Summary
פרוטוקול זה מאפשר הכנת קטעים רוחביים של זרעי דגנים (למשל, אורז) לניתוח של מורפולוגיה של אנדוספרם וגרגר עמילן באמצעות מיקרוסקופיית אלקטרונים סורקת.
Abstract
גרגירי עמילן (SGs) מציגים מורפולוגיות שונות בהתאם למין הצמח, במיוחד באנוספרם של משפחת Poaceae. פנוטיפינג אנדוספרם יכול לשמש לסיווג גנוטיפים המבוססים על מורפוטיפ SG באמצעות סריקת ניתוח מיקרוסקופי אלקטרונים (SEM). ניתן לדמיין SGs באמצעות SEM על ידי חיתוך דרך הליבה (pericarp, שכבות אלורון ואנוספרם) וחשיפת התוכן האורגני. השיטות הנוכחיות דורשות את ליבת האורז להיות מוטבעת בשרף פלסטיק ומדורקת באמצעות מיקרוטום או מוטבעת בקצה פיפטה קטועה ומקטעת ביד באמצעות סכין גילוח. השיטה הקודמת דורשת ציוד מיוחד והיא גוזלת זמן רב, בעוד האחרונה מציגה שורה חדשה של בעיות בהתאם לגנוטיפ אורז. זני אורז גיר, במיוחד, מהווים בעיה עבור סוג זה של חתך בשל האופי הפריך של רקמת האנוספרם שלהם. מוצג כאן טכניקה להכנת קטעי גרעיני אורז שקופים וגיריים למיקרוסקופיה, הדורשת רק טיפים פיפטה ולהב אזמל. הכנת החלקים בתוך גבולות טיפ פיפטה מונעת מאנדופרם גרעיני אורז להתנפץ (עבור פנוטיפים שקופים או 'זגועים') ולהתפורר (עבור פנוטיפים גיר). באמצעות טכניקה זו, דפוס תא אנדוספרם ואת המבנה של SGs שלם ניתן לראות.
Introduction
גרגירי עמילן (SGs) מציגים מורפולוגיות שונות בהתאם למין הצמחים, במיוחד באנוספרם של משפחת פואצ'אי 1,2. פנוטיפינג אנדוספרם יכול לשמש לסווג גנוטיפים המבוססים על פנוטיפ SG באמצעות סריקת ניתוח מיקרוסקופי אלקטרונים. ניתן לדמיין SGs באמצעות סריקת מיקרוסקופיית אלקטרונים (SEM) על ידי חיתוך הקרנל וחטטנות קירות תא אנדוספרם2.
מטרת טכניקה זו היא להכין בקלות מקטעי גרעיני אורז רוחביים אך ורק לניתוח SEM המהיר. הפיתוח של טכניקה זו הונע על ידי הצורך בגישה מהירה של חתך מהיר לפיה דגימות מוכנות למיקרוסקופיית SEM מיד לפני הדמיה באמצעות ציוד מינימלי.
טכניקה זו כוללת החדרת גרעין האורז הקלוף לתוך קצה הפיפטה לשתק מוחלט. זה חשוב במיוחד בעת חתך פנוטיפים גרעיני אורז גיר, אשר פריך בקלות להתפורר תחת לחץ3. גיר הוא איכות לא רצויה באורז שכן היא משפיעה על המראה של הקרנל וגורמת לליבה להישבר בקלות במהלך ליטוש וכרסום3. גיר מציג כאזור אטום בחתך של הקרנל שניתן לראות בעין בלתי מזוינת; ברמה המיקרוסקופית, הגיר מאופיין בגרגרי עמילן קטנים ארוזים באופן רופף. גורמים לגיר יכול להיות גנטי4,5 או סביבתי6,7.
חתך זרעי דגנים הוכנו באופן מסורתי בשיטות תיקון כימיות וחתך בעקבות דגימה הטמעה שעוות פרפין או מטריצה מוצקה אחרת4,8,9,10. בשנת 2010, שיטת Matsushima הוצגה כדרך להימנע מהכנת מדגם גרעיני אורז מסובך וגוזל זמן4. שיטה זו כללה החדרת גרעין האורז הקלוף לקצה פיפטה קטוע. הקצה מוחזק נייח על ידי גוזם בלוקים, וחלקים דקים וחלקיים של אנדופרם נקצרים באמצעות סכין גילוח ידני. טכניקה מהירה נוספת שפותחה בשנת 2016 אפשרה חתך שלם דק של מגוון רחב של זרעים יבשים, כולל זניםגיר 10. שיטות אלה הניעה את התפתחות הטכניקה המהירה המוצגת כאן.
