Name: Automatizado de cuantificación y análisis de los procedimientos de recuento de células usando ImageJ Plugins (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2016-11-17T15:00:00.000+00:00
Duration: 11 min 1 s
Description: Aprende a cuantificar células en suspensión y ensayos de migración usando plugins de ImageJ. Este protocolo automatizado mejora la precisión y eficiencia en análisis de biología celular.

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Este trabajo fue apoyado por el Instituto Canadiense de Investigación en Salud para PC (OR 142730 y OR 89931). Nos gustaría agradecer a Jelena Brkic por su idea inicial del análisis de partículas binarias en ImageJ.

<ol><li>Ricardo, R., Phelan, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Counting+and+Determining+the+Viability+of+Cultured+Cells%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Vis.+Exp%22%5BJournal%5D)">Counting and Determining the Viability of Cultured Cells.</a> J. Vis. Exp. (16), e752(2008).</li>
<li>JoVE Science Education Database. Using a Hemacytometer to Count Cells. Basic Methods in Cellular and Molecular Biology. , Available from:
 <a target="_blank" href="https://www.jove.com/science-education/5048/using-a-hemacytometer-to-count-cells">https://www.jove.com/science-education/5048/using-a-hemacytometer-to-count-cells</a> (2016).</li>
<li>Graham, M. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+coulter+principle%3A+foundation+of+an+industry%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Lab.+Autom%22%5BJournal%5D)">The coulter principle: foundation of an industry.</a> J. Lab. Autom. 8 (6), 72-81 (2003).</li>
<li>Ormerod, M. G., Imrie, P. R. Flow cytometry. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aOrmerod%2C+MG+%22Animal+Cell+Culture%22">Animal Cell Culture</a>. Walker, J. M., Pollard, J. W. , Humana Press. 543-558 (1990).</li>
<li>Eliceiri, K. W., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Biological+Imaging+Software+Tools%5BTitle%5D)+AND+%22Nat.+Methods%22%5BJournal%5D)">Biological Imaging Software Tools.</a> Nat. Methods. 9 (7), 697-710 (2013).</li>
<li>Louis, K. S., Siegel, A. C. Cell viability analysis using Trypan blue: manual and automated methods. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aLouis%2C+KS+%22Mammalian+Cell+Viability%3A+Methods+and+Protocols%22">Mammalian Cell Viability: Methods and Protocols</a>. Stoddart, J. M. , Humana Press. 7-12 (2011).</li>
<li>Scott, W. N. Invasion and motility assays. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aScott%2C+WN+%22Cancer+Cell+Culture%3A+Methods+and+Protocols%22">Cancer Cell Culture: Methods and Protocols</a>. Langdon, S. P. , Humana Press. 225-229 (2004).</li>
<li>Justus, C. R., Leffler, N., Ruiz-Echevarria, M., Yang, L. V. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((In+vitro+Cell+Migration+and+Invasion+Assays%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Vis.+Exp%22%5BJournal%5D)">In vitro Cell Migration and Invasion Assays.</a> J. Vis. Exp. (88), e51046(2014).</li>
<li>Luo, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((MicroRNA-378a-5p+promotes+trophoblast+cell+survival%2C+migration+and+invasion+by+targeting+Nodal%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Cell+Sci%22%5BJournal%5D)">MicroRNA-378a-5p promotes trophoblast cell survival, migration and invasion by targeting Nodal.</a> J. Cell Sci. 125, 3124-3132 (2012).</li>
