Name: 全贴装荧光原位杂交和免疫荧光法在斑马鱼中 Multiciliated 细胞的可视化 (视频) | JoVE Journal
Uploaded: 2017-11-18T13:00:00.000+00:00
Duration: 9 min 33 s
Description: 学习全贴装荧光原位杂交和免疫荧光法在斑马鱼中可视化多纤毛细胞的技术。该方法可同时标记蛋白质和RNA转录本，适用于研究纤毛发育和器官发生机制。

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

playerTrialDesktop

本研究部分得到了R01DK100237基金（授予R.A.W.）以及美国国家科学基金会研究生研究奖学金DGE-1313583（授予A.N.M.）的支持。我们还感谢圣母大学理学院暑期本科生研究奖学金项目对M.U.的支持。我们谨向圣母大学斑马鱼研究中心致以诚挚谢意，感谢其对我们斑马鱼的精心照料。同时，我们也感谢生物科学系以及实验室全体成员给予的大力支持和宝贵建议。

以下实验方案使用由圣母大学斑马鱼研究中心饲养和维护的成年斑马鱼。所有涉及成年斑马鱼及胚胎的操作方法均经机构动物护理与使用委员会批准。
1. 胚胎固定
<ol>
	<li>采用先前描述的方法收集斑马鱼胚胎39,40。在受精后24小时（24 hpf），向胚胎培养皿的E3培养基中加入500 µL非特异性蛋白酶混合液（50 mg/mL），于室温（RT）孵育。</li>
	<li>当胚胎开始从绒毛膜中脱出时，移除胚胎培养皿中的所有液体。</li>
	<li>用新鲜E3培养基清洗胚胎2&#160;– 3次：每次加入约20 mL E3培养基，轻轻晃动培养皿使液体旋转混合，然后将液体倾倒至液体废弃物容器中。</li>
	<li>在固定前对胚胎实施安乐死，向E3培养基中加入&#160;2 mL 0.2% 三卡因（tricaine）。</li>
	<li>使用塑料巴斯德吸管将胚胎转移至5 mL玻璃小瓶中。待胚胎沉降至瓶底后，用吸管吸除大部分三卡因/E3溶液。</li>
	<li>用5 mL 4%多聚甲醛（PFA）在室温（RT）下固定24 hpf的胚胎，固定2–4小时，期间不进行振荡。 
	警告：PFA具有毒性，操作PFA溶液时应在化学通风橱内进行，并佩戴护目镜、手套和实验服。配制PFA固定液时需格外小心，因颗粒状PFA粉末易因静电而飞散。 
	注意：胚胎可在4 °C条件下用4% PFA过夜固定。配制4% PFA时，将1×磷酸盐缓冲液（PBS）加热至沸腾，同时持续搅拌，以完全溶解颗粒状PFA。待溶液冷却至室温后，使用0.45 µm一次性真空过滤装置对4% PFA进行过滤除菌，然后分装至15 mL或50 mL离心管中，于-20 °C保存。</li>
	<li>移除4% PFA溶液，在室温下用含0.1% Tween-20的1×磷酸盐缓冲液（PBST）清洗胚胎两次。再于室温下用5 mL 100%甲醇（MeOH）清洗胚胎一次。向胚胎中加入5 mL新鲜的100%甲醇，于-20 °C孵育至少20分钟。 
	注意：胚胎可在-20 °C条件下保存于100%甲醇中，直至准备进行后续胚胎处理。</li>
</ol>
2. 胚胎制备与杂交
<ol>
	<li>在室温下，用 5 mL 含 50% 甲醇的 1× PBST 溶液洗涤胚胎一次，持续 5 分钟，以进行复水。随后在室温下，用 5 mL 含 30% 甲醇的 1× PBST 溶液洗涤 5 分钟，继续复水。最后在室温下，用 5 mL 1× PBST 溶液洗涤胚胎两次，每次 5 分钟。</li>
	<li>将胚胎在 5 mL 含 1:1,000 蛋白酶 K（pK）（10 mg/mL）的 1× PBST 溶液中孵育 2 分钟，以实现通透化处理。 
	注意：较晚期的胚胎可在上述 pK 浓度下孵育超过 2 分钟；但对于小于 24 hpf 的胚胎，建议使用 5 mg/mL 的 pK 浓度，且孵育时间少于 2 分钟。</li>
	<li>移除 pK 溶液，并立即在室温下用 5 mL 1× PBST 溶液洗涤两次。随后在室温下，将胚胎置于 5 mL 4% 多聚甲醛（PFA）中固定至少 20 分钟。 
	注意：胚胎可在 4 °C 下用 4% PFA 过夜固定。</li>
	<li>移除 PFA 溶液，并在室温下用 5 mL 1× PBST 溶液洗涤两次。</li>
	<li>将胚胎连同 5 mL 1× PBST 转移至平底微量离心管中，将管子垂直放置于微量离心管架上，在室温下操作，以促进每个胚胎与后续杂交溶液之间的充分接触。</li>
	<li>在室温下，用 1.5 mL 杂交溶液（Hyb+）洗涤胚胎两次。加入 1.5 mL 新鲜的 Hyb+ 溶液，并将胚胎置于 70 °C 杂交炉中孵育 4–6 小时。</li>
	<li>将 1.5 mL Hyb+ 溶液替换为足量的探针溶液（每 500 µL Hyb+ 中含 10 µL RNA 探针），确保溶液完全覆盖胚胎。 
	注意：反义 RNA 探针的合成可采用先前描述的方法39。</li>
	<li>将探针在 70 °C 杂交炉中杂交过夜，将各离心管垂直置于微量离心管架上，不进行振荡。</li>
</ol>
3. 热洗涤与封闭
注意：高温洗涤是将适当的溶液加入胚胎后，在70 °C的杂交炉中孵育。为保持洗涤溶液的温度在70 °C，当加入探针/Hyb+混合物时，应将每种溶液的50 mL离心管放入杂交炉中。
<ol>
	<li>移除探针。在70 °C下，用1.5 mL的50%甲酰胺/2×盐-柠檬酸钠（SSC）缓冲液洗涤胚胎两次，每次20-30分钟。 
