Name: Caratterizzazione di trasporto dellelettrone attraverso biofilm vivente (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2018-06-01T12:30:00.000+00:00
Duration: 8 min 52 s
Description: Scopri come misurare la conduttività elettrica di biofilm microbici viventi in condizioni fisiologiche. Questo metodo utilizza elettrodi interdigitati per studiare il trasporto elettronico extracellulare e le sue implicazioni nell'elettrochimica microbica.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

M.D.Y, S.M.G-S. e LMT riconosce l'Office of Naval Research (premio #N0001415WX01038 e N0001415WX00195), il laboratorio di ricerca navale e l'Istituto di Nanoscienze di laboratorio di ricerca navale; M.Y.E.-N. è supportato da l'US Dipartimento di energia Grant DE-FG02-13ER16415.

1. preparazione di interdigitating microelettrodo matrice (IDA)
<ol><li>Ottenere IDA commercialmente disponibile elettrodi modellati su un substrato non conduttivo o sintetizzarli utilizzando metodi standard litografici. 28 Nota: IDA dimensioni e/o materiali possono essere variate sulla base desiderate condizioni per diversi esperimenti. IDAs qui utilizzati sono stati ottenuti in commercio e consisteva di due interdigitating microelettrodo oro modellato su un substrato di vetro collegato ad elettrodi grandi alle estremità opposte della matrice. Gli elettrodi sono esposti mentre le linee di autobus collegamento degli elettrodi per le grandi pastiglie di contatto sono rivestite con materiale isolante sottile. IDAs utilizzati qui sono costituiti da due set di 10 bande di lunga oro microelettrodo µm-wide e 2 mm (source e drain) distanziati di 5 µm apart modellato su una superficie di vetro piano. IDAs utilizzato qui aveva 65 paia di elettrodi (130 totale interdigitating bande). Alternanza di fasce è collegati ad elettrodi alle estremità opposte della matrice.</li>
	<li>Filo e isolare IDA<ol>
<li>Collegare un cavo per ogni pad elettrodo grande utilizzando resina epossidica conduttrice d'argento.<ol>
<li>Preparare la resina epossidica conduttrice secondo le istruzioni del produttore per la resina epossidica specifica in uso con una punta di asta o pipetta miscelazione (istruzioni possono variare dal produttore).</li>
			<li>Posizionare un filo su ogni pad oro, sicuro in posizione con del nastro di laboratorio. Coprire il filo e il pad con epossidica argento usando una punta di asta o pipetta di miscelazione.</li>
			<li>Muovere con cautela per un forno a 80 ° C per 1 h a cura o cura sulla base delle raccomandazioni del produttore per l'epossidica argento conduttiva specifica utilizzato.</li>
			<li>Dopo la resina epossidica cure, è possibile utilizzare un multimetro per garantire connettività elettrica tra la fine del filo e le pastiglie. La resistenza tra il filo e il tampone dovrebbe essere &lt; 5 Ω. Inoltre, è possibile utilizzare il multimetro per verificare che nessun epossidico conduttivo è connessione elettrodi multipli, come questo può breve la matrice. Se la resina epossidica conduttrice è più cavi di collegamento, utilizzare un graffietto per isolare i cavi.</li>
		</ol>
</li>
		<li>Isolare la connessione epoxied rivestendo la connessione con una termica, elettrica e impermeabile materiale isolante. Ritardante di fiamma resine poliuretaniche sono spesso adatte.<ol>
<li>Rimuovere la punta di una provetta conica per centrifuga 15 mL (a circa il marchio di 2,5 mL) come uno stampo per il materiale isolante. Fare due piccoli fori nella parte inferiore per i cavi a sporgere attraverso l'utilizzo di un ago 21G.</li>
			<li>Inserire l'IDA il fili attraverso i fori nella parte inferiore della muffa e della muffa.</li>
			<li>Preparare il materiale isolante specifico. Seguire le istruzioni fornite con la resina specifica ottenuta.</li>
			<li>Pipettare l'isolante nello stampo in modo che la resina epossidica argento è completamente coperto (~2.5 mL) e lasciare per asciugare secondo le specifiche del produttore.</li>
		</ol>
</li>
	</ol>
</li>
</ol>2. elettrochimica reattore installazione, collaudo e inoculazione
<ol><li>Impostare la cella elettrochimica.<ol>
<li>Inserire la cella elettrochimica IDA, controelettrodo ed elettrodo di riferimento. Nota: Il reattore elettrochimico utilizzato può variare notevolmente, fino a quando tutti gli elettrodi forma all'interno. Una considerazione è che l'elettrodo di riferimento dovrebbe essere più vicino possibile all'elettrodo di lavoro dato i limiti pratici del reattore. Qui, usiamo un reattore monocamera con il riferimento dell'elettrodo ~ 2-3 cm dagli elettrodi di lavoro. Inoltre, l'elettrodo contatore deve essere più grande l'elettrodo di lavoro per garantire che non è limitante nel sistema.</li>
		<li>Se si lavora con una coltura pura, sterilizzare il reattore con il controelettrodo all'interno. Sterilizzare l'elettrodo di riferimento in ammollo nella candeggina per 10 min e acqua deionizzata sterile per 10 min. sterilizzare l'IDA mediante immersione in candeggina per 5 s seguita da acqua deionizzata sterile per 10 s prima dell'inserimento nel reattore.</li>
		<li>Riempire la cella elettrochimica con mezzo sterile adatto per la crescita di biofilm. Per g. sulfurreducens17,18, usare acqua dolce mezzo escluse fumarato. Per biocathode MCL,9 usare mezzo artificiale con acqua di mare. 9
</li>
		<li>Collegare gli elettrodi di un bipotentiostat. Collegare un elettrodo di IDA al cavo del lavoro 1, l'altro elettrodo IDA al cavo del lavoro 2, l'elettrodo di riferimento per la Guida di riferimento e il controelettrodo al cavo del contatore.</li>
	</ol>
</li>
	<li>
Test elettrochimici di IDAs. Nota: L'obiettivo principale di questo test è quello di assicurarsi che i due elettrodi sono separati galvanicamente. Tutte le tecniche elettrochimiche sono disponibili nel software utilizzato per controllare il bipotentiostat.<ol>
