Name: Modlu Optik Mikroskopi Yöntemleri Caribbean Reef Yapı Mercanlar içinde Polip Doku Morfoloji ve Yapı Göstermektedir (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2014-09-05T13:00:00.000+00:00
Duration: 10 min 39 s
Description: Keşfedin modüler optik mikroskopi yöntemleriyle Caribbean resif yapı mercanlarında polip doku morfolojisini ve yapısını görüntülemeyi. Bu teknik, mercan biyolojisi ve koruma çalışmaları için değerli bilgiler sunar.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

playerTrialDesktop

Illinois Urbana-Champaign Üniversitesi (UIUC) Genomik Biyoloji Enstitüsü'nde histolog olan Donna Epps'e numune hazırlama ve kesit alma konusundaki yetenekli teknik yardımı için teşekkür ederiz. Bu çalışma, Deniz Araştırmaları Ofisi'nden (N00014-00-1-0609) B.W. Fouke'ye verilen bir araştırma bursu ile desteklenmiştir. Buna ek olarak, C.A.H. Miller, UIUC Jeoloji Bölümü Wanless Bursu, UIUC Jeoloji Bölümü Leighton fonu ve UIUC Jeoloji Bölümü Roscoe Jackson saha çalışması fonundan hibe aldı. Bu yazıda sunulan yorumlar yazarlara aittir ve bağışta bulunan kurumların yorumlarını temsil etmeyebilir. Ayrıca Curaçao'daki Karayip Biyoçeşitlilik Araştırma ve Yönetimi (Carmabi) laboratuvarına mercan dokusu biyopsi örneklerinin toplanmasındaki destekleri ve işbirlikleri için teşekkür ederiz. IGB Medya İletişim Uzmanı Claudia Lutz'a dil düzeltmesi için teşekkür ederiz.