טכניקה חדשה זו מתאימה לחוקרים שרוצים להשיג חתך רוחבי שלם של גרעיני אורז עבור פנוטיפינג אנדוספרם וניתוח מורפולוגיה עמילן באמצעות SEM.
פרוטוקול זה מייצג התאמה של שיטת קצה פיפטה חתוכה Matsushima4, עם כמה שינויים בולטים: (1) גרעינים אינם imbibed בכל שלב של הטכניקה; (2) לא גוזם בלוק ולא ultramicrotome נדרשים להכין את המקטעים. סוג פראי 'שקוף' cultivar(Oryza sativa L. ssp. japonica cv. Nipponbare) וקו 'גיר' מוטגני של Nipponbare (ssg1, גרגר עמילן לא תקני1)4 נבדקו במחקר זה. שני הכתות האלה נבחרו לניתוח כאן כדי להדגים את ההבדלים הטכניים והוויזואליים בעיבוד מקטעי אורז שקופים וגיריים.
Protocol
1. הכנת קטע אורז רוחבי
- דל הקליפה יבשה, גרעינים שלמים כפי שמוצג באיור 1A.
- לשחרר את הקליפים ואת גרעיני האורז dehull על ידי טחינת הגרעינים בין שני פקקי גומי שטוחים. הסר את גרעיני האורז קליפה מן הפאניקה, במידת הצורך.
- הניחו גרעין אחד על פקק גומי שטוח על ספסל עבודה(איור 1B). ודא כי פקק זה נשאר נייח.
- השתמש פקק גומי שטוח שני (איור 1C) כדי לשחט את הקרנל על ידי פיתול אותו נגד פקק הגומי הראשון, באמצעות לחץ מספיק (איור 1D). הסר קליפות מהגרעין, דואג לא לנפץ את endosperm. הסר כל קליפה שנותרה באמצעות מלקחיים עדינים. גרעין נטול קליפה מוצג באיור 1E.
- בעזרת מלקחיים עדינים, הכנס גרעין קליפה בודד לתוך קצה פיפטה מפלסטיק (גודל 250 μL, זרע/קצה אחד)(איור 1F). ודאו שקצה העובר של הקרנל פונה לכיוון הקצה (החרוטי) של קצה הפיפטה(איור 1G).
הערה: החדרת הליבה בדרך זו מבטיחה כי הקרנל יתאים בצורה נוחה ככל האפשר לתוך קצה pipette כמו הליבה צרה יותר לקראת הקצה הפרוקסימלי שלה. - הכנס טיפ פיפטה שני של 250 μL כדי לכפות על הקרנל את קצה הפיפטה ולשמור על חוסר תנועה של הליבה במהלך החתך, תוך שמירה על כך שלא לפגוע בליבה או לכופף את קצה הפיפטה השני (איור 1H). הרכב ה'טלסקופ' הנכון מצוין באיור 1I.
- הניחו את מכלול הטיפים שטוח על ספסל עבודה והחזקו במקומם ביד(איור 1J). מצד שני, השתמשו בלהב אזמל חד (מס' 20) כדי לחתוך את מרכז הקרנל ולחתוך את קצה קצה הטיפה(איור 1K). בעזרת האזמל לחתוך חלקים בעובי 1 מ"מ של גרעין האורז(איור 1L).
הערה: מקטע הקרנל סגור היטב בתוך אנולוס של פלסטיק(איור 1M). עובי מקטע ממוצע עבור שלושה גנוטיפים למופת נמצאים בטבלה 1. חלקים דקים משמעותית מ-1 מ"מ יתנפצו או יתפוררו. חשוב לציין מאיזה חלק של הקרנל כל חלק מקורו אם ניסוי זה מבוצע על מספר סוגים של אורז להשוואה, כמו מורפולוגיה עמילן משתנה לאורך אנדוספרם11.