<li>Eseguire test di conducibilità di controllo (prima crescita di biofilm) per garantire il corretto funzionamento di IDA utilizzando un bipotentiostat.<ol>
<li>Misura il potenziale del circuito aperto di ciascun elettrodo per 1 min. Nota: Su alcuni strumenti, circuito aperto potenziale deve essere raggiunto utilizzando il programma di raccolta di galvanostatici e impostazione della corrente a 0 mA.</li>
			<li>Misura il potenziale del circuito aperto di elettrodo 2 durante l'esecuzione di voltammetria ciclica sull'elettrodo 1 tra + 0,2 V a + 0,6 V (vs lei) a 20 mV/s. Nota: Altri limiti e la frequenza delle analisi per CV può essere utilizzato se lo si desidera. Tuttavia, evitare potenziali che comporterà la generazione di idrogeno o ossigeno.</li>
			<li>Verificare che il circuito aperto potenziali misurato a elettrodo 2 non rispecchiano il potenziale dell'elettrodo 1 durante il CV usando il software potenziostato. Nota: Il potenziale del circuito aperto di elettrodo 2 può cambiare, ma dovrebbe essere indipendente del potenziale di elettrodo 1.</li>
			<li>Ripetere i passaggi da 2.2.1.1 attraverso 2.2.1.3 tranne controllo il potenziale di elettrodo 2 e misura il potenziale del circuito aperto dell'elettrodo 1.</li>
		</ol>
</li>
		<li>Impostare il potenziale di elettrodi di lavoro il potenziale di crescita desiderata del biofilm elettroattivi pertinenti utilizzando il software bipotentiostat. Ad esempio, è possibile utilizzare + 0.5 V (vs lei) per Geobacter sulfurreducens o +0.31 V (vs lei) per biocathode MCL.</li>
	</ol>
</li>
	<li>Crescere pertinenti elettroattivi biofilm<ol>
<li>Inoculare il reattore elettrochimico da un magazzino cultura/arricchimento dei microrganismi elettrochimicamente attivi desiderati utilizzando le tecniche microbiologiche asettiche standard. Per prove standard, inoculare in un 01:20 rapporto (inoculo al volume del reattore) di un OD600 = 0,5 cultura.</li>
		<li>Impostare l'agitazione nel reattore al livello desiderato (~ 200 giri/min) e l'incubatore / bagno di acqua alla temperatura desiderata in base alle condizioni di crescita del biofilm di interesse. Per g. sulfurreducens, utilizzare 30 ° C per una crescita ottimale.</li>
		<li>Incubare il sistema in base a specifici requisiti di microorganism(s) di interesse finché il biofilm colma il divario che separa i due elettrodi. Per stazionario biofilm g. sulfurreducens , incubare per ~ 7-10 giorni. Per biocathode MCL, incubare ~ 7 giorni. In ogni caso, controllare la temperatura a 30 ° C.</li>
	</ol>
</li>
</ol>3. elettrochimici esperimenti gating
<ol><li>Selezionare i parametri sperimentali che verranno utilizzati per determinare la dipendenza di corrente-potenziale per le misurazioni di Gate.
	<ol>
<li>Determinare la portata dei potenziali di cancello che verrà applicato per l'IDA per ottenere la corrente condotta (ISD) contro curva (EG) potenziale di cancello per il sistema. Nota: La gamma dei potenziali cancello esaminato dovrebbe coprire tutti i potenziali con attività redox possibile. Se nessuna informazione circa il sistema di interesse è disponibile, una gamma ampia potenziale dovrebbe essere usato (-da 0,55 a + 0,6 V vs lei). Un approccio di prova ed errore può essere utilizzato per mettere a punto la gamma basata sul sistema oggetto di studio. Cancello di potenziale è definita come: <img alt="Equation 1" src="/files/ftp_upload/54671/54671eq1.jpg"> dove ED è il potenziale dell'elettrodo scarico ed ES è il potenziale dell'elettrodo di origine. La gamma dei potenziali cancello utilizzato è vincolata dai requisiti e limitazioni del sistema specifico di interesse. 18 Nota: Source e drain potenziali che si tradurrà in evoluzione di ossigeno e idrogeno dovrebbero essere evitati come questi processi possono danneggiare il biofilm.</li>
		<li>Determinare la tensione di fonte-drain (VSD) che verrà utilizzata come forza motrice per trasporto di elettroni attraverso la pellicola dall'origine allo scarico. Tensione drain-source è definito come: <img alt="Equation 2" src="/files/ftp_upload/54671/54671eq2.jpg"> Nota: La tensione di fonte-scarico deve essere sufficientemente piccola affinché ISD scalabilità lineare con VSD. 17
</li>
		<li>Scegliere una velocità di scansione (v) a cui EG viene modificato linearmente con il tempo che è indipendente iSD in modo che il sistema può essere approssimato per essere allo stato stazionario per ogni cancello potenziale. Nota: Una velocità di scansione di inferiore a 0,002 V/s viene spesso utilizzata per sistemi biologici. 29 , 30
</li>
		<li>Impostare il software bipotentiostat per eseguire le misurazioni Gate (cioè spazzare il cancello potenziali) sopra l'intervallo selezionato, alla tensione selezionato origine-scarico e alla velocità di scansione desiderata basato sulle considerazioni di cui sopra. Nota: per le misurazioni Gate precedente con g. sulfurreducens,17,19 EG =-da 0,55 V a 0,6 V (vs lei), VSD = 0.01 V o 0,1 V, v = 0.001 V/s. Per Biocathode MCL, EG = 0.25 V a 0.7 V (vs lei), VSD = 0,002 V, v = 0.0002 V/s.<ol>
<li>Inoltre, eseguire una misurazione di base con VSD = 0.000 V (cioè, un CV a ciascun elettrodo individuo effettuato simultaneamente) al v stesso scelto nel passaggio 3.1.3.</li>
		</ol>
</li>
		<li>Eseguire misurazioni Gate utilizzando le condizioni in 3.1.4 sotto entrambi fatturato (con donatore dell'elettrone solubile o accettore presente) e non-fatturato (senza solubile elettrone donatore o accettore). Nota: Non fatturato condizioni sono vantaggiose perché misurazioni non disturbino l'ossidazione o la riduzione dei composti solubili per il metabolismo cellulare, anche se risultati simili dovrebbero essere ottenuti indipendentemente da quale condizione viene utilizzata dopo sottraendo le correnti di fondo (dettagliate in 3.1.8).<ol>
