Name: Amplikon-Sequenzierung mit den Long-Read-Sequenzierungstechnologien (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2025-08-29T13:40:00.000+00:00
Duration: 8 min 57 s
Description: Erfahren Sie, wie portable Long-Read-Sequenzierung die Diagnose von multiresistenter Tuberkulose in ressourcenarmen Regionen ermöglicht. Diese Methode liefert genaue Resistenzprofile ohne Bioinformatik-Expertise.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

<ol><li>Tuberculosis report. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=%22Baltimore+Health+News%22">Baltimore Health News</a>. , WHO. (2022).</li>
<li>WHO Malaria Department report. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=%22Report+20-23%22">Report 20-23</a>. , WHO. (2023).</li>
<li><a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=%22The+End+Strategy+TB%22">The End Strategy TB</a>. 53 (1), WHO. 1689-1699 (2015).</li>
<li>Cabibbe, A. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Application+of+targeted+nextgeneration+sequencing+assay+on+a+portable+sequencing+platform+for+culturefree+detection+of+drugresistant+tuberculosis+from+clinical+samples%5BTitle%5D)+AND+%22J+Clin+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Application of targeted nextgeneration sequencing assay on a portable sequencing platform for culturefree detection of drugresistant tuberculosis from clinical samples.</a> J Clin Microbiol. 58 (10), e0063220(2020).</li>
<li>Jouet, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Deep+amplicon+sequencing+for+culturefree+prediction+of+susceptibility+or+resistance+to+13+antituberculous+drugs%5BTitle%5D)+AND+%22Eur+Respir+J%22%5BJournal%5D)">Deep amplicon sequencing for culturefree prediction of susceptibility or resistance to 13 antituberculous drugs.</a> Eur Respir J. 57 (3), 2002338(2021).</li>
<li>NG, K. C. S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((How+well+do+routine+molecular+diagnostics+detect+Rifampin%5BTitle%5D)+AND+%22J+Clin+Microbiol%22%5BJournal%5D)">How well do routine molecular diagnostics detect Rifampin.</a> J Clin Microbiol. 57 (1), e0128723(2019).</li>
<li>MacLean, E., Kohli, M., Weber, S. F., Suresh, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Advances+in+molecular+diagnosis+of+tuberculosis%5BTitle%5D)+AND+%22J+Clin+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Advances in molecular diagnosis of tuberculosis.</a> J Clin Microbiol. 58 (10), e0158219(2020).</li>
<li>Sibandze, D. B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Rapid+molecular+diagnostics+of+tuberculosis+resistance+by+targeted+stool+sequencing%5BTitle%5D)+AND+%22Genome+Med%22%5BJournal%5D)">Rapid molecular diagnostics of tuberculosis resistance by targeted stool sequencing.</a> Genome Med. 14 (1), 42(2022).</li>
<li>Shah, M., Chihota, V., Coetzee, G., Churchyard, G., Dorman, S. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Comparison+of+laboratory+costs+of+rapid+molecular+tests+and+conventional+diagnostics+for+detection+of+tuberculosis+and+drugresistant+tuberculosis+in+South+Africa%5BTitle%5D)+AND+%22BMC+Infect.+Dis%22%5BJournal%5D)">Comparison of laboratory costs of rapid molecular tests and conventional diagnostics for detection of tuberculosis and drugresistant tuberculosis in South Africa.</a> BMC Infect. Dis. 13 (1), 352(2013).</li>
<li>Hu, T., Chitnis, N., Monos, D., Dinh, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Nextgeneration+sequencing+technologies%3A+An+overview%5BTitle%5D)+AND+%22Hum+Immunol%22%5BJournal%5D)">Nextgeneration sequencing technologies: An overview.</a> Hum Immunol. 82 (10), 801-811 (2021).</li>
<li>Pervez, M. T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+comprehensive+review+of+performance+of+nextgeneration+sequencing+platforms%5BTitle%5D)+AND+%22Biomed+Res+Int%22%5BJournal%5D)">A comprehensive review of performance of nextgeneration sequencing platforms.</a> Biomed Res Int. 2022, 3457806(2022).</li>
<li>Tafess, K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Targetedsequencing+workflows+for+comprehensive+drug+resistance+profiling+of+Mycobacterium+tuberculosis+cultures+using+two+commercial+sequencing+platforms%3A+Comparison+of+analytical+and+diagnostic+performance%2C+turnaround+time%2C+and+cost%5BTitle%5D)+AND+%22Clin+Chem%22%5BJournal%5D)">Targetedsequencing workflows for comprehensive drug resistance profiling of Mycobacterium tuberculosis cultures using two commercial sequencing platforms: Comparison of analytical and diagnostic performance, turnaround time, and cost.</a> Clin Chem. 66 (6), 809-820 (2020).</li>