2. מיקרוסקופיה אור משתקף של מקטעי אורז רוחביים
- השתמש במלקחיים עדינים כדי למקם את מקטעי האורז הרוחבים (שהוכנו בסעיף 1) על פיסת נייר שחורה של מד כבד.
- השג תמונות קלות של קטעים רוחביים של ניפונברה באמצעות סטריאומיקוסקופ עם עור ברווז רכוב להארה אלחונית, כפי שמוצג באיור 1N-S.
- שימו לב למורפולוגיה אנדוספרם תחת הגדלה של פי 10 לפחות.
הערה: כל מקור אפילייט עדיף על מיקרוסקופיית שדה בהירה מכיוון שחלקים המתקבלים בטכניקה זו אינם דקים מספיק כדי שהאור יעבור דרכם.
3. סריקת מיקרוסקופיית אלקטרונים של מקטעי אורז רוחביים
- מניחים את הדגימות על דיסק פחמן דבוק לספח אלומיניום ומניחים על מחזיק דגימת הפחתת טעינה. הסר את טבעת הפלסטיק מן הרכב קצה pipette באמצעות מלקחיים עדינים כדי למנוע את הפלסטיק מלהיכנס למנגנון ואקום של SEM.
הערה: תמונות של תאי אנדוספרם, SGs ותת-כבידה מתקבלות באמצעות מחשב SEM שולחני שאינו דורש דגימות לציפוי מלוטש. - השג את התמונות באמצעות גלאי אלקטרונים אחורי מרובה מצבים ברגישות גבוהה (BSE) ב- 10 kV.
Representative Results
חלקים מסוג פראי Nipponbare (איור 2A) ו- ssg1 (איור 2B) נבדקו תחת שלוש הגדלות: 260x, 920x ו- 4200x. טכניקה זו מאפשרת הכנת חלקים באיכות מספקת כדי להתבונן בתא האנוספרם כולו (איור 3A),גרגירי עמילן מורכבים (איור 3B)ותת-granules בודדים (איור 3C). גרעיני קליפה לוקח יותר זמן לעבד מאשר גרעינים מלוטשים כמו קליפות יבשות צריך להיות מוסר על ידי שחיקה לפני החתך. גרעיני גיר גם לקחת יותר זמן לעבד מאשר גרעינים שקופים מלוטשים, כמו יש לנקוט בזהירות לא לנפץ את הקרנל במהלך חתך. קטע אורז מוכן כראוי צריך להיות בעובי של כ-0.9 מ"מ(טבלה 1)עם מינימום עד ללא ניפוץ של האנדוספרם(איור 1N)ושכבות פריקארפ ואלורון שלמות(איור 1O). מיקום לא תקין של האזמל על קצה הפיפטה כאשר החתך יכול להוביל לחלקים 'סדוקים'(איור 1P). באופן דומה, תמונות שדה בהירות של מקטעים רוחביים אופטימליים של ssg1 (איור 1Q) הדגימו שכבות אנדוספרם, פריקרפ ואלורון שלמות וזמינות להדמיה (איור 1R). מקטע ליבה גירית שבור (איור 1S) עדיין עשוי להיות שמיש להדמיה אם המטרה היחידה היא לצפות ב- SGs, אך תבנית תא אנדוספרם לא תהיה גלויה. ייתכן שיהיה קשה לטפל בסעיף מנותק לצורך ניתוח. יותר גיזה של קירות תא אנדוספרם נצפתה בסוג פראי Nipponbare, כמו התאים ארוזים יותר חזק פחות פריך מאשר גרעיני ssg1. לא נצפתה גיזת תאי אנדוספרמה בחלקי ssg1 וגרגרי עמילן מורכבים ללא פגע.