<li>Ottenere condizioni di fatturato utilizzando lo stesso mezzo di reattore come quello usato per la crescita batterica sull'elettrodo. Questa sostanza contiene un donatore di elettroni solubili, quali acetato per g. sulfurreducens,17 o accettore, come l'ossigeno per Biocathode MCL.</li>
			<li>Ottenere condizioni di non-fatturato facendo lo stesso mezzo di reattore utilizzato per la crescita batterica sull'elettrodo, salvo omettere il donatore dell'elettrone solubile o accettore. Dopo aver verificato che il potenziostato è spento, rimuovere asetticamente il mezzo e aggiungere in mezzo fresco senza il donatore dell'elettrone per sistemi anodiche o accettore per sistemi catodica. In alternativa, può istituire un sistema a flusso continuo per sostituire lentamente il mezzo con il mezzo desiderato per nonturnover condizioni. Nota: Se l'ossigeno è l'accettore di elettroni solubile (per quanto riguarda biocathode MCL), sparge il sistema con una miscela di ~ 15% CO2 e 85% N2 (o una miscela di gas che manterrà il pH corretto nel mezzo).</li>
		</ol>
</li>
		<li>Dopo il completamento delle misurazioni Gate, è possibile utilizzare il software potenziostato per impostare il potenziale di ciascun elettrodo torna alla crescita potenziale per consentire al sistema di ri-stabilizzare (utilizzando gli stessi valori 2.2.2).</li>
		<li>Se sono soddisfatte tutte le condizioni sopra descritte (ISD è indipendente di v e scalabilità lineare con VSD), convertire I valoriSD conducibilità utilizzando le seguenti equazioni come descritto in precedenza31 <img alt="Equation 3" src="/files/ftp_upload/54671/54671eq3.jpg"> <img alt="Equation 4" src="/files/ftp_upload/54671/54671eq4.jpg">
</li>
		<li>dove G è la conduttanza e S è un fattore di scala che dipende dal sistema e fattori variabili come la dimensione degli elettrodi, spaziatura e altezza del biofilm. Per alcuni sistemi, S può essere determinato dalle equazioni predeterminati. 31 in alternativa, S può essere calcolata numericamente utilizzando un software di modellazione, come descritto in precedenza. 17
</li>
		<li>Sottrarre le correnti di fondo per identificare la forma e la grandezza della condotta corrente. O sottrarre la corrente generata a VSD = 0.00 V dalla corrente generata a VSD = 0,01 V o sottrarre lo scolo corrente dall'origine corrente generato con una VSD = 0,01 V. entrambi metodo rimuove correnti di fondo, lasciando solo l'attuale condotta.</li>
	</ol></li>
	<li>Misure di gating elettrochimiche dipendente dalla temperatura
	<ol>
<li>Determinare l'intervallo di temperature di interesse. Questa gamma è altamente dipende dal sistema in fase di studio, tuttavia fisiologicamente rilevanti temperature devono essere utilizzate. Nota: Gli studi precedenti hanno usato una gamma di temperatura di 10 ° C a 30 ° C per lo studio di trasporto dell'elettrone in condizioni fisiologicamente rilevanti per i microrganismi mesofili. 17
</li>
		<li>Ottenere un ricircolo bagnomaria o dall'incubatore per regolare la temperatura del reattore e un reattore di controllo per garantire che il set point e la temperatura effettiva del mezzo è lo stesso.<ol>
<li>Inserire un termometro o la termocoppia in un reattore di controllo dove sarebbe l'IDA.</li>
		</ol>
</li>
		<li>Io fare misurazioni diSD (vedere 3.1.4) sopra la gamma di temperature selezionate sotto fatturato e nonturnover (descritto al punto 3.1.5) condizioni utilizzando il bipotentiostat seguendo una delle due procedure descritte di seguito.<ol>
<li>Generare ISD contro le curve EG , come descritto in precedenza (Vedi 3.1), per ogni temperatura sopra la gamma di temperature di interesse. Per i materiali che esibiscono conducibilità redox, come g. sulfurreducens e Biocathode MCL, la corrente di picco da ogni temperatura viene utilizzato per determinare ISD vs dipendenza da T. Nota: Questo metodo è utilizzato per generare un completo hoSD vs EG curva per ogni temperatura, ma richiede più tempo che la seconda opzione.</li>
			<li>In alternativa, impostare e tenere premuto l'IDA al cancello potenziale che produce massimo condotto corrente utilizzando il bipotentiostat (ottenuti da ISD curva di vs EG , punto 3.1.4) e registrare la massima corrente condotta utilizzando il bipotentiostat mentre la temperatura è in bici tra la gamma di temperature selezionato mediante i comandi a bordo del bagnomaria o dall'incubatore. Nota: con la geometria dell'elettrodo/reattore utilizzata qui, ISD e T sono autorizzati a stabilizzare per almeno 20 min e una media stabile hoSD viene utilizzato per ogni temperatura. Più o meno tempo di stabilizzazione può essere richiesto sulla base del sistema specifico. Questo metodo è più veloce rispetto alla prima e provoca meno stress per il biofilm. Tuttavia, non vengono generate curve piene di Gate.</li>
			<li>La temperatura del ciclo da un set point a altro e viceversa utilizzando nuovamente i controlli a bordo di incubatore o bagnomaria per determinare la reversibilità della reazione per garantire che la temperatura in bicicletta non danneggia il biofilm.</li>
		</ol>
</li>
		<li>Ripristinare la temperatura la temperatura di crescita normale utilizzando i controlli a bordo dell'incubatore o bagnomaria e consentire al sistema di stabilizzare. Nota: Per un conduttore di redox, laSD rispetto a dati di 1/T posso essere misura con l'espressione tasso di Arrhenius, che permette il calcolo dell'energia di attivazione come segue: <img alt="Equation 5" src="/files/ftp_upload/54671/54671eq5.jpg"> <img alt="Equation 6" src="/files/ftp_upload/54671/54671eq6.jpg"> dove Euna è l'energia di attivazione per il trasferimento di elettroni tra cofattori redox adiacente e k è la costante di Boltzmann.</li>
	</ol></li>
</ol>

