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设计,包装,并通过立体定向注射高效价CRISPR复古和慢交付
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JoVE Journal Neuroscience
Designing, Packaging, and Delivery of High Titer CRISPR Retro and Lentiviruses via Stereotaxic Injection

设计,包装,并通过立体定向注射高效价CRISPR复古和慢交付

Full Text
18,365 Views
11:28 min
May 23, 2016

DOI: 10.3791/53783-v

Catherine J. Fricano-Kugler1, Michael R. Williams1, Julia R. Salinaro1, Meijie Li1, Bryan Luikart1

1Department of Physiology and Neurobiology,Geisel School of Medicine at Dartmouth College

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Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

Overview

This protocol demonstrates the use of the CRISPR/Cas9 system for targeted genome editing by creating viruses that knockout specific genes. The method involves stereotaxic injection into the adult mouse brain, facilitating research into neurological disorders.

Key Study Components

Area of Science

  • Neuroscience
  • Genetics
  • Gene Editing

Background

  • The CRISPR/Cas9 system allows for precise genome editing.
  • This technique is more efficient than traditional genetic engineering methods.
  • Understanding gene functions can provide insights into neurological disorders.
  • Viruses can be used to deliver genetic material into specific brain regions.

Purpose of Study

  • To create viruses that express CAS9 and sgRNAs for gene knockout.
  • To investigate the roles of specific genes in neurological disorders.
  • To streamline the process of gene manipulation in research.

Methods Used

  • Designing and packaging viruses expressing fluorescent proteins and gene-editing components.
  • Stereotaxic injection of viral particles into the mouse brain.
  • Cell culture and transfection techniques for virus production.
  • Use of anesthesia and surgical procedures for mouse preparation.

Main Results

  • Successful creation of viral particles capable of gene knockout.
  • Effective delivery of genetic material into targeted brain regions.
  • Demonstrated potential for studying gene functions related to neurological disorders.
  • Streamlined methodology for future genetic research.

Conclusions

  • The CRISPR/Cas9 system is a powerful tool for gene manipulation.
  • This protocol provides a practical approach for neuroscience research.
  • Future studies can leverage this method to explore gene roles in health and disease.

Frequently Asked Questions

What is the CRISPR/Cas9 system?
The CRISPR/Cas9 system is a revolutionary tool for genome editing that allows for precise modifications to DNA.
How are viruses used in this protocol?
Viruses are engineered to carry gene-editing components and are injected into the mouse brain to achieve targeted gene knockout.
What are the advantages of this method?
This method allows for specific gene manipulation without the need for creating genetically modified animals, saving time and resources.
What is stereotaxic injection?
Stereotaxic injection is a precise method used to deliver substances into specific locations in the brain of an animal.
What types of genes can be targeted?
Any gene of interest can be targeted, particularly those associated with neurological and neuro-developmental disorders.
How do researchers confirm successful gene knockout?
Researchers can confirm successful gene knockout through various assays, including PCR and sequencing.

该CRISPR / Cas9系统提供作出有针对性的基因组编辑获得和负担得起科学界的潜力。该协议旨在演示如何创建病毒将基因敲除使用CRISPR / Cas9系统感兴趣的基因,然后立体定位将它们注入成年小鼠大脑。

该程序的总体目标是使研究人员能够设计和包装表达荧光蛋白、CAS9 和 sgRNA 的病毒,然后将它们立体定向注射到小鼠大脑中。这种方法可以帮助回答神经科学领域的特定问题,例如导致神经和神经发育障碍的基因的作用。这项技术的主要优点是能够纵特定基因,而无需花费时间和资源来创造基因工程动物。

在制备细胞之前,使用网站生成 20 个核苷酸的引导链或 sgRNA,用于设计单链寡核苷酸。按照文本方案中的说明订购寡核苷酸并使用它们制备最终质粒后,继续将所有 th-od 细胞从冻存管中移液到 15 mL 锥形管中。接下来加入 2 毫升预热的 CO 2 平衡完全 IMDM。

然后以 500 倍 G 离心细胞 5 分钟,然后吸出上清液并将细胞沉淀重悬于 10 毫升完全 IMDM 中。将细胞接种到 10 cm 细胞培养皿上,并在 37 摄氏度下在 5% 二氧化碳培养箱中孵育过夜。铺板后 24 小时,通过吸出现有培养基并加入 10 毫升预热的 IMDM 来更换培养基。

一旦细胞汇合,就分裂细胞。要分离细胞,吸出培养基并用 5 毫升 PBS 洗涤板。然后向板中加入 1 毫升 0.25% 胰蛋白酶,并在 37 摄氏度下孵育,直到细胞从板中升起。

然后,加入 0.5 毫升 IMDM 以中和胰蛋白酶反应,并将细胞移液到 1.5 毫升试管中。接下来,将细胞以 500 倍 G 离心 5 分钟。将细胞重悬于 1 毫升 IMDM 中,并在 90 微升 PBS 中稀释 10 微升细胞。

