-1::1
Simple Hit Counter
Skip to content

Products

Solutions

×
×
Sign In

AR

EN - EnglishCN - 简体中文DE - DeutschES - EspañolKR - 한국어IT - ItalianoFR - FrançaisPT - Português do BrasilPL - PolskiHE - עִבְרִיתRU - РусскийJA - 日本語TR - TürkçeAR - العربية
Sign In Start Free Trial

RESEARCH

JoVE Journal

Peer reviewed scientific video journal

Behavior
Biochemistry
Bioengineering
Biology
Cancer Research
Chemistry
Developmental Biology
View All
JoVE Encyclopedia of Experiments

Video encyclopedia of advanced research methods

Biological Techniques
Biology
Cancer Research
Immunology
Neuroscience
Microbiology
JoVE Visualize

Visualizing science through experiment videos

EDUCATION

JoVE Core

Video textbooks for undergraduate courses

Analytical Chemistry
Anatomy and Physiology
Biology
Calculus
Cell Biology
Chemistry
Civil Engineering
Electrical Engineering
View All
JoVE Science Education

Visual demonstrations of key scientific experiments

Advanced Biology
Basic Biology
Chemistry
View All
JoVE Lab Manual

Videos of experiments for undergraduate lab courses

Biology
Chemistry

BUSINESS

JoVE Business

Video textbooks for business education

Accounting
Finance
Macroeconomics
Marketing
Microeconomics

OTHERS

JoVE Quiz

Interactive video based quizzes for formative assessments

Authors

Teaching Faculty

Librarians

K12 Schools

Biopharma

Products

RESEARCH

JoVE Journal

Peer reviewed scientific video journal

JoVE Encyclopedia of Experiments

Video encyclopedia of advanced research methods

JoVE Visualize

Visualizing science through experiment videos

EDUCATION

JoVE Core

Video textbooks for undergraduates

JoVE Science Education

Visual demonstrations of key scientific experiments

JoVE Lab Manual

Videos of experiments for undergraduate lab courses

BUSINESS

JoVE Business

Video textbooks for business education

OTHERS

JoVE Quiz

Interactive video based quizzes for formative assessments

Solutions

Authors
Teaching Faculty
Librarians
K12 Schools
Biopharma

Language

ar

EN

English

CN

简体中文

DE

Deutsch

ES

Español

KR

한국어

IT

Italiano

FR

Français

PT

Português do Brasil

PL

Polski

HE

עִבְרִית

RU

Русский

JA

日本語

TR

Türkçe

AR

العربية

    Menu

    JoVE Journal

    Behavior

    Biochemistry

    Bioengineering

    Biology

    Cancer Research

    Chemistry

    Developmental Biology

    Engineering

    Environment

    Genetics

    Immunology and Infection

    Medicine

    Neuroscience

    Menu

    JoVE Encyclopedia of Experiments

    Biological Techniques

    Biology

    Cancer Research

    Immunology

    Neuroscience

    Microbiology

    Menu

    JoVE Core

    Analytical Chemistry

    Anatomy and Physiology

    Biology

    Calculus

    Cell Biology

    Chemistry

    Civil Engineering

    Electrical Engineering

    Introduction to Psychology

    Mechanical Engineering

    Medical-Surgical Nursing

    View All

    Menu

    JoVE Science Education

    Advanced Biology

    Basic Biology

    Chemistry

    Clinical Skills

    Engineering

    Environmental Sciences

    Physics

    Psychology

    View All

    Menu

    JoVE Lab Manual

    Biology

    Chemistry

    Menu

    JoVE Business

    Accounting

    Finance

    Macroeconomics

    Marketing

    Microeconomics

Start Free Trial
Loading...
Home
JoVE Journal
Biology
سير عمل التصوير والتحليل عالي الإنتاجية لتقييم الأنماط الظاهرية لخلايا الجلد وحالات التكاثر في عي...
سير عمل التصوير والتحليل عالي الإنتاجية لتقييم الأنماط الظاهرية لخلايا الجلد وحالات التكاثر في عي...
JoVE Journal
Biology
Author Produced
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Biology
High-throughput Imaging and Analysis Workflow for Evaluating Skin Cell Phenotypes and Proliferation States in Tissue Samples

