Isolamento mirato di colonie batteriche mediante degradazione dell'idrogel con pattern di luce

Prendi un vetrino coprioggetti con uno strato di idrogel fotodegradabile che contiene colonie batteriche intrappolate, geneticamente modificate per emettere fluorescenza.

Posizionare il vetrino coprioggetti in un supporto.

Aggiungere terreni per evitare la disidratazione del campione.

Sotto un microscopio a campo chiaro, concentrati su una singola colonia di interesse.

Utilizzando un software appropriato, progettare un modello di luce per l'estrazione cellulare alla periferia della colonia per rompere i legami strutturali dell'idrogel e ridurre al minimo l'esposizione ai raggi UV alle cellule.

Regola l'intensità della luce UV e la durata dell'esposizione.

Avviare l'esposizione alla luce UV per rompere i legami strutturali nell'idrogel nelle aree esposte che facilitano il rilascio della colonia bersaglio.

Utilizzando un filtro a fluorescenza, identificare la colonia.

Posizionare una punta del tubo sul punto, con l'altra estremità collegata a una siringa.

Passa alla modalità campo chiaro e, utilizzando la siringa, aspira la colonia rilasciata.

Trasferire la colonia in una provetta per ulteriori analisi.

Posizionare il campione in un supporto PDMS e aggiungere il terreno definito sopra il campio