L'ecografia Doppler transcraniale funzionale integra altre modalità di imaging funzionale, con la sua misurazione ad alta risoluzione temporale dei cambiamenti indotti dallo stimolo nel flusso sanguigno cerebrale all'interno delle arterie cerebrali basali. Questo documento sui metodi fornisce istruzioni dettagliate per l'utilizzo di ultrasuoni Doppler transcranici funzionali per eseguire un esperimento di imaging funzionale.