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DOI: 10.3791/65926-v
Qingyue Zhang1,2, Marc A. Kerzhnerman1,2, Nelson García-Vázquez1,2,3, Gergely Rona1,2,4,5
1Department of Biochemistry and Molecular Pharmacology,NYU Grossman School of Medicine, 2The Laura and Isaac Perlmutter Cancer Center,NYU Langone Health, 3Department of Cell Biology,NYU Grossman School of Medicine, 4Howard Hughes Medical Institute,NYU Grossman School of Medicine, 5Institute of Enzymology, Centre of Excellence of the Hungarian Academy of Sciences,HUN-REN Research Centre for Natural Sciences
Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.
This study addresses the detection of single-stranded DNA foci during the G1 phase of the cell cycle, emphasizing the importance of DNA repair mechanisms. Utilizing cell cycle synchronization and RPA2 immunofluorescent staining, the method provides a robust way to visualize DNA damage across various cell cycle stages.
Il seguente protocollo presenta la rilevazione di focolai di DNA a singolo filamento nella fase G1 del ciclo cellulare utilizzando la sincronizzazione del ciclo cellulare seguita dalla colorazione immunofluorescente RPA2.
La risposta al danno del DNA è indispensabile per la vita. Poiché il DNA è costantemente esposto a vari motori dannosi, la mancanza della loro riparazione porta all'instabilità e alle malattie dei genomi. Abbiamo sviluppato un metodo basato sulle proprietà biologiche dell'RPA2, per visualizzare il tratto di DNA a singolo filamento durante la riparazione del DNA in diverse fasi del ciclo cellulare.
Il metodo tradizionale per la rilevazione del DNA a singolo filamento utilizza gli anticorpi BrdU. Questo approccio può essere utilizzato per replicare attivamente le cellule. Inoltre, questo anticorpo tende a reagire in modo incrociato con altri analoghi nucleotidici, limitandone l'uso.
A differenza del BRDU, il nostro approccio ha un rapporto segnale/rumore più elevato, che lo rende utilizzabile in ogni fase del ciclo. Comprendere l'azione delle diverse vie di riparazione del DNA nelle varie fasi del ciclo cellulare e delle cellule potenzialmente non replicanti è fondamentale. Il nostro protocollo fornisce un nuovo approccio e uno strumento per visualizzare i focolai di DNA a singolo filamento, dove gli approcci classici che utilizzano BrdU sono limitati.
Una comprensione completa dei processi di riparazione del DNA potrebbe servire come bersagli terapeutici per trattare il cancro, l'invecchiamento e le malattie neurologiche. La maggior parte delle nostre cellule sono terminalmente differenziate e quindi non si replicano e non si dividono. È fondamentale ottenere una migliore comprensione di come queste cellule riparano varie lesioni del DNA.
Pertanto, il nostro laboratorio si concentrerà principalmente sui processi di riparazione del DNA post-replicativo e sullo sviluppo di nuovi strumenti per studiarli.
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