الدوران المغناطيسي) في الجزيئات البيولوجية. وترد المبادئ التوجيهية لتنفيذ هذه القياسات، بما في ذلك تطبيقات لدراسة الحمض النووي وما يرتبط بها من خيوط نكليوتيد البروتين.
تقنيات جزيء واحد تجعل من الممكن للتحقيق في سلوك الجزيئات البيولوجية الفردية في حل في الوقت الحقيقي. وتشمل هذه التقنيات ما يسمى النهج قوة التحليل الطيفي مثل القوة الذرية المجهري، ملاقط بصرية، وتدفق وتمتد، وملاقط المغناطيسي. بين هذين النهجين، ملاقط المغناطيسي تميزوا من خلال قدرتها على تطبيق عزم الدوران مع الحفاظ على قوة تمتد ثابتة. هنا، ويتضح ذلك كيف يمكن لهذه ملاقط المغناطيسي التكوين التجريبية "التقليدية" يمكن، من خلال التعديل مباشرة من تكوين مجالها لتقليل حجم الحقل عرضية، أن تتكيف مع قياس درجة تطور في جزيء البيولوجية. ويطلق على تكوين الناتج ملاقط المغناطيسية التي تدور بحرية. بالإضافة إلى ذلك، فإنه يظهر كيف مزيد من التعديل من التكوين الحقل يمكن أن تسفر عن حقل عرضية بلغت قوته وسيطة بين أن من & #8220؛ "ملاقط المغناطيسية التقليدية وملاقط المغناطيسية التي تدور بحرية، مما يجعل من الممكن لقياس عزم الدوران مباشرة المخزنة في جزيء البيولوجية. ويطلق على هذا التكوين ملاقط عزم الدوران المغناطيسي. ويوضح شريط الفيديو المرافق بالتفصيل كيفية تحويل ملاقط المغناطيسية التقليدية إلى تدور بحرية ملاقط ملاقط المغناطيسية وعزم الدوران المغناطيسي يمكن أن يتحقق، ويوضح استخدام هذه التقنيات. هذه التكيفات الحفاظ على جميع نقاط القوة في ملاقط المغناطيسية التقليدية بينما توسع كثيرا من براعة هذا أداة قوية.
في السنوات الأخيرة، أثبتت تقنيات احدة جزيء تطبيق على نطاق واسع في دراسة البروتينات والإنزيمات processive السيارات الأخرى، مما أسفر عن نظرة ثاقبة حركية بهم وmechanochemistry الأساسية. في سياق قوة التحليل الطيفي، وقد قدمت مساهمات هامة من خلال القوة الذرية تدفق المجهري وتمتد، وملاقط بصرية والمغناطيسية. ملاقط بصرية والمغناطيسية (MT) قد نجحت لا سيما في الجمع بين مرونة كبيرة من حيث التلاعب الجزيئية مع مكانية عالية والقرار الزماني. هنا، ونحن نركز على MT، والتي يمكن أن تنطبق على كل القوى تمتد وعزم الدوران إلى الجزيئات البيولوجية المربوطة بين سطح والخرز مغنطيسية مسايرة فائقة superparamagnetic 1-3.
ملاقط المغناطيسية (MT، الشكل 1A) هي تقنية متعددة جدا جزيء واحد التي تم استخدامها لرصد كل من الخواص الميكانيكية من الأحماض النووية وكذلك تفاعلها مع البروتينات. MT دينا العديد من القوةق، بما في ذلك البساطة والمتانة الشاملة لتنفيذ التجريبية، وتطبيق السهل من عزم الدوران، وعملية طبيعية والمعايرة واضحة في وضع قوة ثابتة 4، والإرشاد موازية قياسات 5، 6، وغياب التدفئة العينة وphotodamage. بالمقارنة مع غيرها من جزيء واحد النهج، MT توفر طريقة لإجراء قياسات قوة الاعتماد على قوات منخفضة تصل إلى 10 ≈ FN ولها القدرة على التحكم بشكل مباشر درجة الفائق. بينما في الغالب استخدمت النظام التجاري المتعدد الأطراف كأداة تجريبية للتحقيق في العمليات البيولوجية التي تنطوي على الأحماض النووية 7، 8، أنهم وجدوا أيضا تطبيق في الدراسات من الخواص الميكانيكية للبروتينات 9-13 خلايا أو 10، 14-17. تتوفر العديد من المراجع المفيدة التي تصف كيفية بناء وتشغيل MT 4، 18-20.