<ol><li>Boyd, D. A., et al. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aBoyd%2C+DA+%22Biofilms+in+Bioelectrochemical+Systems%22">Biofilms in Bioelectrochemical Systems</a>. , John Wiley & Sons, Inc. 177-210 (2015).</li>
<li>Natan, M. J., Wrighton, M. S. <a target="_blank" href="http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/9780470166383.ch6/summary">Chemically modified microelectrode arrays.</a> Prog Inorg Chem. 7, 391-494 (1990).</li>
<li>Paul, E. W., Ricco, A. J., Wrighton, M. S. <a target="_blank" href="http://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/j100254a028">Resistance of polyaniline films as a function of electrochemical potential and the fabrication of polyaniline-based microelectronic devices.</a> J Phys Chem-US. 89, 1441-1447 (1985).</li>
<li>Dalton, E. F., et al. <a target="_blank" href="http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/030101049080026T">Charge transport in electroactive polymers consisting of fixed molecular redox sites.</a> Chem Phys. 141, 143-157 (1990).</li>
<li>Chidsey, C. E. D., Murray, R. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Electroactive+Polymers+and+Macromolecular+Electronics%5BTitle%5D)+AND+%22Science%22%5BJournal%5D)">Electroactive Polymers and Macromolecular Electronics.</a> Science. 231, 25-31 (1986).</li>
<li>Chidsey, C. E. D., Murray, R. W. <a target="_blank" href="http://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/j100398a051">Redox capacity and direct current electron conductivity in electroactive materials.</a> J Phys Chem-US. 90, 1479-1484 (1986).</li>
<li>Gregoire, K. P., Glaven, S. M., Hervey, J., Lin, B., Tender, L. M. <a target="_blank" href="http://jes.ecsdl.org/content/161/13/H3049.full">Enrichment of a High-Current Density Denitrifying Microbial Biocathode.</a> J Electrochem Soc. 161, H3049-H3057 (2014).</li>
<li>Siegert, M., Yates, M. D., Spormann, A. M., Logan, B. E. <a target="_blank" href="http://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/acssuschemeng.5b00367">Methanobacterium dominates biocathodic Archaeal communities in methanogenic microbial electrolysis cells.</a> ACS Sus Chem Eng. 3, 1668-1676 (2015).</li>
<li>Wang, Z., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+previously+uncharacterized%2C+nonphotosynthetic+member+of+the+Chromatiaceae+is+the+primary+CO2-fixing+constituent+in+a+self-regenerating+biocathode%5BTitle%5D)+AND+%22Appl+Environ+Microbiol%22%5BJournal%5D)">A previously uncharacterized, nonphotosynthetic member of the Chromatiaceae is the primary CO2-fixing constituent in a self-regenerating biocathode.</a> Appl Environ Microbiol. 81, 699-712 (2015).</li>
<li>Marshall, C. W., Ross, D. E., Fichot, E. B., Norman, R. S., May, H. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Long-term+Operation+of+Microbial+Electrosynthesis+Systems+Improves+Acetate+Production+by+Autotrophic+Microbiomes%5BTitle%5D)+AND+%22Environ+Sci+Technol%22%5BJournal%5D)">Long-term Operation of Microbial Electrosynthesis Systems Improves Acetate Production by Autotrophic Microbiomes.</a> Environ Sci Technol. 47, 6023-6029 (2013).</li>
<li>Strik, D. P. B. T. B., Picot, M., Buisman, C. J. N., Barrière, F. <a target="_blank" href="http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/elan.201200358/full">pH and Temperature Determine Performance of Oxygen Reducing Biocathodes.</a> Electroanalysis. 25, 652-655 (2013).</li>
<li>Strycharz, S. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Reductive+dechlorination+of+2-chlorophenol+by+Anaeromyxobacter+dehalogenans+with+an+electrode+serving+as+the+electron+donor%5BTitle%5D)+AND+%22Environ+Microbiol+Report%22%5BJournal%5D)">Reductive dechlorination of 2-chlorophenol by Anaeromyxobacter dehalogenans with an electrode serving as the electron donor.</a> Environ Microbiol Report. 2, 289-294 (2010).</li>
<li>Yates, M. D., et al. <a target="_blank" href="http://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/acs.estlett.7b00335">Microbial Electrochemical Energy Storage and Recovery in a Combined Electrotrophic and Electrogenic Biofilm.</a> Environ Sci Technol Lett. 4, 374-379 (2017).</li>
<li>Tender, L. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Harnessing+microbially+generated+power+on+the+seafloor%5BTitle%5D)+AND+%22Nature+Biotechnology%22%5BJournal%5D)">Harnessing microbially generated power on the seafloor.</a> Nature Biotechnology. 20, 821-825 (2002).</li>
<li>Yates, M. D., Siegert, M., Logan, B. E. <a target="_blank" href="http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0360319914022733">Hydrogen evolution catalyzed by viable and non-viable cells on biocathodes.</a> Int J Hydrogen Energ. 39, 16841-16851 (2014).</li>
<li>Fokina, O., Eipper, J., Winandy, L., Kerzenmacher, S., Fischer, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Improving+the+performance+of+a+biofuel+cell+cathode+with+laccase-containing+culture+supernatant+from+Pycnoporus+sanguineus%5BTitle%5D)+AND+%22Bioresource+Technol%22%5BJournal%5D)">Improving the performance of a biofuel cell cathode with laccase-containing culture supernatant from Pycnoporus sanguineus.</a> Bioresource Technol. 175, 445-453 (2015).</li>
<li>Yates, M. D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Thermally+activated+long+range+electron+transport+in+living+biofilms%5BTitle%5D)+AND+%22Phys+Chem+Chem+Phys%22%5BJournal%5D)">Thermally activated long range electron transport in living biofilms.</a> Phys Chem Chem Phys. 17, 32564-32570 (2015).</li>
<li>Yates, M. D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Measuring+conductivity+of+living+Geobacter+sulfurreducens+biofilms%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Nano%22%5BJournal%5D)">Measuring conductivity of living Geobacter sulfurreducens biofilms.</a> Nat Nano. 11, 910-913 (2016).</li>
<li>Snider, R. M., Strycharz-Glaven, S. M., Tsoi, S. D., Erickson, J. S., Tender, L. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Long-range+electron+transport+in+Geobacter+sulfurreducens+biofilms+is+redox+gradient-driven%5BTitle%5D)+AND+%22Proc+Natl+Acad+Sci+USA%22%5BJournal%5D)">Long-range electron transport in Geobacter sulfurreducens biofilms is redox gradient-driven.</a> Proc Natl Acad Sci USA. 109, 15467-15472 (2012).</li>