<li>Use of targeted nextgeneration sequencing to detect drugresistant tuberculosis. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=%22WHO+rapid+communication%22">WHO rapid communication</a>. , WHO. https://www.who.int/publications/i/item/9789240076372 (2023).</li>
<li>Hazra, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Impact+of+wholegenome+sequencing+of+Mycobacterium+tuberculosis+on+treatment+outcomes+for+MDRTB%2FXDRTB%3A+A+systematic+review%5BTitle%5D)+AND+%22Pharmaceutics%22%5BJournal%5D)">Impact of wholegenome sequencing of Mycobacterium tuberculosis on treatment outcomes for MDRTB/XDRTB: A systematic review.</a> Pharmaceutics. 15 (6), 1408(2023).</li>
<li>Shea, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Comprehensive+wholegenome+sequencing+and+reporting+of+drug+resistance+profiles+on+clinical+cases+of+Mycobacterium+tuberculosis+in+New+York+State%5BTitle%5D)+AND+%22J+Clin+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Comprehensive wholegenome sequencing and reporting of drug resistance profiles on clinical cases of Mycobacterium tuberculosis in New York State.</a> J Clin Microbiol. 55 (6), 1871-1882 (2017).</li>
<li>Meehan, C. J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Whole+genome+sequencing+of+Mycobacterium+tuberculosis%3A+Current+standards+and+open+issues%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Rev+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Whole genome sequencing of Mycobacterium tuberculosis: Current standards and open issues.</a> Nat Rev Microbiol. 17 (10), 533-545 (2019).</li>
<li>Heupink, T. H., Verboven, L., Warren, R. M., Van Rie, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Comprehensive+and+accurate+genetic+variant+identification+from+contaminated+and+lowcoverage+Mycobacterium+tuberculosis+whole+genome+sequencing+data%5BTitle%5D)+AND+%22Microb+Genom%22%5BJournal%5D)">Comprehensive and accurate genetic variant identification from contaminated and lowcoverage Mycobacterium tuberculosis whole genome sequencing data.</a> Microb Genom. 7 (1), e000555(2021).</li>
<li>Wang, X., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Interpretation+of+the+third+edition+of+WHO+consolidated+guidelines+on+tuberculosis%3A+Module+3%3A+Diagnosis%3A+Rapid+diagnostics+for+tuberculosis+detection%5BTitle%5D)+AND+%22Chin+J+Antituberc%22%5BJournal%5D)">Interpretation of the third edition of WHO consolidated guidelines on tuberculosis: Module 3: Diagnosis: Rapid diagnostics for tuberculosis detection.</a> Chin J Antituberc. 46 (2), 120-130 (2024).</li>
<li>Kambli, P., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Targeted+nextgeneration+sequencing+directly+from+sputum+for+comprehensive+genetic+information+on+drugresistant+Mycobacterium+tuberculosis%5BTitle%5D)+AND+%22Tuberculosis%22%5BJournal%5D)">Targeted nextgeneration sequencing directly from sputum for comprehensive genetic information on drugresistant Mycobacterium tuberculosis.</a> Tuberculosis. 127 (1), 102051(2021).</li>
<li>Use of targeted nextgeneration sequencing to detect drugresistant tuberculosis. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=%22Rapid+Communication%22">Rapid Communication</a>. , WHO. 1-8 (2023).</li>
<li>Nandlal, L., Perumal, R., Naidoo, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Rapid+molecular+assays+for+the+diagnosis+of+drugresistant+tuberculosis%5BTitle%5D)+AND+%22Infect+Drug+Resist%22%5BJournal%5D)">Rapid molecular assays for the diagnosis of drugresistant tuberculosis.</a> Infect Drug Resist. 15 (1), 4971-4984 (2022).</li>
<li>Dippenaar, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Nanopore+sequencing+for+Mycobacterium+tuberculosis%3A+A+critical+review+of+the+literature%2C+new+developments%2C+and+future+opportunities%5BTitle%5D)+AND+%22J+Clin+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Nanopore sequencing for Mycobacterium tuberculosis: A critical review of the literature, new developments, and future opportunities.</a> J Clin Microbiol. 60 (5), e0123422(2022).</li>