<li>Adorno, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+Mutant-p53%2FSmad+Complex+Opposes+p63+to+Empower+TGFbeta-Induced+Metastasis%5BTitle%5D)+AND+%22Cell%22%5BJournal%5D)">A Mutant-p53/Smad Complex Opposes p63 to Empower TGFbeta-Induced Metastasis.</a> Cell. 137, 87-98 (2009).</li>
<li>Chung, T. K. H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Dysregulation+of+microRNA-204+mediates+migration+and+invasion+of+endometrial+cancer+by+regulating+FOXC1%5BTitle%5D)+AND+%22Int.+J.+Cancer%22%5BJournal%5D)">Dysregulation of microRNA-204 mediates migration and invasion of endometrial cancer by regulating FOXC1.</a> Int. J. Cancer. 130, 1036-1045 (2012).</li>
<li>Kramer, N., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((et+al.+In+vitro+cell+migration+and+invasion+assays%5BTitle%5D)+AND+%22Mutat.+Res.%2FRev.+Mutat%22%5BJournal%5D)">et al. In vitro cell migration and invasion assays.</a> Mutat. Res./Rev. Mutat. 752, 10-24 (2013).</li>
<li>Al-Khazraji, B. K., Medeiros, P. J., Novielli, N. M., Jackson, D. N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((An+automated+cell-counting+algorithm+for+fluorescently-stained+cells+in+migration+assays%5BTitle%5D)+AND+%22Biol.+Proced.+Online%22%5BJournal%5D)">An automated cell-counting algorithm for fluorescently-stained cells in migration assays.</a> Biol. Proced. Online. 13, 1-6 (2011).</li>
<li>Rasband, W. S. ImageJ. , National Institutes of Health. Bethesda, Maryland, USA. Available from:
 <a target="_blank" href="http://rsb.info.nih.gov/ij/">http://rsb.info.nih.gov/ij/</a> (2007).</li>
<li>Abramoff, M. D., Magalhaes, P. J., Ram, S. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Image+processing+with+ImageJ%5BTitle%5D)+AND+%22Biophotonics+Intern%22%5BJournal%5D)">Image processing with ImageJ.</a> Biophotonics Intern. 11, 36-42 (2004).</li>
<li>Grishagin, I. V. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Automatic+cell+counting+with+ImageJ%5BTitle%5D)+AND+%22Anal.+Biochem%22%5BJournal%5D)">Automatic cell counting with ImageJ.</a> Anal. Biochem. 473, 63-65 (2015).</li>
<li>Thomas, C. R., Paul, G. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Applications+of+image+analysis+in+cell+technology%5BTitle%5D)+AND+%22Curr.+Opin.+Biotech%22%5BJournal%5D)">Applications of image analysis in cell technology.</a> Curr. Opin. Biotech. 7 (1), 35-45 (1996).</li>
<li><a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Appreciating+data%3A+warts%2C+wrinkles+and+all%5BTitle%5D)+AND+%22Nat.+Cell+Biol%22%5BJournal%5D)">Appreciating data: warts, wrinkles and all.</a> Nat. Cell Biol. 8, 203(2006).</li>
<li>Rossner, M., Yamada, K. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((What%27s+in+a+picture%3F+The+temptation+of+image+manipulation%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Cell+Biol%22%5BJournal%5D)">What's in a picture? The temptation of image manipulation.</a> J. Cell Biol. 166, 11-15 (2004).</li>
<li><a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Count+objects+in+an+image+in+Adobe+Photoshop%5BTitle%5D)+AND+%22Helpx.adobe.com%22%5BJournal%5D)">Count objects in an image in Adobe Photoshop.</a> Helpx.adobe.com. , Available from:
 <a target="_blank" href="https://helpx.adobe.com/photoshop/using/counting-objects-image.html">https://helpx.adobe.com/photoshop/using/counting-objects-image.html</a> (2016).</li>
</ol>