<li>Strycharz-Glaven, S. M., Snider, R. M., Guiseppi-Elie, A., Tender, L. M. <a target="_blank" href="http://pubs.rsc.org/en/content/articlelanding/2011/ee/c1ee01753e">On the electrical conductivity of microbial nanowires and biofilms.</a> Energ Environ Sci. 4, 4366-4379 (2011).</li>
<li>Malvankar, N. S., Tuominen, M. T., Lovley, D. R. <a target="_blank" href="https://www.tib.eu/en/search/id/BLSE%3ARN307893550/Comment-on-On-electrical-conductivity-of-microbial/">Comment on "On electrical conductivity of microbial nanowires and biofilms" by S. M. Strycharz-Glaven, R. M. Snider, A. Guiseppi-Elie and L. M. Tender, Energy Environ. Sci., 2011, 4, 4366.</a> Energy Environ. Sci. 5, 6247-6249 (2012).</li>
<li>Malvankar, N. S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Tunable+metallic-like+conductivity+in+microbial+nanowire+networks%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Nanotechnol%22%5BJournal%5D)">Tunable metallic-like conductivity in microbial nanowire networks.</a> Nat Nanotechnol. 6, 573-579 (2011).</li>
<li>Strycharz-Glaven, S. M., Tender, L. M. <a target="_blank" href="http://pubs.rsc.org/en/content/articlelanding/2012/ee/c2ee03056j/">Reply to the 'Comment on "On electrical conductivity of microbial nanowires and biofilms"' by N. S. Malvankar, M. T. Tuominen and D. R. Lovley, Energy Environ. Sci., 2012, 5.</a> Energy Environ. Sci. 5, 6250-6255 (2012).</li>
<li>Strycharz-Glaven, S. M., et al. <a target="_blank" href="http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/celc.201402168/abstract">Electron Transport through Early Exponential-Phase Anode-Grown Geobacter sulfurreducens Biofilms.</a> Chem Electro Chem. 1, 1957-1965 (2014).</li>
<li>Chidsey, C. E., Feldman, B. J., Lundgren, C., Murray, R. W. <a target="_blank" href="http://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/ac00294a026">Micrometer-spaced platinum interdigitated array electrode: fabrication, theory, and initial use.</a> Anal Chem. 58, 601-607 (1986).</li>
<li>Li, C., Lesnik, K. L., Fan, Y., Liu, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Redox+Conductivity+of+Current-Producing+Mixed+Species+Biofilms%5BTitle%5D)+AND+%22PLOS+ONE%22%5BJournal%5D)">Redox Conductivity of Current-Producing Mixed Species Biofilms.</a> PLOS ONE. 11, e0155247(2016).</li>
<li>Malvankar, N. S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Tunable+metallic-like+conductivity+in+microbial+nanowire+networks%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Nano%22%5BJournal%5D)">Tunable metallic-like conductivity in microbial nanowire networks.</a> Nat Nano. 6, 573-579 (2011).</li>
<li>Ing, N. L., Nusca, T. D., Hochbaum, A. I. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Geobacter+sulfurreducens+pili+support+ohmic+electronic+conduction+in+aqueous+solution%5BTitle%5D)+AND+%22Phys+Chem+Chem+Phys%22%5BJournal%5D)">Geobacter sulfurreducens pili support ohmic electronic conduction in aqueous solution.</a> Phys Chem Chem Phys. 19, 21791-21799 (2017).</li>
<li>Fricke, K., Harnisch, F., Schröder, U. <a target="_blank" href="http://pubs.rsc.org/en/content/articlehtml/2008/EE/B802363H">On the use of cyclic voltammetry for the study of anodic electron transfer in microbial fuel cells.</a> Energ Environ Sci. 1, 144-147 (2008).</li>
<li>Marsili, E., Rollefson, J. B., Baron, D. B., Hozalski, R. M., Bond, D. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Microbial+biofilm+voltammetry%3A+direct+electrochemical+characterization+of+catalytic+electrode-attached+biofilms%5BTitle%5D)+AND+%22Appl+Environ+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Microbial biofilm voltammetry: direct electrochemical characterization of catalytic electrode-attached biofilms.</a> Appl Environ Microbiol. 74, 7329-7337 (2008).</li>
<li>Kankare, J., Kupila, E. -L. <a target="_blank" href="http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/002207289280074E">In-situ conductance measurement during electropolymerization.</a> J Electroanal Chem. 322, 167-181 (1992).</li>
<li>Byun, H. S., Pirbadian, S., Nakano, A., Shi, L., El-Naggar, M. Y. <a target="_blank" href="http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/celc.201402211/abstract">Kinetic Monte Carlo Simulations and Molecular Conductance Measurements of the Bacterial Decaheme Cytochrome MtrF.</a> Chem Electro Chem. 1, 1932-1939 (2014).</li>
<li>El Kasmi, A., Wallace, J. M., Bowden, E. F., Binet, S. M., Linderman, R. J. <a target="_blank" href="http://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/ja973417m">Controlling interfacial electron-transfer kinetics of cytochrome c with mixed self-assembled monolayers.</a> J Am Chem Soc. 120, 225-226 (1998).</li>
<li>Bortolotti, C. A., et al. <a target="_blank" href="http://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/jz200734a">The Reorganization Energy in Cytochrome c is Controlled by the Accessibility of the Heme to the Solvent.</a> J Phys Chem Lett. 2, 1761-1765 (2011).</li>
<li>Gallaway, J. W., Calabrese Barton, S. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Kinetics+of+Redox+Polymer-Mediated+Enzyme+Electrodes%5BTitle%5D)+AND+%22J+Am+Chem+Soc%22%5BJournal%5D)">Kinetics of Redox Polymer-Mediated Enzyme Electrodes.</a> J Am Chem Soc. 130, 8527-8536 (2008).</li>
<li>Thackeray, J. W., White, H. S., Wrighton, M. S. <a target="_blank" href="http://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/j100269a048">Poly(3-methylthiophene)-coated electrodes: optical and electrical properties as a function of redox potential and amplification of electrical and chemical signals using poly(3-methylthiophene)-based microelectrochemical transistors.</a> J Phys Chem-US. 89, 5133-5140 (1985).</li>
<li>Jugnet, Y., Tourillon, G., Duc, T. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Evidence+of+Intrinsic+Extended+%CF%80-Bonding+Band+and+Metalliclike+Behavior+in+Undoped+and+Doped+Electropolymerized+Poly+%283-methylthiophene%29+Films%5BTitle%5D)+AND+%22Phys+Rev+Lett%22%5BJournal%5D)">Evidence of Intrinsic Extended π-Bonding Band and Metalliclike Behavior in Undoped and Doped Electropolymerized Poly (3-methylthiophene) Films.</a> Phys Rev Lett. 56, 1862-1865 (1986).</li>
</ol>