<li>Chan, W. S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Rapid+and+economical+drug+resistance+profiling+with+nanopore+MinION+for+clinical+specimens+with+low+bacillary+burden+of+Mycobacterium+tuberculosis%5BTitle%5D)+AND+%22BMC+Res+Notes%22%5BJournal%5D)">Rapid and economical drug resistance profiling with nanopore MinION for clinical specimens with low bacillary burden of Mycobacterium tuberculosis.</a> BMC Res Notes. 13 (1), 123(2020).</li>
<li>Feuerriegel, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Rapid+genomic+first+and+secondline+drug+resistance+prediction+from+clinical+Mycobacterium+tuberculosis+specimens+using+DeeplexMycTB%5BTitle%5D)+AND+%22Eur+Respir+J%22%5BJournal%5D)">Rapid genomic first and secondline drug resistance prediction from clinical Mycobacterium tuberculosis specimens using DeeplexMycTB.</a> Eur Respir J. 57 (4), 2004784(2021).</li>
<li>GenoScreen product brochure. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=%22Deeplex+MycTB%22">Deeplex MycTB</a>. , GenoScreen. (2023).</li>
<li>Mtafya, B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+practical+approach+to+render+tuberculosis+samples+safe+for+application+of+tuberculosis+molecular+bacterial+load+assay+in+clinical+settings+without+a+biosafety+level+3+laboratory%5BTitle%5D)+AND+%22Tuberculosis%22%5BJournal%5D)">A practical approach to render tuberculosis samples safe for application of tuberculosis molecular bacterial load assay in clinical settings without a biosafety level 3 laboratory.</a> Tuberculosis. 138 (1), 102194(2023).</li>
<li>Suganthi, P., Usharani, B., Venkateswari, R., Muthuraj, M. Biosafety practices in mycobacteriology laboratory. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aSuganthi%2C+P+%22Research+Advances+in+Microbiology+and+Biotechnology%22">Research Advances in Microbiology and Biotechnology</a>. 3, B P International (a part of SCIENCEDOMAIN International). Chennai. 1-39 (2023).</li>
<li>consolidated guidelines on tuberculosis. Module 4: Treatment and care. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=%22WHO+guideline%22">WHO guideline</a>. , WHO. (2022).</li>
<li>Williams, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Matrixbased+DNA+extraction+for+targeted+nextgeneration+sequencing+on+decontaminated+sputum+samples%5BTitle%5D)+AND+%22J+Vis+Exp%22%5BJournal%5D)">Matrixbased DNA extraction for targeted nextgeneration sequencing on decontaminated sputum samples.</a> J Vis Exp. (181), e68147(2025).</li>
<li>Delahaye, C., Nicolas, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Sequencing+DNA+with+nanopores%3A+Troubles+and+biases%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+One%22%5BJournal%5D)">Sequencing DNA with nanopores: Troubles and biases.</a> PLoS One. 16 (2), e0245534(2021).</li>
<li>Zhao, K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Rapid+identification+of+drugresistant+tuberculosis+genes+using+direct+PCR+amplification+and+Oxford+Nanopore+Technology+sequencing%5BTitle%5D)+AND+%22Can+J+Infect+Dis+Med+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Rapid identification of drugresistant tuberculosis genes using direct PCR amplification and Oxford Nanopore Technology sequencing.</a> Can J Infect Dis Med Microbiol. 2022, 8845672(2022).</li>
<li>Tagliani, E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Culture+and+nextgeneration+sequencingbased+drug+susceptibility+testing+unveil+high+levels+of+drugresistantTB+in+Djibouti%3A+Results+from+the+first+national+survey%5BTitle%5D)+AND+%22Sci+Rep%22%5BJournal%5D)">Culture and nextgeneration sequencingbased drug susceptibility testing unveil high levels of drugresistantTB in Djibouti: Results from the first national survey.</a> Sci Rep. 7 (1), 15076(2017).</li>
<li>Smith, C., Halse, T. A., Shea, J., Modestil, H., Fowler, R. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Assessing+nanopore+sequencing+for+clinical+diagnostics%3A+For+Mycobacterium+tuberculosis%5BTitle%5D)+AND+%22J+Clin+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Assessing nanopore sequencing for clinical diagnostics: For Mycobacterium tuberculosis.</a> J Clin Microbiol. 59 (7), e0123421(2021).</li>
</ol>