איור S1 מדגים את אמינות התוצאות בטכניקת 'הטלסקופ' לקטע גרעיני אורז. קווי אורז שזוהו כמפיקי ליבה שקופים – סוג פראי עמילן עמיד (RS) קו היברידי Xieyou 7954 (Oryza sativa L. ssp. indica)12,13,14 ( איורS1A) ומוטנט שנוצר קובלט RS11113,15 ( איורS1B) יצרו קטעים שדרכם האור נראה באמצעות סטריאומיקוסקופ. תמונות SEM המתאימות חשפו כי קווים אלה מייצרים את פנוטיפ אנדוספרם האורז 'הרגיל': גרגירי עמילן רב-התדרלי ארוזים היטב. יצרני גרעין גיר, מגוון מסחרי Yi-Tang16 (איור S1C)ו RS413,מוטציה של RS11115 (איור S1D),הציגו קטעי ליבה לבנים ואטום. תמונות ה- SEM המתאימות הציגו מורפולוגיה שונה במידה ניכרת בהשוואה לקו הרקע של RS שקוף סוג הבר: גרגירי עמילן היו עגולים ונארזו באופן רופף. סוג פראי Xiushui 11 (Oryza sativa L. ssp. japonica) (איור S1E)והמוטציה שלו, KMD1 (Kemingdao1), המבטאים את הגן Cry1Ab לעיכוב טרפת חרקים17,18,19 ( איורS1F) הציגו קטעים ומורפוטיפים אנדוספרם הדומים לקווי ה- RS השקוף.
הטכניקה המוצגת כאן היא אופטימלית להכנת דגימות של גרעיני אורז מסוג גיר לניתוח פנוטיפי, אך גם מספקת יתרונות לפיצוח פנוטיפים של גרעיני אורז שקופים20: חיתוך הדגימות באמצעות לחץ מלמעלה מפחית את הסיכון לניפוץ האנדוספרם ונקע. ניתן להכין דוגמאות בקלות תוך שניות(טבלה 2). גנוטיפים מרובים נותחו באמצעות טכניקה זו כדי לבדוק את יעילותה (טבלה 3). כפי שמוצג באיור S2, טכניקה זו יכולה להיות מיושמת על זרעים של מינים אחרים. דגם מונוקוט Brachypodium distachyon מייצר זרעים קשים מאוד המכילים רק עמילן B-גרגר21, אשר חסר puroindoline A, חלבון המעניק רכות גרגרי עמילן22. עדיין ניתן היה להשיג מקטע רוחבי שלם(איור S2A). קבלת קטע רוחבי שלם מחיטה חורפית לבנה רכה (SWWW) הייתה מאתגרת אך ניתן לבצע אותה(איור S2B). זרעי SWWW עשירים בפורואינדולינה A וגדולים בהשוואה לזרעי B. distachyon וגרעיני אורז. זרעים אלה מתפוררים לעתים קרובות בעת חתך באמצעות הרכב הטלסקופ.
| גנוטיפ | רוחב מקטע ממוצע (מיקרומטר) באמצעות הרכבה של טלסקופ | רוחב מקטע ממוצע (מיקרומטר) חתך ביד חופשית |
| ניפונברה (קליפה) | 971.7 ± 152.4ab | 1059.571 ± 394.2ab |
| שיו 7954 | 825.1 ± 128.3b | 1306.187 ± 179.1a |
| RS4 | 910.6 ± 165.0ab | 1126.694 ± 395.3ab |
| אמצעים ואחריו אותן אותיות אינם שונים באופן משמעותי ב- P < 0.01 באמצעות ניתוח חד כיווני של שונות (ANOVA) ומבחן טוקי (n = 10). ניתוחים סטטיסטיים בוצעו באמצעות תוכנת JMP 15. | ||
טבלה 1: עובי מקטע ליבה ממוצע.
| גנוטיפ | זמן ממוצע (ים)* |
| ניפונברה (קליפה) | 14.7 ± 1.36a |
| שיו 7954 | 9.81 ± 0.98b |
| RS4 | 11.9 ± 1.28c |
| *באמצעות הרכב הטלסקופ. | |
| אמצעים ואחריו אותן אותיות אינם שונים באופן משמעותי ב- P < 0.01 באמצעות ניתוח חד כיווני של שונות (ANOVA) ומבחן טוקי (n = 10). ניתוחים סטטיסטיים בוצעו באמצעות תוכנת JMP 15. | |
טבלה 2: זמן הכנה לדוגמה ממוצע.
