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DOI: 10.3791/66530-v
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Qui, presentiamo un protocollo che descrive in dettaglio l'acquisizione, l'elaborazione e l'analisi di una serie di esperimenti NMR volti a caratterizzare le interazioni proteina-glicano in soluzione. Vengono descritte le metodologie più comuni basate su ligandi e proteine, che indubbiamente contribuiscono ai campi della glicobiologia strutturale e degli studi di riconoscimento molecolare.
La nostra ricerca approfondisce lo studio di diversi sistemi di lectine glicano, esplorando le loro connessioni con la salute e la malattia. Abbiamo unito metodologie di chimica, biologia e biomedicina per studiare a fondo i ruoli nelle risposte immunitarie ai patologi, dal cancro alle infezioni batteriche e virali. Recentemente, le scienze del glico hanno segnato pietre miliari rivoluzionarie trasformando la progettazione, la sintesi e l'analisi dei glicani negli aspetti strutturali del riconoscimento molecolare dal livello atomico a quello cellulare.
Questi progressi pongono le basi per terapie fluorescenti o avanzate a base di glicani. Questo protocollo delinea le procedure per l'acquisizione, l'elaborazione e l'analisi di due delle più potenti metodologie NMR impiegate nel campo dei glicani. Queste metodologie, la differenza di trasferimento di saturazione e l'analisi delle perturbazioni chimiche sicure offrono informazioni precise sugli aspetti strutturali e dinamici del riconoscimento molecolare dei licheni.
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