-1::1
Simple Hit Counter
Skip to content

Products

Solutions

×
×
Sign In

TR

EN - EnglishCN - 简体中文DE - DeutschES - EspañolKR - 한국어IT - ItalianoFR - FrançaisPT - Português do BrasilPL - PolskiHE - עִבְרִיתRU - РусскийJA - 日本語TR - TürkçeAR - العربية
Sign In Start Free Trial

RESEARCH

JoVE Journal

Peer reviewed scientific video journal

Behavior
Biochemistry
Bioengineering
Biology
Cancer Research
Chemistry
Developmental Biology
View All
JoVE Encyclopedia of Experiments

Video encyclopedia of advanced research methods

Biological Techniques
Biology
Cancer Research
Immunology
Neuroscience
Microbiology
JoVE Visualize

Visualizing science through experiment videos

EDUCATION

JoVE Core

Video textbooks for undergraduate courses

Analytical Chemistry
Anatomy and Physiology
Biology
Calculus
Cell Biology
Chemistry
Civil Engineering
Electrical Engineering
View All
JoVE Science Education

Visual demonstrations of key scientific experiments

Advanced Biology
Basic Biology
Chemistry
View All
JoVE Lab Manual

Videos of experiments for undergraduate lab courses

Biology
Chemistry

BUSINESS

JoVE Business

Video textbooks for business education

Accounting
Finance
Macroeconomics
Marketing
Microeconomics

OTHERS

JoVE Quiz

Interactive video based quizzes for formative assessments

Authors

Teaching Faculty

Librarians

K12 Schools

Biopharma

Products

RESEARCH

JoVE Journal

Peer reviewed scientific video journal

JoVE Encyclopedia of Experiments

Video encyclopedia of advanced research methods

JoVE Visualize

Visualizing science through experiment videos

EDUCATION

JoVE Core

Video textbooks for undergraduates

JoVE Science Education

Visual demonstrations of key scientific experiments

JoVE Lab Manual

Videos of experiments for undergraduate lab courses

BUSINESS

JoVE Business

Video textbooks for business education

OTHERS

JoVE Quiz

Interactive video based quizzes for formative assessments

Solutions

Authors
Teaching Faculty
Librarians
K12 Schools
Biopharma

Language

tr_TR

EN

English

CN

简体中文

DE

Deutsch

ES

Español

KR

한국어

IT

Italiano

FR

Français

PT

Português do Brasil

PL

Polski

HE

עִבְרִית

RU

Русский

JA

日本語

TR

Türkçe

AR

العربية

    Menu

    JoVE Journal

    Behavior

    Biochemistry

    Bioengineering

    Biology

    Cancer Research

    Chemistry

    Developmental Biology

    Engineering

    Environment

    Genetics

    Immunology and Infection

    Medicine

    Neuroscience

    Menu

    JoVE Encyclopedia of Experiments

    Biological Techniques

    Biology

    Cancer Research

    Immunology

    Neuroscience

    Microbiology

    Menu

    JoVE Core

    Analytical Chemistry

    Anatomy and Physiology

    Biology

    Calculus

    Cell Biology

    Chemistry

    Civil Engineering

    Electrical Engineering

    Introduction to Psychology

    Mechanical Engineering

    Medical-Surgical Nursing

    View All

    Menu

    JoVE Science Education

    Advanced Biology

    Basic Biology

    Chemistry

    Clinical Skills

    Engineering

    Environmental Sciences

    Physics

    Psychology

    View All

    Menu

    JoVE Lab Manual

    Biology

    Chemistry

    Menu

    JoVE Business

    Accounting

    Finance

    Macroeconomics

    Marketing

    Microeconomics

Start Free Trial
Loading...
Home
JoVE Journal
Biology
Mikrotübül Tabanlı Aktif Nematiklerin Oluşturulması, Sınırlandırılması ve Gözlemlenmesi
Mikrotübül Tabanlı Aktif Nematiklerin Oluşturulması, Sınırlandırılması ve Gözlemlenmesi
JoVE Journal
Biology
This content is Free Access.
JoVE Journal Biology
Forming, Confining, and Observing Microtubule-Based Active Nematics