سير عمل التصوير والتحليل عالي الإنتاجية لتقييم الأنماط الظاهرية لخلايا الجلد وحالات التكاثر في عينات الأنسجة

Full Text
704 Views
11:24 min
October 31, 2025

DOI: 10.3791/67696-v

Salome Stierli1, Flurin Sturzenegger2, Whitney Shannon Jordaan1, Sofia Micheli1, Joana Raquel Martins2, Lukas Sommer1

1Institute of Anatomy,University of Zurich, 2Center for Microscopy and Image Analysis,University of Zurich

AI Banner

Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

Overview

This study investigates the combination of the iterative-bleaching-extends-multiplexity (IBEX) and Click-iT EdU labeling to detect and categorize dividing cell types in highly dynamic processes, particularly in murine skin repair. The developed open-source image processing pipeline facilitates high-throughput image acquisition and analysis.

Key Study Components

Research Area

  • Cell division and categorization
  • Dynamic biological processes
  • High-throughput imaging techniques

Background

  • Importance of imaging in understanding cell proliferation
  • Need for effective tissue processing methods
  • Previous limitations in multiplex imaging approaches

Methods Used

  • Multiplex optical imaging method and Click-iT EdU labeling
  • Fixed frozen murine tissue sections
  • High-throughput image acquisition technology

Main Results

  • Successful detection of differentiating cell types involved in skin repair
  • Accurate imaging of cellular proliferation using novel techniques
  • Comparison with traditional antibody immunofluorescence methods

Conclusions

  • Demonstrates an effective approach for studying cell proliferation in complex biological contexts
  • Offers a valuable tool for biology research without requiring programming skills

Frequently Asked Questions

What is the purpose of using IBEX with Click-iT EdU labeling?
To detect and categorize dividing cell types in dynamic biological processes.
How does this study improve imaging techniques?
It provides a high-throughput imaging pipeline that is open-source and accessible to researchers.
What type of tissue is primarily examined in this study?
Frozen murine skin tissue sections are used to illustrate the techniques.
What key findings were reported regarding cell proliferation?
The methods effectively reveal different proliferating cell types during skin repair.
Is programming knowledge required to use the imaging pipeline?
No, the pipeline is designed to be user-friendly and does not require programming experience.
What comparison was made to validate the imaging results?
The study compares EdU labeling results with KI-67 immunofluorescence on paraffin-embedded tissues.
What is the significance of the open-source aspect of the pipeline?
It allows wider accessibility and encourages collaborative improvements in imaging methodologies.

يتيح الجمع بين التبييض التكراري والتمديد والتعددية (IBEX) ومقايسة وضع العلامات التجارية على النوكليوتيدات (Click-iT EdU) اكتشاف وتصنيف أنواع الخلايا المنقسمة في عمليات ديناميكية للغاية في أقسام أنسجة الفئران المجمدة الثابتة. علاوة على ذلك ، يوفر خط أنابيب معالجة الصور مفتوح المصدر الجديد الحصول على الصور وتحليلها عالي الإنتاجية.

يجمع هذا البروتوكول بين طريقة التصوير البصري متعدد الإرسال وتصنيف IBEX و Click-iT EDU لاكتشاف وتصنيف أنواع الخلايا المنقسمة في عمليات ديناميكية للغاية ، مثل إصلاح الجلد. علاوة على ذلك ، نحن نقدم خط أنابيب جديد لمعالجة التصوير مفتوح المصدر للحصول على الصور وتحليلها عالي الإنتاجية. قم بتغطية صفيحة 24 بئرا ب 200 ميكرولتر من جيلاتين الألومنيوم الكروم واحتضان اللوحة لمدة 15 دقيقة على شاكر هزاز.

ثم قم بإزالة الجيلاتين تماما وجفف الآبار المطلية لمدة 60 دقيقة في فرن 40 درجة. قم بقص الأنسجة المضمنة في OCT بسمك 15 إلى 30 ميكرومتر في التبريد ونقلها بسرعة إلى بئر مطلي يحتوي على ملليلتر من PBS. قم بإزالة PBS بعناية باستخدام ماصة سعة ملليلتر واحد تهدف إلى إبقاء قسم الأنسجة في منتصف البئر.