Los autores declaran que no tienen intereses financieros contrapuestos.

Los pasos críticos, solución de problemas y limitaciones La propia naturaleza de los métodos de cálculo automatizados, específicamente los de análisis de partículas, requiere la capacidad matemática para definir estas partículas. En consecuencia, tanto la exactitud de la calculadora de la concentración de células y el contador de ensayo de migración depende mayormente en la fidelidad de la imagen, es decir, cómo de cerca la imagen capturada se asemeja a la membrana de célula o muestra de ensayo...

En el recuento de células in vitro es una importante técnica básica en una amplia gama de experimentos de cultivo de tejidos. Determinar con precisión el número de células en un cultivo es esencial para la reproducibilidad experimental y 1,2 normalización. El recuento de células se puede realizar manualmente usando un hemocitómetro, así como el uso de una variedad de métodos automatizados, cada uno con sus propias ventajas y desventajas 3,4,5. La mayoría de los métodos automatizados para el recuento de células pertenecen a una de dos clases, los que utilizan el principio de Coulter o citometría de flujo. Contador Coulter toman ventaja de las células resistencia eléctrica para determinar el número y tamaño de las células. Ellos son rápidos, precisos y más barato que los citómetros de flujo. Sin embargo, rara vez se utilizan sólo para el recuento de células debido a su costo considerable en comparación con el conteo manual 3. Citómetros de flujo, por otro lado, son caros pero tienen muchas aplicaciones tales como el recuento de células, el análisis de la forma de las células, structure y la célula de medida interna Marcadores de 4,5. Las máquinas que utilizan cualquiera de estos dos principios están disponibles de muchos fabricantes. Conteo manual es asequible, pero consume tiempo y sujeto a un sesgo, mientras que los métodos automatizados vienen con una fracción del tiempo necesario para que el recuento manual, pero el uso de máquinas costosas 6. Otros procedimientos de cultivo celular común están en ensayos de motilidad de las células in vitro, a saber, la migración celular y la invasión 7. ensayos de migración y la invasión se utilizan comúnmente para investigar la motilidad celular y la invasión en respuesta a una respuesta quimiotáctica. Además, se utilizan ampliamente para estudiar el desarrollo embrionario, la diferenciación, la respuesta inflamatoria, y la metástasis de múltiples tipos de células 7-11. Las células que han migrado o invadido través de la membrana porosa de un ensayo de migración se pueden cuantificar de dos maneras diferentes. En primer lugar, mediante la tinción de las células con un colorante fluorescente, la disociación from de la membrana, y la cuantificación utilizando un lector fluorescente 12. Una limitación de este método de cuantificación es que ningún registro puede ser retenido de las membranas y no hay posibilidad de un mayor análisis 13. El segundo método de cuantificación es para emigrado / células para ser fijados y teñidos con colorante fluorescente o más comúnmente, con colorantes citológicos como cristal violeta, colorante azul de toluidina o hematoxilina invadió; a continuación, las células se cuantificaron utilizando manualmente las imágenes microscópicas invertidas de estas membranas, que es una tarea que consume mucho tiempo 12,13. Para superar los inconvenientes de conteo de células manual, se desarrollaron dos contadores de células automatizadas fiables y precisos para la concentración de células y para el ensayo de migración. Estos algoritmos contador de células automatizado fueron desarrollados para ImageJ como un plugin usando lenguaje de programación Java de Oracle. ImageJ es una herramienta de procesamiento de imagen pública y ampliamente usada desarrollado por el Instituto Nacional del ciLTH (NIH) 14,15; por lo tanto, escribir estos plugins para ImageJ facilita una fácil integración en la comunidad biológica. Automatización de recuento de células garantiza un alto rendimiento y reproducibilidad en comparación con el conteo manual. Aunque otro software y plugins disponibles se pueden utilizar para calcular la concentración de células a través de análisis de imágenes 5,16,17, Cell Concentración Calculadora Plugin es rápido y también puede manejar diluciones de células y tratamientos. Por otra parte, todos los resultados y cálculos de estos dos contadores se pueden guardar y exportar. Los dos plugins descritos en este documento están optimizados para el uso de un microscopio de contraste de fases de imágenes de células vivas y gran campo de visión (toda la captura de membrana) de imágenes para membranas de ensayo de migración a través del uso de un microscopio de disección. Los plugins son de libre acceso para descargar las instrucciones de instalación de: http://peng.lab.yorku.ca/imagej-plugins.