| גנוטיפ | רקע | איכות |
| ניפונברה | סוג פראי | שקוף |
| גרגר עמילן לא תקני1 (ssg1) | ניפונברה | צ'וקי |
| עמילן עמיד (RS) Xieyou 7954 | סוג פראי | שקוף |
| RS111 | שיו 7954 | שקוף |
| RS4 | RS111 | צ'וקי |
| יי-טאנג, 'חיים חדשים', מותג לוג'ורן | שיו 7954 | צ'וקי |
| שיושי 11 | סוג פראי | שקוף |
| קמינגדאו1 (KMD1) | שיושי 11 | שקוף |
טבלה 3: גנוטיפי אורז שנבדקו במחקר זה.
איור 1: הכנת מקטעי אורז רוחביים. (A)גרעין ניפונברה מסוג פראי עם קליפה שלמה. (B). הקרנל מונח על פקק גומי שטוח בקוטר 4 אינץ '. (ג)קליפות הוסרו על ידי שחיקת הקרנל בין שני פקקי גומי מעוררי תיאבון. (ד)קליפה הופרדו מגרעין האורז. (ה)תקריב של גרעיני אורז קליפה. קצה העובר מצוין. (ו)החדרת ליבה לטיפ פיפטה באמצעות מלקחיים עדינים. (G)הקרנל נתקע בקצה הדיסטלי של קצה הפיפטה. (H)החדרת קצה הפיפטה השני כדי לשתק את הקרנל לחתך (הרכבה 'טלסקופית'). (אני)גרעין האורז הותקן בצורה נוחה בקצה הדיסטלי של קצה הפיפטה. (J)חתך של גרעין האורז בתוך המכלול. (K)תקריב של קטע לחתוך. (L)חלק מהגרעין מוקף אנולוס הפלסטיק. (M)תקריב של החלק הרוחב. (N)קטע רוחבי מסוג פראי ניפונברה. (O)תקריב של האנוספרם בתוך קטע ניפונברה מסוג הפראי. (P)חלק מסכן, תת-אופטימלי של גרעין ניפונברה מסוג פראי. (Q)קטע רוחבי של מוטציה ניפונברה ssg14. (R)תקריב של אנדוספרם בתוך מקטע ssg1. (S)חלק מסכן, תת-אופטימלי של ssg1. בר (לוחות A, N-S) = 1 מ"מ. גרעין אורז מלא וחלקים צולמו באמצעות סטריאומיקוסקופ עם מצלמת זום דיגיטלית ואורות עור ברווז. אנא לחץ כאן כדי להציג גירסה גדולה יותר של איור זה.
איור 2: תמונות SEM של מקטעי ליבה רוחביים. (א)ניפונברה מסוג פראי, כת שקופה. גרגירי העמילן המורכבים התחזקו בחוזקה זה לזה; (B)מוטציה ניפונברה ssg14,פנוטיפ גיר. גרגירי העמילן המורכבים היו ארוזים באופן רופף וחסרים את האופי המצחיני של מורפוטיפ עמילן מסוג בר ניפונברה. הגדלה משמאל לימין: 260x, 920x ו- 4200x. אורך הסרגל מצוין בחלוניות. אנא לחץ כאן כדי להציג גירסה גדולה יותר של איור זה.
איור 3: אנטומיה מיקרוסקופית SEM של מקטע ליבה רוחבי של Xiushui 11. (A)תא אנדוספרם יחיד מסומן באדום. הגדלה פי 260. (B)גרגר עמילן מורכב מתואר באדום. הגדלה פי 920. (C)תת-granules עמילן מרובים מסומנים באדום. הגדלה פי 2250. אורכי פס מסומנים בחלוניות. אנא לחץ כאן כדי להציג גירסה גדולה יותר של איור זה.
איור S1: קטעים רוחביים של גנוטיפי אורז אחרים שהוכנו עבור SEM בטכניקה זו. (A)עמילן עמיד (RS) Xieyou 795412. (B)RS111, מוטציה שקופה ברמה גבוהה של 795413. (C) RS4, מוטציה גירית של RS11115. (D)יי-טאנג, מגוון מסחרי של אורז עמילוז גבוה16. (ה)שיושי 11. (ו) KMD1 (קמינגדאו1)17,18,19. הגדלה פי 10 לתמונות שדה בהירות. פס לבן = הגדלה של 1 מ"מ. 2250x עבור תמונות SEM. אורכי פס מסומנים בחלוניות. אנא לחץ כאן כדי להוריד נתון זה.