Howevإيه، MT التقليدية لا تتبع الحركة الدورانية مباشرة، و، في حين أنها تطبيق عزم الدوران، وأنها لا تقيس عزم الدوران مباشرة. بالإضافة إلى أنها تحد من دوران حر من حبل الحمض النووي. هنا، نقدم اثنين من ملاقط ملحقات المغناطيس. أول، ووصف تدور بحرية ملاقط المغناطيسي (FOMT، الشكل 1B) 21، بما يسمح للقياسات التوازن تقلبات زاوية والتغيرات في تطور من المربوطة جزيئات الحمض النووي، من دون تقييد الحركة الدورانية حول محور حبل. الثانية، ووصف ملاقط عزم الدوران المغناطيسي (الإنتقالي العسكري، الشكل 1C)، والتي لديها القدرة على تطبيق ومباشرة قياس كل القوى والعزم على الجزيئات الحيوية واحدة 22-27.
في بروتوكول التالية، ونحن نفترض أن القارئ لديه في له / لها التصرف على 'التقليدية' الصك طن متري. نشير للقارئ إلى مناقشة لمراجع حول كيفية بناء وتشغيل MT إعداد، وكذلك consideالحصص التي يجب أن تؤخذ بعين الاعتبار في اختيار حبات مغناطيسية، مغناطيس، وإجراءات تتبع. بالإضافة إلى ذلك، المادتين 1 و 2 من نص البروتوكول تصف كيف نستعد عادة واحتضان عينة الحمض النووي للاستخدام في MT وكذلك القياسات الأولية التي يمكن القيام بها على الحمض النووي واحد في MT التقليدية. البابين 3 و 4 من نص البروتوكول توضيح كيفية أداة MT يمكن تكييفها بسهولة واستخدامها لقياس FOMT وMTT.
عند تشغيل التجارب باستخدام MTT أو FOMT، عددا من الخيارات يجب القيام بها فيما يتعلق الخرز، والمغناطيس، والبروتوكولات تتبع، وما إلى ذلك أفضل الخيارات لإجراء تعتمد على التجربة المثيرة للاهتمام. أدناه، ونحن تصف المقايضات التي تصاحب الخيارات المختلفة، والتي ينبغي أن تسهل اختيار تجربة معينة. المقبل، ونحن تصف العديد من الخطوات الحاسمة التي تصاحب تشكيلة وتسيير الإنتقالي العسكري وFOMT التجارب. أخيرا، ونحن نناقش أهمية الإنتقالي العسكري وFOMT فيما يتعلق بأساليب القائمة وكذلك التطبيقات المستقبلية.
اعتبارات قبل بداية الإنتقالي العسكري وFOMT التجارب
أي تجربة تتطلب واحد لتحديد نوع حبة المغناطيسي للاستخدام. يمكن للمرء اختيار بين عدة streptavidin المغلفة الخرز المتاحة تجاريا مغنطيسية مسايرة فائقة superparamagnetic، على سبيل المثال، 0.25 ميكرومتر الخرز دائرة نصف قطرها 0.5 ميكرومتر الخرز دائرة نصف قطرها، أو 1.4 ميكرومتر الخرز دائرة نصف قطرها (قهه الجدول مواد). حبات أكبر سيكون زيادة لحظة المغناطيسي بالمقارنة مع حبات أصغر (التحجيم تقريبا، حيث بلغ حجم) وبالتالي استخدامها سيسهل تطبيق أعلى القوات (القوات النموذجية التي تحققت في أدواتنا، انظر الجدول 1). عندما تتبع الزاوي باستخدام الخرز علامة هو المطلوب، ونحن نعمل مع 1.4 ميكرومتر عادة نصف قطرها 0.5 ميكرومتر واستخدام نصف قطرها الخرز البيروكسيديز غير المغناطيسية والخرز علامة (انظر الفقرة 1.9 للبروتوكول المرفق المقابلة). فمن المستحسن استخدام حبات صغيرة خاصة لFOMT، والجدول الزمني مميزة لحبة التناوب τ C يساوي نسبة السحب للنظام أكثر من الربيع المستمر γ / ك θ لها؛ الأهم من ذلك أن معامل السحب التناوب ذات الصلة لالزاوي جداول النطاق الزمني القياس على النحو ~ R 3 حبة، أي مع القوة الثالثة في دائرة نصف قطرها (انظر الجدول 2 لالوقت مميزة المقاييس لعدة تركيبات الحمض النووي حبة في FOMT والقياسات الإنتقالي العسكري). تخفيضات المرفقة في أقصى القوة التي يمكن تطبيقها يمكن معالجتها باستخدام كومة من مغناطيس اسطواني انقلبت 27. مع ذلك، في القياسات FOMT قد يكون من الضروري أحيانا لتقديم تنازلات بين أفضل قرار الزمانية للتحقيق أقصى قدر من القوة وتطبيقها.
