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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Aquí, presentamos un método TGA modificado para la estimación del contenido de lignina en biomasa vegetal herbácea. Este método estima el contenido de lignina formando enlaces específicos de tioéter con lignina y presenta una ventaja sobre el método de Klason, ya que requiere una muestra relativamente pequeña para la estimación del contenido de lignina.
La lignina es un polímero natural que es el segundo polímero más abundante en la Tierra después de la celulosa. La lignina se deposita principalmente en las paredes celulares secundarias de las plantas y es un heteropolímero aromático compuesto principalmente por tres monolignoles con una importancia industrial significativa. La lignina juega un papel importante en el crecimiento y desarrollo de las plantas, protege de las tensiones bióticas y abióticas, y en la calidad del forraje, la madera y los productos industriales de lignina. La estimación precisa del contenido de lignina es esencial tanto para la comprensión fundamental de la biosíntesis de lignina como para las aplicaciones industriales de la biomasa. El método del ácido tioglicólico (TGA) es un método altamente confiable de estimar el contenido total de lignina en la biomasa vegetal. Este método estima el contenido de lignina formando tioéteres con los grupos de alcohol bencílico de lignina, que son solubles en condiciones alcalinas e insolubles en condiciones ácidas. El contenido total de lignina se estima utilizando una curva estándar generada a partir de lignina de bambú comercial.
La lignina es uno de los componentes de carga vitales de las paredes celulares de las plantas y el segundo polímero más abundante en la Tierra1. Químicamente, la lignina es un heteropolímero reticulado compuesto por compuestos fenólicos complejos de alto peso molecular que forman una fuente natural renovable de polímeros aromáticos y síntesis de biomateriales2,3. Este polímero natural juega un papel importante en el crecimiento de las plantas, el desarrollo, la supervivencia, el soporte mecánico, la rigidez de la pared celular, el transporte de agua, el transporte de minerales, la resistencia al alojamiento, el desarrollo de tejidos y órganos, la deposición de energía y la protección contra tensiones bióticas y abióticas4,5,6,7. La lignina se compone principalmente de tres monolignoles diferentes: alcoholes de coniferilo, sinapilo y p-coumaril que se derivan de la vía proanoide fenilo8,9. La cantidad de lignina y la composición de los monómeros varían según la especie vegetal, el tipo de tejido/órgano y las diferentes etapas del desarrollo de las plantas10. La lignina se clasifica ampliamente en lignina de madera blanda, madera dura y hierba en función de la fuente y la composición del monolignol. La madera blanda se compone principalmente de alcohol de coniferilo en un 95% con un 4% de p-coumaryl y un 1% de alcoholes sinapílicos. La madera dura tiene alcoholes de coniferilo y sinapilo en proporciones iguales, mientras que la lignina de hierba está compuesta por varias proporciones de alcoholes de coniferilo, sinapilo y p-coumarílico11,12. La composición de los monómeros es crítica, ya que determina la resistencia a la lignina, la descomposición y la degradación de la pared celular, así como la determinación de la estructura molecular, la ramificación y la reticulación con otros polisacáridos13,14.