	注意：探针可在-20 °C下保存于Hyb+中，供日后重复使用。</li>
	<li>在70 °C下，用1.5 mL的2×SSC缓冲液洗涤胚胎一次，持续15分钟。再在70 °C下，用1.5 mL的0.2×SSC缓冲液洗涤胚胎两次，每次20-30分钟。弃去0.2×SSC，加入1.5 mL封闭试剂，于4 °C下过夜孵育。 
	注意：也可在室温下孵育封闭试剂4小时，代替过夜孵育。</li>
</ol>
4. 抗体孵育与马来酸缓冲液洗涤
注意：胚胎需避免暴露于环境光下。
<ol>
	<li>用 0.2 mL 封闭剂中的抗 DIG-POD 抗体（按 1:1,000 比例稀释）替换原有的封闭剂，于室温下避光（使用铝箔或其他避光覆盖物）孵育 3 小时。 
	注意：也可选择在 4 °C 下孵育过夜。</li>
	<li>3 小时后，在 1.5 mL 马来酸缓冲液中于室温下洗涤胚胎 2–4 次，每次 10–15 分钟。随后在 1.5 mL 新鲜的马来酸缓冲液中于 4 °C 下孵育胚胎过夜。 
	注意：过夜孵育于马来酸缓冲液中并非必需，但可降低探针背景信号。</li>
</ol>
5. 探针检测及过氧化物酶的去除
注意：胚胎需避免暴露于环境光下。
<ol>
	<li>移除马来酸缓冲液，加入 1.5 mL 的 1x PBS 替代。在室温下用 1.5 mL 的 1x PBS 洗涤胚胎两次，每次 5 分钟。在室温下用 0.2 mL 的 Cy3 荧光染色液孵育胚胎 60 分钟。 
	注意：不同探针的孵育时间可能有所不同。</li>
	<li>在室温下，用以下浓度的甲醇（MeOH）与 1x PBS 的混合液各 1.5 mL，依次为 30% MeOH、50% MeOH、75% MeOH 和 100% MeOH，洗涤胚胎一次，每次 10 分钟。</li>
	<li>在室温下用 1.5 mL 含 1% H2O2 的甲醇溶液孵育胚胎 30 分钟。在室温下用 1.5 mL 的以下甲醇与 1x PBS 混合液依次洗涤胚胎一次，每次 10 分钟：75% MeOH、50% MeOH 和 30% MeOH。最后在室温下用 1.5 mL 的 1x PBS 洗涤胚胎两次，每次 5 分钟。 
	注意：胚胎可在 4°C 的 PBS 中保存过夜。</li>
</ol>
6. 免疫荧光
注意：胚胎需避免暴露于环境光下。
<ol>
	<li>在室温下，用 1.5 mL ddH2O 清洗胚胎 5 分钟。在室温下，用 1.5 mL 预冷的丙酮（保存于 -20 °C）清洗胚胎 7 分钟。在室温下，用 1.5 mL ddH2O 再清洗胚胎一次，持续 5 分钟。在室温下，用 1.5 mL 含 1% DMSO 的 1× PBST（PBDT）清洗胚胎一次，持续 5 分钟。</li>
	<li>将胚胎置于 1.5 mL PBDT + 10% 胎牛血清（FBS）中，在摇床上室温孵育 2 小时。</li>
	<li>移除 PBDT + FBS，加入 1.5 mL 一抗溶液，其中包含抗乙酰化微管蛋白抗体（小鼠来源）和抗γ-微管蛋白抗体（兔来源），用 PBDT + 1% FBS 按 1:400 比例共同稀释。在 4 °C 下孵育过夜。 
	注意：孵育时间可能因一抗不同而有所变化。可能需要测试不同时间间隔以优化标记效果。</li>
</ol>
7. 二抗
注意：胚胎需避免暴露于环境光下。
<ol>
	<li>为去除胚胎中过量的未结合抗体，在室温下将胚胎置于 1.5 mL PBDT + 1% FBS + 0.1 M NaCl 中，在摇床上洗涤 1 分钟。</li>
	<li>在室温下，将胚胎在 1.5 mL PBDT + 1% FBS + 0.1 M NaCl 中洗涤 5 次，每次 30 分钟，置于摇床上；随后在 1.5 mL PBDT + 1% FBS 中于室温下继续在摇床上洗涤 30 分钟。</li>
	<li>将胚胎在 4 °C 下避光孵育过夜，加入 200 µL 二抗溶液（Alexa 488 山羊抗小鼠 IgG 和 Alexa 647 山羊抗兔 IgG），用 PBDT 按 1:500 比例共同稀释。</li>
</ol>
8. DAPI 染色
注意：胚胎需避免暴露于环境光下。
<ol>
	<li>在室温下，用 1.5 mL PBDT 快速清洗胚胎两次。弃去 PBDT，加入 1.5 mL DAPI（用 1× PBST 稀释至 1:15000），在摇床上室温孵育 15 分钟。</li>
	<li>用 1.5 mL PDBT + 1% FBS + 0.1 M NaCl 在室温下清洗胚胎三次，每次 15–20 分钟。将胚胎保存在 1.5 mL PBDT 中，置于 4 °C，待后续封片和成像时使用。</li>
</ol>
9. 斑马鱼前肾的封片与成像
<ol>
	<li>将胚胎侧卧置于载玻片上，加入约 10 µL 的 PBDT 溶液。</li>
	<li>用精细镊子在胚胎眼睛后方轻轻挤压，去除头部及部分卵黄球。</li>
	<li>使用精细镊子轻轻刮除胚胎体部残留的卵黄球。用细纸巾吸除载玻片上离散的卵黄和多余液体。</li>
	<li>在胚胎剩余的尾部滴加一滴封片介质，调整位置使尾部侧向平铺。盖上盖玻片以压平样品，随后放入带盖的玻片盒中。</li>
	<li>在共聚焦显微镜下以 60 倍放大倍数观察肾脏纤毛，使用以下通道：DAPI 显示为蓝色（激光波长 408.0 nm），FITC 显示为绿色（激光波长 488.0 nm），Cy3 染料标记显示为红色（激光波长 561.0 nm），Alexa 680 显示为白色（激光波长 637.0 nm）。</li>
</ol>