بالإضافة إلى ذلك، يتطلب تجربة اختيار تكوين المغناطيس. في ملاقط المغناطيسية التقليدية التكوين (الشكل 1A)، ونحن عادة استخدام زوج من 5x5x5 ملم مغناطيس مكعب في اتجاه رأسي مع وجود فجوة 0.5 أو 1 ملم بين المغناطيس 4. عندما متباعدة المغناطيس على طول محور س (ص)، وهذا ينتج مجال مغناطيسي أن يتم توجيه المقام الأول على طول المحور x (ص). للتجارب FOMT، يتم تحديد نقطة جذب على شكل إسطوانيا-في الذي يتم توجيه المجال المغناطيسي في المقام الأول مركزعلى طول المحور z (الشكل 1B). في الممارسة العملية، ونحن نستخدم كومة من ثلاثة من هذه مغناطيس على شكل إسطوانيا، كل يبلغ قطرها 6 مم وثقب 2 مم قطر المركزي، وذلك لسمك مجموعه 6 مم. عندما يتم سحب القوات المطلوب أعلى، ويفضل "كومة المعكوسة" التكوين المغناطيس التي يتم مكدسة المغناطيس أسفل مع مغنطة المعاكس. لتحقيق التكوين الإنتقالي العسكري (الشكل 1C)، ونحن إضافة المغناطيس إضافية إلى جانب كومة المغناطيس الرئيسي لتكوين FOMT، وعادة اسطوانة الصلبة مع 4 مم وارتفاعه 7 مم. لنرى كيف القوات القصوى التي تحققت في أدواتنا تعتمد على تكوين المغناطيس، انظر الجدول رقم 1.
المعراخ من MTT وFOMT التجارب
منذ حبات مغناطيسية لها (تقريبا) عن سطح البحر بين functionalized موحد (streptavidin عادة) ومنذ المرفقات كل من ن بين functionalizedالحبال حمض ucleic والخرز علامة (في حال استخدمت علامة القائم على حبة تتبع الزاوي) يحدث عن طريق الحضانة بسيطة في الحل، واحد لا تتحكم فيها حبل و / أو علامة حبة نعلق على حبة المغناطيسي. حبات مغناطيسية يكون محور مغنطة يفضل أن يميل إلى محاذاة على طول اتجاه المجال الخارجي. إذا كنا دلالة على نقطة حيث محور مغنطة يفضل يتقاطع سطح حبة كما القطبين الشمالي والجنوبي، ثم حبات حيث يتم إرفاق الحمض النووي حبل بالقرب من خط الاستواء سوف تتبع خارج الحلقة الدائرية مع دائرة نصف قطرها قريبة أو أكبر قليلا من دائرة نصف قطرها حبة في FOMT؛ في المقابل، والخرز التي تعلق على مقربة من القطب الجنوبي تتقلب على الحلقة الدائرية مع دائرة نصف قطرها صغير جدا في FOMT، والتي يمكن أن تحول دون تركيب الدائرة باستخدام المعادلات 3-5. نلاحظ أنه من خلال الهندسة الكروية بسيطة، واحتمال ربط بالقرب من خط الاستواء هو أكبر بكثير من مرفق بالضبط في القطبين؛ وبالتالي، فإن معظم بسيتم المربوطة EADS بحيث تتبع الزاوي (س، ص) المستندة يمكن القيام بها بنجاح.
يحمل حجة مماثلة لمرفق من الخرز علامة للحصول على علامة مقرها تتبع الزاوي إيمانية. يتم استخدام حبة علامة لخلق التفاوت في صورة حبة المغناطيسية التي تمكن تتبع زاوية. إذا تم إرفاق حبة علامة بالضبط في القطب الشمالي أو الجنوبي من حبة (أي مباشرة في أعلى أو في أسفل)، والصورة الناتجة لا يزال متماثل بالتناوب وفشل بروتوكول تتبع الزاوي. ومع ذلك، من خلال نفس الحجة الهندسة الكروية، وفرصة لحبة علامة إرفاق مباشرة في واحدة من أعمدة صغيرة نسبيا؛ نجد أنه في الممارسة الأكثر الخرز علامة إعطاء التماثل كافية لتمكين تتبع الزاوي. أخيرا، نلاحظ أن في ملاقط المغناطيسية التقليدية الاتجاه الحقل في (س، ص) الطائرة؛ وبالتالي، فإن محور مغنطة المفضل للحبة محاذاة في اله (س، ص) الطائرة والقطبين الشمالي والجنوبي، كما هو محدد أعلاه، ستكون في الجانبين من حبة، من غير المحتمل أن الوضع في FOMT أو الإنتقالي العسكري، حيث القطبين هي في أعلى وأسفل.
