翻訳後修飾とバリアントの高速、定量的な方法はペプチドのゲノムへのマッピングを有効に

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2018年5月22日

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2018年5月22日

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Proteogenomic ツールの紹介ポゴと高速、量的なポスト翻訳の修正、変形のためのプロトコルの参照ゲノム上に質量分析法によってペプチド マッピングを有効にします。このツールは統合、proteogenomic や個人的なプロテオーム研究直交ゲノム解析データとのインタ フェースを表示するために使用します。

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PoGoソフトウェア

Chapters in this video

0:05

タイトル

0:51

PoGoGUIを用いたペプチドのマッピング

2:36

Integrative Genomics Viewerでの可視化

3:57

カスタムバリアントデータベースによって同定されたペプチドのリファレンスゲノムへのマッピング

4:44

PoGoGUIを用いた複数ファイルからのペプチドのマッピング

5:48

マッピング済みペプチドからのトラックハブの作成およびUCSCゲノムブラウザでのトラックハブの可視化

6:50

結果:翻訳後修飾およびバリアントを利用したペプチドのゲノムへのマッピング

8:21

結論

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