Mikrotübül Tabanlı Aktif Nematiklerin Oluşturulması, Sınırlandırılması ve Gözlemlenmesi

Full Text
3,197 Views
08:37 min
January 13, 2023

DOI: 10.3791/64287-v

Fereshteh L. Memarian1, Dimitrius A. Khaladj1, Derek Hammar1, Linda S. Hirst1

1Department of Physics,University of California

AI Banner

Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

Overview

This study focuses on the preparation and confinement of active nematics formed from microtubules and kinesin motors, contributing to advances in experimental techniques for studying complex fluid systems. The methods outlined simplify the approaches needed for newcomers in the field, enabling them to explore the dynamics of active materials more effectively.

Key Study Components

Research Area

  • Active Nematics
  • Nonlinear dynamics
  • Liquid crystal behavior

Background

  • Active nematics exhibit unique chaotic dynamics and topological defects.
  • Recent theoretical studies focus on the confinement of active nematics in microscale geometries.
  • Experimentalists have faced challenges in confining these materials effectively.

Methods Used

  • Construction of flow cells for confining active materials.
  • Utilization of microtubules and kinesin motors as the biological system.
  • Techniques for surface treatment and preparation of hydrophilic/hydrophobic supports.

Main Results

  • Successfully demonstrated the preparation of active nematic systems.
  • Identified a homogenous texture with mobile topological defects.
  • Validated imaging techniques for observing microtubule behavior.

Conclusions

  • This study offers a reproducible method for preparing active nematics.
  • The results enhance understanding of complex fluid behaviors in biological systems.

Frequently Asked Questions

What are active nematics?
Active nematics are complex fluids characterized by the continuous movement of particles driven by the active forces generated by motor proteins, leading to unique dynamical behaviors.
How do you prepare the hydrophilic cover slips?
Hydrophilic cover slips are prepared by cleaning with soapy water and ethanol, treating with a silane solution, and coating with an acrylamide solution.
What is the significance of using microtubules and kinesin motors?
Microtubules and kinesin motors serve as a model system for studying active matter, providing insights into the mechanics of biological processes at the microscale.
What imaging techniques are employed in this study?
Epi-fluorescence microscopy is used to visualize the behavior and dynamics of the confined active nematic layers.
Why is controlling the environment important for active nematics?
Control over the surrounding environment is crucial for directing the behavior of active nematics and studying their interactions under various conditions.
Can these methods be applied to other systems?
Yes, the techniques may be adapted for studying various types of active matter systems beyond nematics.

Burada, protein hazırlama ve yapım ve aktif nematik hapsetme için kuyuların kullanımı da dahil olmak üzere mikrotübüllerden ve kinesin motorlarından aktif nematiklerin hazırlanması için yöntemler sunulmaktadır.

Aktif Nematik, doğrusal olmayan dinamikler ve sıvı kristaller alanlarını genişleten heyecan verici bir araştırma konusu olarak ortaya çıkmıştır. Ölümcül topolojik kusurlar ve kaotik dinamikler sergileyen karmaşık akışkanlar vardır. Literatürde sınırlı Aktif Nematiklere odaklanan birçok yeni teorik çalışma bulunmaktadır.

Bununla birlikte, deneycilerin malzemeyi mikro ölçekli geometrilerle sınırlamaları zor olmuştur. Tekniğimiz, deney düzeneğini daha basit hale getirir, böylece yeni gruplar alana girebilir ve bu heyecan verici malzemeleri deneyebilir. Teknikler diğer EQUIS aktif madde sistemlerine uygulanabilir, örneğin bir faz oluşturma etkisi oluşturmak için ve gelecekte daha aktif fazlar geliştirildikçe, deneycilerin benzer nematikleri kullanarak malzemeyi sınırlamanın yollarını bulmaları gerekir.