NOT: Reaktifler Mercan Örneklerinin Seri Blok Yüz Görüntüleme için hazırlanacak 1. Preinfiltration Wax <ol><li> , Bir cam beher içinde, STEARINI pullarının 3.6 g eritin. Sıcak bir plaka (60-70 ° C) için iyice karıştırın. </li><li> Sudan IV 400 mg ekleyin (balmumu arka floresan en aza indirmek için). İyice karıştırın ve bir kırmızı saydam solüsyon elde edilene kadar bekleyin. </li><li> 96 ml sıcak erimiş parafin (% 100) ekleyin ve iyice karıştırın. </li></ol> 1.2) Gömme Wax <ol><li> , Bir cam beher içinde, STEARINI pullarının 7.2 g eritin ve sıcak bir plaka üzerinde iyice karıştırılır (60-70 ° C). </li><li> Sudan IV 0.8 g ekleyin. İyice karıştırın ve bir kırmızı saydam solüsyon elde edilene kadar bekleyin. </li><li> Parafin granülleri (162 gr) ekleyin ve parafin, tamamen eriyene kadar karıştırın. </li><li> Beyaz granül yapısında bir Vybar 30 gr eklemek ve aynı beher içinde tamamen eritmek; Ergitildikten sonra karıştırılır. </li><li> Gevşek bir kapak ile cam şişe kapatın. 60 ° C&#39;lik bir konveksiyon ov cam şişe yerleştirintr sıvı halde tutmak için maddeler. Bu fırında bütün sızmaları yürütmek. </li><li> 100 ml her biri iki cam şişe içinde 200 ml kırmızı mum toplam hacmi bölün. Bir sızıntı için alikosunu ve nihai gömme için diğer kullanın. </li></ol> 1.3) Seri Blok Yüz Görüntüleme için gömülmesi Mercan Dokular <ol><li> Fosfat tamponlu tuzlu su (3 x 5 dk) (paraformaldehid içinde 4-5 ° C de 3-6 ay) mercan alana (SI video 1) içinde toplanır ve saklanan polipleri yıkayın ve hazır yansıması zaman kirecini. 24 saat boyunca ya da polipler CaCO 3 tamamen yoksun olarak Excal kadar çözelti içinde polipler kirecini. Örnekleri kurutmak için 1x iksilen yerine, ardından bir 25, 50, 75, ve% 100 etanol serileri içerisinde, tek bir blok olarak birkaç polipler kireçlenmiş mercan inkübe edin. </li><li> % 100 ksilen yedeği içeren önceden ısıtılmış 65 ° C fırında işlenmiş polipler yerleştirin. Changi ile iki kere 30 dakika süre ile inkübetaze çözelti kadar değişmektedir. Poliplerin yukarıdan aşağıya bakan üst yüzeyi mümkün olduğu kadar düz olduğu şekilde polipler döndürün. </li><li> 1: 1: 1 ve 1: 2 solüsyonlar yapmak yerine 2 ksilen ve 50 ml Falcon tüpleri içerisinde preinfiltration balmumu (adım 1.1). </li><li> 30-60 dakika, her seferinde 100% preinfiltration mum 3x inkübasyon takip preinfiltration balmumunun bu üç artan konsantrasyonları ile mercan polipler inkübe edin. </li><li> Not: numunelerin kalınlığına bağlı olarak, basamak 1.3.1-1.3.5 daha uzun bir süre ile arttırılabilir. </li><li> Balmumu gömme örnekleri taşı 100% preinfiltration mum 3x inkübasyondan sonra (adım 1.2.6 bakınız). </li><li> 30 dakika sonra gömme balmumu çıkarın. Taze gömme balmumu ile değiştirin ve 65 ° C&#39;de 4 saatlik bir inkübasyon en az devam etmektedir. </li></ol> 1.4) Kırmızı Wax katıştırma <ol><li> Bloğu (beyaz mum yerleştirilir ve üstüne bir paslanmaz çelik tepsiyi fotoğraflamak hangi sample) yerleştirilir. Bir kez balmumu içine alınır, bu gereklidir, numunenin yer gömülü kırmızı mum opak olarak görünmez hale gelecektir. </li><li> Yeni ısıtılmış paslanmaz çelik gömme kalıp etrafında yüksek erime noktası balmumu küçük damla koyun ve soğumasını bekleyin. Adım 1.2.6 belirtildiği gibi ikinci konteyner taze erimiş gömme balmumu küçük bir hacim dökün. </li><li> Beyaz mum nokta üzerine hızlı bir şekilde bakacak mercan polip yerleştirin, daha sonra paslanmaz çelik tepsi üzerine plastik bir numune tutucu yerleştirmek ve balmumu plastik kalıp yüzeyine kadar gelir ve böylece daha fazla balmumu gömme dökün. </li><li> 65 ° C fırında dışarı tüm kurulum alın ve mumu tamamen sertleşir kadar bir tezgah ya da serin bir yüzey üzerinde soğumasını bekleyin. </li><li> Bu gün ya da iki 6 saat kadar sürebilir. Uzun süreli depolama için ışıktan korumalı 4 ° C &#39;de bir buzdolabında kurutulmuş blok, koyun. </li></ol> 1.5) Seri Blok Yüz Kur at Kesit <ol><li> Trblok im ve mikrotomu ile 1 mikron bölümleri kesti. Onlar tozu gibi olacak gibi bölümleri toplamak etmeyin. Biz sadece blok yüzünü görüntüleme vardır, unutmayın. Beyaz mum yok başladığı zaman örnek görüntülenir. </li><li> Örneklemin bir bölümü kaldırıldı her zaman içeren düzgün blok yüz görüntüleri yakalayın. Mercan polip SI Videolu 2 olarak kaybolana kadar devam edin. </li><li> Tutanak / Kromatofor / mercan polip otomatik floresan almak için bir FITC floresan filtre kullanarak siyah beyaz kamera ile görüntüleri yakalayın. Görüntü her türün 3-4 dekalsifiye çekirdekler. </li></ol> 2. Görüntüleme Mercanlar altında İki foton Floresan Mikroskopi <ol><li> Kısa sürede su altında hasat gibi her toplama (deniz kıyısında) yerinde% 4 paraformaldehitte, çapı yaklaşık bir inç etrafında 10-12 polipleri içeren, mercan polip çekirdekleri Fix. </li><li> Görüntüleme kadar 4 ° C &#39;de örnekleri tutun. Yıkanmış çekirdek inci yerleştirilirbaş aşağı bir kapak cam alt çanak e aynı solüsyonu (0.17 mm kalınlığında). </li><li> 10X (0.3 NA) objektif kullanılarak 780 nm uyarma, görüntü iki farklı büyütme (dijital zoom) 3-4 polipler bir iki foton lazer kullanılarak. Mercan polip şekli ve yüksekliği de görüntüleme objektif çalışma mesafesi ile sınırlıdır numuneler (genellikle 1-2 mm) ve görüntüleme derinliği arasında değişmektedir. </li><li> Etrafında 5.000-10.000 görüntüleri, toplamda 10 veya 20 mikron aralığında z ekseni boyunca xy odak düzlemi başına görüntüleri ve 50-100 görüntüleri yaklaşık 25-100 (5 x 5 veya 10 x 10 fayans) toplamak için karo tarama modunu kullanın / mercan polip. </li><li> Dört polip alanlara Görüntü üç çekirdek ve mercan türleri temsil etmek. NOT: Görüntü alma süresi 2-5 saat / polip alanı arasında değişir. </li><li> LSM 5. 3D görüntü analizi ve rendering yazılımları 3D Render gibi sistemin sabit diskine ham veri formatında tüm görüntüleri saklayın. </li></ol> 3. 3D Volume Rendering ve VisualizatioSBFI n ve İki foton spektral Floresan Veri <ol><li> Programda kare kırpma aracını kullanarak tek bir polip üzerinde odaklanarak dosya boyutunu azaltmak ve derleme bir tek tiff dosyası olarak toplama yazılımı (8 bit formatında kaydederek de dosya boyutunu azaltmak) için 2D verileri kırpın. </li><li> Imaris hacim algoritması altında modülünü Aşan programında SBFI verilerin monte dosyaları (adım 1.5.1 toplanan) veya (adım 2.1.4 toplanan) iki foton optik bölümden kiremitli çoklu z yığınları açın. </li><li> Bir gölge projeksiyon kullanarak 3D render SBFI verileri yansıtın. Vokselden bir katı yüzey deseni (SI Video 3) oluşturmak için eşiklenir olduğunuz bir isosurface modu oluşturun. </li><li> Mercan 3D yapısı ve şekli ortaya çıkarmak için xz, xy bir kırpma düzlem algoritması kullanarak 3D projeksiyonları ve yz dik modları gözünüzde canlandırın. </li><li> Aynı Imaris programda bir anahtar kare animasyon modülünü kullanarak projeksiyonlar animasyon (SI ViDEOS 3-7). </li><li> 5% sıkıştırmada video dosyalarını oluşturmak ve hacim kullanarak avi formatında bir film klipleri oluşturmak (SI Videolar 4 ve 6), 3D ve Isosurface modaliteleri (SI Video 5 ve 7). </li></ol>