في التجارب FOMT، خطوة حاسمة هي المواءمة بين المغناطيس أسطواني مثل أن الحقل المغناطيسي شعاعي لا يكاد يذكر في القرب من حبة. يتم تنفيذ هذا التوافق لحبة واحدة في وقت واحد. للحكم على ما إذا كانت الحركة حبة في FOMT يتم توزيعها بالتساوي على الحلقة الدائرية، ينبغي قياس الوقت يتجاوز 20 · τ C. كما τ C يساوي ~ 45 ثانية لمدة 8 الحمض النووي KBP وحبة دائرة نصف قطرها 0.5 ملم، وقياس الوقت هو ~ 900 ثانية في المراحل النهائية من المحاذاة. للمقارنة، واستخدام الحمض النووي KBP 1.9 و 0.25 ملم حبات نصف قطرها يقلل τ C عشرين ضعفا إلى ~ 2 ثانية (انظر أيضا الجدول 2).
خطوات واعتبارات حاسمة لتتبع خلال FOMT وMTT التجارب
لتتبع تقلبات في حبة في الطائرة، أي في (س، ص) الموقف، ونحن توظيف التحليل عبر ارتباط لمحات كثافة عرضها بواسطة حبة في فترات زمنية لاحقة 35، 36. وهذا يمكن أن يتم على بكسل فرعية القرار إلى دقة بضعة نانوميتر 20. لتتبع الحركة حبة في ض، ونحن عادة استخدام أسلوب تصميم أول مرة من قبل غوس وكروكيت، الذي البؤري على الهدف في (OFP) يتم إزاحة بدقة في الاتجاه الرأسي، بينما تصوير حلقات حيود حبة تعلق على الحمض النووي 20 . في هذه الطريقة، يتم إنشاء ملف تعريف المعايرة ربط نمط حيود من حبة إلى المسافة بين حبة وOFP 19. عندما يتم محرف هذا الملف المعايرة، والتشريد العمودي للحبة يمكن قياسها أيضا بدقة تصل إلى بضعة نانومتر 20.نشير القارئ إلى مراجع إضافية التي تصف الخوارزميات أكثر دقة تتبع 37، 38 وكذلك تطبيقها موازية تتبع من الخرز متعددة 5، 6، 37.
عند استخدام تتبع الزاوي التي تعتمد على تحويل (س، ص) مناصب في الإحداثيات الزاوي، فإننا ننصح المضي قدما على النحو التالي. من تتبع الوقت الذي يتتبع حبة خارج الحلقة الدائرية، استخدم (خ ط، ط ذ) وظائف (حيث مؤشر يدل على نقطة ط القياس اللاحق) لتتناسب مع مركز الدائرة (س 0، ص 0) ودائرة نصف قطرها R (الشكل 2A) عن طريق التقليل:
(3)
حيث تدير أكثر من مجموع جميع نقاط البيانات. بعد fittiنانوغرام س 0، ذ 0، وR الدائرة، وتحديد الإحداثيات القطبية (ص ط، ط θ) لكل نقطة بيانات في تتبع الوقت باستخدام:
(4)
(5)
لاحظ أنه ينبغي للمرء أن الحرص على "بسط" وθ زاوية، أي يقفز لإضافة مرحلة ± π عند الاقتضاء. قانون مكتوب خصيصا للمناسبة وتحويلها من (س، ص) إلى (ص، θ) بتنسيق يتوفر من الكتاب عند الطلب. في FOMT، وقت تتبع فيه حبة يتتبع خارج الحلقة الدائرية يمكن الحصول عليها من خلال تحقيق المواءمة الخشنة (راجع الخطوة 3.3) وتسجيل التقلبات الحرارية للحبة. في الإنتقالي العسكري، fluctu الحراريةations غير كافية لتتبع خارج الحلقة الدائرية؛ بدلا من ذلك، استخدم تتبع الوقت حيث المغناطيس ببطء (عادة عند 0.1 هرتز) استدارة من قبل العديد من المنعطفات لتناسب الدائرة باستخدام المعادلات 3-5.