איור S2: טכניקה שימושית לזרעים אחרים. (א)קטע רוחבי של ברום סגול כוזב (ברכיפודיום דיסטכיון ל. גישה Bd21) זרע. (ב)קטע רוחבי של חיטה חורפית לבנה רכה (טריטיקום אסטיבום ל. ג. אוגוסטה) זרעים. שדה בהיר, הגדלה פי 20. בר = 1 מ"מ. אנא לחץ כאן כדי להוריד את הדמות הזאת.
Discussion
הטכניקה המוצגת כאן מייצגת גישה מהירה, פשוטה וחדה לקראת הכנת חתך אורז רוחבי להדמיית SEM שולחנית. טכניקת חתך זו מאפשרת תצפית מהירה של מבנה אנדוספרם, צורת תא אנדוספרם, גודל ותבנית, גרגירים מורכבים ומורפולוגיה של עמילן. לצורך סינון פנוטיפינג אנדוספרם ונבטים, חיוני להשיג חתך שלם של גרעין האורז4,23,24. חשוב ביותר להכניס את הקרנל כולו בתוך קצה הפיפטה כדי למנוע את הלחץ של להב האזמל מלאלץ את האנוספרם להתפורר או להתנפץ. בתנאי שהרכבת 'הטלסקופ' בנויה כראוי, ניתן להכין דגימות להדמיה תוך 15 שניות(טבלה 2)תוך שימוש בחומרים שכבר נמצאים ביד בסביבת מעבדה טיפוסית. טכניקה זו חלה על חתך רוחב של כל זרע אליפסואידי כארבעה מילימטרים בקוטר בנקודה הרחבה ביותר שלה. זרעי דגם הדשא Brachypodium distachyon (איור S2A) ניתן לחלק באופן דומה אך אינם נשארים סגורים בתוך אנולוס. זרעים גדולים יותר, כמו חיטה, שבר בקלות ודורשים טיפול בעת חתך(איור S2B).
עם זאת, ישנן מספר מגבלות לטכניקה המוצגת כאן. חלקים שהושגו בטכניקה זו אינם דקים מספיק כדי שהאור יעבור דרכה אוסר על שימוש בטכניקה זו לגישות מיקרוסקופיות מבוססות אור משודר כמו שדה בהיר (עובי מדגם מרבי של 500 מיקרומטר עבור חלקי ליבת אורז25) ומיקרוסקופיית אלקטרונים שידור (TEM) (500 ננומטר עובי מדגם מרבי26 ). השימוש בקצה פיפטה כ'מטריצה ' של חתך מגביל גם את גודל הזרע שניתן לחלק באמצעות טכניקה זו. פתרון בעיות נוסף יידרש כדי להתאים טכניקה זו עבור מינים שונים מאוד מאורז, ואת הגודל של "מטריצה" מוגבל על ידי גודל טיפים pipette זמין לרכישה.
יתרון מובהק נוסף שטכניקה זו מספקת הוא איכות הדגימות שניתן להפיק מגרעיני אורז פנוטיפ גיר. ראוי לציין כי אפילו מחקר Matsushima הודה כי היה קשה להשיג חתך בשיטה מסוימת זו עבור פנוטיפיםגיר 4, כפי ששוכפל במחקר זה לצורך השוואה (איור 1S). במקרה שלהם, היה צורך לתקן כימית דגימות אורז גיר שלהם ולהטביע אותם שרף לחתך. הטכניקה החדשה, בשילוב עם הדמיית SEM שולחנית, מאפשרת לחוקר להכין בקלות חלקים רוחביים של גרעיני אורז למיקרוסקופיה עם עקביות רבה יותר מאשר ללא תמיכה בלי תנועה (טבלה 3).