<ol><li><a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=%22Climate+Change+2013%3A+The+Physical+Science+Basis.+Contribution+of+Working+Group+I+to+the+Fifth+Assessment+Report+of+the+Intergovernmental+Panel+on+Climate+Change%22">Climate Change 2013: The Physical Science Basis. Contribution of Working Group I to the Fifth Assessment Report of the Intergovernmental Panel on Climate Change</a>. Stocker, T. F., Qin, D., Plattner, G. -K., Tignor, M., Allen, S. K., Boschung, J., Nauels, A., Xia, Y., Bex, V., Midgley, P. M. , Cambridge University Press. 1535(2013).</li>
<li>Buddemeir, R. W., Kleypas, J. A., Aronson, R. B. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aBuddemeir%2C+RW+%22Coral+Reefs+%26+Global+Climate+Change%3A+Potential+Contributions+of+Climate+Change+to+Stresses+on+Coral+Reef+Ecosystems%29%22">Coral Reefs & Global Climate Change: Potential Contributions of Climate Change to Stresses on Coral Reef Ecosystems)</a>. 46, Pew Center on Global Climate Change. (2004).</li>
<li>Wilkinson, C. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aWilkinson%2C+C+%22Status+of+coral+reefs+of+the+world%22">Status of coral reefs of the world</a>. , Australian Institute of Marine Science. Townsville. 1-2 (2004).</li>
<li>Lough, J. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Climate+records+from+corals%5BTitle%5D)+AND+%22WIREs+Clim.+Chang%22%5BJournal%5D)">Climate records from corals.</a> WIREs Clim. Chang. 1, 318-331 (2010).</li>
<li>Harvell, C. D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Tropical+Archaea%3A+diversity+associated+with+the+surface+microlayer+of+corals%5BTitle%5D)+AND+%22Mar.+Ecol.+Prog.+Ser%22%5BJournal%5D)">Tropical Archaea: diversity associated with the surface microlayer of corals.</a> Mar. Ecol. Prog. Ser. 273, 81-88 (2004).</li>
<li><a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=%22Coral+Health+and+Disease%22">Coral Health and Disease</a>. Rosenberg, E., Loya, Y. , Springer. (2004).</li>
<li>Rohwer, F., Breitbart, M., Jara, J., Azam, F., Knowlton, N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Diversity+of+bacteria+associated+with+the+Caribbean+coral+Montastrea+franksi%5BTitle%5D)+AND+%22Coral+Reefs%22%5BJournal%5D)">Diversity of bacteria associated with the Caribbean coral Montastrea franksi.</a> Coral Reefs. 20, 85-91 (2001).</li>
<li>Frias-Lopez, J., Zerkle, A. L., Bonheyo, G. T., Fouke, B. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Partitioning+of+bacterial+communities+between+seawater+and+healthy%2C+black+band+diseased%2C+and+dead+coral+surfaces%5BTitle%5D)+AND+%22Appl.+Environ.+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Partitioning of bacterial communities between seawater and healthy, black band diseased, and dead coral surfaces.</a> Appl. Environ. Microbiol. 68, 2214-2228 (2002).</li>
<li>Stanley, G. D. Jr <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+evolution+of+modern+corals+and+their+early+history%5BTitle%5D)+AND+%22Earth+Sci.+Rev%22%5BJournal%5D)">The evolution of modern corals and their early history.</a> Earth Sci. Rev. 60, 195-225 (2003).</li>
<li>Piggot, A. M., Fouke, B. W., Sivaguru, M., Sanford, R., Gaskins, H. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Change+in+zooxanthellae+and+mucocyte+tissue+density+as+an+adaptive+response+to+environmental+stress+by+the+coral+Montastraea+annularis%5BTitle%5D)+AND+%22Mar.+Biol%22%5BJournal%5D)">Change in zooxanthellae and mucocyte tissue density as an adaptive response to environmental stress by the coral Montastraea annularis.</a> Mar. Biol. 156, 2379-2389 (2009).</li>
<li>Stanley, G. D. Jr <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Photosymbiosis+and+the+evolution+of+modern+coral+reefs%5BTitle%5D)+AND+%22Evolution%22%5BJournal%5D)">Photosymbiosis and the evolution of modern coral reefs.</a> Evolution. 1, 3(2006).</li>
<li>Gordon, B. R., Leggat, W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Symbiodinium%E2%80%94Invertebrate+Symbioses+and+the+Role+of+Metabolomics%5BTitle%5D)+AND+%22Mar.+Drugs%22%5BJournal%5D)">Symbiodinium—Invertebrate Symbioses and the Role of Metabolomics.</a> Mar. Drugs. 8, 2546-2568 (2010).</li>
<li>Schlichter, D., Weber, W., Fricke, H. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+chromatophore+system+in+the+hermatypic%2C+deep-water+coral+Leptoseris+fragilis+%28Anthozoa%3A+Hexacorallia%29%5BTitle%5D)+AND+%22Marine+Biology%22%5BJournal%5D)">A chromatophore system in the hermatypic, deep-water coral Leptoseris fragilis (Anthozoa: Hexacorallia).</a> Marine Biology. 89, 143-147 (1994).</li>
<li>Fouke, B. W., Meyers, W. J., Hanson, G. N., Beets, C. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Chronostratigraphy+and+dolomitization+of+the+Seroe+Domi+Formation%2C+Curacao%2C+Netherlands+Antilles%5BTitle%5D)+AND+%22Facies%22%5BJournal%5D)">Chronostratigraphy and dolomitization of the Seroe Domi Formation, Curacao, Netherlands Antilles.</a> Facies. 35, 293-320 (1996).</li>
<li>Frias-Lopez, J., Bonheyo, G. T., Jin, Q., Fouke, B. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Cyanobacteria+associated+with+coral+black+band+disease+in+Caribbean+and+Indo-Pacific+reefs%5BTitle%5D)+AND+%22Appl.+Environ.+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Cyanobacteria associated with coral black band disease in Caribbean and Indo-Pacific reefs.</a> Appl. Environ. Microbiol. 69, 2409-2413 (2003).</li>
<li>Frias-Lopez, J., Klaus, J., Bonheyo, G. T., Fouke, B. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+bacterial+community+associated+with+black+band+disease+in+corals%5BTitle%5D)+AND+%22Appl.+Environ.+Microbiol%22%5BJournal%5D)">The bacterial community associated with black band disease in corals.</a> Appl. Environ. Microbiol. 70, 5055-5062 (2004).</li>
<li>Frias-Lopez, J., Bonheyo, G. T., Fouke, B. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Identification+of+differential+gene+expression+in+bacteria+associated+with+coral+black+band+disease+using+RNA-arbitrarily+primed+PCR%5BTitle%5D)+AND+%22Appl.+Environ.+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Identification of differential gene expression in bacteria associated with coral black band disease using RNA-arbitrarily primed PCR.</a> Appl. Environ. Microbiol. 70, 3687-3694 (2004).</li>