نلاحظ أن لالإنتقالي العسكري، فمن المهم أن تختار النهج السليم تتبع الزاوي، أي عبر علامة تتبع الزاوي (الشكل 1C، 1D الشكل، الشكل 3A) أو عن طريق تحويل (س، ص) مناصب في الإحداثيات الزاوي ( 1D الشكل، الشكل 2B). في حين أن الدقة في تتبع الزاوي من (س، ص) مواقف واستخدام الخرز علامة عادة قابلة للمقارنة، فمن المهم أن ندرك أن يحدث الحديث المتبادل بين تقلبات حبة في (س، ص) والزاوية، كما هو موضح في يانسن وآخرون (32): وبالتالي، تتبع الزاوي من (س، ص) مواقف صالحة فقط شريطة أن التقلبات في البراونية (خ، ذ) المساهمة تكاد لا تذكر فقط لعدم اليقين في تنسيق الزاوي، والاستخدام السليم لها من (س، ص) تتبع قد تتطلب ضبط للفخ صلابة التناوب عبر تعديل موقف المغناطيس الجانب. عادة، واستخدام أعلى فخ صلابة يتطلب استخدام تتبع الزاوي باستخدام الخرز علامة. استخدام الخرز علامة يتطلب خطوة إضافية المرفق، والذي قد يقلل من عدد من الحبال صالحة للاستعمال (انظر البروتوكول المرفق في الخطوة 1.9). عند استخدام تتبع القائم على حبة علامة، فمن المهم لاختيار حبات مغناطيسية والتي لها تعلق حبة علامة بالقرب من خط الاستواء للحصول على أفضل النتائج.
أهمية FOMT وMTT المناهج بالمقارنة مع الأساليب القائمة والتطبيقات
في ما سبق، لقد أظهرنا كيف يمكن للمرء، بدءا من MT التقليدية، بسهولة تعديل تكوينات المغناطيس لتحويل الصك إلى الإنتقالي العسكري أو FOMT. هذا واضحة مodification، والتي قد تكون مصحوبة إدخال تتبع الزاوي عندما كان المطلوب استخدام علامة تتبع الزاوي، هو نقطة قوية الفوري عن كل من التكوينات، كما أنها تسمح للمستخدم لتطبيق عزم الدوران، وقياس عزم الدوران، أو قياس تطور تبعا ل التجربة في متناول اليد. كما ذكر في المقدمة، سواء FOMT والاستفادة MTT من العديد من نقاط القوة الموجودة لMT، ولا سيما على البساطة، مع الإنتقالي العسكري على وجه الخصوص الاستفادة أيضا من قدرة قياسات موازية 5، 6 (هذه ليست بالسهولة التي تحققت في FOMT نظرا متطلبات المواءمة بين حبل فيما يتعلق وسط المغناطيس أسطواني). والجدير بالذكر أن MTT وFOMT لا تتطلب، في تناقض مع تقنيات أخرى، خصيصا نانو جزيئات ملفقة 22، 39، 40، التصميم البصري مجمع 41، أو إدخال حبات إضافية ضمن المربوطة (DNA) جزيء 42. مثل سقد التقنيات ذر مع ذلك توفر مزايا أخرى مثل دقة أعلى الزمنية 27، 43، 44. كلا FOMT وMTT أن تجد التطبيقات المستقبلية في دراسة الجينوم المعالجة، وسلوك المحركات الجزيئية في الحمض النووي على حد سواء تتأثر ولها عواقب على تطور المحلية وعزم الدوران. تطبيقات إضافية يمكن العثور عليها في مجال تكنولوجيا النانو الناشئة من الحمض النووي 27 أو في مجال أوسع من المحركات الدوارة نشط في معالجة البيولوجية 7، 45.