La investigación de la lignina está ganando importancia en forrajeo, industrias textiles, industrias papeleras, y para bioetanol, biocombustibles y bioproductos debido a su bajo costo y alta abundancia15,16. Se utilizaron varios métodos químicos (por ejemplo, bromuro de acetilo, detergentes ácidos, Klason y oxidación de permanganato) junto con métodos instrumentales (por ejemplo, espectroscopia de infrarrojo cercano (NIR), espectroscopia de resonancia magnética nuclear (RMN) y espectrofotometría ultravioleta (UV)) para la cuantificación de lignina9,17. Los métodos de análisis de lignina generalmente se clasifican en función de la radiación electromagnética, la gravimetría y la solubilidad. El principio detrás de la estimación de la lignina por radiación electromagnética se basó en la propiedad química de la lignina por la cual absorbe la luz en longitudes de onda específicas. Estos resultados fueron estimados basados en el principio que la lignina tiene una absorbancia ULTRAVIOLETA más fuerte que carbohidratos. En 1962, Bolker y Somerville utilizaron pellets de cloruro de potasio para estimar el contenido de lignina en la madera18. Sin embargo, este método tiene inconvenientes en la estimación del contenido de lignina a partir de muestras herbáceas debido a la presencia de compuestos fenólicos no lignina y la ausencia de un coeficiente de extinción adecuado. En 1970, Fergus y Goring encontraron que los máximos de absorción de los compuestos de guaiacyl y syringyl estaban en 280 nm y 270 nm, lo que corrigió el problema del coeficiente de extinción del método Bolker y Somerville19. Más tarde, la espectroscopia infrarroja, una técnica altamente sensible para caracterizar fenólicos, también se utilizó para la estimación de lignina con una pequeña cantidad de muestras de biomasa vegetal. Un ejemplo de esta tecnología fue la espectrofotometría de transformada de Fourier de reflectancia difusa. Este método, sin embargo, carece de un estándar adecuado similar al método UV20. Más tarde, el contenido de lignina fue estimado por NIRS (espectroscopia de infrarrojo cercano) y RMN (espectroscopia de resonancia magnética nuclear). Aunque, hay desventajas en estos métodos, no alteran la estructura química de la lignina, conservando su pureza20.
El método gravimétrico de Klason es un método analítico directo y más fiable para la estimación de lignina de tallos leñosos. La base para la estimación gravimétrica de la lignina es la hidrólisis/solubilización de compuestos no lignínicos y la recolección de lignina insoluble para gravimetría21. En este método, los hidratos de carbono se eliminan por hidrólisis de la biomasa con H2 CONCENTRADO2SO4 para extraer residuos de lignina20,22. El contenido de lignina estimado por este método se conoce como lignina insoluble en ácido o lignina Klason. La aplicación del método Klason depende de la especie de planta, el tipo de tejido y el tipo de pared celular. La presencia de cantidades variables de componentes no lignínicos como taninos, polisacáridos y proteínas, da lugar a diferencias proporcionales en la estimación del contenido de lignina insoluble/soluble en ácido. Por lo tanto, el método de Klason sólo se recomienda para la estimación de lignina de biomasa con alto contenido de lignina, como los tallos leñosos17,23. Los métodos de solubilidad como el bromuro de acetilo (AcBr), la lignina insoluble en ácido y el ácido tioglicólico (TGA) son los métodos más comúnmente utilizados para estimar el contenido de lignina de varias fuentes de biomasa vegetal. Kim et al. establecieron dos métodos para la extracción de lignina por solubilización. El primer método extrae lignina como residuo insoluble solubilizando celulosa y hemicelulosa, mientras que el segundo método separa la lignina en la fracción soluble, dejando la celulosa y la hemicelulosa como residuo insoluble24.
Métodos similares empleados en la estimación de la lignina basados en la solubilidad son los métodos del ácido tioglicólico (TGA) y del bromuro de acetilo (AcBr)25. Tanto los métodos de TGA como los de bromuro de acetilo estiman el contenido de lignina midiendo la absorbancia de la lignina solubilizada a 280 nm; sin embargo, el método AcBr degrada los xilanos durante el proceso de solubilización de lignina y muestra un falso aumento en el contenido de lignina26. El método del tioglicolato (TGA) es el método más confiable, ya que depende de la unión específica con los grupos de tioéter de los grupos de alcohol bencílico de lignina con TGA. La lignina unida a TGA se precipita en condiciones ácidas utilizando HCl, y el contenido de lignina se estima utilizando su absorbancia a 280 nm27. El método TGA tiene ventajas adicionales de menos modificaciones estructurales, una forma soluble de estimación de lignina, menos interferencia de componentes no lignina y una estimación precisa de lignina debido a la unión específica con TGA.