<ol><li>Lieschke, G. J., Currie, P. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Animal+models+of+human+disease%3A+zebrafish+swim+into+view%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Rev+Genet%22%5BJournal%5D)">Animal models of human disease: zebrafish swim into view.</a> Nat Rev Genet. 8, 353-367 (2007).</li>
<li>Goldsmith, J. R., Jobin, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Think+small%3A+zebrafish+as+a+model+system+of+human+pathology%5BTitle%5D)+AND+%22J+Biomed+Biotechnol%22%5BJournal%5D)">Think small: zebrafish as a model system of human pathology.</a> J Biomed Biotechnol. 2012, 817341(2012).</li>
<li>Howe, K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+zebrafish+reference+genome+sequence+and+its+relationship+to+the+human+genome%5BTitle%5D)+AND+%22Nature%22%5BJournal%5D)">The zebrafish reference genome sequence and its relationship to the human genome.</a> Nature. 496, 498-503 (2013).</li>
<li>Drummond, I. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Kidney+development+and+disease+in+the+zebrafish%5BTitle%5D)+AND+%22J+Am+Soc+Nephrol%22%5BJournal%5D)">Kidney development and disease in the zebrafish.</a> J Am Soc Nephrol. 16, 299-304 (2005).</li>
<li>Wingert, R. A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+cdx+genes+and+retinoic+acid+control+the+positioning+and+segmentation+of+the+zebrafish+pronephros%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+Genet%22%5BJournal%5D)">The cdx genes and retinoic acid control the positioning and segmentation of the zebrafish pronephros.</a> PLoS Genet. 3, 1922-1938 (2007).</li>
<li>Wingert, R. A., Davidson, A. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+zebrafish+pronephros%3A+a+model+to+study+segmentation%5BTitle%5D)+AND+%22Kindey+Int%22%5BJournal%5D)">The zebrafish pronephros: a model to study segmentation.</a> Kindey Int. 73 (10), 1120-1127 (2008).</li>
<li>Wingert, R. A., Davidson, A. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Zebrafish+nephrogenesis+involves+dynamic+spatiotemporal+expression+changes+in+renal+progenitors+and+essential+signals+from+retinoic+acid+and+irx3b%5BTitle%5D)+AND+%22Dev+Dyn%22%5BJournal%5D)">Zebrafish nephrogenesis involves dynamic spatiotemporal expression changes in renal progenitors and essential signals from retinoic acid and irx3b.</a> Dev Dyn. 240, 2011-2027 (2011).</li>
<li>Chambers, B. E., Wingert, R. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Renal+progenitors%3A+roles+in+kidney+disease+and+regeneration%5BTitle%5D)+AND+%22World+J+Stem+Cells%22%5BJournal%5D)">Renal progenitors: roles in kidney disease and regeneration.</a> World J Stem Cells. 8 (11), 367-375 (2016).</li>
<li>Drummond, B. E., Wingert, R. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Insights+into+kidney+stem+cell+development+and+regeneration+using+zebrafish%5BTitle%5D)+AND+%22World+J+Stem+Cells%22%5BJournal%5D)">Insights into kidney stem cell development and regeneration using zebrafish.</a> World J Stem Cells. 8 (2), 22-31 (2016).</li>
<li>Poureetezadi, S. J., Wingert, R. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Little+fish%2C+big+catch%3A+zebrafish+as+a+model+for+kidney+disease%5BTitle%5D)+AND+%22Kidney+Int%22%5BJournal%5D)">Little fish, big catch: zebrafish as a model for kidney disease.</a> Kidney Int. 89 (6), 1204-1210 (2016).</li>
<li>Kramer-Zucker, A. G., Olale, F., Haycraft, C. J., Yoder, B. K., Schier, A. F., Drummond, I. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Cilia-driven+fluid+flow+in+the+zebrafish+pronephros%2C+brain+and+Kupffer%27s+vesicle+is+required+for+normal+organogenesis%5BTitle%5D)+AND+%22Development%22%5BJournal%5D)">Cilia-driven fluid flow in the zebrafish pronephros, brain and Kupffer's vesicle is required for normal organogenesis.</a> Development. 132, 1907-1921 (2005).</li>
<li>Liu, Y., Narendra, P., Kramer-Zucker, A., Drummond, I. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Notch+signaling+controls+the+differentiation+of+transporting+epithlelia+and+multiciliated+cells+in+the+zebrafish+pronephros%5BTitle%5D)+AND+%22Development%22%5BJournal%5D)">Notch signaling controls the differentiation of transporting epithlelia and multiciliated cells in the zebrafish pronephros.</a> Development. 134, 1111-1122 (2007).</li>
<li>Ma, M., Jiang, Y. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Jagged2a-Notch+signaling+mediates+cell+fate+choice+in+the+zebrafish+pronephric+duct%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+Genetics%22%5BJournal%5D)">Jagged2a-Notch signaling mediates cell fate choice in the zebrafish pronephric duct.</a> PLoS Genetics. 3, e18(2007).</li>
<li>Li, Y., Cheng, C. N., Verdun, V. A., Wingert, R. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Zebrafish+nephrogenesis+is+regulated+by+interactions+between+retinoic+acid%2C+mecom%2C+and+Notch+signaling%5BTitle%5D)+AND+%22Dev+Biol%22%5BJournal%5D)">Zebrafish nephrogenesis is regulated by interactions between retinoic acid, mecom, and Notch signaling.</a> Dev Biol. 386 (1), 111-122 (2014).</li>
<li>Wang, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((miR-34b+regulates+multiciliogenesis+during+organ+formation+in+zebrafish%5BTitle%5D)+AND+%22Development%22%5BJournal%5D)">miR-34b regulates multiciliogenesis during organ formation in zebrafish.</a> Development. 140, 2755-2764 (2013).</li>
<li>Marra, A. N., Wingert, R. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Epithelial+cell+fate+in+the+nephron+tubule+is+mediated+by+the+ETS+transcription+factors+etv5a+and+etv4+during+zebrafish+development%5BTitle%5D)+AND+%22Dev+Biol%22%5BJournal%5D)">Epithelial cell fate in the nephron tubule is mediated by the ETS transcription factors etv5a and etv4 during zebrafish development.</a> Dev Biol. 411 (2), 231-245 (2016).</li>
<li>Marra, A. N., Li, Y., Wingert, R. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Antennas+of+organ+morphogenesis%3A+the+roles+of+cilia+in+vertebrate+kidney+development%5BTitle%5D)+AND+%22Genesis%22%5BJournal%5D)">Antennas of organ morphogenesis: the roles of cilia in vertebrate kidney development.</a> Genesis. 54 (9), 457-469 (2016).</li>
<li>Duffy, J. L., Suzuki, Y. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Ciliated+human+renal+proximal+tubular+cells.+Observations+in+three+cases+of+hypercalcemia%5BTitle%5D)+AND+%22Am+J+Pathol%22%5BJournal%5D)">Ciliated human renal proximal tubular cells. Observations in three cases of hypercalcemia.</a> Am J Pathol. 53, 609-616 (1968).</li>
<li>Katz, S. M., Morgan, J. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Cilia+in+the+human+kidney%5BTitle%5D)+AND+%22Ultrastruct+Pathol%22%5BJournal%5D)">Cilia in the human kidney.</a> Ultrastruct Pathol. 6, 285-294 (1984).</li>
<li>Hassan, M. O., Subramanyan, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Ciliated+renal+tubular+cells+in+crescentic+glomerulonephritis%5BTitle%5D)+AND+%22Ultrastruct+Pathol%22%5BJournal%5D)">Ciliated renal tubular cells in crescentic glomerulonephritis.</a> Ultrastruct Pathol. 19, 201-203 (1995).</li>