בעידן החדש של פנומיקה ומטבולומיה, חשוב לפקח על קווים מוטגניים וספריות מתויגות טרנספוסון כדי להבין טוב יותר את הפונקציה והחשיבות של עמילן בזרעים. בנוסף, ג'נבנק רייס הבינלאומי מחזיק מעל 130,000 גישות אורז27. טכניקת פנוטיפינג זרעים מהירה כמו זו המוצגת כאן תזרז סיווג ודגימה לאיכות תזונתית28. לבסוף, טכניקה זו עשויה להיות שימושית לאור השפעות שינוי האקלים פולש. מתח עונתי בטמפרטורה גבוהה במהלך מילוי תבואה כבר זוהה כגורם העיקרי לגיר6, אבל מחקרים אחרונים סיבכו את עליית הטמפרטורות העולמיות בהגדלת הגיר של תשואות אורז7,29. פנוטיפינג אנדוספרם מזורז כזה עשוי לעזור לספק תמונה חקלאית רחבה של ההשפעה של עליית הטמפרטורות העולמיות.
Disclosures
למחברים אין מה לחשוף.
Acknowledgments
המחברים אסירי תודה למערכות למחקר (SFR Corp.) על השימוש במכשיר הפנומן ProX Desktop SEM שלהם, כמו גם על הסיוע הטכני המסופק על ידי מריה פילרינוס (מערכות למחקר (SFR) קורפ) ו Chloë van Oostende-Triplet (ביולוגיה של התא ומתקן הליבה לרכישת תמונה, הפקולטה לרפואה, אוניברסיטת אוטווה). המימון ניתן על ידי קרן החדשנות דלת הפחמן (LCIF) ממשרד הפיתוח הכלכלי של אונטריו, יצירת מקומות עבודה וסחר, וחלבונים קלים קורפ.
Materials
| Name | Company | Catalog Number | Comments |
| JMP 15 | SAS | N/A | N/A |
| Leit Adhesive Carbon Tabs 12 mm (Pack of 100) | Agar Scientific | AGG3347N | N/A |
| Phenom Pro Desktop SEM | Thermo Scientific | PHENOM-PRO | N/A |
| Pipette Tips RC UNV 250 µL | Rainin | 17001116 | N/A |
| SEM Pin Stub Ø12.7 Diameter Top, Standard Pin, Aluminium | Micro to Nano | 10-002012-50 | N/A |
| Shandon Microdissecting Fine Tips Thumb Forceps, Fine Tips, 12.7 cm | Thermo Scientific | 3120019 | N/A |
| Shandon Scalpel Blade No. 20, Sterile, 4.5 cm | Thermo Scientific | 28618256 | N/A |
| Shandon Stainless-Steel Scalpel Blade Handle | Thermo Scientific | 5334 | N/A |
| Zeiss V20 Discovery Stereomicroscope | Zeiss | N/A | N/A |
References
- James, M. G., Denyer, K., Myers, A. M.
- Shapter, F. M., Henry, R. J., Lee, L. S. Endosperm and starch granule morphology in wild cereal relatives. Plant Genetic Resources. 6 (2), 85-97 (2008).
- Ashida, K., Iida, S., Yasui, T. Morphological, physical, and chemical properties of grain and flour from chalky rice mutants. Cereal Chemistry. 86 (2), 225-231 (2009).
- Matsushima, R., Maekawa, M., Fujita, N., Sakamoto, W. A rapid, direct observation method to isolate mutants with defects in starch grain morphology in rice. Plant and Cell Physiology. 51 (5), 728-741 (2010).
- Zhao, X., et al. Identification of stable QTLs causing chalk in rice grains in nine environments. Theoretical and Applied Genetics. 129 (1), 141-153 (2016).
- Nagato, K., Ebata, M. Effects of high temperature during ripening period on the development and the quality of rice kernels. Japanese Journal of Crop Science. 34 (1), 59-66 (1965).
- Zhao, X., Fitzgerald, M. Climate change: implications for the yield of edible rice. PLoS One. 8 (6), 66218 (2013).
- Zhao, Z. K., Mu, T. H., Zhang, M., Richel, A. Effects of high hydrostatic pressure and microbial transglutaminase treatment on structure and gelation properties of sweet potato protein. LWT - Food Science and Technology. 115, 108436 (2019).