M270 (R = 1.4 ميكرومتر حبة) | MyOne (R = 0.5 ميكرومتر حبة) | Ademtech (R = 0.25 ميكرون حبة) | |
MT التقليدية (زوج من مكعب 5 × 5 × 5 مم 3 المغناطيس، 1 ملم الفجوة، المحاذاة العمودية) | 70 السندات الإذنية | 8 السندات الإذنية | 1.6 السندات الإذنية |
FOMT أو MTT * (كومة من ثلاثة مغناطيس اسطواني، 6 مم، 2 مم فجوة قطرها) | 9 السندات الإذنية | 1 السندات الإذنية | 0.2 السندات الإذنية |
FOMT أو MTT * (كومة من ثلاثة مغناطيس اسطواني، 6 مم، 1 مم فجوة قطرها) | 18 السندات الإذنية | 2 السندات الإذنية | 0.4 السندات الإذنية |
FOMT أو MTT * (كومة من ثلاثة مغناطيس اسطواني مع مشاركة واحدة انقلبت، 1 ملم الفجوة قطر) | ~ 50 السندات الإذنية | 9 السندات الإذنية | 1.8 السندات الإذنية |
* وجود المغناطيس الجانب الصغيرة في MTT له تأثير يذكر على قوة تمتد
الجدول 1. حققت قوات أقصى عادة لتكوينات مختلفة وأنواع المغناطيس حبة.
R = 1.4 ميكرومتر حبة | R = 0.5 ميكرومتر حبة | R حبة =0.25 ميكرومتر | |
معامل الاحتكاك * | 120 نانومتر · · السندات الإذنية ثانية | 5.5 نانومتر · · السندات الإذنية ثانية | 0.7 نانومتر · · السندات الإذنية ثانية |
النطاق الزمني مميزة: FOMT، 10 KBP الحمض النووي ** | 1200 ثانية | 55 ثانية | 7 ثانية |
النطاق الزمني مميزة: FOMT، DNA 1 KBP | 120 ثانية | 5.5 ثانية | 0.7 ثانية |
النطاق الزمني مميزة: MTT، ك ف = 100 السندات الإذنية · نانومتر / راد | 1.2 ثانية | 0.06 ثانية | 0.007 ثانية |
النطاق الزمني مميزة: MTT، ك ف = 1000 السندات الإذنية · نانومتر / راد | 0.12 ثانية | 0.006 ثانية = 6 ميللي ثانية | ق = 0.0007 0.7 ميللي ثانية |
* معامل الاحتكاك للدوران حول محور من خلال "خط الاستواء" (أي الوضع هو مبين في الشكل 1B)، التي قدمها 14 · ع · ح · R حبة 3، حيث h هو اللزوجة من المخزن المؤقت.
** في FOMT، ونظرا لصلابة فخ التناوب من صلابة التوائية من الحمض النووي، ك ف، الحمض النووي = C · ك ب ر / L C، حيث C هو طول فعالة استمرار التوائية، يفترض أن تكون 80 نانومتر هنا ( والتي هي من سمات نظام قوة وسيطة، F ~ 1 PN) وL C هو طول كفاف من الحمض النووي، 0.34 نانومتر لكل زوج قاعدة.
الجدول 2. معاملات الاحتكاك والزمنية المميزة المقاييس وFOMT وMTT.
The authors have nothing to disclose.
وأيد هذا العمل من قبل TU دلفت، ومنظمة هولندا للبحث العلمي (NWO)، ومؤسسة للبحوث الأساسية في المسألة، ومؤسسة العلوم الأوروبية.
Sandblaster | Great Lake Orthodontics | 190-070 Microetcher II | |
Nitrocellulose | Life Technologies | LC2001 | |
Magnetic particle concentrator | Life Technologies | 12002D | |
Non-magnetic latex beads (0.5 μm radius) | Polysciences | 17010 | |
Non-magnetic latex beads (1.5 μm radius) | Sanbio | PV05N/2179 | |
Antidigoxigenin | Roche | 11 214 667 001 | |
Streptavidin-coated superparamagnetic beads (0.25 μm radius) | Ademtech | 3150 | |
Streptavidin-coated superparamagnetic beads (0.5 μm radius, “MyOne”) | Life Technologies | 650.01 | |
Streptavidin-coated superparamagnetic beads (1.4 μm radius, “M270”) | Life Technologies | 653.05 | |
Biotin-coated latex beads (0.5 μm radius) | Life Technologies | F-8768 | |
Cubic magnets for conventional tweezers | Supermagnete | W-05-N50-G | |
Cylindrical magnet for MTT and FOMT | Supermagnete | R-06-02-02G | |
Side magnet for MTT | Supermagnete | S-04-07-N | |
Linear stage | Physik Instrumente | M-126.PD | |
Rotary stage | Physik Instrumente | C-150 | |
High-resolution automated sample stage | Physik Instrumente | P-733.2D | |
Software for coding analysis routines | The Mathworks | Matlab | custom-written routines are available from the authors |