<table><tbody><tr><td>HyClone Medios líquidos clásicos: RPMI 1640 - con L-glutamina</td><td>Fisher Scientific</td><td>SH3002702</td><td>medios de cultivo celular&nbsp;</td></tr><tr><td>Suero bovian fetal (FBS)</td><td>GIBCO BRL</td><td>P00015</td><td>Suministro de medios</td></tr><tr><td>Línea celular de trofoblastos HTR8/SVneo</td><td>Las células se obtuvieron del Dr. Charles Graham (Queen' s University, Kingston, Canadá)El</td><td></td> <td>software está diseñado para trabajar con cualquier línea celular.</td></tr><tr><td>Tripsina</td><td>GIBCO BRL</td><td>27250-018</td><td>Preparada al 0,20% (p/v) en 10 &micro; M EDTA 1x PBS</td></tr><tr><td>Accutase</td><td>Innovative Cell Technologies</td><td>AT104</td><td></td></tr><tr><td>Placas de cultivo celular de 10 cm</td><td>SARSTEDT</td><td>833902</td><td>Cualquier placa tratada con cultivo de tejidos será adecuada</td></tr><tr><td>Inserciones de membrana de poliéster Transwell - 8.0&nbsp; y micro; m Tamaño de poro</td><td>Costar 3422 pedido a Fisher Scientific 7200150</td><td></td><td>para placas de 24 pocillos; Tamaño de poro: 8.0 y micro; m; 6,5 mm de diámetro; 0,33 cm2 área de crecimiento</td></tr><tr><td>HARLECO Tinciones y reactivos para hematología, EMD Millipore - Soluciones 1, 2 y 3</td><td>EMD Millipore y pedidos de VWR</td><td>65044A, B y El</td><td>juego de tinción C Hemacolor consta de tres botellas de polietileno de 500 ml (16,9 oz) e incluye un fijador de metanol (Solución 1), una tinción de eosina o ácido (Solución 2) y una tinte básica o azul de metileno (Solución 3)</td></tr><tr><td>Aplicador con punta de algodón</td><td>Puritan Medical</td><td>806-WC</td><td></td></tr><tr><td>Hojas de afeitar industriales de un solo filo</td><td>VWR</td><td>55411 - 055</td><td>Grosor: 0,30 mm (0,012")</td></tr><tr><td>Portaobjetos de microscopio - Prelimpios/lisos</td><td>Fisher Scientific</td><td>12550A3</td><td>Dimensiones: 25 mm x 75 mm x 1,0 mm</td></tr><tr><td>Cubreobjetos Fisherbrand - Rectángulos n.º 1</td><td>Fisher Scientific</td><td>12-545E</td><td>Grosor: 0,13 a 0,17 mm; Tamaño: 50 mm x 22 mm</td></tr><tr><td>Fisher Chemical Permount Montaje Medio</td><td>Fisher Scientific</td><td>SP15-500</td><td></td></tr><tr><td>Leica Microscopio de disección estereoscópica Leica</td><td>Microsystems</td><td></td><td>El microscopio está equipado con una cámara microscópica Leica modelo MC170 HD y el software de la cámara es Leica App. Suite (LAS E2) Versión 3.1.1 [Compilación: 490]. Partes del microscopio:&nbsp; LED3000 Modelo de iluminación de luz puntual: MEB126, Leica M80 Modelo de portador óptico M80, objetivo acromático 1.0X, WD=90&nbsp; mm Modelo: MOB306 & Acromático objetivo 0.32X, WD=303&nbsp; mm Modelo: MOB315, Video Objective 0.5X Modelo: MTU-293</td></tr><tr><td>Hemacytometer</td><td>Assistant Germany&nbsp;</td><td></td><td>0,100 mm Profundidad - 0,0025 mm2</td></tr><tr><td>Microscopio de luz invertida Olympus</td><td>Corporation CKX41SF</td><td></td><td>El microsope está equipado con Lumenera Infinity 1-2 2.0 Megapixel CMOS Color Camera & el software de la cámara es Infinity analyze Version 6.5.2</td></tr><tr><td>Cabina de flujo laminar 1300 Series A2</td><td>Thermo Scientific&nbsp;</td><td>Modelo: 1375</td><td>Cualquier cabina de flujo laminar para trabajos de cultivo celular será adecuada&nbsp;</td></tr><tr><td>Incubadora de cultivos</td><td>celulares Thermo Scientific&nbsp;</td><td>Modelo: 370</td><td>Cualquier incubadora de cultivo celular será adecuada - Las células se cultivaron en un ambiente humidificado, 5% CO2, 37 &deg; C&nbsp;</td></tr><tr><td>ImageJ</td><td>NIH</td><td>Versión 1.50e</td><td>Versión mínima requerida</td></tr><tr><td>Java Runtime Environment Oracle</td><td></td><td>Versión 1.8.0_66</td><td>Versión mínima requerida</td></tr></tbody></table>

automatizado de cuantificación y análisis de los procedimientos de recuento de células usando imagej plugins