للقيام بذلك بشكل فعال ، قم بشفط PBS ببطء من حواف البئر ، واضبط موضع الماصة حسب الحاجة لمنع الأنسجة من التحول. جفف أقسام المناديل لمدة ساعة في فرن 37 درجة مئوية. أعد الترطيب بملليلتر واحد PBS لمدة خمس دقائق.

نفل الأنسجة ب 500 ميكرولتر من 0.5٪ تريتون لمدة 30 دقيقة في درجة حرارة الغرفة. اغسل المناديل لفترة وجيزة مرتين باستخدام PBS وقم بإجراء تفاعل Click-iT لمدة 30 دقيقة في درجة حرارة الغرفة. حافظ على العينات محمية من الضوء.

اغسل المناديل لفترة وجيزة مرتين باستخدام برنامج تلفزيوني. قم بحظره لمدة ساعة واحدة باستخدام مخزن مؤقت مانع في درجة حرارة الغرفة. أضف الأجسام المضادة الأولية للدورة الأولى.

واحتضان الطبق طوال الليل عند أربع درجات مئوية. يغسل مع PBS ثلاث مرات. قم بإجراء تلطيخ الأجسام المضادة الثانوي.

بالنسبة للدورة الأولى ، قم بتطبيق الأجسام المضادة الثانوية للأجسام المضادة الأولية غير المقترنة مع صبغة نووية. احتضان العينات المحمية من الضوء لمدة 60 دقيقة في درجة حرارة الغرفة. اغسل المناديل ثلاث مرات بملليلتر واحد لمدة خمس دقائق في درجة حرارة الغرفة.

اترك حوالي 500 ميكرولتر من PBS في كل بئر وأحضر اللوحة إلى المجهر. في برنامج Meta Express ، انقر فوق الفرز ثم إعداد الاستحواذ. انقر فوق الزر إخراج.

نظف الجزء السفلي من اللوحة بنسبة 70٪ من الإيثانول وأدخل اللوحة في المجهر. انقر فوق الزر تحميل اللوحة. ضمن علامة التبويب الهدف والكاميرا، حدد التكبير المطلوب.

كوضع اكتساب، حدد وضع الشق متحد البؤر 51 ميكرومتر. ضمن علامة التبويب لوحة، حدد طراز اللوحة. انتقل إلى علامة التبويب "زيارة مواقع اللوحات".

ضمن خيارات الموقع ، انقر فوق عدد ثابت من المواقع. اضبط عدد الأعمدة والصفوف بحيث يتم تغطية البئر بأكمله تقريبا. انقر فوق مواقع التداخل 10٪ حدد فقط البئر الأول للاستحواذ بالنقر بزر الماوس الأيمن فوق البئر المقابل على خريطة اللوحة.

انتقل إلى علامة التبويب التركيز البؤري التلقائي للاكتساب. للتركيز البؤري التلقائي الجيد ، حدد خيار اللوحة وأسفل البئر. بالنسبة للتركيز التلقائي للموقع، حدد خيار جميع المواقع.

انتقل إلى علامة التبويب الأطوال الموجية واختر عدد الأصباغ المراد تصويرها في الدورة الحالية. انتقل إلى علامة التبويب الطول الموجي الأولى. اختر الليزر مع إزاحة Z لتحديد موضع Z، وانقر فوق الزر Calculate Offset لتعيين ارتفاع التصوير الصحيح.

اختر الصورة التي تكون فيها العينة أفضل تركيز. اضغط على زر التركيز البؤري. يتم عرض صورة في التركيز البؤري للأنسجة.

اضبط طاقة الإضاءة على 50٪ اضبط شدة الحد الأقصى المستهدف على 2000 واضغط على التعريض التلقائي. بالنسبة للسلسلة Z ، اختر صورة عرض من السلسلة Z و 2D ، ولتصحيح التظليل ، اختر تظليل FL فقط. كرر الخطوات للأطوال الموجية الأخرى ، ولكن بدلا من الليزر مع إزاحة Z ، اختر Z-offset من W1 واختر صفرا.

