Preparazione automatica del campione per l'analisi multiplexata delle modifiche post-traduzionali delle istane a singola (sc-hPTM2)

Stiamo facendo avanzare la proteomica a singola cellula con un metodo multiplex automatizzato per studiare l'eterogeneità globale della cromatina per modifiche post-traduzionali. Ciò che rende questo protocollo impegnativo è la preparazione proteomica su scala picogrammica, la marcatura multiplex e la risoluzione di peptidi istoni complessi modificati combinatori. Per cominciare, ricostituire le cellule epatocellulari del carcinoma epatocellulare dell'epatite G2/C3A a una concentrazione finale di 200-500 cellule per microlitro in PBS gelato.

Imposta la larghezza dell'impulso e la tensione di trasmissione di ogni ugello ai valori forniti dal produttore. Per la massima efficienza del pickup, assicurarsi che lo spostamento Z tra i due ugelli differisca di meno di 50 micrometri. Identifica la posizione ottimale di contatto per ciascun ugello e confronta le letture dell'altezza Z nella scheda di configurazione dell'ugello.