<li>Klaus, J. S., Frias-Lopez, J., Bonheyo, G. T., Heikoop, J. M., Fouke, B. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Bacterial+communities+inhabiting+the+healthy+tissues+of+two+Caribbean+reef+corals%3A+interspecific+and+spatial+variation%5BTitle%5D)+AND+%22Coral+Reefs%22%5BJournal%5D)">Bacterial communities inhabiting the healthy tissues of two Caribbean reef corals: interspecific and spatial variation.</a> Coral Reefs. 24, 129-137 (2005).</li>
<li>Klaus, J., Janse, I., Sandford, R., Fouke, B. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Coral+microbial+communities%2C+zooxanthellae%2C+and+mucus+along+gradients+of+seawater+depth+and+coastal+pollution%5BTitle%5D)+AND+%22Environ.+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Coral microbial communities, zooxanthellae, and mucus along gradients of seawater depth and coastal pollution.</a> Environ. Microbiol. 9, 1291-1305 (2007).</li>
<li>van Duyl, F. C. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3avan+Duyl%2C+FC+%22Atlas+of+the+living+reefs+of+Curacao+and+Bonaire+%28Netherlands+Antilles%29%22">Atlas of the living reefs of Curacao and Bonaire (Netherlands Antilles)</a>. , Diss. Vrije Universiteit. Amsterdam. (1985).</li>
<li>Carricart-Ganivet, J. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Sea+surface+temperature+and+the+growth+of+the+West+Atlantic+reef+building+coral+Montastraea+annularis%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Exp.+Mar.+Biol.+Ecol%22%5BJournal%5D)">Sea surface temperature and the growth of the West Atlantic reef building coral Montastraea annularis.</a> J. Exp. Mar. Biol. Ecol. 302, 249-260 (2004).</li>
<li>Barnes, D. J., Lough, J. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Coral+skeletons%3A+Storage+and+recovery+of+environmental+information%5BTitle%5D)+AND+%22Global+Chang.+Biol%22%5BJournal%5D)">Coral skeletons: Storage and recovery of environmental information.</a> Global Chang. Biol. 2, 569-582 (1996).</li>
<li>Mohun, T. J., Weninger, W. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Generation+of+volume+data+by+episcopic+three-dimensional+imaging+of+embryos%5BTitle%5D)+AND+%22Cold+Spring+Harbor+Protocols%22%5BJournal%5D)">Generation of volume data by episcopic three-dimensional imaging of embryos.</a> Cold Spring Harbor Protocols. 6, 069591(2012).</li>
<li>Mohun, T. J., Weninger, W. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Imaging+heart+development+using+high-resolution+episcopic+microscopy%5BTitle%5D)+AND+%22Curr.+Opin.+Genet.+Dev%22%5BJournal%5D)">Imaging heart development using high-resolution episcopic microscopy.</a> Curr. Opin. Genet. Dev. 21, 573-578 (2011).</li>
<li>Mohun, T. J., Weninger, W. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Embedding+embryos+for+episcopic+fluorescence+image+capturing+%28EFIC%29%5BTitle%5D)+AND+%22Cold+Spring+Harb.+Protoc%22%5BJournal%5D)">Embedding embryos for episcopic fluorescence image capturing (EFIC).</a> Cold Spring Harb. Protoc. 6, 069575(2012).</li>
<li>Rosenthal, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Rapid+high+resolution+three+dimensional+reconstruction+of+embryos+with+episcopic+fluorescence+image+capture%5BTitle%5D)+AND+%22Birth+Defects+Res.+C%3A+Embryo+Today%3A+Rev%22%5BJournal%5D)">Rapid high resolution three dimensional reconstruction of embryos with episcopic fluorescence image capture.</a> Birth Defects Res. C: Embryo Today: Rev. 72, 213-223 (2004).</li>
<li>Slyfield, C. R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Three-dimensional+surface+texture+visualization+of+bone+tissue+through+epifluorescence-based+serial+block+face+imaging%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Microsc%22%5BJournal%5D)">Three-dimensional surface texture visualization of bone tissue through epifluorescence-based serial block face imaging.</a> J. Microsc. 236, 52-59 (2009).</li>
<li>Weninger, W., Mohun, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Phenotyping+transgenic+embryos%3A+a+rapid+3-D+screening+method+based+on+episcopic+fluorescence+image+capturing%5BTitle%5D)+AND+%22Nat.+Genet%22%5BJournal%5D)">Phenotyping transgenic embryos: a rapid 3-D screening method based on episcopic fluorescence image capturing.</a> Nat. Genet. 30, 59-65 (2001).</li>
<li>Weninger, W., Mohun, T. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aWeninger%2C+W+%22Three-dimensional+analysis+of+molecular+signals+with+episcopic+imaging+techniques.+Reporter+Genes%22">Three-dimensional analysis of molecular signals with episcopic imaging techniques. Reporter Genes</a>. , Humana Press. 35-46 (2007).</li>
<li>Gerneke, D. A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Surface+imaging+microscopy+using+an+ultramiller+for+large+volume+3D+reconstruction+of+wax-and+resin-embedded+tissues%5BTitle%5D)+AND+%22Microsc.+Res.+Tech%22%5BJournal%5D)">Surface imaging microscopy using an ultramiller for large volume 3D reconstruction of wax-and resin-embedded tissues.</a> Microsc. Res. Tech. 70, 886-894 (2007).</li>
<li>Denk, W., Horstmann, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Serial+block-face+scanning+electron+microscopy+to+reconstruct+three-dimensional+tissue+nanostructure%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+Biol%22%5BJournal%5D)">Serial block-face scanning electron microscopy to reconstruct three-dimensional tissue nanostructure.</a> PLoS Biol. 2, e329(2004).</li>
<li>Salih, A., Larkum, A., Cox, G., Kühl, M., Hoegh-Guldberg, O. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Fluorescent+pigments+in+corals+are+photoprotective%5BTitle%5D)+AND+%22Nature%22%5BJournal%5D)">Fluorescent pigments in corals are photoprotective.</a> Nature. 408, 850-853 (2000).</li>
<li>Sivaguru, M., Mander, L., Fried, G., Punyasena, S. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Capturing+the+surface+texture+and+shape+of+pollen%3A+A+comparison+of+microscopy+techniques%5BTitle%5D)+AND+%22PloS+one%22%5BJournal%5D)">Capturing the surface texture and shape of pollen: A comparison of microscopy techniques.</a> PloS one. 7 (6), (2012).</li>
<li>Helmchen, F., Denk, W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Deep+tissue+two-photon+microscopy%5BTitle%5D)+AND+%22Nat.+Methods%22%5BJournal%5D)">Deep tissue two-photon microscopy.</a> Nat. Methods. 2, 932-940 (2005).</li>
</ol>