انتقل إلى خطوة السلسلة Z وأدخل حجم الخطوة المطلوب. انقر فوق الزر تركيز. اسحب سهم الموضع الحالي حتى يتم الوصول إلى الجزء السفلي من الأنسجة وانقر فوق الزر Set B.

اسحب سهم الموضع إلى أعلى المنديل وانقر فوق الزر تعيين T. انقر فوق F2 ، إيقاف ، اضغط على بدء البث المباشر مرة أخرى. تأكد من أن المرحلة في البئر الأول بالنقر بزر الماوس الأيسر عليها.

ابحث عن حدود الأنسجة وحدد جميع المواقع التي تحتوي على الأنسجة للحصول عليها بالنقر بزر الماوس الأيمن. انتقل إلى علامة التبويب تشغيل واكتب اسم اللوحة. انقر فوق حفظ البروتوكول.

قم بإعداد منطقة الاستحواذ لجميع الآبار الأخرى. قم بتشغيل Control و Journal وابدأ التسجيل ثم Control على الفور ، دفتر اليومية ، إيقاف التسجيل. احفظ دفتر اليومية الذي تم إنشاؤه وافتحه مرة أخرى عبر التحكم ودفتر اليومية وتحرير دفتر اليومية.

في اللوحة اليمنى ، انتقل إلى اكتساب اللوحة ، وقم بتحميل البروتوكول من الملف وانقر فوق اكتساب اللوحة لإضافة هذه الخطوات إلى دفتر اليومية. انقر نقرا مزدوجا فوق تحرير اكتساب اللوحة ، وقم بتحميل البروتوكول من الملف ، واختر البروتوكول المحفوظ للبئر الأول. كرر الخطوات الخاصة بكل بئر سيتم الحصول عليها ، مع التأكد من تحميل البروتوكول المعني دائما.

انقر فوق تشغيل دفتر اليومية لبدء عملية الاستحواذ. قبل 30 دقيقة من نهاية المجلة ، ابدأ في تحضير كاشف التبييض. قم بإذابة 10 ملليغرام من بوروهيدريد الليثيوم في 10 ملليلتر من H2O المقطر المزدوج ومرر عبر مرشح 0.22 ميكرومتر.

اتركيه لمدة 10 دقائق. يجب أن يبدأ الحل في تكوين فقاعات. لضمان التبييض الفعال ، استخدم كاشف التبييض في غضون أربع ساعات بعد التحضير.

أضف محلول التبييض إلى العينات واحتضنه لمدة 15 دقيقة مع إبقاء العينات معرضة للإضاءة المحيطة. يجب أن تظهر فقاعات صغيرة على الأنسجة. اغسل العينات المبيضة ثلاث مرات باستخدام مليلتر واحد من PBS لمدة خمس دقائق ، كل منها في درجة حرارة الغرفة.

أضف الأجسام المضادة الأولية للدورة التالية واحتضن طوال الليل عند أربع درجات مئوية. يكشف تصوير IBEX متعدد الإرسال جنبا إلى جنب مع وضع العلامات Click-iT EDU عن هياكل مختلفة وأنواع الخلايا المتكاثرة في الجلد المصاب. يظهر وضع العلامات على EDU على العينات المحفوظة بالتبريد أنه متشابه عند إجراء وضع العلامات على التألق المناعي للأجسام المضادة ل KI-67 على أقسام الأنسجة المضمنة بالبارافين ، بالإضافة إلى وضع العلامات على الخلايا باستخدام KI 67 باستخدام قياس التدفق الخلوي.

يسمح استخدام هذا البروتوكول بالكشف الدقيق عن تكاثر الخلايا في العمليات البيولوجية المعقدة. علاوة على ذلك ، لا يتطلب خط أنابيب معالجة التصوير مفتوح المصدر أي خبرة في البرمجة وينشئ ملفات يمكن معالجتها باستخدام برامج غير تجارية ، مثل فيجي و quPath. علاوة على ذلك ، لا يتطلب هذا البروتوكول أي معدات باهظة الثمن ، وبالتالي ، يمكن إجراؤه في معظم إعدادات البحث.

