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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Un protocole pour correctement identifier et analyser les synapses hippocampiques tranches à l’aide d’immunofluorescence est décrite dans cet article.
Dans le cerveau, les synapses sont spécialisées des jonctions entre les neurones, détermination de la force et la propagation de la signalisation neuronale. Le nombre de synapses est étroitement contrôlée pendant le développement et la maturation neuronale. Ce qui est important, déficits dans nombre de synapse peuvent conduire à un dysfonctionnement cognitif. Par conséquent, l’évaluation du nombre de synapses fait partie intégrante de la neurobiologie. Cependant, comme les synapses sont petites et très compacte dans le cerveau intact, l’évaluation du nombre absolu est difficile. Ce protocole décrit une méthode permettant de facilement identifier et évaluer les synapses hippocampiques tranches rongeurs à l’aide de la microscopie par immunofluorescence. Il comprend une procédure en trois étapes afin d’évaluer les synapses des images de haute qualité microscopie confocale en analysant la co-localisation des protéines préalables- et post-synaptiques dans des tranches d’hippocampe. Il explique également comment l’analyse est effectuée et donne des exemples représentatifs de synapses excitatrices et inhibitrices. Ce protocole fournit une base solide pour l’analyse des synapses et peut être appliqué à toute recherche sur la structure et le fonctionnement du cerveau.
Le cerveau humain est composé d’environ 1014 synapses. Nombre de Synapse est étroitement contrôlée pendant le développement et la maturation du système nerveux central (CNS). Au cours du développement, nombre de synapse est modulée par la synaptogénèse et l’élagage pour former des réseaux de neurones fonctionnels. Apprentissage et la mémoire sont pris en charge par le règlement du nombre de synapses et la force, un processus appelé potentialisation synaptique et dépression1. Ce qui est important, la stabilisation des synapses matures est essentielle au maintien des connexions réseau neuronal. En outre, les déficits en densité de synapse ont été signalés aux premiers stades des maladies neurodégénératives comme la maladie d’Alzheimer (ma)2. La capacité de précisément identifier et évaluer le nombre de synapses est donc fondamentale pour l’évaluation de la pathologie et la physiologie du cerveau.
L’extrême densité et la nature compacte de synapses font qu’il est difficile d’estimer leur nombre précis dans certaines zones du cerveau intact. Synapses chimiques dans le système nerveux central sont constitués de deux neurones en apposition étroite, séparés par une fente synaptique3. Le terminal présynaptique, ou bouton synaptique, émerge d’un axone et se compose de vésicules accumulés, qui contiennent des neurotransmetteurs qui définissent la spécificité d’une synapse — à savoir, glutamate et acide gamma - aminobutyrique (GABA) pour excitateurs et inhibiteur de synapses, respectivement. Les membranes des vésicules contiennent des transporteurs vésiculaires spécifiques à chaque neurotransmetteur : transporteur vésiculaire glutamate (vGlut) de glutamate et transporteur vésiculaire de GABA (vGAT) de GABA. Le terminal post-synaptique est une structure très dense composée de plusieurs protéines, y compris des récepteurs, molécules d’adhésion et les protéines de l’échafaudage. Dans les synapses excitatrices, post-synaptiques densité-95 protein (PSD-95) est le plus abondant échafaud protéines4, modulation excitatrice N-methyl-D-aspartate(NMDA-) et le récepteur de l’acide α-amino-3-hydroxy-5-methyl-4-isoxazolepropionic (AMPA) fonction, tandis que gephyrin les chevilles des récepteurs inhibiteurs de l’inhibiteur postsynaptique borne5. Dans l’ensemble, la spécificité des protéines aux compartiments préalables- et post-synaptiques de l’aide dans la différenciation et l’identification des sous-types de la synapse.
L’évaluation du nombre de synapses peut être effectuée avec différentes techniques. Le plus commun est l’utilisation de la microscopie électronique (EM), qui permet l’analyse de la synapse dans les zones cérébrales intactes et compact avec fort grossissement et la résolution. Cependant, cette technique est très coûteuse, nécessite la préparation des échantillons complexes et est très chronophage. Autres techniques incluent l’utilisation de tableau tomographie6, qui a un inconvénient majeur car il nécessite un équipement spécialisé et coûteux pour effectuer l’analyse. En outre, des lignées transgéniques exprimant des marqueurs spécifiques de synaptiques sont utiles à l’évaluation de synapse numéro7, mais la génération de nouvelles lignes peut être restrictives et coûteuses, et la surexpression de protéines peut entraîner indésirable hors cible phénotypes.
