Perfil espacial completo de transcriptomas independientes de la especie a través de Stereo-seq

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31 de octubre de 2025

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Anna K. Casasent^*¹ , Danielle L. Stolley^*¹ , Basant T. Gamal^*² , Arnold Dahay² , Samuel Mok² , Lidia Rocha³ , Vincent Li³ , Arizona T. Nguyen³ , Boyu Zhang⁴ , Clay T. Brasuell⁴ , Erika J. Thompson⁴ , Thomas Huynh³ , Jared K. Burks¹ , Sammy Ferri-Borgogno²

¹Department of Hematopoietic Biology and Malignancies, The University of Texas MD Anderson Cancer Center, ²Department of Gynecologic Oncology and Reproductive Medicine, The University of Texas MD Anderson Cancer Center, ³Department of Veterinary Medicine & Surgery, University of Texas MD Anderson Cancer Center, ⁴Department of Genetics, The University of Texas MD Anderson Cancer Center

^* These authors contributed equally

Este artículo presenta un protocolo para realizar perfiles transcriptómicos espaciales completos del ARN del huésped, viral, fúngico y del microbioma a partir de secciones de tejido fijadas en formol e incluidas en parafina utilizando Stereo-seq, que permite el mapeo de alta resolución de diversos transcriptomas mientras preserva la arquitectura del tejido.