<li>Ong, A. C., Wagner, B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Detection+of+proximal+tubular+motile+cilia+in+a+patient+with+renal+sarcoidosis+associated+with+hypercalcemia%5BTitle%5D)+AND+%22Am+J+Kidney+Dis%22%5BJournal%5D)">Detection of proximal tubular motile cilia in a patient with renal sarcoidosis associated with hypercalcemia.</a> Am J Kidney Dis. 45, 1096-1099 (2005).</li>
<li>Worthington, W. C., Cathcart, R. S. III <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Ependymal+cilia%3A+distribution+and+activity+in+the+adult+human+brain%5BTitle%5D)+AND+%22Science%22%5BJournal%5D)">Ependymal cilia: distribution and activity in the adult human brain.</a> Science. 139, 221-222 (1963).</li>
<li>Cowan, M. J., Galdwin, M. T., Shelhamer, J. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Disorders+of+ciliary+motility%5BTitle%5D)+AND+%22Am+J+Med+Sci%22%5BJournal%5D)">Disorders of ciliary motility.</a> Am J Med Sci. 321, 3-10 (2001).</li>
<li>Jain, R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Temporal+relationship+between+primary+and+motile+ciliogenesis+in+airway+epithelial+cells%5BTitle%5D)+AND+%22Am+J+Respir+Cell+Mol+Biol%22%5BJournal%5D)">Temporal relationship between primary and motile ciliogenesis in airway epithelial cells.</a> Am J Respir Cell Mol Biol. 43, 731-739 (2010).</li>
<li>Stubbs, J. L., Vladar, E. K., Axlerod, J. D., Kitner, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Multicilin+promotes+centriole+assembly+and+ciliogenesis+during+multiciliate+cell+differentiation%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Cell+Biol%22%5BJournal%5D)">Multicilin promotes centriole assembly and ciliogenesis during multiciliate cell differentiation.</a> Nat Cell Biol. 14, 140-147 (2012).</li>
<li>Tan, F. E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Myb+promotes+centriole+amplification+and+later+steps+of+the+multiciliogenesis+program%5BTitle%5D)+AND+%22Development%22%5BJournal%5D)">Myb promotes centriole amplification and later steps of the multiciliogenesis program.</a> Development. 140, 4277-4286 (2013).</li>
<li>Zhou, F., Narasimhan, V., Shboul, M., Chong, Y. L., Reversade, B., Roy, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Gmnc+is+a+master+regulator+of+the+multiciliated+cell+differentiation+program%5BTitle%5D)+AND+%22Curr+Biol%22%5BJournal%5D)">Gmnc is a master regulator of the multiciliated cell differentiation program.</a> Curr Biol. 25, 3267-3273 (2015).</li>
<li>Jowett, T. <a target="_blank" href="http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0091679X0861821X">Analysis of Protein and gene expression.</a> Methods Cell Biol. 59, 63-85 (1999).</li>
<li>Schulte-Merker, S. <a target="_blank" href="https://books.google.com/books?id=zS-5CKOjCIgC&pg=PA39&lpg=PA39&dq=Looking+at+Embryos+Schulte&source=bl&ots=mqm0o5OPaM&sig=usQ4HF0pGM7oova5E5Vwx0RBACw&hl=en&sa=X&ved=0ahUKEwji3oiZ7LjUAhXk8YMKHXJYDVkQ6AEIJjAA#v=onepage&q=Looking%20at%20Embryos%20Schulte&f=false">Chapter 2: Looking at Embryos.</a> Zebrafish: A practical approach. 261, 39-58 (2002).</li>
<li>Brend, T., Holley, S. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Zebrafish+whole+mount+high-resolution+double+fluorescent+in+situ+hybridization%5BTitle%5D)+AND+%22J+Vis+Exp%22%5BJournal%5D)">Zebrafish whole mount high-resolution double fluorescent in situ hybridization.</a> J Vis Exp. (25), (2009).</li>
<li>Lauter, G., Soll, I., Hauptmann, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Two-color+fluorescent+in+situ+hybridization+in+the+embryonic+zebrafish+brain+using+differential+detection+systems%5BTitle%5D)+AND+%22BMC+Dev+Biol%22%5BJournal%5D)">Two-color fluorescent in situ hybridization in the embryonic zebrafish brain using differential detection systems.</a> BMC Dev Biol. 11, (2011).</li>
<li>Drummond, B. E., Li, Y., Marra, A. N., Cheng, C. N., Wingert, R. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+tbx2a%2Fb+transcription+factors+direct+pronephros+segmentation+and+corpuscle+of+Stannius+formation+in+zebrafish%5BTitle%5D)+AND+%22Dev+Biol%22%5BJournal%5D)">The tbx2a/b transcription factors direct pronephros segmentation and corpuscle of Stannius formation in zebrafish.</a> Dev Biol. 421 (1), 52-66 (2017).</li>
<li>Jaffe, K. M., Thiberge, S. Y., Bisher, M. E., Burdine, R. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Imaging+cilia+in+zebrafish%5BTitle%5D)+AND+%22Methods+Cell+Biol%22%5BJournal%5D)">Imaging cilia in zebrafish.</a> Methods Cell Biol. 97, 415-435 (2010).</li>
<li>Lauter, G., Soll, I., Hauptmann, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Multicolor+fluorescent+in+situ+hybridization+to+define+abutting+and+overlapping+gene+expression+in+the+embryonic+zebrafish+brain%5BTitle%5D)+AND+%22Neural+Dev%22%5BJournal%5D)">Multicolor fluorescent in situ hybridization to define abutting and overlapping gene expression in the embryonic zebrafish brain.</a> Neural Dev. 6, (2011).</li>
<li>Sorrells, S., Toruno, C., Stewart, R. A., Jette, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Analysis+of+apoptosis+in+zebrafish+embryos+by+whole-mount+immunofluorescence+to+detect+activated+caspase+3%5BTitle%5D)+AND+%22J+Vis+Exp%22%5BJournal%5D)">Analysis of apoptosis in zebrafish embryos by whole-mount immunofluorescence to detect activated caspase 3.</a> J Vis Exp. (82), e51060(2013).</li>
<li>Schumacher, J. A., Zhao, E. J., Kofron, M. J., Sumanas, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Two-color+fluorescent+in+situ+hybridization+using+chromogenic+substrates+in+zebrafish%5BTitle%5D)+AND+%22Bio+Techniques%22%5BJournal%5D)">Two-color fluorescent in situ hybridization using chromogenic substrates in zebrafish.</a> Bio Techniques. 57, 254-256 (2014).</li>
<li>Julich, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((beamter%2FdeltaC+and+the+role+of+Notch+ligands+in+the+zebrafish+somite+segmentation%2C+hindbrain+neurogenesis+and+hypochord+differentiation%5BTitle%5D)+AND+%22Dev+Biol%22%5BJournal%5D)">beamter/deltaC and the role of Notch ligands in the zebrafish somite segmentation, hindbrain neurogenesis and hypochord differentiation.</a> Dev Biol. 286, 391-404 (2005).</li>
<li>Gross-Thebing, T., Paksa, A., Raz, E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Simultaneous+high-resolution+detection+of+multiple+transcripts+combined+with+localization+of+proteins+in+whole-mount+embryos%5BTitle%5D)+AND+%22BMC+Biology%22%5BJournal%5D)">Simultaneous high-resolution detection of multiple transcripts combined with localization of proteins in whole-mount embryos.</a> BMC Biology. 12, (2014).</li>
<li>Cheng, C. N., Li, Y., Marra, A. N., Verdun, V., Wingert, R. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Flat+Mount+Preparation+for+Observation+and+Analysis+of+Zebrafish+Embryo+Specimens+Stained+by+Whole+Mount+In+situ+Hybridization%5BTitle%5D)+AND+%22J+Vis+Exp%22%5BJournal%5D)">Flat Mount Preparation for Observation and Analysis of Zebrafish Embryo Specimens Stained by Whole Mount In situ Hybridization.</a> J Vis Exp. (89), e51604(2014).</li>
<li>Poureetezadi, S. J., Donahue, E. K., Wingert, R. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+Manual+Small+Molecule+Screen+Approaching+High-throughput+Using+Zebrafish+Embryos%5BTitle%5D)+AND+%22J+Vis+Exp%22%5BJournal%5D)">A Manual Small Molecule Screen Approaching High-throughput Using Zebrafish Embryos.</a> J Vis Exp. (93), e52063(2014).</li>
</ol>

