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La minería del genoma guiada por espectrometría de masas como herramienta para descubrir nuevos productos naturales
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Mass Spectrometry-Guided Genome Mining as a Tool to Uncover Novel Natural Products
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La minería del genoma guiada por espectrometría de masas como herramienta para descubrir nuevos productos naturales

DOI:
10.3791/60825-v

•

11:13 min

•

March 12, 2020

•

, , ,
1Department of Organic Chemistry, Institute of Chemistry,University of Campinas (UNICAMP), 2Center for Natural and Human Sciences,Federal University of ABC (UFABC)

Chapters

  • 00:04Introduction
  • 02:54Genome Mining for Biosynthetic Gene Clusters
  • 03:46Strain Cultivation
  • 04:51Acquiring Mass Spectra and Preparation for GNPS Analysis
  • 05:43GNPS Analysis
  • 08:33Results: Genome Sequence Analysis and Molecular Networking
  • 09:46Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Aquí se establece y se describe un protocolo de minería del genoma guiado por espectrometría de masas. Se basa en la información de la secuencia del genoma y el análisis LC-MS/MS y tiene como objetivo facilitar la identificación de moléculas a partir de extractos microbianos y vegetales complejos.

Tags

Mass SpectrometryGenome MiningNatural Product DiscoveryMolecular NetworkingWhole Genome SequencingGenotype-to-chemotypeBiosynthetic ClustersSecondary MetabolismGNPSStreptomycesFungiPlants

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