<table><tbody><tr><td>15 mL & 1,5 mL oder 2 mL Lo-Bindungsröhren</td><td>Eppendorf</td><td>EP0030108051-250EA</td><td></td></tr><tr><td>1kb-Leiter</td><td>Thermo Fisher Scientific</td><td>SM0311</td><td></td></tr><tr><td>2-mL Schraubkappenröhren</td><td>Scientific Specialties Inc</td><td>P2TUB056C-0001,5ST</td><td></td></tr><tr><td>2 mm sterile Glasperlen</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>Z273627-1EA</td><td></td></tr><tr><td>AMPure XP Bead</td><td>Beckman Colter</td><td>A63881</td><td></td></tr><tr><td>Deeplex Myc-TB&nbsp;</td><td>GenoScreen</td><td>20090205</td><td></td></tr><tr><td>Elektrophoresekammer</td><td>Thermo Fisher Scientific</td><td>A25977</td><td></td></tr><tr><td>Ethylalkohol, Pure</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>E7023-500ML</td><td></td></tr><tr><td>FastPrep-Homogenisierer</td><td>MP Biomedizin</td><td>116005500</td><td></td></tr><tr><td>Filterpipettenspitzen (10 & micro; L)&nbsp;</td><td>Bio-Smart Scientific</td><td>FT-10-R</td><td></td></tr><tr><td>Filterpipettenspitzen (1000 & micro; L)&nbsp;</td><td>Bio-Smart Scientific</td><td>FT-1000-R</td><td></td></tr><tr><td>Filterpipettenspitzen (20 & micro; L)&nbsp;</td><td>Bio-Smart Scientific</td><td>FT-20-R</td><td></td></tr><tr><td>Filterpipettenspitzen (200 & micro; L)&nbsp;</td><td>Bio-Smart Scientific</td><td>FT-200-R</td><td></td></tr><tr><td>Flow-cell&nbsp;</td><td>Oxford Nanopore Technologien</td><td>FLO-MIN114</td><td></td></tr><tr><td>Heizblock</td><td>Eppendorf</td><td>5382000031</td><td></td></tr><tr><td>InstaGen-Matrix</td><td>Bio-Rad</td><td>BBRD7326030</td><td></td></tr><tr><td>Magnetisches Rack&nbsp;</td><td>Thermo Fisher Scientific&nbsp;</td><td>12321D</td><td></td></tr><tr><td>Mikrozentrifuge</td><td>Eppendorf&nbsp;</td><td>5406000046</td><td></td></tr><tr><td>Günstling</td><td>Oxford Nanopore Technologien</td><td>MK1B</td><td></td></tr><tr><td>Native-Barcoding-Kit V14&nbsp;</td><td>Oxford Nanopore Technologien</td><td>SQK-NBD114.24</td><td></td></tr><tr><td>NEB Blunt/TA Ligase Master Mix</td><td>SCHNABEL</td><td>M0367</td><td></td></tr><tr><td>NEBNext Schnellligationsmodul</td><td>SCHNABEL</td><td>E6056</td><td></td></tr><tr><td>NEBNext Ultra II End-Reparatur-/dA-Tailing-Modul</td><td>SCHNABEL</td><td>E7546</td><td></td></tr><tr><td>Nukleasefreies Wasser (NFW)</td><td>Thermo Fisher Scientific</td><td>AM9937</td><td></td></tr><tr><td>Pipetten (P10, P20, P200 und P1000)</td><td>Eppendorf</td><td>EP3123000918-1EA</td><td></td></tr><tr><td>Qubit-Assay-Röhren</td><td>Thermo Fisher Scientific</td><td>Q32856</td><td></td></tr><tr><td>Qubit dsDNA HS Assay Kit</td><td>Thermo Fisher Scientific</td><td>Q33231</td><td></td></tr><tr><td>Qubit-Fluorometer</td><td>Thermo Fisher Scientific</td><td>Q33226</td><td></td></tr><tr><td>SYBR Safe DNA-Gel-Stamm</td><td>Thermo Fisher Scientific</td><td>S33102</td><td></td></tr><tr><td>UltraPure Agarose</td><td>Thermo Fisher Scientific</td><td>17852</td><td></td></tr><tr><td>Universal Hood III transilluminator (Molecular Imager Gel Doc XR System)</td><td>Bio-Rad</td><td>170-8170</td><td></td></tr><tr><td>Vortex-Mixer</td><td>Lasec</td><td>WMBB0L0E0216</td><td></td></tr></tbody></table>