使用血细胞计数器或自动细胞计数仪对细胞进行计数,并用完全 IMDM 重新接种细胞。第 5 天,在转染前 2 小时更换培养基,并确保 10 厘米板中正好有 10 mL 培养基。接下来,使用两支 5 ml 圆底聚苯乙烯管制备用于两次分离的转染试剂。

将第一管标记为 DNA,将第二根管标记为 2X HBS。然后在 PH 值为 7.4 的 Tris EDTA 中将 DNA 浓度调节至 1 μg/μL。要制备慢病毒和逆转录病毒的转染试剂,请将所需的组分缓慢添加到标记的 DNA 管中,同时不断敲击试管进行混合。

之后,将 1 毫升 2X HBS 添加到标有 2X HBS 的试管中。接下来,缓慢地将 DNA 管中的 1 毫升内容物添加到 2X HBS 管中,一次一滴。连续敲击 2X HBS 管,观察每次滴液后形成的磷酸钙沉淀物,以确保成功制备转染复合物。

随后在室温下避光孵育试管 30 分钟。30 分钟后,向每个 10 cm 细胞板中加入 1 mL 慢速液滴转染试剂,并在 37 °C 下孵育细胞过夜。在第 6 天更换培养基。

第 7 天,用 10 毫升血清移液管将含有病毒颗粒的培养基转移到 50 毫升锥形管中,然后在 4 摄氏度下储存。然后向每个细胞板中加入 8 毫升 0.5% FBS 培养基。第八天,收集含有病毒颗粒的细胞培养基,并将其与前一天的收获物混合在 50 毫升锥形管中。

在该步骤中,将病毒上清液以 2000 倍 G 离心 10 分钟。然后,通过 0.45 微米低蛋白结合注射器过滤器过滤病毒培养基来纯化病毒培养基。接下来,向培养基中加入 5X 聚乙二醇 6000 溶液。

将试管倒置数次以混合。然后将病毒混合物在 4 摄氏度下孵育至少 12 小时。第 9 天,将病毒混合物以 2500 倍 G 离心 45 分钟。

45 分钟后,弃去上清液并再次离心 2 分钟。然后再次去除上清液。然后,加入 320 μL 无菌 PBS 重悬沉淀,并在摇床上室温孵育 30 分钟。

第二天,将病毒分装并在零下 80 摄氏度下冷冻等分试样。要开始此过程,请剃掉麻醉小鼠的头部,以便为注射部位做准备。将 4% 异氟醚直接进入鼻锥。

接下来,将鼠标放入立体定向仪器中。将咬杆插入口中,直到牙齿掉入插槽中,然后再固定耳杆。确保动物的身体在加热垫上,并且鼻子位于鼻锥中。

接下来,通过捏脚来确认麻醉。然后涂抹人工泪液来润滑眼睛。随后用聚维酮碘和利多卡因擦拭剃光的头部。

现在沿着头皮中线做一个小切口。用棉签擦干颅骨并涂抹过氧化氢以帮助观察前囟。使用解剖镜,找到头骨上的前囟,并将钻头放在其上方。

将 X、Y 和 Z 平面的数字立体定向坐标设置为零。为了确保头部在喙尾 Y 轴上水平,将钻头放在 lambda 上并调平头部,使 Z 坐标在前囟和 lambda 处大致等于零。为确保头部沿 X 轴水平,请将钻头放在前囟和 lambda 之间的中点上,并在距两侧中点一毫米处测量 Z 坐标,以确保它们相等。

接下来将异氟醚降低到 2%,然后将钻头放在所需的坐标上并小心地钻穿头骨。钻完所有孔后,将充满病毒的注射器贴在立体定向器械上。将注射器置于孔的中心,并将头骨处的 Z 坐标设置为零。

慢慢将注射器降低到最深的 Z 深度,并使用立体定向注射器以每分钟 0.25 微升的速度开始注射。在最深的 Z 深度完成注射后,等待一分钟,然后将其升高到下一个坐标,然后再次开始注射。继续此模式,直到注入所有 Z 注入坐标。

最后一次注射后,等待 2 分钟后再取出注射器。然后从立体定向器械中取出鼠标并缝合头皮。在手术部位涂抹利多卡因和抗菌乳膏,并在将动物转移到加热的恢复室之前服用止痛药。

这张 10X 宽视野荧光图像表明,高滴度逆转录病毒感染了大量细胞,这些细胞的形态可以通过荧光团表达进行评估。在这个例子中,表达 GFP 或 mCherry 的病毒被共同注射到齿状回中。使用逆转录病毒系统,可以使用一种病毒进行一种以 GFP 为标记的基因作和另一种以 mCHerry 为标记的基因作,然后评估由于每种病毒引起的单个或附加变化。

这是注射范围的 3D 重建,其中在 21 个连续切片上追踪了病毒传播的闭合轮廓。然后对齐轮廓描记以生成用于体积量化的 3D 图像。病毒总传播以绿色显示,dendate 局部传播以紫色显示。

该图像显示病毒除了填充齿状回的喙尾轴外,还沿针道和胼胝体传播。体内病毒注射后,我们使用其他方法,如组织学、电生理学或双重显微镜检查来研究基因作对神经元发育的影响。

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