Gli autori non hanno nulla a rivelare.

Durante l'installazione di IDA, è fondamentale per verificare che l'origine e lo scarico non sono corto insieme prima misure elettrochimiche di Gate, come questo altererà ISD vs curva EG e potrebbe portare a interpretazioni e risultati errati. È anche fondamentale per selezionare VSD e v tale che la corrente è linearmente dipendente da VSD e indipendente di v. Se questo non è il caso, le equazioni descritte sopra non possono essere utilizzate per calcolare la conduttività.
...

Extracellulare di trasporto dell'elettrone (EET) è un processo che consente alcuni microrganismi per il trasporto di elettroni tra processi metabolici intracellulari e insolubile accettori o donatori che risiedono all'esterno della cella, che vanno da minerali naturali per elettrodi. In alcuni casi, EET consente microrganismi formare elettricamente conduttivo della multi-cellula spesse biofilm su superfici di elettrodo, in cui le cellule non a diretto contatto con l'elettrodo possono utilizzare ancora come un ricettore dell'elettrone metabolica o donatore. C'è un notevole interesse in tali biofilm come catalizzatori di elettrodo per varie applicazioni, come elettrosintesi microbica, rilevamento/rimozione di contaminanti e generazione di energia a distanza e stoccaggio,7,8,9 ,10,11,12,13,14 a causa della diversità dei processi metabolici, eseguita da microrganismi e la durevolezza di biofilm microbici rispetto a base di enzima bioelettrodi. 15 , 16 inoltre, EET vie possono potenzialmente essere utilizzate per modifiche elettricamente controllo o segnale di naturali o geneticamente microbici processi metabolici coinvolti, ad esempio, nella produzione di un prodotto desiderato o rilevamento di un analita o stimolo. La conduttività elettrica di elettrocatalitica biofilm, che li distingue da altri materiali biologici, è un aspetto centrale della loro proprietà elettrocatalitiche, ancora poco è capito circa il processo di EET fondo nell'ambiente dell'elettrodo, e ciò che è noto è fortemente contestata. 17 , 18 , 19 , 20 , 21 , 22 , 23 , 24
Qui descritto è un metodo di 2 elettrodi per misurare la conducibilità attraverso biofilm living, elettrodo-coltivate utilizzando matrici interdigitating elettrodo (IDAs). IDAs consistono di elettrodi rettangolari paralleli modellati sulla superficie di vetro piano in modo tale che ogni altra band è collegata ai lati opposti della matrice risultante in 2 elettrodi (la fonte e scolo). L'esame attento di una IDA (Vedi ad esempio, la figura 6.12b di ref #1) rivela che il divario che separa le bande adiacenti è anche collegati in modo tale da formare un singolo spacco che intreccia avanti e indietro attraverso la matrice che separa i due elettrodi. Il risultato è un lungo e stretto che separa gli elettrodi di source e drain, ottenendo molto alta fonte-scarico correnti quando un materiale conduttivo è formato, il cast, polimerizzato o cresciuto (nel caso del tipo di biofilm considerato qui) la matrice. Inoltre, le piccole dimensioni degli elettrodi si traduce in piccolo sfondo corrente a causa della capacità di carica e di cambiare in stato di ossidazione del materiale conduttivo con cambio a cancello potenziale, poiché la quantità di materiale necessario per rendere la conducibilità le misurazioni con IDAs sono così piccole. La tecnica di base di IDA gating elettrochimico descritto qui, sviluppato per caratterizzare i polimeri conduttivi a film sottile,2,3,4,25 solo recentemente è stata applicata ai sistemi viventi. 18 un'altra tecnica utilizzata per misurare la conducibilità dei biofilm vivente utilizzato un grande formato split elettrodi di source e drain e metri di origine per impostare la porta potenziali. 26 , 27 tuttavia, preoccupazioni per questi metodi sono state dettagliate in precedenza. 18
Incapsula il protocollo qui sotto la nostra esperienza con effettuare accurate misure di conduttività del vivere biofilm MCL Geobacter sulfurreducens e biocathode. G. sulfurreducens è un elettrodo di modello riducendo l'organismo in grado di utilizzare materiali insolubili, compresi gli elettrodi, come il ricettore dell'elettrone metabolica suola. Inoltre, forma biofilm spesse che sono in grado di trasportare elettroni su più celle di lunghezza, che lo rende un organismo modello ideale per studiare il trasferimento di elettroni a distanza extracellulare anodica. Includiamo anche dettagli per lo studio della biocathode MCL, un biofilm aerobica, autotrofi comunità mista isolato dal catodo di una cella a combustibile microbica bentonico. Biocathode MCL (così chiamato per i tre costituenti primari – Marinobacter, Chromatiaceaea e Labrenzia) è in grado di ossidanti un elettrodo come suo unico elettrone donatore e trasporto di elettroni su più celle di lunghezza, rendendo ha un interessante sistema di catodico per studiare. Inoltre, biocathode MCL ha la più alta conducibilità segnalata per un sistema vivente fino ad oggi utilizzando questi metodi. L'inclusione di questi biofilm elettroattivi diversificata in questo protocollo è destinato per evidenziare che questa tecnica è applicabile al trasporto di elettroni attraverso qualsiasi biofilm vivente in grado di interagire elettricamente con elettrodi di misura.

