RNA-fluorescens in situ-hybridisering (FISH) for at visualisere mikrobiel kolonisering og infektion i Caenorhabditis elegans tarme

Tarmmikrober, herunder ekstracellulære bakterier og intracellulære patogener som Orsay-virus og microsporidia (svampe), er ofte forbundet med vilde Caenorhabditis nematoder. Denne artikel præsenterer en protokol til påvisning og kvantificering af mikrober, der koloniserer og / eller inficerer C. elegans nematoder, og til måling af patogenbelastning efter kontrollerede infektioner i laboratoriet.