Automated Quantification and Analysis of Cell Counting Procedures Using ImageJ Plugins

El Instituto Nacional de Salud de ImageJ es una suite de software de libre acceso de gran alcance, el procesamiento de imágenes. ImageJ tiene algoritmos de análisis de partículas integrales que se pueden utilizar con eficacia para contar diversas partículas biológicas. Al contar un gran número de muestras de células, el hemocitómetro presenta un cuello de botella en cuanto a tiempo. Del mismo modo, contando membranas a partir de ensayos de migración / invasión con la célula Contador ImageJ plugin, aunque precisa, es la mano de obra intensiva excepcionalmente, subjetiva, y la mala fama por causar dolor en la muñeca. Para hacer frente a esta necesidad, hemos desarrollado dos plugins dentro de ImageJ con la única tarea de hemocitómetro automático (o volumen conocido) y el recuento de células de migración / invasión. Ambos plugins se basan en la capacidad de adquirir micrografías de alta calidad con el fondo mínimo. Son fáciles de usar y optimizado para el conteo rápido y análisis de muestras de gran tamaño con herramientas de análisis incorporadas para ayudar a la calibración de los recuentos. Al combinar el principio básicos de contador de células con un análisis automatizado algoritmo de recuento y post-conteo, esto aumenta en gran medida la facilidad con la que los ensayos de migración pueden ser procesados ​​sin pérdida de precisión.

Calculadora Concentración celular La Figura 1 presenta el proceso general de calibración CCC y adquisición de imágenes contable. Figura 1A y 1B representan la imagen de calibración P-cuadrado y cálculo de la longitud P-cuadrado en píxeles. CCC determina la concentración de células en un volumen dado mediante la fórmula: <img alt="Ecuación 1" src="/file...

Este artículo describe la cuantificación de hemocitómetros y micrografías de migración/invasión a través de dos nuevos complementos de código abierto de ImageJ: Cell Concentration Calculator y migration assay Counter. Además, describe los protocolos de adquisición y calibración de imágenes, así como analiza en detalle los requisitos de entrada de los complementos.

Automatizado de cuantificación y análisis de los procedimientos de recuento de células usando ImageJ Plugins

The National Institute of Health&#39;s ImageJ is a powerful, freely available image processing software suite. ImageJ has comprehensive particle analysis ...

El objetivo general de este protocolo es utilizar herramientas de análisis digital para realizar rápidamente conteos precisos de células en una suspensión o en una membrana de ensayo de migración e invasión. Este protocolo puede ayudar a los investigadores a cuantificar el número de células necesario para técnicas comunes y ensayos de movilidad celular in vitro. La principal ventaja de este método es que proporciona conteos rápidos y precisos de células, incluyendo múltiples filtros y herramientas de análisis.Para comenzar, ajuste la iluminación del microscopio al máximo. Cambie al objetivo de 4x y asegúrese de que se estén utilizando los filtros de contraste de fase. Luego, dentro del software del microscopio, configure los ajustes de captura de imagen a sus valores predeterminados.Ahora coloque un hemocitómetro estándar sobre la platina del microscopio y capture una imagen para el paso de calibración del volumen de la imagen. Ajuste el tiempo de exposición según sea necesario. En ImageJ, dentro de la calculadora de concentración celular, abra la imagen y haga clic en el botón Obtener dimensión de la imagen.Esta acción rellena los cuadros de texto de ancho y alto de la imagen con

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Una mejor visualización y análisis cuantitativo de los efectos de drogas Uso de células micropatterned

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Uso de bibliotecas de visión artificial para optimizar la cuantificación de núcleos

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