作者无任何利益冲突需要披露。

上述方案经过优化，适用于在24小时受精后（hpf）的斑马鱼胚胎前肾管中对odf3b转录本和α-微管蛋白标记多纤毛细胞（MCCs）。为获得最佳结果，建议使用新鲜固定并制备的胚胎。若胚胎经固定后于-20 °C条件下保存在甲醇（MeOH）或Hyb+溶液中超过一周，仍可使用，但随着保存时间延长，非特异性背景染色的可能性会增加。
对该技术进行修改和故障排除是必要的，以便将该方法适用于其他特定标记组合，例如其他反义核糖探针和其他抗体。针对整体装片过程中各步骤参数调整的多种方法 原位 杂交已在我们团队及其他团队先前的研究中有所记载31,34,36,38,39同样，每种蛋白质抗体在染色时间方面均需进行一定的优化，而针对每种一抗的稀释比例和孵育时间的大致范围，最好通过评估已有文献记录的结果来确定。28,35对于年龄小于24 hpf的胚胎，pK处理时间应短于2分钟；而对于年龄大于24 hpf的胚胎，pK处理时间应长于2分钟。此外，年龄大于24 hpf的胚胎在pK处理前应进行色素漂白。
使用荧光染色液染色后，必须通过一系列甲醇和过氧化氢洗涤步骤，彻底去除残留的染料、抗体以及过氧化物酶。随后立即进行PBS洗涤，以清除胚胎中多余的甲醇。重要的是，在进行免疫荧光抗体操作之前，我们发现丙酮和去离子水洗涤可降低胚胎彼此之间或与离心管之间的黏附倾向。根据我们的经验，针对特定转录因子及其他基因的抗体，尽管在Western blot中可能具有良好的效果，但在斑马鱼的免疫荧光（IF）实验中效果不佳。然而，一些高度保守且丰度较高的蛋白，如α-微管蛋白（α-tubulin）和β-连环蛋白（β-catenin），在斑马鱼的免疫荧光实验中表现良好16,37。
利用FISH技术，可以对斑马鱼中尚无特异性抗体的基因的RNA转录本进行可视化观察。通过将FISH与IF相结合（如本方案所示），可实现RNA转录本与蛋白质的共定位检测 体内 (图2该方案的灵活性使其能够快速排查问题，从而在多种组织和时间点实现对各种RNA转录本和蛋白质的可视化。结合斑马鱼胚胎本身已被广泛认可的优势，FISH + IF方案为研究发育通路调控相关基因和蛋白质的表达提供了又一有力工具。

在过去的几十年中，斑马鱼（Danio rerio）已成为研究发育生物学的重要模式生物。其胚胎在母体外发育，且具有光学透明性。此外，眼睛、肾脏和前脑等重要器官的形成过程迅速，受精后24小时（hpf）内即可形成基本结构。尤为重要的是，斑马鱼基因组与哺乳动物高度保守1,2,3。同时，斑马鱼与哺乳动物的器官在解剖结构和生理功能上具有相似性。斑马鱼的胚胎肾脏（即前肾）体现了该模型系统在研究早期肾发生过程中基因功能以及脊椎动物肾单位中保守的上皮细胞群体命运决定方面的价值4,5,6,7,8,9,10。同样，斑马鱼胚胎在研究多纤毛细胞（MCCs）发生发育过程中的作用也日益重要11,12,13,14,15,16,17。
顾名思义，多纤毛细胞（MCCs）是一类上皮细胞，其特征是顶端表面具有一束可运动的纤毛17。在斑马鱼中，MCCs参与液体流动，并在受精后24小时（24 hpf）以类似“盐与胡椒”&#34;salt-and-pepper&#34;的分布方式散在分布于前肾每个肾单位的中段11,12,13,14,15,16,17。尽管目前仅在少数人类肾脏疾病病例中观察到MCCs的存在18,19,20,21，但MCCs在其他哺乳动物组织（如脑和气管）中则较为常见22,23,24，这为实验设计带来了诸多挑战。包括斑马鱼在内的多种脊椎动物模型中的精巧研究表明，MCC命运决定存在一条保守的发育通路，其中Notch信号通路可抑制MCC的发育12,17,25,26,27。因此，斑马鱼前肾为在活体（in vivo）条件下研究MCC发育的遗传机制提供了一个易于操作的模型系统11,12,13,14,15,16,17。
斑马鱼胚胎的透明性及其易于进行遗传操作的特性，在研究调控细胞命运、组织生长以及早期胚胎发育的遗传与分子通路时，已被证明具有极高的价值。1,2,3因此，传统的蛋白质和基因转录本可视化技术，例如 原位 杂交和整体免疫荧光染色已应用于斑马鱼并进行了优化16,28,29,30,31,32,33,34,35,36,37,38通过结合常用的FISH和IF实验方案，可以对MCCs进行标记和分析 体内16,28,37,38.