Este método de TGA se modifica en función del tipo de muestra de biomasa vegetal utilizada para la estimación del contenido de lignina. Aquí, modificamos y adaptamos el método rápido de TGA de pajitas de arroz27 a los tejidos de algodón para estimar el contenido de lignina. Brevemente, las muestras de plantas en polvo secas se sometieron a tampón de solubilización de proteínas y extracción de metanol para eliminar las proteínas y la fracción soluble en alcohol. El residuo insoluble del alcohol fue tratado con TGA y la lignina precipitada bajo condiciones ácidas. Se generó una curva estándar de lignina utilizando lignina de bambú comercial y se obtuvo una línea de regresión (y = mx+c). El valor "x" utiliza valores de absorbancia promedio de lignina a 280 nm, mientras que los valores "m" y "c" se ingresaron desde la línea de regresión para calcular la concentración desconocida de lignina en muestras de biomasa de plantas de algodón. Este método se divide en cinco fases: 1) preparación de muestras de plantas; 2) lavar las muestras con agua y metanol; 3) tratamiento del pellet con TGA y ácido para precipitar lignina; 4) precipitación de lignina; y 5) la preparación de la curva estándar y la estimación del contenido de lignina de la muestra. Las dos primeras fases se centran principalmente en la preparación del material vegetal, seguida de las extracciones de agua, PSB (tampón de solubilización de proteínas) y metanol para obtener el material insoluble en alcohol. Luego, se trató con TGA (ácido tioglicólico) y HCl para formar un complejo con lignina en la tercera fase. Al final, se utilizó HCl para precipitar lignina, que se disolvió en hidróxido de sodio para medir su absorbancia a 280 nm28.
1. Preparación de muestras de plantas
2. Lavar muestras con agua, PSB y metanol
3. Tratamiento de pellets con TGA y ácido para precipitar lignina
4. Precipitación de lignina
5. Preparación de la curva estándar y estimación de lignina en la muestra
Se compararon dos líneas experimentales de algodón diferentes para las diferencias en su contenido de lignina en diferentes tejidos. El contenido de lignina extraído de cada muestra se midió a 280 nm y registró sus respectivos valores de absorbancia. Los valores medios de absorbancia de cada réplica biológica se compararon con la línea de regresión de la curva estándar de lignina(Tabla 2, Figura 3C). La línea de regresión, y = mx + c, se utiliza para calcular el contenido desconocido de lignina de las líneas experimentales extraídas, muestra 1 y muestra 2. Los resultados de los valores medios de OD se sustituyeron en "x" mientras que los valores "m" y "c" se taparon a partir de la línea de regresión de la curva estándar de lignina para obtener la concentración de lignina "y" en mg (Tabla 3, Figura 3B). En el siguiente paso, para calcular por 1 mg de contenido de lignina, divida el valor "y" por el peso de la muestra (15 mg) después de la extracción de metanol. En el siguiente paso, para calcular por gramo (= 1.000 mg) el valor y/15 se multiplicó por 1.000. Para obtener % de lignina dividimos el valor de y/15 entre 1.000 y multiplicamos por 100. El promedio de lignina % para tres réplicas biológicas (de cada línea, muestra 1 y muestra 2) se comparó entre las dos líneas experimentales de la muestra 1 (11,7%) y muestra 2 (10,3%). Los valores de lignina fueron consistentes entre las réplicas biológicas, lo que sugiere que el método TGA es un método confiable y altamente específico para medir el contenido de lignina. También se realizaron estudios de comparación entre diferentes tipos de tejidos (raíz, tallo y hojas) de dos líneas experimentales de algodón, y ambas líneas mostraron un contenido relativamente menor de lignina en las hojas (3,4%) en comparación con los tallos (9,4% a 9,9%) y raíces (9,4% a 9,2%) (Tabla 4, Figura 4).

