ホスト病原体のタンパク質 - タンパク質相互作用の風景を特徴づけるために比較的アプローチ

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2013年7月18日

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2013年7月18日

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Mandy Muller^*¹^,² , Patricia Cassonnet^*¹ , Michel Favre¹ , Yves Jacob¹^,³ , Caroline Demeret¹

¹Unité de Génétique, Papillomavirus et Cancer Humain (GPCH), Institut Pasteur , ²Cellule Pasteur, Université Sorbonne Paris Cité, ³Center for Cancer Systems Biology (CCSB), Harvard Medical School, Department of Cancer Biology, Dana Farber Cancer Institute

^* These authors contributed equally

この記事では、ホストと二つの直交の方法を組み合わせて使用して病原体のタンパク質間の高い自信インタラクションデータセットの識別に焦点を当てています：酵母ツーハイブリッドHT-GPCA呼ばれる哺乳動物細胞におけるハイスループット相互作用アッセイが続く。

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宿主病原体相互作用

酵母ツーハイブリッド法

Gaussiaルシフェラーゼアッセイ

比較インタラクトミクス

病原体菌株変異体

タンパク質断片相補法

階層的クラスタリング

細胞内相互作用パートナー

ハイスループットスクリーニング

Chapters in this video

0:05

タイトル

2:02

酵母ツーハイブリッドスクリーニング

5:21

PCRおよびシーケンシングによるHIS3陽性クローンのスクリーニング

7:00

細胞へのトランスフェクション

8:26

細胞溶解およびGaussiaルシフェラーゼ量の測定

9:23

ホタルルシフェラーゼ活性の測定および標準化発光比（NLR）の算出

10:29

結果：ヒトパピローマウイルス早期タンパク質E2、E6、E7におけるウイルス-宿主タンパク質間相互作用の特性解析

13:05

結論

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