<table><tbody><tr><td>非特异性蛋白酶混合溶液</td><td>罗氏</td><td>11459643001，链霉菌蛋白酶（pronase from Streptomyces griseus）</td><td>在 E3 中稀释 &lt;强&gt;无&lt;/strong&gt; 亚甲蓝配制成50 mg/mL储存液；于-20℃保存&amp;deg;C</td></tr><tr><td>E3 溶液</td><td></td><td></td><td>将50倍浓缩的E3溶液（250 mM NaCl、8.5 mM KCl、16.5 mM CaCl₂、16.5 mM MgSO₄溶于蒸馏水中）用蒸馏水稀释；加入1 × 10⁻⁵ M亚甲蓝（sigma M9140）以抑制污染</td></tr><tr><td>三卡因（氨基苯甲酸乙酯甲磺酸盐）</td><td>Fluka</td><td>A5040-250G</td><td>配制0.2%的储存液：将1 g三卡因粉末溶于10 mL pH 9.5的Tris溶液中，再用蒸馏水定容至500 mL</td></tr><tr><td>胚胎培养皿</td><td>VWR</td><td>351029</td><td></td></tr><tr><td>5 mL 玻璃小瓶</td><td>Wheaton</td><td>225012</td><td></td></tr><tr><td>一次性塑料巴斯德吸管</td><td>VWR</td><td>414004-004</td><td></td></tr><tr><td>4% 多聚甲醛（PFA）溶液</td><td>电子显微镜服务</td><td>19210</td><td>将4% PFA溶于1×PBS中，在通风橱内加热至沸腾。冷却后分装，于-20℃保存&amp;deg;C. 解冻后请勿再次冷冻。</td></tr><tr><td>10X PBS</td><td>American Bioanalytical</td><td>AB11072</td><td>用蒸馏水稀释，配制成1X工作液</td></tr><tr><td>Tween-20 储存液</td><td>American Bioanalytical</td><td>AB02038</td><td>用蒸馏水稀释配制0.1% Tween-20储存液。</td></tr><tr><td>含0.1% Tween 20的1X磷酸盐缓冲液（PBST）</td><td>Sigma</td><td>P9416</td><td>1× PBS 中含 0.1% Tween-20</td></tr><tr><td>甲醇（MeOH）</td><td>Sigma</td><td>34860-4L</td><td></td></tr><tr><td>蛋白酶K</td><td>罗氏</td><td>3115879001</td><td>溶于蒸馏水中，配制成10 mg/mL的储存液；分装后于-20℃保存&amp;deg;C</td></tr><tr><td>平底微量离心管</td><td>VWR</td><td>87003-300; 87003-298</td><td></td></tr><tr><td>甲酰胺</td><td>American Bioanalytical</td><td>AB00600</td><td>-20储存&amp;deg;C</td></tr><tr><td>杂交溶液（HYB+）</td><td></td><td></td><td>50% 甲酰胺，5X SSC，0.1% Tween-20，5 mg/mL 酵母多聚 RNA，50 &amp;mu;克/&amp;mu;L 肝素；于 -20 ℃ 保存&amp;deg;C</td></tr><tr><td>杂交炉</td><td>Fisher Scientific</td><td>13-247-10Q</td><td></td></tr><tr><td>20X 盐水-柠檬酸钠（SSC）缓冲液</td><td>American Bioanalytical</td><td>AB13156</td><td>用蒸馏水稀释，配制成 2X 和 0.2X 储存液</td></tr><tr><td>封闭试剂溶液</td><td>罗氏</td><td>11096176001</td><td>用马来酸缓冲液稀释，配制成10%的储存液；4℃保存&amp;deg;C</td></tr><tr><td>马来酸缓冲液</td><td>Sigma</td><td>M0375 和 S7653</td><td>150 mM 马来酸，100 mM NaCl（pH 7.5）</td></tr><tr><td>抗地高辛-POD，Fab片段</td><td>罗氏</td><td>11207739910</td><td>4℃保存&amp;deg;C</td></tr><tr><td>Cy3荧光染色液</td><td>PerkinElmer, Inc.</td><td>NEL744001KT，TSA Plus Cyanin3 系统</td><td>4℃保存&amp;deg;C；通过将试剂盒中的TSA试剂（溶于60 μL DMSO中）用缓冲液按1:50比例新鲜配制染色液</td></tr><tr><td>过氧化氢（H2O2）</td><td>Sigma</td><td>H1009-500mL</td><td>4℃保存&amp;deg;C</td></tr><tr><td>分子生物学级蒸馏水（ddH₂O）</td><td>Mediatech</td><td>25-055-CM</td><td></td></tr><tr><td>丙酮</td><td>American Bioanalytical</td><td>AB00636-01000</td><td>在 -20 保存一份等分试样&amp;deg;C</td></tr><tr><td>DMSO</td><td>American Bioanalytical</td><td>AB00435-01000</td><td></td></tr><tr><td>胎牛血清（FBS）</td><td>Gibco</td><td>10438-034</td><td>分装并保存于 -20&amp;deg;C</td></tr><tr><td>单克隆抗乙酰化微管蛋白抗体 克隆 6-11B-1</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>T6793</td><td>分装并保存于 -20&amp;deg;C</td></tr><tr><td>抗-&amp;gamma;兔源抗-tubulin抗体</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>T5192</td><td>分装并储存在 -20&amp;deg;C</td></tr><tr><td>odf3b cDNA 克隆 MGC:63985</td><td>OpenBiosystems</td><td>图像：6792478</td><td>将细菌甘油菌种保存于 -80&amp;deg;C</td></tr><tr><td>NaCl</td><td>American Bioanalytical</td><td>AB01915-05000</td><td></td></tr><tr><td>Alexa Fluor 647 山羊抗兔 IgG</td><td>Life Technologies</td><td>A21245</td><td>4℃保存&amp;deg;C；避光保存</td></tr><tr><td>Alexa Fluor 488 山羊抗小鼠 IgG</td><td>Life Technologies</td><td>A11029</td><td>4℃保存&amp;deg;C；避光保存</td></tr><tr><td>DAPI</td><td>Life Technologies</td><td>D1306</td><td>分装并保存于 -20&amp;deg;C</td></tr><tr><td>载玻片</td><td>赛默飞世尔科技</td><td>4445</td><td></td></tr><tr><td>玻璃盖玻片</td><td>赛默飞世尔科技</td><td>12-540A</td><td>18 x 18 mm</td></tr><tr><td>精细镊子</td><td>Roboz</td><td>RS-1050</td><td>Dumont 镊子 55 型</td></tr><tr><td>封片剂</td><td>Polysciences, Inc.</td><td>18606，Aqua-Poly/Mount</td><td>4℃保存&amp;deg;C</td></tr><tr><td>共聚焦显微镜及配套软件</td><td></td><td></td><td>我们使用配备 NIS-elements AR 软件的尼康 C2plus 共聚焦显微镜</td></tr><tr><td>摇床</td><td>伯乐（Bio-Rad）</td><td>1660710EDU</td><td></td></tr></tbody></table>

通过整体荧光标记联合方案可视化斑马鱼中的多纤毛细胞 原位 杂交与免疫荧光

Visualizing Multiciliated Cells in the Zebrafish Through a Combined Protocol of Whole Mount Fluorescent In Situ Hybridization and Immunofluorescence

近年来，斑马鱼胚胎因其具有诸如 子宫外 胚胎发育与光学透明性。特别是，斑马鱼胚胎已成为研究脊椎动物肾脏器官发生以及多纤毛细胞（MCC）发育的重要模式生物。为了在斑马鱼胚胎肾脏中可视化多纤毛细胞，我们建立了一种整体荧光标记的联合实验方案 原位 荧光原位杂交（FISH）和整体免疫荧光（IF）技术，可实现高分辨率成像。本文描述了我们用于共定位RNA转录本与蛋白质的技术，作为一种通过分析多种谱系因子的表达来深入理解发育程序调控的工具。

