翻訳後修飾とバリアントの高速、定量的な方法はペプチドのゲノムへのマッピングを有効に
10.7K 回視聴
•
3 件の引用
•
09:10 分
•
2018年5月22日
DOI :10.3791/57633-v
2018年5月22日
•10.7K 回視聴
Christoph N. Schlaffner1,2,3 , Georg J. Pirklbauer2 , Andreas Bender3 , Judith A.J. Steen1 , Jyoti S. Choudhary2,4
1Department of Neurobiology, F. M. Kirby Neurobiology Center, Boston Children's Hospital, Harvard Medical School, 2Proteomic Mass Spectrometry, Wellcome Trust Sanger Institute, Wellcome Genome Campus, 3Centre for Molecular Informatics, Department of Chemistry, University of Cambridge, 4Functional Proteomics Group, Chester Beatty Laboratories, Institute of Cancer Research
Proteogenomic ツールの紹介ポゴと高速、量的なポスト翻訳の修正、変形のためのプロトコルの参照ゲノム上に質量分析法によってペプチド マッピングを有効にします。このツールは統合、proteogenomic や個人的なプロテオーム研究直交ゲノム解析データとのインタ フェースを表示するために使用します。
Chapters in this video
0:05
Title
0:51
Mapping of Peptides using PoGoGUI
2:36
Visualizing in the Integrative Genomics Viewer
3:57
Mapping Peptides Identified Through a Custom Variant Database to a Reference Genome
4:44
Mapping Peptides from Multiple Files Using PoGoGUI
5:48
Generating a Track Hub from Mapped Peptides and Visualizing a Track Hub in the UCSC Genome Browser
6:50
Results: Post-translational Modification and Varient Enabled Mapping of Peptides to Genomes
8:21
Conclusion
Related Videos
著作権 © 2026 MyJoVE Corporation. 無断転載を禁じます。