En raison de ces limitations et par souci de simplicité, de nombreux chercheurs évaluent nombre de synapses en examinant les concentrations en protéines synaptiques total. Cependant, perte synapse peut être observée avant des changements importants en protéines, comme des résultats de remodelage synaptiques structurelles dans la dispersion de l’apposition de pré- et post-synaptiques, avec aucune dégradation de protéines synaptiques. En outre, AD, des niveaux de protéines synaptiques sont réduits suivant synapse dégénérescence ou mort neuronale8,9. La quantification des niveaux totaux ne permet pas cette distinction. Ainsi, il est nécessaire d’élaborer une méthode précise, accessible et fiable pour l’évaluation du nombre de synapses dans le cerveau.
Dans cet article, nous décrivons comment bien identifier et déterminer le nombre de synapses en utilisant la microscopie par immunofluorescence dans des tranches de cerveau de rongeurs hippocampe. Les synapses sont définies par la co-localisation de pré- et post-synaptiques des marqueurs qui apparaissent dans une distribution ponctuée. Nous avons démontré la validité de cette technique à travers l’étude de Wnt signaling dans le cerveau. WNTs sont importants pour la formation, élimination et l’entretien des synapses de protéines sécrétées. L’induction in vivo d’un antagoniste sécrétée de la cascade de signalisation Wnt, Dickkopf-1 (Dkk1), entraîne une perte synaptique excitatrice tout en préservant des synapses inhibitrices dans le hippocampe10. Nous illustrons l’identification et le comptage des synapses excitatrices et inhibitrices dans des tranches d’hippocampe d’une souris adulte exprimant Dkk1 et mettez en surbrillance la transférabilité de cette technique à d’autres types de préparations de cultures tissulaires.
toutes les expériences à l’aide de la souris et les rats ont été approuvés et réalisée à l’aide de procédures de l’annexe 1 couvertes en vertu de la Loi de 1986 sur les animaux particuliers (procédures scientifiques). La recette du liquide céphalo-rachidien artificiel (FSCA) se trouvent dans le tableau 1.
1. préparation de tranches Hippocampal aiguë
2. Immunofluorescence pour marqueurs synaptiques
Remarque : les recettes de tous les tampons utilisés peuvent être trouvées dans le tableau 2.
3. Confocal Acquisition d’images et analyse
figure 1 : analyse des punctums synaptique en utilisant l’analyse d’image logiciel. (A) capture d’écran de la personnalisation de protocole intensité seuil. L’exemple donné est pour PSD-95, dans lequel l’examen sélectionné ont une taille de > 0,1 µm 3 et < 0,8 µm 3 et les objets qui se chevauchent réduites présents. Notez que l’image affichée est un avion confocal permettre la visualisation plus facile de synaptique examen et sélection des paramètres précis. (B) capture d’écran de l’analyse de sortie du logiciel (suite à la sélection du protocole optimisé). Un exemple d’examen synaptique brut numéros mesures basées sur le volume. Ces valeurs sont ensuite exportés vers un logiciel de feuille de calcul. s’il vous plaît cliquez ici pour visionner une version agrandie de cette figure.
figure 2 : contrôle de la qualité des arrangements de tranche et de paramètre pour examen synaptique. (A) représentant images confocales (objectif 40) de la région d’intérêt : la CA1 stratum radiatum (sr) et le stratum oriens (donc) d’une tranche de hippocampe sont identifiés par MAP2 coloration. Echelle = 2 µm. (B) images confocales (60 x objectif et une supplémentaire 1,3 X grossissement sur le logiciel d’acquisition) de CA1 stratum radiatum, avec excitateur marqueurs-vGlut1 (vert) et le PSD-95 (rouge)-de tranches d’hippocampe. Notez l’identification des punctums claire pré- et post-synaptiques. Punctums supérieure à 0,8 µm 3 sont exclus de la quantification (flèches blanches). Echelle = 2 µm (C) Confocal images (60 x objectif et une supplémentaire 1,3 X grossissement sur le logiciel d’acquisition) de CA1 stratum radiatum, avec excitateur marqueurs-vGlut1 (vert)-du cryostat-coupe des sections hippocampiques du cerveau entier fixe du PFA. Noter la présence de grands trous et une coloration irrégulière, contagieuse vGlut1. Echelle = 2 µm. s’il vous plaît cliquez ici pour visionner une version agrandie de cette figure.
Perte de Synapse survient tôt dans les maladies neurodégénératives comme AD et la maladie de Parkinson2,11,12. Cependant, les mécanismes moléculaires qui sous-tendent ces déficits restent mal compris. Lacunes dans la signalisation Wnt ont été associés à AD13,14,15,16,17. WNTs sont des glycoprotéines sécrétées et jouent un rôle essentiel dans la formation des synapses et la modulation de la transmission synaptique18,19,20,21. Récemment, nous avons identifié Wnts comme régulateurs clés de maintenance synaptique dans le système nerveux mature10,22. Etudier avec précision l’impact de la signalisation Wnt sur les synapses dans l’hippocampe de souris génétiquement modifiées, nous avons profité d’une préparation de tranches de cerveau et de la microscopie confocale à évaluer les changements dans le nombre de synapses. Nous avons identifié des tranches en bonne santé dont la structure a été bien conservé (Figure 2 a). En outre, la sélection des punctums synaptique a été soigneusement définie, à l’exclusion des grands objets colorés représentant probablement les protéines agrégées (Figure 2 b). Ce critère a été appliqué à toutes les images, avec les mêmes paramètres d’analyse rigoureux.