Prosedürü gösterenler, laboratuvarımdan yüksek lisans öğrencileri olan Derek Hammar ve Fereshteh Memaryan olacak. Akrilamid kaplamalı hidrofilik kapak kaymaları hazırlamak için, kapak kaymalarını sabunlu su, etanol ve 0.1 molar sodyum hidroksit ile nano saf su kullanarak alternatif durulamalarla iyice temizleyerek başlayın. Durulandıktan sonra kapak, 100 mililitre etanol, bir mililitre münzevi asit ve 500 mikrolitre trimetoksisilil propil metakrilattan oluşan Silan çözeltisi ile 15 dakika boyunca kayar.

Daha sonra nano saf su ile durulayın. 95 mililitre nano saf sudan ve beş mililitre ağırlığın yüzde 40 Akrilamidinden bir akrilamid çözeltisi hazırlayın. Daha sonra çözeltiyi vakumlu bir fırında 30 dakika boyunca gazdan arındırın, sülfit başına 0.07 gram amonyum ve 2.3 milimolar nihai konsantrasyon için 35 mikrolitre Tetrametiletilendiamin ekleyin.

Yukarı bakarken kapak kaymalarının üzerine akrilamid çözeltisi dökün ve gece boyunca oda sıcaklığında inkübe edin. Hidrofobik mikroskop hazırlamak için pipet 100 mikrolitre su itici çözeltiyi temiz bir cam mikroskop kaydırağı üzerine kaydırır. Ardından üstüne başka bir temiz cam slayt yerleştirin.

Bu, su itici çözeltinin iki dakika boyunca oturduğu yüzeyde eşit bir şekilde kaplanmasını sağlar. İkinci cam sürgüyü çıkarın ve ilk slaytı nano saf suyla iyice durulayın. Daha sonra azot gazı ile kurulayın.

% 1.8 floro yüzey aktif madde içeren bir mühendislik yağı karışımı hazırlayın. 40 mikrometre çift taraflı yapışkan ara parçaları kullanarak cam sürgüyü ve kapak kaymasını monte edin. Ara parçaları hidrofobik mikroskop slaytına 1,5 milimetre arayla yerleştirin.

Ardından, akrilamid kaplı kapak kaymasını, yapışması için işlenmiş bir yan yüzü aşağı bakacak şekilde ara parçaların üzerine yerleştirin. Akış hücresi hemen oluşturulduktan sonra, yağ karışımını ayrı bir şişede bir pipet kullanarak kapalı alanı dolduran akış hücresine pipetleyin, altı mikrolitre aktif malzemeyi 3.73 mikrolitre karışımla yavaşça karıştırın. Bir mikrolitre mikrotübül çözeltisi 0.6 mikrolitre ATP çözeltisi ve 0.67 mikrolitre M iki B tampon pipeti altı mikrolitre taze karıştırılmış aktif malzeme, akış hücresinin bir açık ucuna.

Bir miktar yağ, kanala enjekte edildiğinde sulu çözelti tarafından yer değiştirecektir. Bu, akış kanalının karşı ucunda küçük bir kağıt mendil parçası kullanılarak kötü bir şekilde ortaya çıkarılabilir. Doldurduktan sonra, akış hücresinin her iki tarafını 20 saniye boyunca UV ışığına maruz kaldığında sertleşen bir epoksi yapıştırıcı ile kapatın.

Aktif katmanı kabul edilebilir iki sıvı arasında yarı 2B katmanda sınırlamak için. Akış hücresini, üstte sulu faz ve santrifüjün altında daha yoğun yağ tabakası 10 dakika boyunca 212 G'de olacak şekilde sallanan bir kova santrifüjüne yerleştirin. Bu adım tamamlandıktan sonra akış hücresi, 10 x veya 20 x büyütme hedefi ile görüntüleme için bir epi-floresan mikroskobuna alınabilir.