野生型斑马鱼胚胎在24 hpf时固定，并立即按上述方法进行制备。图1展示了实验流程以及部分代表性发育阶段。步骤1-8概述的流程包括样本获取、固定以及对固定组织进行操作，以使用反义核糖探针标记内源性转录本，随后通过免疫荧光标记目标蛋白。流程中的步骤9指专门设计用于优化斑马鱼胚胎躯干部位成像的封片与成像技术。在步骤9的示意图中，我们展示了将组织置于载玻片上时的操作方法。在此步骤中，去除胚胎头部和卵黄球，将尾部置于载玻片和盖玻片之间，呈侧向排列。建议去除卵黄球和头部，以便更佳地观察前肾中驻留的多纤毛细胞（MCC）群体，因为卵黄球具有自发荧光，且会阻碍封片过程。
使用共聚焦显微镜获得的代表性图像见图2，该图展示了同一野生型胚胎在60倍放大倍数下的图像以及相同放大倍数下的数字放大图像。上方图层面板显示各个独立通道的图像，下方两个图层面板为这些成像数据的合并叠加图像。白色方框（左列图像中）标示出数字放大区域的范围（右列图像）。在数字放大的最终图层面板中，细胞核经DAPI标记，多纤毛细胞（MCCs）通过设计用于识别odf3b的反义RNA探针进行检测，其中γ-微管蛋白抗体标记基体，α-微管蛋白标记纤毛。在合并叠加图像的数字放大图中，黄色虚线圆圈标示一个MCC的边界，该细胞因含有odf3b转录本、多个基体和纤毛而被识别。相邻的单纤毛细胞以黄色点状圆圈标记，其识别依据为具有单个基体和单根纤毛的表型。
<img alt="胚胎免疫荧光工作流程图，显示固定、杂交和染色步骤。" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/56261/56261fig1.jpg" data-altupdatedat="1788250015000" data-alt="图1"> 
图1：实验流程示意图。 该流程图展示了一个实验工作流程，并配有关键阶段的示意图，其中雪花表示低温孵育，三条弯曲的线代表加热，时钟表示长时间孵育。该流程最短可在6天内完成（参见各阶段右上角标注的天数），但某些步骤可根据方案中的说明延长操作时间。图中详细绘制了封片过程，展示了最终位于载玻片与盖玻片之间的胚胎尾部。黑色虚线框标出了以60倍放大倍数成像的区域。<a href="https://cloudflare.jove.com/files/ftp_upload/56261/56261fig1large.jpg" target="_blank">请点击此处查看该图的放大版本。</a>
<img alt="野生型细胞的荧光显微镜图像，60倍放大；DAPI、odf3b、微管蛋白标记；比较分析。" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/56261/56261fig2.jpg" data-altupdatedat="1788250015000" data-alt="Figure 2"> 
图2：斑马鱼前肾多纤毛细胞（MCC）成像的代表性结果。 对24小时受精后（hpf）野生型斑马鱼胚胎进行60倍放大倍率的最大强度投影图像，以及同一胚胎在共聚焦显微镜下60倍数字放大的图像。白色方框标示了放大区域。各单独染色图像包括DAPI（细胞核）、odf3b（多纤毛细胞，MCCs）、γ-微管蛋白（基体）和α-微管蛋白（纤毛），分别标注后合并显示于下方两个图面板中。在数字放大图中，我们对细胞位置进行了如下近似标注：虚线黄色圆圈勾勒出一个多纤毛细胞，点线黄色圆圈勾勒出一个单纤毛细胞。<a href="https://cloudflare.jove.com/files/ftp_upload/56261/56261fig2large.jpg" target="_blank">请点击此处查看该图的高清版本。</a>

纤毛发育对正常器官形成至关重要。本方案描述了一种优化的方法，用于标记和观察斑马鱼的纤毛细胞。

近年来，斑马鱼胚胎因其体外胚胎发育等特性，已成为研究发育生物学的常用模型……

本实验方案的总体目标是对斑马鱼体内的多纤毛细胞进行标记和原位可视化。该方法有助于回答发育生物学领域的一些关键问题，例如，哪些因素调控胚胎期斑马鱼肾脏中的多纤毛细胞？该技术的主要优势在于可同时标记蛋白质和RNA转录本，这在缺乏斑马鱼特异性抗体的情况下尤为有用。我们在分析胚胎经过改造后纤毛的存在情况时，首次产生了使用该方法标记原肾中多纤毛细胞的想法。首先，在室温下无振荡条件下，用5毫升4%多聚甲醛固定受精后24小时的斑马鱼胚胎，固定时间为2至4小时。接着，用含0.1%吐温20的磷酸盐缓冲液（PBS）洗涤胚胎两次，随后用5毫升100%甲醇洗涤一次。然后，将胚胎在 5 毫升新鲜的 100% 乙醇中于 -20 摄氏度孵育至少 20 分钟。为准备杂交，将新生胚胎在 5 毫升 50% 甲醇与 PBST 的混合液中重新水化 5 分钟，随后在 5 毫升 30% 甲醇与 PBST 的混合液中继续孵育 5 分钟。用 5 毫升 PBST 洗涤胚胎两次，每次 5 分钟，并将胚胎立即在 5 毫升 1:1,000 的蛋白酶 K 与 PBST 溶液中孵育 2 分钟，随后再用 5 毫升 PBST 洗涤两次。在室温下，用5毫升4%多聚甲醛固定胚胎，时间不少于20分钟，随后用5毫升PBST 20洗涤两次。为促进胚胎与杂交溶液之间的相互作用，将胚胎转移至直立的平底微量离心管中，每管加入5毫升PBST，置于微量离心管架上，再用1.5毫升杂交溶液洗涤胚胎两次，每次5分钟。第二次洗涤后，将胚胎在1.5毫升新鲜杂交溶液中于70摄氏度的杂交炉中孵育4至6小时。然后，将杂交液替换为10微升目标RNA探针和500微升杂交液，在70摄氏度下进行过夜探针杂交。次日早晨，在70摄氏度下用1.5毫升含50%甲酰胺的2X SSC（盐酸钠-柠檬酸钠缓冲液）洗涤胚胎两次，每次20至30分钟。随后，在70摄氏度下用1.5毫升2X SSC单独洗涤胚胎一次，持续15分钟，再在70摄氏度下用1.5毫升0.2X SSC洗涤两次，每次20至30分钟。第二次洗涤后，加入1.5毫升封闭剂，于4摄氏度下过夜孵育。次日早晨，将封闭剂更换为0.2毫升封闭剂中含1:1,000比例的辣根过氧化物酶标记的抗地高辛抗体，于室温避光孵育3小时。随后，用1.5毫升马来酸缓冲液洗涤胚胎2至4次，每次洗涤10至15分钟，接着在1.5毫升新鲜马来酸缓冲液中于4摄氏度下过夜孵育。第二天早晨，将苹果酸缓冲液更换为1.5毫升PBS，用1.5毫升PBS洗涤胚胎两次，每次洗涤5分钟。将胚胎在0.2毫升Si3荧光染色液中孵育60分钟，随后用1.5毫升浓度递增的甲醇溶液连续洗涤四次，每次10分钟。最后一次孵育后，将胚胎在室温下置于1.5毫升含1%过氧化氢的甲醇溶液中孵育30分钟。随后，将胚胎在1.5毫升梯度降低的甲醇溶液中每次清洗10分钟，接着在1.5毫升PBS中清洗两次，每次5分钟。然后，将胚胎在1.5毫升双蒸水中清洗5分钟，随后在1.5毫升-20°C的丙酮中清洗7分钟。再将胚胎在另外1.5毫升双蒸水中清洗5分钟，最后在含有1% DMSO或PBDT的1.5毫升PBST中清洗5分钟。将胚胎置于含有10% FBS的1.5毫升PBDT中，在室温下于摇床上孵育两小时。随后，弃去PBDT和FBS，加入1.5毫升一抗溶液，在4°C条件下过夜孵育。次日早晨，先用含FBS和0.1摩尔氯化钠的1.5毫升PBDT在摇床上洗涤胚胎1分钟，随后用含FBS和氯化钠的1.5毫升PBDT在摇床上进行五次洗涤，每次30分钟。最后一次洗涤后，用1.5毫升仅含PBDT、FBS的溶液在摇床上室温孵育30分钟，随后在200微升相应二抗溶液中于4摄氏度避光过夜孵育。次日早晨，用1.5毫升PBDT溶液快速洗涤胚胎两次，然后在1.5毫升DAPI溶液中于摇床上孵育15分钟。接着，用含FBS和氯化钠的1.5毫升PBDT溶液洗涤胚胎三次，每次洗涤15至20分钟，最后将胚胎保存在1.5毫升PBDT溶液中，于4摄氏度避光保存。为了成像斑马鱼肾脏，将胚胎侧卧置于载玻片上，加入约10微升PBDT。使用一对精细镊子和解剖显微镜，挤压第一个胚胎的眼睛后方，以去除头部及部分卵黄球。然后，轻轻刮除胚胎体上残留的卵黄球。去除卵黄球时，注意不要触碰卵黄囊延伸部分，因为目标组织容易撕裂，且位于该延伸结构的正上方。用一片薄纸巾吸去载玻片上已解离的卵黄及多余液体。随后，在残留的尾部加一滴封片介质，并将尾部侧向放置。用盖玻片压平尾部，并将载玻片放入带盖的玻片盒中。随后，使用共聚焦显微镜的60倍物镜，在适当的荧光通道下对肾脏纤毛进行成像。在以下展示的经上述方法染色的斑马鱼胚胎代表性图像中，多纤毛细胞可根据用于检测ODF3B转录本表达的反义核糖探针信号、标记基体的配子微管蛋白以及标记纤毛的乙酰化α-微管蛋白来识别。事实上，在此放大倍数下观察胚胎前肾，可见一个具有 ODF3B 转录本、多个基体和纤毛的多纤毛细胞。相邻的单纤毛细胞则可通过其单一基体和单一纤毛的表型加以区分。在进行该操作时，务必使用新鲜固定的胚胎，并在加入第一抗体后，将样品避光保存，防止暴露于环境光线下。