Yazarlar herhangi bir çıkar çatışması beyan etmemektedir.

Mercan resif araştırma deniz ortamında faaliyet eşzamanlı fiziksel, kimyasal analizi ve biyolojik olayları içeren, son derece disiplinler arası araştırma çabası. Karmaşık mercan kayalığı ekosistemlerin çalışma bu nedenle en iyi bağlamsal çerçeve (Şekil 10) bir &#39;Ten Selahiyet&#39; içinde tamamlanır. Bu grafik derleme mercan ekosistem mekansal boyutları geniş bir yelpazede (10 -9 10 5 m) kapsadığını göstermektedir. Ayrıca, bu egzersiz geobiological alanını birleştirmek ve laborat...

Küresel ısınma ve eşlik eden çevresel değişim, doğrudan tropik deniz mercanlar 1-4 sağlığını ve dağıtımını etkiliyor. Birden etkiler Mercan ağarması ve bulaşıcı hastalıkların 5-6 ortaya çıkması gibi, izlenmektedir. Ancak, bu çevresel tehditlere gelecek mercan yanıtı daha doğru tahmin histolojik &quot;temel&quot; &quot;görünüşte sağlıklı&quot; mercanlar için doku morfolojisi ve hücre yapısını ve dağılımını tanımlayan, kurulacak gerektirecektir. Buna karşılık, mercanlar ardından nicel mukayese edilebilir &quot;etkiledi&quot;. &quot;Sağlıklı yanıtı&quot; Ayrıca çevresel geçişlerini karşısında teraziye böylece Ayrıca, bu temel, çevre koşulları altında çeşitli görünüşte sağlıklı mercanlar için kurulmalıdır. Bu temel oluşturma yönünde bir ilk adım olarak, yüksek çözünürlüklü 3D çalışma ne kadar görünüşte sağlıklı mercan polip dokusunun üstlenilmiştirmorfolojisi ve hücresel kompozisyon güneş ışığı parlaklığındaki su derinliği arttıkça (WD) ve eşlik eden düşüşler yanıt verir. Sonuçlar daha sonra mercan adaptasyon daha kapsamlı bir mekanistik anlayış kurmak için, yanı sıra mercan-symbiont evrim içgörü ve hafif hasat geliştirme kazanmak için kullanılabilir. Stony mercanlar (Scleractinia) toplu mercan 7-10 holobiont olarak anılacaktır diğer mikroorganizmaların karmaşık bir montaj, ev sahipliği sömürge deniz omurgasız hayvanlardır. Bu çalışmada gerçekleştirilen araştırma eş zamanlı doku pigmentlerin artan su derinliği ve görünüşte sağlıklı konak mercan simbiyotik zooxanthellae ile değişiklikleri izlemek için üstün görüntüleme teknolojileri paketini kullanmak istiyor. Bu mercan İşitme göstergeleri olarak, görünüşte sağlıklı mercanlar ve eylem için bir batimetrik degrade boyunca gerekli karşılaştırmalı doku hücresi &quot;dayanak&quot; kuracaklth 10. Mercan pigmentler denilen Kromatofor, absorbe yansıtmak, dağılım, kırmak, kırabilen, ya da başka güneş radyasyonunun 11 ile müdahale hareket. Zooxanthellae-chromatophore endosimbiyotik ilişkisi mercan hayvan 12 stratejik avantajlı ışık hasat optimizasyonu ve iskelet büyüme stratejileri Birlikte evrimin varlığını, yanı sıra besinsel plastisite (vites besleme stratejilerini autotrophy heterotrophy kadar geri ve ileri-) sağladı. Curaçao güney Karayip ada ülkesi (Hollanda Antilleri eskiden parçası) Aruba La Blanquilla takımada (Şekil 1A) uzanımlı doğu-batı içinde yaklaşık 65 km kuzeyinde Venezuela yatıyor. Curaçao 70 km uzunluğundaki güney sahili modern bir sürekli ve Miyosen-Pliyosen-Pleistosen-Holosen antik saçak mercan kayalığı yollarını 13,14 içerir. Curaçao yaklaşık 3 ° C Bir değişir yıllık SST ortalamanually, 27.5 ± 0.5 ° C arasında bir yıllık ortalama sıcaklık, erken Eylül ayında 29 ° C maksimum Ocak ayı sonlarında 26 ° C minimum değişen (NOAA SST Veri 2000-2010, ayarlar). Daha önce iyi çalışılmış ve olmuştur çünkü Curaçao (Şekil 1A) kuzeybatı ucuna yakın yalan Playa Kalki de mercan kayalığı (12 ° 22&#39;31.63 &quot;N, 69 ° 09&#39;29.62&quot; W), örnekleme için seçildi Bu konumda deniz ekosistemi taze kirlenmemiş deniz suyu 7,15-19 yıkanıyor. . İki yakından ilgili scleractinian mercan türlerinin, M. annularis ve M faveolata, bu çalışmada deney ve analiz için seçildi her türün çünkü: (1) raf tatili ve bakımından resif sistem üzerinde sergileyen belirgin bir biçimde farklı ve örtüşmeyen batimetrik dağılımları ilişkili karbonat çökel çökelme ortamları (M. annularis aralık = 0-10 m WD M. faveolataaralık = 10-20 m, WD 20, Şekil 1B, 2A ve 2B); (2) Karayip Denizi 21 genelinde yaygın bir mercan resif çatısı kurucusudur; ve (3) iyi çalışılmış ekolojik, fizyolojik ve evrimsel ilişkileri 22 sahiptir. Bu çalışma için alan örnekleme deniz Curaçao&#39;da Playa Kalki standart Dalış teknikleri kullanılarak gerçekleştirilmiştir. Bir sığ-to-derin su batimetrik transekt raf tatili boyunca rafta koştu kuruldu ve derin su ön resif ortamlara edildi. (1) üç ayrı M. ~ 1 m çap mercan başkanları: Görünüşe sağlıklı mercan başkanları sonra da dahil olmak üzere, bu batimetrik transect boyunca örnekleme için tespit edildi 5 m su derinliğine (WD) idi hepsi annularis; M. ve (2) üç ayrı ~ 1 m çap mercan kafaları faveolata, her biri 12 m WD vardı. Fotosentez için aktif radyasyon (PAR) 33-36% P olarak ölçüldü5 m WD&#39;nin en AR ve 10 m WD 18-22% PAR. SST 5 m ve 12 m hem derinliklerdeki 26 ° C iken Örnekleme Ocak ayında yapılmıştır. Bu altı mercan başkanları Her (yani. Altı yarım küre mercan başkanları her birinde yaklaşık 45 ° N enlemi) eşdeğer mekansal konumlarda üç nüsha örnekleri alındı. Her bir numune, bir temizlenmiş zımba ile toplandı, 2.5 cm çapında bir mercan doku iskelet biyopsiye oluşuyordu. Üç mercan doku-iskelet biyopsileri mercan başkanları her birinden eldivenli elleriyle standart SCUBA örneklenmiştir (M. 9 5 m WD koloniler annularis ve M. 9 ila 12 m WD de faveolata). Hemen derinlikte toplanarak her bir biyopsi örneği çekirdek, steril bir 50 ml polipropilen santrifüj tüpüne yerleştirilmiş, vidalı kapaklı kapalı ve yüzeyin geri döndü. Deniz suyu, her santrifüj tüpüne dekante edildi ve her bir çekirdek biyopsisi daha sonra, daldırma, depolanması ve% 4 paraformaldehid içinde taşınmıştır. 23-30 hayvansal örneklerin çok sayıda türleri dahil olmak üzere biyolojik numunelerde geniş bir yelpazesi üzerinde gerçekleştirilmiştir. Floresan veya parlak bir alan teknikleri ile ya optik / ışık mikroskobu kullanılan bu çalışmaların çoğu. Ancak, çalışmalar son 31 tarama elektron seri blok yüz görüntüleme kullanarak ultra-yüksek büyütme yapılmıştır. Bu çalışmada, bir tadil edilmiş SBFI protokolü geliştirilmiştir ve ilk kez mercan uygulanır. M. Çünkü annularis ve M. faveolata mercan polipleri kalınlığı 1-2 mm olan, ışık mikroskobu rutin tekniklerden herhangi birinin mercan polip dokusunun bütün kalınlığı içinden geçebilme kabiliyetine sahip olacaktır. Bu nedenle, özellikle mercan örnekleri için tasarlanmış SBFI numune hazırlama protokolü var. Ayrıca, özel bir stereomikroskopta tutucu tasarladık, X ve y doğrultularında hareket motorlu hangi. Bu cihaz, oldukça mikroskop önünde düzenli mikrotom kullanılarak bölümleri toplama daha numunenin blok yüz görüntülerini alır. Ayrıca mercan dokuların bütün kalınlığı boyunca görüntü aynı mercan polip bir doğrusal olmayan optik iki-fotonlu mikroskopik tekniği sundu. Bu yumuşatma açısından ve numune hazırlama (dehidratasyon) ve işleme protokolleri tarafından uyarılan olabilir doku morfolojisi ve hacim (büzüşmesi) değişim olasılığı SBFI tarafından dayatılan sınırlamaların üstesinden gelir. Ayrıca, mercan emisyon profilleri spektral kromatoforların ve fotosentetik zooxanthellae arasındaki tepe emisyonlarını ve varyasyonları belirlemek için çözüldü. Bu sonuçlar, kullanılan yöntemin bağlamında elde etme süresi ile ilgili bireysel avantajları, süre ve str ödün vermeden ince yapı ayrıntıları çözmek için yeteneği değerlendirilmiştirmercan dokusu uctural bütünlüğü.