İlk olarak, PDMS için bir ana kalıp tasarlayın. Bu, bir alt tabaka üzerindeki 3D baskı sütunları ile elde edilebilir. Reçine ana kalıbını 3D yazdırdıktan sonra, izopropanol ile temizleyin ve daha sonra kalıbı 45 dakika boyunca bir UV lambası altında ve fırında iki saat boyunca 120 santigrat derecede kürleyin, bir elastomer kürleme maddesi ve bir elastomer baz kullanarak poli boya metil camgöbeğini hazırlayın.

İki bileşeni metal spatula kullanarak 1 ila 10 oranında karıştırın. Bu kabarcıkları çıkarmak için, karışımı bir saat boyunca gazdan arındırmak için bir vakum altına yerleştirin, ardından kürlenmemiş PDMS şeffaf görünmelidir. PDMS'yi uygun bir kalıba dökün ve 60 santigrat derecede kürlenmek için gece boyunca bırakın.

Hidrofilik bir PDMS yüzeyi hazırlamak için PDMS'yi hem etanol hem de izopropanol ile 10 dakika temizleyin, ardından üç kez deiyonize suyla iyice durulayın ve kurutun. Kuru kürlenmiş PDMS'yi temizlemek için beş dakika boyunca bir plazma temizleyici kullanın. Bu, yüzeyi daha hidrofilik hale getirir.

Daha sonra, bir silan çözeltisi hazırlayın ve akrilamid kaplamayı hazırlamak için substratı 15 dakika boyunca bu çözeltiye batırın, substratı deiyonize suyla iyice durulayın ve akrilamid çözeltisine batırın. Kullanıma hazır olduğunda, yüzeyi deiyonize suyla durulayın ve hemen kullanım için azotla kurulayın. PDMS'yi epoksi yapıştırıcı ile bir cam slayda takın, aktif karışımın bir mikrolitresini PDM'lerin substratına pipetleyin ve hemen aktif ağ damlacığının üzerine silikon yağı ekleyin.

Aktif ağ kuyuya taşınacaktır. Bu işlem 60 dakika kadar sürer. PDMS cihazını, yağ tabakası su tabakasının üzerinde olacak şekilde sallanan bir kova santrifüjüne yerleştirin ve 212 G'de 12 dakika boyunca döndürün.Bu adım tamamlandıktan sonra, malzemenin kayıt ilerlemesini görüntülemek için malzemeyi mikroskopa götürün.

Dengelendiği gibi. Temsili görüntü, benzer uzunluklardaki kısa mikrotübülleri göstermektedir. Bireysel mikrotübüller, küçük boyutlarından dolayı görüntü almak zor olabilir.

Floresan mikroskobu için tasarlanmış yüksek hassasiyetli bir kameranın kullanılması bu uygulama için en iyisidir. İyi biçimlendirilmiş bir aktif pnömatik tabaka, önemli boşluk alanları ve mobil topolojik kusurlar olmadan doku bakımından homojendir. Bununla birlikte, kusur çekirdeklerinde bazı kabul edilebilir küçük boşluklar olabileceğini unutmayın.

Hidrofilik veya hidrofobik bir yüzeye sahip olmak için uygun yüzey işlemi. Bu yöntemle geometri rulosu kolayca tartışılabilir ve sadece fiziksel sınırlama değiştirilerek aktif yapı kontrol edilebilir.