View the full transcript and gain access to thousands of scientific videos

Sign In Start Free Trial

Explore More Videos

هذا الشهر في JoVE العدد 224

Related Videos

تحليلات السكان الخلية خلال الجلد التسرطن

06:53

تحليلات السكان الخلية خلال الجلد التسرطن

Related Videos

12.9K Views

التحليل السريع واستكشاف الإسفار الميكروسكوب الصور

11:41

التحليل السريع واستكشاف الإسفار الميكروسكوب الصور

Related Videos

12.7K Views

سير العمل عالية المحتوى، الكمي خلية فردية من نيون علامات من المجاهر البيانات العالمي، بدعم من برمجيات المصدر المفتوح

09:57

سير العمل عالية المحتوى، الكمي خلية فردية من نيون علامات من المجاهر البيانات العالمي، بدعم من برمجيات المصدر المفتوح

Related Videos

13.5K Views

عالية الإنتاجية توصيف الخلايا الجذعية البالغة المهندسة لتسليم العوامل العلاجية لاستراتيجيات اعصاب

09:19

عالية الإنتاجية توصيف الخلايا الجذعية البالغة المهندسة لتسليم العوامل العلاجية لاستراتيجيات اعصاب

Related Videos

11.2K Views

وإنتاجية عالية منصة ميكروأري الخليوي لتحليل مترابط من تمايز الخلايا وقوات الجر

12:04

وإنتاجية عالية منصة ميكروأري الخليوي لتحليل مترابط من تمايز الخلايا وقوات الجر

Related Videos

10.1K Views

التمييز وتوصيف السكان غير المتجانسة باستخدام تقنيات التصوير الكمي

09:48

التمييز وتوصيف السكان غير المتجانسة باستخدام تقنيات التصوير الكمي

Related Videos

7.8K Views

في فيفو اثنين من اللون 2-الفوتون التصوير من الخلايا المراسل الموسومة وراثيا في الجلد

05:45

في فيفو اثنين من اللون 2-الفوتون التصوير من الخلايا المراسل الموسومة وراثيا في الجلد

Related Videos

7.9K Views

تحليل صورة التشفير الشريطي المتعدد للتنميط المناعي وتوصيف الخرائط المكانية في تحليل الخلية الواحدة لعينات أنسجة البارافين

08:18

تحليل صورة التشفير الشريطي المتعدد للتنميط المناعي وتوصيف الخرائط المكانية في تحليل الخلية الواحدة لعينات أنسجة البارافين

Related Videos

2.2K Views

يمتد التبييض التكراري من التعددية باستخدام أتمتة التلوين للمرافق الأساسية

04:52

يمتد التبييض التكراري من التعددية باستخدام أتمتة التلوين للمرافق الأساسية

Related Videos

550 Views

تصوير الخلايا الحية مع التصوير الفوتوغرافي بفاصل زمني لدراسة حركية تكاثر الخلايا الكيراتينية للبشرة

07:21

تصوير الخلايا الحية مع التصوير الفوتوغرافي بفاصل زمني لدراسة حركية تكاثر الخلايا الكيراتينية للبشرة

Related Videos

476 Views

JoVE logo
Contact Us Recommend to Library
Research
  • JoVE Journal
  • JoVE Encyclopedia of Experiments
  • JoVE Visualize
Business
  • JoVE Business
Education
  • JoVE Core
  • JoVE Science Education
  • JoVE Lab Manual
  • JoVE Quizzes
Solutions
  • Authors
  • Teaching Faculty
  • Librarians
  • K12 Schools
  • Biopharma
About JoVE
  • Overview
  • Leadership
Others
  • JoVE Newsletters
  • JoVE Help Center
  • Blogs
  • JoVE Newsroom
  • Site Maps
Contact Us Recommend to Library
JoVE logo

Copyright © 2026 MyJoVE Corporation. All rights reserved

Privacy Terms of Use Policies
WeChat QR code