Figura 1: Preparación de la muestra de biomasa vegetal. (A) Material vegetal de algodón recolectado de la casa verde. (B) Macetas suavemente volteadas para separar las raíces. (C) Lavado a fondo en agua para eliminar toda la suciedad. (D) Tejidos separados de raíces, tallos y hojas. (E)Tejido secado al aire durante 2 días después de separar el tejido. (F) El tejido secado al aire se transfiere a la incubadora a 49 °C durante 10 días. (G)Se utilizó una amoladora de biomasa para moler muestras de biomasa vegetal. (H) Muestras de biomasa de plantas de tierra de raíz, tallo y hoja. (I)Las muestras de tierra se cargan en los viales de molienda, se colocan en la cámara del molino congelador, se ponen a tierra en el molino congelador a una velocidad de 10 CPS durante 3 ciclos. (J) Viales triturados que muestren polvo de tejido finamente molido después de la molienda en el molino congelador. (K) Polvo de tejido finamente molido de raíz, tallo y hoja después de utilizar el molino congelador para la molienda. Haga clic aquí para ver una versión más amplia de esta figura.

Figura 2:Pasos críticos involucrados en la extracción de lignina mediada por TGA. Diagrama de flujo de los pasos críticos involucrados en la extracción de lignina de la biomasa vegetal a la estimación del contenido de lignina utilizando el método TGA: 1. Preparación de muestras de plantas mediante secado y molienda suficientes en polvo fino utilizando el molino congelador; 2. 20 mg de polvo tisular se sometieron a PSB, metanol y lavados con agua, secó y se extrajo material insoluble en alcohol; 3. Usando TGA y ácido, la lignina fue precipitada; 4. Preparación de la curva estándar de lignina utilizando lignina de bambú comercial; 5. Estimación del contenido de lignina. Haga clic aquí para ver una versión más amplia de esta figura.

Figura 3:Preparación de la curva estándar y estimación dela lignina en la muestra. (A) Tabla que muestra las diferentes concentraciones de lignina de bambú comercial utilizada para generar la curva estándar de lignina a partir de lecturas de absorbancia a 280 nm. (B)Gráfica dispersa generada con el programa Excel utilizando los valores de la tabla A.(C)Gráficas de barras que representan el contenido estimado de lignina del tejido radicular de las muestras 1 y 2. Haga clic aquí para ver una versión más amplia de esta figura.
| solución | Existencias necesarias | preparación |
| Tampón de solubilización de proteínas (PSB) | 1 M Tris HCl pH 8,8 y 0,5 M EDTA pH 8,0 | Para preparar 100 mL de solución de trabajo de PSB con concentración final de 50 mM Tris, 0,5 mM de EDTA y 10 % de SDS, añadir 5 mL de 1 M Tris, 1 mL de EDTA y 10 g de SDS a 80 mL de agua estéril, mezclar, disolver y hacer el volumen final hasta 100 mL con agua estéril. Autoclave a 121 °C, 15 psi de presión, durante 30 min. |
| 1 M Tris HCl | Para preparar 100 mL de 1 M Tris, añadir 12,1 g de Tris HCl (peso molecular = 121,14 g) en 80 mL de agua. Mezclar Tris HCl agitando sobre un agitador magnético, ajustar el pH con NaOH a 8,8 y componer el volumen a 100 mL con agua estéril y autoclave a 121 °C, 15 psi de presión, durante 30 min. | |
| 0,5 M EDTA (Etilendiamina tetraaceticacid) | Para preparar 100 mL de 0,5 M EDTA añadir 18,6 g de EDTA en 70 mL de agua. Ajuste el pH a 8.0 (EDTA se disuelve completamente a pH 8.0) usando pellets de hidróxido de sodio y ensaje el volumen a 100 mL. Autoclave la solución a 121 °C, 15 psi de presión, durante 30 min. | |
| 3 N Ácido clorhídrico (HCL) | Para preparar 100 mL de 3 N HCl, añadir 26 mL de HCL concentrado a 74 mL de agua estéril. | |
| Hidróxido de sodio del 4% (NaOH) | Preparar 1 N solución de hidróxido de sodio, añadir 4 g de hidróxido de sodio en 90 mL de agua estéril, disolver, componer el volumen a 100 mL y autoclave a 121 °C, 15 psi de presión, durante 30 min. |
Tabla 1: Preparación de las soluciones utilizadas en el protocolo. Tabla que muestra la preparación de las diferentes soluciones utilizadas en el protocolo.