Explore More Videos

Biyoloji Sayı 191

Related Videos

Sökme Mikrotubul saplı tarafından Driven Hareketleri Eğitim için Segment Mikrotübüller hazırlanması

12:20

Sökme Mikrotubul saplı tarafından Driven Hareketleri Eğitim için Segment Mikrotübüller hazırlanması

Related Videos

14.9K Views

Sıcaklık Kullanarak Mikrotübül Bazlı 3D Aktif Sıvıların Akış Hızlarını Kontrol Etme

08:04

Sıcaklık Kullanarak Mikrotübül Bazlı 3D Aktif Sıvıların Akış Hızlarını Kontrol Etme

Related Videos

7.6K Views

In vivo Caenorhabditis elegans Nöronlarında Mikrotübül Dinamiklerinin ve Oryantasyonunun Değerlendirilmesi

07:43

In vivo Caenorhabditis elegans Nöronlarında Mikrotübül Dinamiklerinin ve Oryantasyonunun Değerlendirilmesi

Related Videos

3.5K Views

Çapraz Bağlı ve Tek Mikrotübüllerin Dinamiğinin In Vitro TIRF Mikroskobu ile Eşzamanlı Görselleştirilmesi

07:20

Çapraz Bağlı ve Tek Mikrotübüllerin Dinamiğinin In Vitro TIRF Mikroskobu ile Eşzamanlı Görselleştirilmesi

Related Videos

3K Views

Yeniden yapılandırılmış aktif mikrotübül demetleri içindeki kuvvetleri doğrudan ölçme

07:47

Yeniden yapılandırılmış aktif mikrotübül demetleri içindeki kuvvetleri doğrudan ölçme

Related Videos

2K Views

Tek Aktin Filamentlerin ve Demetlerin Montaj Dinamiğini İncelemek için Mikroakışkanlar ve Floresan Mikroskobu Kullanma

08:02

Tek Aktin Filamentlerin ve Demetlerin Montaj Dinamiğini İncelemek için Mikroakışkanlar ve Floresan Mikroskobu Kullanma

Related Videos

3.2K Views

Mikrotübül taktoidlerinin kendi kendine montajı

08:49

Mikrotübül taktoidlerinin kendi kendine montajı

Related Videos

4.6K Views

Aktin-Mikrotübül Kompozitlerinin Ayarlanabilir Motor Tahrikli Dinamiği ve Mekaniği ile Yeniden Yapılandırılması ve Karakterize Edilmesi

09:10

Aktin-Mikrotübül Kompozitlerinin Ayarlanabilir Motor Tahrikli Dinamiği ve Mekaniği ile Yeniden Yapılandırılması ve Karakterize Edilmesi

Related Videos

3.8K Views

Hücre Hücre İskeletinin Model Sistemi Olarak (Poro-)Elastik Kasılma Aktomyosin Ağlarının Mekaniği

08:50

Hücre Hücre İskeletinin Model Sistemi Olarak (Poro-)Elastik Kasılma Aktomyosin Ağlarının Mekaniği

Related Videos

1.2K Views

Aktif Aktin Bazlı Montajların Kasılma ve Deformasyon Modlarının In Vitro Olarak Ayarlanması: İki Boyutlu Aktif Ağlardan Sıvı Kristal Damlalara

06:48

Aktif Aktin Bazlı Montajların Kasılma ve Deformasyon Modlarının In Vitro Olarak Ayarlanması: İki Boyutlu Aktif Ağlardan Sıvı Kristal Damlalara

Related Videos

918 Views

JoVE logo
Contact Us Recommend to Library
Research
  • JoVE Journal
  • JoVE Encyclopedia of Experiments
  • JoVE Visualize
Business
  • JoVE Business
Education
  • JoVE Core
  • JoVE Science Education
  • JoVE Lab Manual
  • JoVE Quizzes
Solutions
  • Authors
  • Teaching Faculty
  • Librarians
  • K12 Schools
  • Biopharma
About JoVE
  • Overview
  • Leadership
Others
  • JoVE Newsletters
  • JoVE Help Center
  • Blogs
  • JoVE Newsroom
  • Site Maps
Contact Us Recommend to Library
JoVE logo

Copyright © 2026 MyJoVE Corporation. All rights reserved

Privacy Terms of Use Policies
WeChat QR code