Nous avons utilisé un système de modèle transgénique qui induit l’expression de l’antagoniste de Wnt Dkk1 sécrétée chez les adultes (voir la Table des matières)10,22de contrôle de souris (iDkk1) de la tétracycline. Nous avons démontré que le blocus de signalisation Wnt dans l’hippocampe adulte déclenche perte synapse excitatrice spécifiquement dans la région CA1 de radiatum strate (Figure 3). Figure 3 illustre représentant images confocales de marqueurs de pré- et post-synaptiques excitateurs (vGlut1 et PSD-95, respectivement) acquis auprès des tranches d’hippocampe d’iDkk1 de souris exprimant Dkk1 pour deux semaines, ainsi que leurs contrôles respectifs. Nous avons analysé ces images à l’aide du logiciel Volocity et a démontré une réduction significative du nombre de synapses excitatrices, quantifiée par la co-localisation d’examen vGlut1 et PSD-95-marquée dans la région CA1 de l’hippocampe de souris iDkk1 après la induction de Dkk1 pendant deux semaines (Figure 3 b, * p < 0,05 ; Test de Kruskal-Wallis ; 6 souris par génotype). Dans la région CA1 stratum radiatum, le nombre de punctums de synapse excitatrice par 1 000 µm3 a été ramené de 500 chez les souris témoins à 300 chez les souris iDkk1. En revanche, expression de Dkk1 induite n’a pas affecté le nombre de synapses inhibitrices (identifié par la co-localisation entre les pré- et post-synaptiques marqueurs vGAT et gephyrin, respectivement), comme illustré à la Figure 4 a-B (p > 0,05 ; Test de Kruskal-Wallis ; 3 souris par génotype).
Ce qui est important, nous avons effectué une analyse de puissance statistique pour estimer le nombre de tranches et animaux requis pour générer ces résultats robustes. À l’aide de R, nous avons calculé qu’il fallait environ 35 tranches par condition (animaux de tranches x 6 3 images x 3 = 36) pour détecter une taille d’effet important (f = 0,4) avec 80 % de certitude (puissance = 0,8) à une ANOVA à avec blocage et la réplication, comme décrit dans l’étape 3.2.6.

Figure 3 : perte des synapses excitatrices dans des tranches d’hippocampe de souris iDkk1. (A) images confocales représentatifs des CA1 stratum radiatum Voir la synapses excitatrices, identifiés par la co-localisation entre vGlut1 et PSD-95 (flèches blanches). Le panneau inférieur représente un grossissement supérieur du rectangle en surbrillance. Barreaux de l’échelle = 2 µm. (B) le pourcentage de synapses excitatrices entre contrôle et iDkk1 a été quantifié à l’aide des logiciels mentionnés dans la Table des matières (* p < 0,05 ; Test de Kruskal-Wallis ; 6 souris par génotype). Les données sont représentées ± SEM Ce chiffre a été modifié par référence10. S’il vous plaît cliquez ici pour visionner une version agrandie de cette figure.

Figure 4 : synapses inhibitrices sont inchangés dans des tranches d’hippocampe de souris iDkk1. (A) images confocales représentatif du stratum radiatum CA1 des synapses inhibitrices, identifié par la co-localisation entre vGAT et gephyrin (flèches blanches). Le panneau inférieur représente un grossissement supérieur du rectangle en surbrillance. Barreaux de l’échelle = 2 µm. (B) pourcentage des synapses inhibitrices entre souris contrôle et iDkk1, tel que quantifié à l’aide du logiciel Volocity (p > 0,05 ; Test de Kruskal-Wallis ; 3 souris par génotype). Les données sont représentées ± SEM Ce chiffre a été modifié par référence10. S’il vous plaît cliquez ici pour visionner une version agrandie de cette figure.