Tabla 2: Curva estándar de lignina preparada de 0,5 mg a 3,5 mg de lignina de bambú industrial. Gráfico disperso con línea de regresión que muestra los valores m y c. Haga clic aquí para descargar esta tabla.
Tabla 3: Plantilla de lignina utilizada para el cálculo del contenido desconocido de lignina utilizando lecturas de absorbancia de muestras a 280 nm (como x) y valores de línea de regresión de curva estándar 'm' y 'c' de la curva estándar. Haga clic aquí para descargar esta tabla.
Tabla 4: Contenido de lignina de diferentes tejidos (raíz, tallo y hojas) de la planta de algodón en la etapa posterior a la floración. Haga clic aquí para descargar esta tabla.
Los autores declaran que no tienen ningún conflicto de intereses.
Aquí, presentamos un método TGA modificado para la estimación del contenido de lignina en biomasa vegetal herbácea. Este método estima el contenido de lignina formando enlaces específicos de tioéter con lignina y presenta una ventaja sobre el método de Klason, ya que requiere una muestra relativamente pequeña para la estimación del contenido de lignina.
Agradecemos al Departamento de Plant &Soil Science y Cotton Inc. por su apoyo parcial a este estudio.
| BioEspectrofotómetro cinético | Eppendorf cinética | 6136000010 | Para medir la absorbancia a 280 nm |
| Centrífuga | Eppendorf | 5424 | Para centrifugar muestras |
| Lignina de bambú comercial | Aldrich 1002171289 | Se utiliza en la preparación de la curva estándar | |
| Agua destilada | Fischer Scientific | 16690382 | Utilizado en el protocolo |
| Tubos Falcon | VWR | 734-0448 | Recipientes para soluciones |
| Molino congelador | Spex Sample Prep | 68-701-15 | Para la molienda fina de muestras de tejidos vegetales |
| Bloque de calor/ Mezclador térmico | Eppendorf | 13527550 | Para pasos de temperatura controlada durante la extracción de lignina |
| Agitador de placa calefactora | Walter | WP1007-HS | Se utiliza para la preparación de soluciones |
| Ácido clorhídrico (HCL) | Sigma | 221677 | Utilizado en el protocolo |
| Incubadora | Fisherbrand | 150152633 | Para el secado a fondo de muestras de tejido vegetal |
| Báscula de medición | Mettler toledo | 30243386 | Para medir el peso del tejido vegetal, patrones y tubos de microfuga |
| Metanol (100 %) | Fischer Scientific | 67-56-1 | Utilizado en el protocolo |
| Tubos de microfuga (2 mL) | Microcentrífuga | Z628034-500EA | Recipientes para la extracción de lignina |
| Biomasa vegetal gerinder | Hanchen | Amazon | Se utiliza para triturar muestras secas |
| Medidor de pH | Fisher Scientific | AE150 | Medición de pH para soluciones preparadas para la extracción de lignina |
| Incubadora/horno con control de temperatura | Fisher Scientific | 15-015-2633 | Utilizado en el protocolo |
| Ácido tioglicólico (TGA) | Sigma Aldrich | 68-11-1 | Utilizado en el protocolo |
| Secador al vacío | Eppendorf | 22820001 | Se utiliza para el secado de muestras |
| Mezclador de vórtice | Eppendorf | 3340001 | Para la mezcla adecuada de muestras |