visualizing-multiciliated-cells-zebrafish-through-combined-protocol

Research

科研

JoVE Journal

Developmental Biology

发育生物学

全贴装荧光原位杂交和免疫荧光法在斑马鱼中 Multiciliated 细胞的可视化

在本视频中，我们演示了一种利用共聚焦显微镜在单细胞分辨率下对活体斑马鱼胚胎中发育中的脊椎动物大脑进行分析的方法。该方法包括对单细胞斑马鱼胚胎进行显微注射，随后对发育中的大脑进行固定和成像的技术流程。...

活体斑马鱼胚胎大脑的共聚焦显微镜成像

整体原位杂交是发育生物学中最常用的技术之一。本文中，我们介绍一种高分辨率的双荧光原位杂交实验方案，用于分析单个基因的精确表达模式，并确定两个基因表达区域的重叠情况。我们同时包含碘化丙啶核复染步骤，以突出显示组织结构。...

斑马鱼全胚胎高分辨率双荧光标记 原位 杂交

本方案描述了在活体斑马鱼胚胎中对单个神经元或神经嵴细胞进行成像的方法。该方法利用荧光共聚焦延时显微镜观察细胞行为及肌动蛋白的定位。...

斑马鱼胚胎中单个神经元和神经嵴细胞的活体成像及肌动蛋白细胞骨架观察

理解塑造早期胚胎的形态发生过程的关键在于能够以高分辨率对细胞进行成像。本文介绍一种在完整斑马鱼胚胎中利用膜定位的绿色荧光蛋白对单个细胞或少量细胞簇进行标记的技术。...

斑马鱼后脑中细胞的标记与成像

本文介绍了一种对斑马鱼胚胎中组织特异性荧光进行半自动化成像的实验方案。...

斑马鱼胚胎中组织特异性荧光的半自动化成像

成像细胞器及其他亚细胞结构的动态行为 体内 可以揭示它们在生理和疾病状态下的功能。本文介绍了对两种细胞器——中心体和线粒体——进行遗传标记的方法，并利用宽场显微镜和共聚焦显微镜对活体斑马鱼胚胎中这些细胞器的动态行为进行成像。...

活体斑马鱼胚胎中亚细胞结构的成像

本文描述了在整只斑马鱼胚胎中对磷酸化表位进行免疫染色的技术，并进一步在小至初级纤毛的细胞结构中进行双色荧光共聚焦定位。这些固定和成像技术可用于确定特定蛋白质出现或激活的位置及其动力学特征。...

对整装斑马鱼胚胎纤毛器官中的磷酸化表位进行免疫染色

本方案展示了在早期斑马鱼胚胎冷冻切片上进行连续免疫荧光和免疫组织化学染色的方法，从而实现对特定细胞群体中蛋白共定位的精确分析。...

石蜡切片斑马鱼胚胎的连续免疫荧光与免疫组织化学染色

本文介绍了一种利用荧光抗体在斑马鱼胚胎和幼鱼整体样本中检测蛋白质的实验方案。...

斑马鱼胚胎和幼鱼的整体免疫组织化学染色

本方案描述了如何通过结合获取图像的方法 原位 斑马鱼胚胎切片的杂交与免疫组织化学 原位...

原位 杂交联合免疫组织化学在冰冻切片斑马鱼胚胎中的应用

学习全贴装荧光原位杂交和免疫荧光法在斑马鱼中可视化多纤毛细胞的技术。该方法可同时标记蛋白质和RNA转录本，适用于研究纤毛发育和器官发生机制。

通过整体荧光标记联合方案可视化斑马鱼中的多纤毛细胞原位杂交与免疫荧光

探索更多视频

通过整体荧光标记联合方案可视化斑马鱼中的多纤毛细胞 原位 杂交与免疫荧光

探索更多视频

通过整体荧光标记联合方案可视化斑马鱼中的多纤毛细胞原位杂交与免疫荧光