RNA-fluorescens in situ Hybridisering (FISH) för att visualisera mikrobiell kolonisering och infektion i Caenorhabditis elegans tarmar

Tarmmikrober, inklusive extracellulära bakterier och intracellulära patogener som Orsay-viruset och mikrosporidier (svampar), är ofta associerade med vilda Caenorhabditis-nematoder . Denna artikel presenterar ett protokoll för att upptäcka och kvantifiera mikrober som koloniserar och / eller infekterar C. elegans nematoder, och för att mäta patogenbelastning efter kontrollerade infektioner i laboratoriet.