amplikon-sequenzierung mit den long-read-sequenzierungstechnologien

Amplicon Sequencing using the Long-Read Sequencing Technologies

Amplikon-Sequenzierung mit den Long-Read-Sequenzierungstechnologien

The World Health Organization (WHO) continues to emphasize the urgent need for a rapid, cost-effective, and user-friendly diagnostic method for ...

amplicon-sequencing-using-the-long-read-sequencing-technologies

Research

Forschung

JoVE Journal

Biochemistry

Biochemie

Hier beschreiben wir ein Verfahren zur Herstellung der beiden einzigen gelesen und gepaart Ende Illumina mRNA-Seq-Sequenzierung Bibliotheken zur Genexpressionsanalyse auf T7 lineare RNA-Amplifikation basieren. Dieses Protokoll erfordert nur 10 Nanogramm ab Gesamt-RNA und erzeugt sehr konsistent Bibliotheken für ganze Transkripte.

Single Read und Paired End mRNA-Seq Illumina Bibliotheken von 10 Nanogramm Gesamt-RNA

Die Charakterisierung der mikrobiellen Gemeinschaft ist ein langjähriges Ziel in der Umweltmikrobiologie. Next-Generation-Sequencing-Methoden ermöglichen nun die Charakterisierung mikrobieller Gemeinschaften in einer noch nie dagewesenen Tiefe mit minimalem Kosten- und Arbeitsaufwand. Wir beschreiben hier unseren Ansatz zur Sequenzierung bakterieller ribosomaler 16S-RNA-Gene mit einem Tischsequenzierer.

Next-Generation-Sequenzierung der ribosomalen 16S-RNA Gene Amplikons

Dieses Protokoll beschreibt eine Methode für die Zuordnung Pre-mRNA 3' End-Verarbeitung Websites.