<table><tbody><tr><td>Mercan Doku İskeleti</td><td></td><td></td><td>2.5 cm Doğal yaşam alanından biyopsi</td></tr><tr><td>Arch Punch Karot Cihazı</td><td>C.S. Osborne ve Şirket</td><td>No. 149</td><td>Mercan biyopsisi alımı için</td></tr><tr><td>Paraformaldehit</td><td>Elektron Mikroskobu Bilimleri</td><td>RT 15700</td><td>%16 Önceden Seyreltilmiş</td></tr><tr><td>Histoclear/Safeclear II</td><td>Elektron Mikroskobu Bilimleri</td><td>RT 64111-04</td><td>Ksilen, Dehidrasyon ve Deparafinizasyona Toksik Olmayan Alternatif</td></tr><tr><td>Ksilen ve Etanol</td><td>Fisher Bilimsel</td><td></td><td>Dehidrasyon</td></tr><tr><td>Parafin Balmumu</td><td>Richard Allen Bilimsel</td><td>Tip H REF 8338</td><td>Sızma çözeltisi</td></tr><tr><td>Vybar</td><td>Mum Yapıcı</td><td></td><td>Kırmızı Balmumu</td></tr><tr><td>Bileşeni Stearin</td><td>Mum Yapıcı</td><td></td><td>Kırmızı Balmumu</td></tr><tr><td>Bileşeni Sudan IV</td><td>Fisher Chemical</td><td>S667-25</td><td>Kırmızı Balmumu-Opak arka plan</td></tr><tr><td>Buğday RuJumu Aglütininin (WGA)</td><td>Life Technologies</td><td>W32466</td><td>Etiketleme için&nbsp; Mercan Mukus</td></tr><tr><td>Altın Ömrünü Uzatır</td><td>Teknolojiler</td><td>P36095</td><td>Solmaya karşı dayanıklı montaj ortamı</td></tr><tr><td>Floro Çanak</td><td>Dünyası Hassas Aletler</td><td>FD-35-100</td><td>İki fotonlu görüntüleme için</td></tr><tr><td>XY Motor, Sürücü ve Kontrolör</td><td>Lin Mühendislik</td><td>211-13-01R0, R325, R256-RO</td><td>XY Translasyon Hareketi</td></tr><tr><td>Sıcak Plaka</td><td>Corning</td><td>DC-220</td><td>Tüm balmumu</td></tr> <tr><td>eritmeKonveksiyonlu Fırın</td><td>Yamato</td><td>DX-600</td><td>Sızma ve Gömme</td></tr><tr><td>Doku İşlemcisi</td><td>Leica</td><td>ASP 300</td><td>Dehidrasyon, Sızma</td></tr><tr><td>Mikrotomu</td><td>Leica</td><td>RM2055</td><td>Tek kullanımlık bıçaklar</td></tr><tr><td>Stereo Mikroskop</td><td>Carl Zeiss</td><td>Stereolumar V 12</td><td>1.5x (30 mm WD)</td></tr><tr>ApoTome <td>Carl Zeiss</td> Axiovert M 200<td>ile Objektif Floresan Mikroskobu</td><td>, ApoTome I Sistemi</td><td>Bir polipin ince kesitini görüntüleme: Zooxanthellae</td></tr><tr><td>Axiocam kamera</td><td>Carl Zeiss</td><td>MRm</td><td>Monokrom kamera 1388x1040 piksel</td></tr><tr><td>Axiovision Yazılımı</td><td>Carl Zeiss</td><td>Sürüm 4.8</td><td>Görüntü elde etme programı</td></tr><tr><td>İki Fotonlu Lazer</td><td>Spektrafizik</td><td>Maitai eHP, darbeli lazer (70 fs)</td><td>DeepSee modülü ile</td></tr><tr><td>Lazer Tarama Mikroskobu</td><td>Carl Zeiss</td><td>Spektral Dedektörlü LSM 710</td><td>34 kanal PMT algılama</td></tr><tr>İki <td>foton ve spektral görüntü elde etmek için</td><td>Zen Yazılımı</td><td>Carl Zeiss</td><td>2010 veya üzeri</td></tr><tr><td>Imaris Suite Software</td><td>Bitplane, Inc.,</td> <td>Sürüm 7.0 veya üzeri</td><td>3D Hacim, Iso-yüzey Oluşturma, Görselleştirme</td></tr></tbody></table>