| Composants de saccharose élevé FSCA | Concentration de | Notes |
| NaCl | 75 mM | |
| NaHCO3 | 25 mM | |
| KCl | 2,5 mM | |
| NaH2PO4, 2 H2O | 1,25 mM | |
| Acide kynurénique | 1,25 mM | |
| Acide pyruvique | 2 mM | |
| EDTA | 0,1 mM | |
| CaCl2 | 1 mM | Ajouter après oxygénation de solution |
| MgCl2 | 4 mM | Ajouter après oxygénation de solution |
| D-Glucose | 25 mM | |
| Saccharose | 100 mM | |
| Chambre immergée FSCA composants | ||
| NaCl | 125 mM | |
| NaHCO3 | 25 mM | |
| KCl | 2,5 mM | |
| NaH2PO4, 2 H2O | 1,25 mM | |
| CaCl2 | 1 mM | Ajouter après oxygénation de solution |
| MgCl2 |
Tableau 1 : Composition de fsca.
| Tampon de blocage/perméabiliser | Concentration de | Notes |
| Sérum de l’âne | 10 % | |
| Triton-X | 0,50 % | |
| PBS | 1 x | |
| 10 x PBS | pH à 7.4 | |
| NaCl | 1,37 M | |
| KCl | 27 mM | |
| NaH2PO4 | 100 mM | |
| KH2PO4 | 18 mM | |
| 4 % PFA/4% saccharose | pH à 7.4 | |
| PBS | 1 x | Diluer de 10 x |
| PFA | 1,33 M | |
| Saccharose | 117 mM |
Tableau 2 : Tampons utilisés pour la coloration par immunofluorescence.
Les auteurs n’ont rien à divulguer.
Un protocole pour correctement identifier et analyser les synapses hippocampiques tranches à l’aide d’immunofluorescence est décrite dans cet article.
Ce travail a été soutenu par la MRC, EU FP7, ARUK, Wellcome Trust et maladie de Parkinson UK. Nous tenons également à remercier Mme Johanna Buchler pour sa contribution d’images confocales et les membres du laboratoire pour leurs commentaires constructifs sur le manuscrit et la méthodologie.
| Vibratome | Leica | VT1000S | |
| Anticorps primaire | Millipore | AB5905 | vGlut1 (1:2000) |
| Anticorps primaire | Thermo Scientific | MA1-046 | PSD-95 (1:500) |
| Anticorps primaire | Systèmes synaptiques | 131 004 | vGAT (1:500) |
| Anticorps primaire | Systèmes synaptiques | 147011 | Géphyrine (1:500) |
| Anticorps primaire | Abcam | ab5392 | MAP2 (1:10000) |
| Anticorps secondaire | Jackson Laboratories | 706-545-148 | Donkey Anti-Guinea Pig Alexa Fluor 488 (1:600) |
| Anticorps secondaire | Abcam | ab175470 | Donkey Anti-Rabbit Alexa Fluor 568 (1:600) |
| Milieu de montage | SouthernBiotech | 00-4958-02 | Fluoromount-G |
| Confocal Microscope | Olympus | NA | FV1000 Microscope confocal utilisant un objectif à huile à ouverture numérique (NA) 60x 1,35. Pour vGlut1, utilisez un laser 488 avec un pourcentage de puissance de 14 %. Pour le PSD-95, utilisez un laser 559 avec un pourcentage de puissance de 20 %. |
| Logiciel d’analyse | PerkinElmer | NA | Volocity |
| Scalpel | Swann-Morton | 203 | No 11 |
| Super Glue | Loctite | 1446875 | |
| 95 % O2, 5 % CO2 | BOC | NA | |
| Cylindre 24 puits | Corning | 3524 | |
| Lames de verre Thermo | 7107 | Boîte de Pétri de08 à 1,0 mm d’épaisseur | |
| Corning | 430167 | ||
| souris iDkk1 | N/A | N/A | Les souris ont été obtenues en croisant des souris transgéniques tetO Dkk1 avec des souris transgéniques CaMKII&alpha ; rtTA2. souris transgéniques TetO Dkk1 et CaMKII&alpha ; Les rtTA2 ont été croisés dans un état hétérozygote. Les deux lignées de souris ont été élevées dans un fond C57BL/6J. Un seul transgénique et un seul compagnon de portée WT ont été utilisés comme témoins. |
| Nom | Entreprise | Numéro de catalogue | Comments |
| Réactifs pour solutions : | |||
| NaCl | Sigma | V800372 | |
| KCl | Sigma | P9333 | |
| Na2HPO< sub>4 | Sigma | 255793 | |
| KH2PO4 | Sigma | P9791 | |
| Ca2Cl | Sigma | 223506 | |
| Mg2Cl | Sigma | M9272 | |
| NaH2PO4 | Sigma | 71505 | |
| Acide kynurénique | Sigma | K3375 | |
| NaHCO3 | Sigma | S5761 | |
| Acide pyruvique | Sigma | 107360 | |
| EDTA | Sigma | E6758 | |
| D-Glucose | Sigma | G5767 | |
| Saccharose | Sigma | S8501 | |
| Triton-X | Sigma | T8787 | |
| Sérum d’âne | Millipore | S30-100ml | |
| PFA | Sigma | P6148 |