ExCYT: 高次元フローサイトメトリーデータの分析を合理化するためのグラフィカルユーザーインターフェイス

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2019年1月16日

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John-William Sidhom¹^,²^,³ , Debebe Theodros¹^,²^,⁴ , Benjamin Murter¹^,² , Jelani C. Zarif¹^,² , Sudipto Ganguly¹^,² , Drew M. Pardoll¹^,² , Alexander Baras¹^,²^,⁵

¹The Bloomberg~Kimmel Institute for Cancer Immunotherapy, Johns Hopkins University School of Medicine, ²The Sidney Kimmel Comprehensive Cancer Center, Johns Hopkins University School of Medicine, ³Department of Biomedical Engineering, Johns Hopkins University School of Medicine, ⁴Department of Immunology, Johns Hopkins University School of Medicine, ⁵Department of Pathology, Johns Hopkins University School of Medicine

ExCYT は、MATLAB ベースグラフィカルユーザーインターフェイス (GUI) を介して流れ cytometry データをよく分析できる採用法 t SNE、さまざまな自動および手動による次元圧縮を含む高次元データの解析技術クラスタリングの方法、ヒートマップなど、および新規高次元フローがプロットされます。