modlu optik mikroskopi yöntemleri caribbean reef yapı mercanlar içinde polip doku morfoloji ve yapı göstermektedir

Multimodal Optical Microscopy Methods Reveal Polyp Tissue Morphology and Structure in Caribbean Reef Building Corals

Görüntüleme tekniklerinin entegre bir takımdır Karayip resif bina mercanlar Montastraea annularis ve M. oluşan üç boyutlu (3D) morfoloji ve polip dokuların hücre yapısını belirlemek için uygulanan olmuştur faveolata. Bu yaklaşımlar, floresan mikroskobu (FM), seri blok yüz görüntüleme (SBFI) ve iki-fotonlu lazer konfokal tarama mikroskobu (TPLSM) içerir. SBFI fiziksel kestileme sonra derin doku görüntüleme sağlar; fazla 2 mm doku derinliklerine doku yüzey dokusu ve 3D görselleştirme ayrıntıları. Doku hücresel yapının Tamamlayıcı FM ve TPLSM verim ultra-yüksek çözünürlüklü görüntüler. Sonuçlar: (1) dış bireysel mercan poliplerinin duvar ve daha önce bildirilmemiştir loblu doku morfolojileri tanımlanan (2) kromatoforların ve algler gibi dinoflagellat zooxanthellae endosimbiyont 3D dağılımı ve doku yoğunluğunun birinci yüzeyi haritaları hazırlandı. Spektral soğurma bezelye500 nm ve 675 nm ks, sırasıyla öneririz M. annularis ve M. faveolata klorofil ve kromatoforların benzer türlerini içerir. Ancak, M. annularis ve M. doku yoğunluğu ve bu anahtar hücresel bileşenlerin 3D dağılımında önemli farklılıklar sergilerler faveolata. Görüntüleme yöntemleri odaklanarak bu çalışma SBFI dekalsifiye mercan dokuların büyük mm çaplı numune analiz için son derece yararlı olduğunu gösterir. Ücretsiz FM ve TPLSM nondecalcified mercan doku örneklerinde hücresel dağılımı ve yoğunluğu ince milimetreden ölçek değişikliklerini ortaya koymaktadır. TPLSM tekniği verir: (1) minimal invaziv numune hazırlama, (2) üstün optik kesit yeteneği, ve (3) minimum ışık emme ve saçılması, hala derin doku görüntüleme izin verirken.

(Bu çalışma için özel olarak üretilmiş; Şekil 3) Bir özel tasarlanmış SBFI cihaz M. dış yüzey dokusu ve morfolojisi ilk detaylı 3D sayısal yükseklik haritaları (DEM) üretildi annularis ve M. faveolature mercan polipleri (Şekil 4 ve SI Videolar 1-2). Bu eş, her polip (Şekil 4B, 4D ve 4E) merkezinden dışa doğru yayılan mercan dokusu daha önce tanımlanmamış yığılmış lob görüntüleri vermiştir. Bu loblar radyal dış ve alt yükseklik...

Görüntüleme tekniklerinin entegre bir takımdır Karayip mercan Montastraea annularis ve M. polip morfolojisi ve doku yapısını belirlemek için uygulanan olmuştur faveolata. Floresan, seri blok yüz ve iki foton odaklı lazer tarama mikroskopisi lobate yapısı, polip duvarlar ve tahmini chromatophore ve zooxanthellae yoğunluklarını ve dağılımlarını belirledik.

Modlu Optik Mikroskopi Yöntemleri Caribbean Reef Yapı Mercanlar içinde Polip Doku Morfoloji ve Yapı Göstermektedir

An integrated suite of imaging techniques has been applied to determine the three-dimensional (3D) morphology and cellular structure of polyp tissues ...

Aşağıdaki deneyin genel amacı, ince yapının yanı sıra mercan pigmentlerini ve lokalizasyonlarını anlamak için bir ila iki milimetre kalınlığındaki mercan poliplerini 3D olarak görüntülemektir. Bu, önce numunenin balmumu içine gömülmesi, ardından numunenin bir mikrotom kullanılarak bir mikronluk bölümler halinde kesilmesiyle elde edilir. Daha sonra, mercan poliplerini görüntülemek ve 3D görüntüyü yeniden oluşturmak için özel olarak tasarlanmış bir seri blok yüz tekniği kullanılır.Birden fazla 2D görüntü kullanılarak, tekniğin mercan dokusunun ince yapısal detaylarını yapısal bütünlüğünden ödün vermeden çözme yeteneğini gösteren sonuçlar elde edilir. Prosedürün gösterilmesi. Bugün, araştırma grubumla işbirlikçi olan Dr.Maunde Siva gurusu olacak.Ön filtrasyon balmumu hazırlamak için, 3.6 gram direksiyonu pullar halinde eritin, sıcak bir plaka üzerinde bir cam beherde. Sonra, 400 miligram Sudan ekleyin. Balmumu arka plan floresansını en aza indirmek için dört, iyice karıştırın ve kırmızı yarı saydam bir çözelti elde edilene kadar bekleyin.Sonra 81 gram parafin ekleyin ve iyice karıştırın. Daha sonra, 15 gram beyaz granül VI bar ekleyin ve aynı beherde tamamen eritin. Eridikten sonra, t

multimodal-optical-microscopy-methods-reveal-polyp-tissue-morphology

Research

JoVE Journal

Environment

Çevre

Yüzeysel doku görüntü verilerini hemoglobin konsantrasyonu, melanin konsantrasyonu ve oksijen satürasyonu dahil olmak üzere doku fizyolojik parametreleriyle birlikte kaydedebilen multimodal bir mikroendoskopun montajı ve kullanımı açıklanmıştır. Bu teknik, doku yapısını ve perfüzyonu değerlendirmek için yararlı olabilir ve araştırmacının bireysel ihtiyaçları için optimize edilebilir.

