Using Cleavage Under Targets and Tagmentation (CUT&#38;Tag) Assay in Mouse Myoblast Research

Yuefeng Li; Xiaofen Wu; Ping Hu

doi:10.3791/66066

Cleavage Under Targets and Tagmentation (CUT&Tag) Assay in Mouse Myobblast Researchにおける活用

JoVE Journal
Developmental Biology
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Using Cleavage Under Targets and Tagmentation (CUT&Tag) Assay in Mouse Myoblast Research

Cleavage Under Targets and Tagmentation (CUT&Tag) Assay in Mouse Myobblast Researchにおける活用

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07:09 min

March 1, 2024

DOI: 10.3791/66066-v

Yuefeng Li^1,2, Xiaofen Wu^1,2, Ping Hu^1,2

¹Guangzhou Laboratory, ²The Key Laboratory of Biological Targeting Diagnosis, Therapy and Rehabilitation of Guangdong Higher Education Institutes,The Fifth Affiliated Hospital of Guangzhou Medical University

Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

エピジェネティックな分野に不慣れな研究者は、CUT&TagがChIPアッセイの非常に簡単な代替手段であることに気づくでしょう。CUT&Tagは、希少細胞集団と初代細胞集団のエピジェネティック研究に多大な恩恵をもたらし、非常に少数の細胞から高品質のデータを生成しました。このプロトコールでは、マウス後肢筋から単離したマウス筋芽細胞に対するH3K4me1 CUT&Tagアッセイの実施について説明します。

私たちのグループでは、成体骨格筋幹細胞のゲノム構造と転写が、特に幹細胞の関与、分化、白癬などの硫酸塩の変化時にどのように制御および維持されるかに焦点を当てています。成体骨格筋幹細胞は、筋肉組織中の単核細胞のわずか1%しか占めておらず、筋肉消化から得られる単一細胞懸濁液には乏しいため、High-C、ChIP、およびATAC配列を用いたクロマチン特徴研究には課題があります。クロマチン免疫沈降法(ChIP)は、ゲノムの特徴をプロファイリングするための重要なツールとなっています。

Steven Henikoff博士によって開発された、よりシンプルで効率的なcut&tag技術は、特に希少細胞集団のエピジェネティクスの研究において、しばしばChIPを凌駕しています。その使いやすさは、エピジェネティックな専門家ではない研究者を含む研究者のアクセスを広げます。

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