- Feiz, L., et al. Puroindolines co-localize to the starch granule surface and increase seed bound polar lipid content. Journal of Cereal Science. 50 (1), 91-98 (2009).
- Zhao, L., Pan, T., Guo, D., Wei, C. A simple and rapid method for preparing the whole section of starchy seed to investigate the morphology and distribution of starch in different regions of seed. Plant Methods. 14 (1), 16 (2018).
- Zhao, L., Pan, T., Cai, C., Wang, J., Wei, C. Application of whole sections of mature cereal seeds to visualize the morphology of endosperm cell and starch and the distribution of storage protein. Journal of Cereal Science. 71, 19-27 (2016).
- Li, C., Dong, S., Li, G., Yuan, G., Dong, W. Breeding and application of the new combination of hybrid rice "Xieyou 7954". Journal of Zhejiang University (Agriculture and Life Sciences). 19 (3), 179-181 (2002).
- Shu, X., Jia, L., Ye, H., Li, C., Wu, D. Slow digestion properties of rice different in resistant starch. Journal of Agricultural and Food Chemistry. 57 (16), 7552-7559 (2009).
- Zhou, H., et al. Critical roles of soluble starch synthase SSIIIa and granule-bound starch synthase Waxy in synthesizing resistant starch in rice. Proceedings of the National Academy of Sciences. 113 (45), 12844-12849 (2016).
- Yang, C. Z., et al. Starch properties of mutant rice high in resistant starch. Journal of Agricultural and Food Chemistry. 54, 523-528 (2006).
- Zhou, Y., Zou, Y., Jiang, Y., Li, B. Detection methods for resistance starch content of Yi-Tang rice and optimization of pretreatment. Food Science and Biotechnology. 36, 416-419 (2017).
- Cheng, X., Sardana, R., Kaplan, H., Altosaar, I. Agrobacterium-transformed rice plants expressing synthetic cryIA(b) and cryIA(c) genes are highly toxic to striped stem borer and yellow stem borer. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 95 (6), 2767-2772 (1998).
- Liu, H., et al. Rapid detection of P-35S and T-nos in genetically modified organisms by recombinase polymerase amplification combined with a lateral flow strip. Food Control. 107, 106775 (2020).
- Shu, Q., et al. Transgenic rice plants with a synthetic cry1Ab gene from Bacillus thuringiensis were highly resistant to eight lepidopteran rice pest species. Molecular Breeding. 6 (4), 433-439 (2000).
- Lisle, A. J., Martin, M., Fitzgerald, M. A. Chalky and translucent rice grains differ in starch composition and structure and cooking properties. Cereal Chemistry. 77 (5), 627-632 (2000).
- Chen, G., et al. Dynamic development of starch granules and the regulation of starch biosynthesis in Brachypodium distachyon: comparison with common wheat and Aegilops peregrina. BMC Plant Biology. 14 (1), 198 (2014).
- Giroux, M. J., Morris, C. F. Wheat grain hardness results from highly conserved mutations in the friabilin components puroindoline a and b. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 95 (11), 6262-6266 (1998).
- Matsushima, R., Hisano, H. Imaging amyloplasts in the developing endosperm of barley and rice. Scientific Reports. 9, 3745 (2019).
- Matsushima, R., et al. Amyloplast-localized SUBSTANDARD STARCH GRAIN4 protein influences the size of starch grains in rice endosperm. Plant Physiology. 164 (2), 623-636 (2014).
- Monjardino, P., et al. Development of flange and reticulate wall ingrowths in maize (Zea mays L.) endosperm transfer cells. Protoplasma. 250 (2), 495-503 (2013).
- Tizro, P., Choi, C., Khanlou, N. Sample preparation for transmission electron microscopy. Methods in Molecular Biology. 1897, 417-424 (2019).
- International Rice Genebank. , Available from: www.irri.org (2018).
- Liu, Q. H., Zhou, X. B., Yang, L. Q., Li, T. Effects of chalkiness on cooking, eating and nutritional qualities of rice in two indica varieties. Rice Science. 16 (2), 161-164 (2009).
- Morita, S., Wada, H., Matsue, Y. Countermeasures for heat damage in rice grain quality under climate change. Plant Production Science. 19 (1), 1-11 (2016).