Multimodal Görüntüleme ve Non-invaziv için Spektroskopisi Fiber paket Mikroendoskopi Platformu,<em&gt; İn Vivo</em&gt; Doku Analizi

Bir tüp kurdunun, Hydroides elegans'ın kalsifikasyonunu gözlemlemenin yanı sıra ilk kalsifiye materyalin yerini belirlemede ve karakterize etmede yararlı olan çeşitli mikroskopi yöntemlerinin kullanımını gösteriyoruz. Canlı mikroskopi ve elektron mikroskobu, biyomineralizasyonun incelenmesinde önemli olan fonksiyonel ve materyal bilgileri sağlamak için birlikte kullanılır.

Bir Deniz Tubeworm Canlı Optik ve Elektron Mikroskobu Teknikleri Kullanılarak kalsifikasyon Olaylar Karakterizasyonu

Mercanlar hem insanlar hem de deniz canlıları için önemli olan biyoçeşitlilik ekosistemleri oluştururlar. Ancak, hala tam potansiyel ve birçok mercan hücrelerinin fonksiyonu anlamıyorum. Burada, taşlı mercan hücre popülasyonlarının izolasyonu, etiketlemi ve ayrılması için geliştirilmiş bir protokol salıyoruz.

Skleraktin Hücre Popülasyonlarının İzolasyoniçin Floresan-Aktive Hücre Sıralaması

3D modeller ve ortomozaikler oluşturmak için sualtı hareketten yapı fotogrametri araştırmaları yapmak için ayrıntılı bir protokol sağlıyoruz.

Yapı-hareket-hareket-fotogrametri kullanarak bentik ekosistemleri izlemek için bir alan astarı

Polip kurtarma, mercan poliplerinin onları kolonilerine bağlayan dokuyu sindirdiği ve birey olarak yaşamak için ondan ayrıldığı akut stresin neden olduğu bir süreçtir. Mevcut protokol, hipersalin veya kalsiyum içermeyen deniz suyu arıtımları kullanılarak kurtarma yoluyla mercan mikroyayılımının nasıl indükleneceğini açıklamaktadır.

Mercan Kolonilerinde Polip Kefalinin Laboratuvar Deneysel Kullanımı için Bireyselleştirilmiş Mikropropagatlar Elde Edilmesini İndüklemek

Coral Arks adı verilen demirli orta su jeodezik yapıları, açık deniz de dahil olmak üzere daha önce çalışmayan alanlarda mercan resif topluluklarını oluşturmak, izlemek ve rahatsız etmek için kullanılabilecek modüler, ölçeklenebilir ve dikey olarak ayarlanabilir bir araştırma platformu sağlar.

Mercan Resif Arkları: Resif Topluluklarını Birleştirmek için Bir Yerinde Mezokozmos ve Araç Seti

Bu protokol, mercan holobiontunun fizyolojik özelliklerini araştırmak için kullanılabilecek bir mikro-respirometri sisteminin kurulumunu ve çalıştırılmasını açıklar.

Yeni Bir Mikro-Respirometri Aracı Kullanılarak Mercan Holobiontunun Fizyolojik Karakterizasyonu

Burada, gaz kromatografisi-kütle spektrometrisi analizi için bir mercan holobiontundan polar ve yarı polar metabolitlerin yanı sıra ayrılmış mercan konakçı dokusu ve Symbiodiniaceae hücre fraksiyonlarının ekstraksiyonunu ve hazırlanmasını sunuyoruz.

Gaz Kromatografisi-Kütle Spektrometresi Tabanlı Sert Mercan Örneklerinin Hedefli Metabolomikleri

Burada, ekolojik veri çıkarma, analiz ve uygulama için hazır coğrafi referanslı ve zaman serisi hizalı çıktılarla sonuçlanan, önemli ölçüde basitleştirilmiş ve tam otomatik bir görüntü işleme boru hattı da dahil olmak üzere, su altı fotogrametri verilerinin toplanması ve işlenmesi için bir protokol sunulmaktadır.

Reefshape: Bentik Habitat İzleme için Zaman Serisi Sualtı Fotogrametri Verilerinin Verimli Bir Şekilde Toplanması ve Otomatik İşlenmesi için Bir Sistem

Bu protokol, mercan resifi toplulukları için yapısal karmaşıklık, topluluk bileşimi ve nüfus demografisi ölçümlerini çıkarmak için kullanılan dört aşamalı bir geniş alan görüntüleme anketi metodolojisini kapsar. Toplanan görüntülerin kalitesi ve kaynak görüntülere entegre erişim, protokolün her adımında önceliklendirilir.

Geniş Alan Görüntüleme ile Sualtı Ortamlarının Yapısının, Bileşiminin ve Değişiminin Ölçülmesi

Etiketsiz optik görüntüleme modalitelerini birleştiren çok modlu bir platform kullanarak, hücresel dinamikleri ve metabolizmayı görselleştirmek ve ölçmek için bir protokol geliştirdik. Çoklu foton floresansı, ikinci harmonik üretimi ve uyarılmış Raman saçılma mikroskobu yoluyla görüntüleme yoluyla, hücresel ve moleküler çevreye bütünsel bir genel bakış oluşturabiliriz.

Hücresel metabolizmayı incelemek için multimodal optik görüntüleme platformu

Keşfedin modüler optik mikroskopi yöntemleriyle Caribbean resif yapı mercanlarında polip doku morfolojisini ve yapısını görüntülemeyi. Bu teknik, mercan biyolojisi ve koruma çalışmaları için değerli bilgiler sunar.

Modlu Optik Mikroskopi Yöntemleri Caribbean Reef Yapı Mercanlar içinde Polip Doku Morfoloji ve Yapı Göstermektedir

Daha fazla video keşfet