3' Ende Sequenzierung Bibliothek Vorbereitung mit A-seq2

In voller Länge individuelle proviralen Sequenzierung (FLIPS) bietet eine effiziente und Hochdurchsatz-Methode für die Verstärkung und die Abfolge der einzelnen, in der Nähe von Full-Length (intakt und Defekte) HIV-1-Proviruses und ermöglicht die Bestimmung ihres Potenzials Replikation-Kompetenz. FLIPS überwindet Grenzen der früheren Assays entwickelt, um die latente HIV-1-Reservoir-Sequenz.

Verstärkung des in der Nähe von Full-Length HIV-1 Proviruses für Next Generation Sequencing

Long-Read Sequenzen erleichtern erheblich die Montage komplexer Genome und Charakterisierung von strukturellen Variation. Wir beschreiben eine Methode um ultra-lange Sequenzen durch Sequenzierung Nanopore-basierte Plattformen zu generieren. Das Konzept nimmt eine optimierte DNA-Extraktion, gefolgt von modifizierten Bibliothek Vorbereitungen, Hunderte von Kilobase liest mit moderaten Abdeckung aus menschlichen Zellen zu generieren.

Ultra-lange lesen Sequenzierung für ganze genomische DNA-Analysen

Die Nanopore-Sequenzierung ist eine neuartige Technologie, die eine kostengünstige Sequenzierung an entfernten Orten und ressourcenarmen Umgebungen ermöglicht. Hier stellen wir ein Protokoll zur Sequenzierung von mRNAs aus Vollblut vor, das mit solchen Bedingungen kompatibel ist.

Sequenzierung von mRNA aus Vollblut mit Nanopore-Sequenzierung

Dieses Protokoll beschreibt einen Arbeitsablauf von Ex-vivo - oder In-vitro-Zellkulturen bis hin zur transkriptomischen Datenvorverarbeitung für ein kostengünstiges Transkriptom-basiertes Wirkstoff-Screening.

Kosteneffizientes transkriptomisches Wirkstoff-Screening

Die aktuelle Studie beschreibt einen Workflow für die Nanoporensequenzierung von Plasmiden, wenn die chromosomale Sequenz bereits bekannt oder von Interesse ist. Ein anfänglicher Plasmid-DNA-Anreicherungsschritt sorgt für eine optimale Plasmidsequenztiefe und maximiert die Anzahl der pro Flusszelle sequenzierbaren Proben.

Langlesen-Plasmid-Sequenzierung und -Montage mit Workflows auf Basis von Nanoporensequenzierungen

Die vorliegende Studie beschreibt eine einfache Methode zur Erkennung von endogenen Ebenen der Rab10 Phosphorylierung von Leucin-reiche wiederholen Kinase 2.

Rab10 Phosphorylierung Erkennung von LRRK2 Aktivität mit SDS-PAGE mit einem Phosphat-Bindung

Eines der schwierigsten Stressbedingungen, die Organismen im Laufe ihres Lebens zu begegnen bedeutet die Anhäufung von Oxidantien. Bei oxidativem Stress Zellen auf Molekulare Chaperone angewiesen. Hier präsentieren wir Ihnen Methoden zu untersuchen, die Redox-regulierte Anti-Aggregation Tätigkeit, als auch strukturelle Veränderungen, die EZB der Chaperon-Funktion mit HDX-MS zu überwachen.

Hsp33 des Redox-regulierten Chaperon Aktivität definieren und Mapping Konformationsänderungen auf Hsp33 mit Wasserstoff-Deuterium Austausch Massenspektrometrie

Erfahren Sie, wie portable Long-Read-Sequenzierung die Diagnose von multiresistenter Tuberkulose in ressourcenarmen Regionen ermöglicht. Diese Methode liefert genaue Resistenzprofile ohne Bioinformatik-Expertise.

Amplikon-Sequenzierung mit den Long-Read-Sequenzierungstechnologien

Weitere Videos entdecken