<table><tbody><tr><td>IDAs</td><td>CH Instruments</td><td>012125</td><td>Prodotto da ALS-Japan; venduto da CH Instruments</td></tr><tr><td></td><td>Filo Digikey</td><td>W7-ND</td><td></td></tr><tr><td>Argento conduttivo epossidico</td><td>Microscopia elettronica scienze 12670-EE</td><td></td><td></td></tr><tr><td>Materiale isolante</td><td>3M</td><td>2131-B</td><td>Composto ritardante di fiamma Scotchast</td></tr><tr><td>15 mL provetta da centrifuga conica</td><td>VWR</td><td>89004-368</td><td></td></tr><tr><td>ago da 21 g</td><td>VWR</td><td>BD-305165</td><td></td></tr><tr><td>puntali per pipette da 5 mL</td><td>VWR</td><td>82018-842</td><td></td></tr><tr><td>pipettatore da 5 mL</td><td>VWR</td><td>89079-976</td><td></td></tr><tr><td>Componenti del mezzo d'acqua dolce</td><td>Sigma Aldrich</td><td>Tutti i prodotti chimici</td><td></td> di laboratorio standard</tr><tr><td>&nbsp; &nbsp; &nbsp; Cloruro</td><td></td><td></td><td></td> di ammonio</tr><tr><td>&nbsp; &nbsp; &nbsp; Sodio fosfato monobasico</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>&nbsp; &nbsp; &nbsp; Bicarbonato</td><td></td><td></td><td></td>di sodio</tr><tr><td>Componenti medi artificiali per acqua di mare</td><td>Sigma Aldrich</td><td>Tutti i prodotti chimici</td><td></td> di laboratorio standard</tr><tr><td>&nbsp; &nbsp; &nbsp; Cloruro di</td><td></td><td></td><td></td> sodio</tr><tr><td>&nbsp; &nbsp; &nbsp; Cloruro di magnesio esaidrato</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td> &nbsp; &nbsp; Solfato di magnesio eptaidrato</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td> &nbsp; &nbsp; Cloruro di</td><td></td><td></td><td></td> potassio</tr><tr><td>&nbsp; &nbsp; &nbsp; Bicarbonato</td><td></td><td></td><td></td> di sodio</tr><tr><td>&nbsp; &nbsp; &nbsp; Cloruro di calcio diidrato</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td> &nbsp; &nbsp; Cloruro</td><td></td><td></td><td></td> di ammonio</tr><tr><td>&nbsp; &nbsp; &nbsp; Elettrodo</td> di riferimento Ag/AgCl bibasico <td></td><td></td><td></td>fosfato di potassio</tr><tr><td></td><td>Basi</td><td>MF-2079</td><td></td></tr><tr><td>Controelettrodo a barre in grafite</td><td>Microscopia elettronica</td><td>scienze 70230</td><td></td></tr><tr><td>Bagno d'acqua a ricircolo</td><td>Thermo Scientific</td><td>152-5256</td><td></td></tr><tr><td>Bipotenziostato</td><td>Pine Instruments</td><td>WD-20</td><td>http://www.voltammetry.net/pine/aftermath/user</td></tr><tr><td>Ancorette</td><td>VWR</td><td>58947-114</td><td></td></tr><tr><td>G. sulfurreducens coltura</td><td>ATCC</td><td>51573</td><td></td></tr><tr><td>Reattore incamiciato</td><td>Pine Instruments</td><td>RRPG085</td><td></td></tr></tbody></table>

caratterizzazione di trasporto dell'elettrone attraverso biofilm vivente

Characterizing Electron Transport through Living Biofilms

Qui dimostriamo che il metodo di gating elettrochimico utilizzato per caratterizzare la conduttività elettrica di biofilm microbici elettrodo-coltivate in condizioni fisiologicamente rilevanti. 1 queste misurazioni vengono eseguite su biofilm vivente in mezzo acquoso utilizzando origine e scarico elettrodi modellati su una superficie di vetro in una configurazione specializzata indicata come un array di elettrodi interdigitating (IDA). Un biofilm è coltivato che si estende attraverso il gap che collega la fonte e scolo. I potenziali sono applicati agli elettrodi (ES ed ED) generando una corrente di fonte-scarico (ISD) attraverso il biofilm tra gli elettrodi. La dipendenza della conducibilità elettrica sul potenziale del cancello (la media delle potenzialità di source e drain, EG = [ED + ES] / 2) è determinata sistematicamente cambiando il cancello potenziale e misurando il conseguente drenaggio di origine corrente. La dipendenza della conducibilità sul cancello potenziale fornisce meccanicistici informazioni sul processo di trasporto extracellulare dell'elettrone sottostante la conduttività elettrica del biofilm specifico sotto inchiesta. Il metodo di misurazione gating elettrochimico qui descritto si basa direttamente su quello utilizzato dal M. S. Wrighton2,3 e colleghi e R. W. Murray4,5,6 e colleghi in il 1980 è indagare su polimeri conduttivi a film sottile.

IDAs erano cablata, isolate e testate per garantire che i due elettrodi erano elettricamente isolati da altro (Figura 1). Reattori sono stati assemblati, inoculati con g. sulfurreducense incubate fino a quando un biofilm colmato il divario tra gli elettrodi. Il biofilm di g. sulfurreducens può essere visto visivamente per coprire la matrice. Altri biofilm possono richiedere al ricercatore di fare un gating misure elettrochimiche per vedere s...

Un protocollo per la misurazione di conduttività elettrica di biofilm microbici viventi in condizioni fisiologicamente rilevanti è presentato.

Caratterizzazione di trasporto dell'elettrone attraverso biofilm vivente

Here we demonstrate the method of electrochemical gating used to characterize electrical conductivity of electrode-grown microbial biofilms under ...

L'obiettivo generale di questa procedura sperimentale è determinare la quantità di corrente che può essere condotta attraverso un materiale vivente in situ, nonché il meccanismo impiegato dal materiale vivente per trasportare la corrente. Questo metodo potrebbe aiutare a rispondere a domande chiave nel campo dell'elettrochimica microbica come: come possono alcuni biofilm spostare gli elettroni per centinaia di micron per supportare il metabolismo cellulare? Il vantaggio principale di questa tecnica è che gli elettrodi interdigitati forniscono un rapporto segnale/rumore molto elevato e possono essere scalati per adattarsi a molte configurazioni di reattori diverse.Questi metodi possono fornire informazioni sul trasporto di elettroni extracellulari di lunghezza multicellulare nei biofilm. Può essere applicato anche ad altri sistemi, come i film polimerici elettricamente conduttivi. I ricercatori nuovi a questo metodo avranno difficoltà perché richiede un bipotenziostato per impostare separatamente i potenziali di entrambi gli elettrodi e misurare la corrente su ciascun elettrodo separatamente.Per iniziare, è necessario ottenere elettrodi IDA disponibili in commercio modellati su un s

characterizing-electron-transport-through-living-biofilms

Research

Ricerca

JoVE Journal

Chemistry

Chimica

Fonte: Tokunou, Y. et al., Rilevamento elettrochimico dell'effetto isotopico cinetico del deuterio sul trasporto extracellulare degli elettroni in Shewanella oneidensis MR-1. J. Vis. Esp. (2018)Questo video dimostra l'assemblaggio e il funzionamento di un modello di reattore elettrochimico progettato per simulare la formazione di biofilm su superfici di elettrodi. La stimolazione elettrochimica controllata favorisce l'adesione microbica, portando allo sviluppo graduale di un biofilm monostrato...

Sviluppo di un biofilm monostrato batterico utilizzando un reattore elettrochimico

Viene dimostrata la crescita cronoamperometrica di biofilm microbici elettroattivi anodici in un reattore a batch alimentato utilizzando una configurazione a tre elettrodi, controllata da un potenziostato. Il trasferimento extracellulare di elettroni è caratterizzato mediante voltammetria ciclica in presenza del donatore di elettroni e in assenza del donatore di elettroni. Viene dimostrata l'analisi fondamentale dei dati.

Biofilm microbici elettroattivi derivati dalle acque reflue: crescita, mantenimento e caratterizzazione di base

L'obiettivo di questo metodo è di descrivere l'uso di un sistema microfluidico per lo sviluppo del biofilm multispecie che contengono specie tipicamente identificate nella placca dentale sopragengivale umana. Metodi per descrivere l'architettura biofilm, la vitalità biofilm, e un approccio alla raccolta biofilm per le analisi di coltura-dipendente o indipendente dalla cultura sono evidenziati.

L&#39;uso di un high-throughput<em&gt; In Vitro</em&gt; Microfluidic sistema per sviluppare orale biofilm Multi-specie

I biofilm hanno interazioni complesse con l'ambiente circostante. Per studiare in modo completo le interazioni biofilm-ambiente, presentiamo qui una serie di metodi per creare un ambiente chimico eterogeneo per lo sviluppo del biofilm, per quantificare la velocità del flusso locale e per analizzare il trasporto di massa all'interno e intorno alle colonie di biofilm.

Metodi per caratterizzare il co-sviluppo di biofilm e Habitat Eterogeneità

Questo studio presenta lo sviluppo di metodologie riproducibili per studiare gli inibitori del biofilm e i loro effetti sulla multicellularità del Bacillus subtilis.

Metodologie per lo studio<em&gt; B. subtilis</em&gt; I biofilm come modello per Caratterizzare piccole molecole inibitori biofilm

Questo articolo presenta un metodo per la coltivazione di un biofilm per in situ spettrometria totale di ione secondaria tempo di volo per la mappatura chimica allo stato idratato, attivata da un reattore di microfluidica, sistema per analisi presso l'interfaccia liquida di vuoto. Shewanella oneidensis MR-1 con proteine di fluorescenza verde è stato usato come modello.

In Situ Caratterizzazione di Shewanella oneidensis MR1 biofilm di SALVI e ToF-SIMS

Qui presentiamo un protocollo della intero-cellula elettrochimici esperimenti per studiare il contributo del trasporto di protoni per il tasso di trasporto dell'elettrone extracellulare attraverso il membrana esterna citocromi complessi di Shewanella oneidensis MR-1.

Elettrochimico rilevamento di deuterio isotopo effetto cinetico su extracellulare di trasporto dell'elettrone nella Shewanella oneidensis MR-1

Citometria a flusso in combinazione con il clustering visual offre un facile da usare e veloce metodo per lo studio di biofilm acquatici. Può essere utilizzato per la caratterizzazione di biofilm, rilevamento delle modifiche nella struttura della comunità di biofilm e la rilevazione delle particelle abiotiche incorporato nel biofilm.

Caratterizzazione di biofilm acquatici con citometria a flusso

Qui presentiamo un protocollo per caratterizzare il trasferimento di elettroni extracellulari mediato (EET) nei batteri lattici utilizzando un sistema bioelettrochimico a tre elettrodi e due camere. Illustriamo questo metodo con il Lactiplantibacillus plantarum e il mediatore redox acido 1,4-diidrossi-2-naftoico e forniamo una descrizione approfondita delle tecniche elettrochimiche utilizzate per valutare l'EET mediata.

Caratterizzazione del trasferimento di elettroni extracellulari mediato nei batteri dell'acido lattico con un sistema bioelettrochimico a tre elettrodi e due camere

In questo lavoro, una procedura per quantificare i parametri di trasporto di massa di sostanze chimiche in vari materiali è presentato. Questo processo prevede l'impiego di un modello di diffusione basato inversa analisi al vapore profili di emissione registrati dal tempo reale, spettrometria di massa in alto vuoto.

Un approccio di analisi inversa per la caratterizzazione dei Trasporti Chemical nelle vernici

Scopri come misurare la conduttività elettrica di biofilm microbici viventi in condizioni fisiologiche. Questo metodo utilizza elettrodi interdigitati per studiare il trasporto elettronico extracellulare e le sue implicazioni nell'elettrochimica microbica.

Caratterizzazione di trasporto dell'elettrone attraverso biofilm vivente

Esplora altri video