Name: 기능화 비스 - 펩타이드의 고상 합성은 방법론 을 안전 잡아라사용 (동영상) | JoVE Journal
Uploaded: 2012-05-15T13:00:00.000+00:00
Duration: 11 min 42 s
Description: 배우세요 고상 합성법을 사용하여 기능화된 비스-펩타이드를 합성하는 방법입니다. HMBA 레진에서 안전 잡아라 클리브지 기법으로 약 10% 수율을 달성하며, 단백질 상호작용 및 촉매 연구에 활용됩니다.

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저자는 유용한 토론이 고체 상 합성 기술과 매튜 플로리다 파커의 초기 개발을 위해 박사 Z, 재커리 브라운과 제니퍼 Alleva 감사드립니다. 이 작품은 Cephalon, 주식 회사에서 지원하는 국방 위협 감소 기관 (국방부-DTRA) (HDTRA1-09-1-0009)와 호르스트 Witzel 원정대 수상에 의해 지원됩니다

1. 설치 <ol><li> 고체 상 합성을위한 반응이 설정은 그림 1과 같이 진공 하에서 밀폐된 여과 플라스크에 폴리 프로필렌 튜브를 통해 연결되어있는 폴리 프로필렌 필터 카트리지 또는 유리 반응기입니다. 반응은 자기 볶음 표시줄이나 반응을 통해 질소를 품어하여 혼합 수 있습니다. </li><li> 그것이 반응 용기는 불활성 분위기 하에서 억제시킬 수 있으며 밀폐 용기에서 시약의 제거를 허용로 건조 튜브 및 석유 버블러 갖춘 아르곤 실린더에 연결된 가스 매니폴드도 권장합니다. </li><li> 모든 작업은 연기 후드 및 적절한 개인 보호 장비 (안전 안경, 실험 복과 nitrile 장갑) 필요로 진행됩니다. </li></ol> 2. 수지에 비스 - 펩타이드 첫째로드 <ol><li> 8 ML 반응 용기에 HMBA-AM 수지 (0.88 mmol / G 로딩, 100 μmol)의 114 MG를 저울질하고 자기 저어 막대를 추가합니다. 회의 최상위를 쏠적어도 5 분 동안 아르곤과 고무 심장과 퍼지 튜브와 전자 들어왔습니다. </li><li> 한편, 그림 3 (586.63 g / 몰, 2eq)와 1 59.2 밀리그램의 화합물 1 117.3 밀리그램의 무게를 - (mesitylene-2-sulfonyl)-3-니트로-1 ,2,4-triazole (MSNT, 296.0 15 ML 일회용 원심 튜브로 G / 몰, 2eq) 2 ML 무수 dichloromethane (DCM)에서 해산. 완전히 녹아까지 솔루션과 믹스에 1-methylimidazole (NMI, 80.81 ML / 몰, 3eq) 24 μL를 추가합니다. </li><li> 주사기를 통해 반응 혈관에 활성화된 솔루션을 전송하고 아르곤 하룻밤 (~ 10 시간) 아래로 휘몰아 수 있습니다. </li><li> 심장을 제거하고 반응 혼합물을 드레인. DCM (5 배)와 dimethylformamide (DMF) (5 배)와 수지 씻으십시오. 수지로드의 정도를 평가하기 위해 섹션 10.1에서 설명한 &quot;메틸 레드 시험&quot;을 수행합니다. 수지는 메틸 레드 시험 중에 빨간색으로 남아있다면 2.2와 2.3가 반복되어야 단계. 부정적인 메틸 레드 시험 나타내는 노란 색깔, 선호이다;그러나, 모든 남아있는 수산기 그룹이 다음 단계로, 약간 긍정적인 결과 (밝은 오렌지색 수지 색상)에 공을되기 때문이다 허용있을 수 있습니다. </li></ol> 3. 상한 먼저 비스 - 펩타이드와 동시 수지의 Deprotection <ol><li> 반응 용기에 DCM 1 ML 추가 다음 삼십초 (기포 발생) 이상 아세트산 dropwise에 1 ML 33 % 브롬화 수소 (HBr)를 추가하고 15 분 동안 저어 수 있습니다. DCM (5 배)와 수지를 분출과 씻고 나서 다시 한 번 과정을 반복합니다. </li><li> DCM (5 배) 후 DMF (5 배)와 수지 씻으십시오. N의 5 % V / V 솔루션, DMF의 N-diisopropylethylamine (DIPEA) 후 DCM (5 배)하고 다시 DMF (5 배)로 씻어로 두 번 세척하여 수지를 무력화. &quot;메틸 레드 시험&quot;과 섹션 10.1 10.2에 나와 &quot;chloranil 검사&quot;를 수행합니다. 결과 chloranil 시험 메틸 시험 빨간색과 긍정을위한 부정이어야합니다. </li></ol> 4. 커플링 Boc / tBu 방지 작용 비스 - 아미더 산성 없음 <ol><li> 무수 DCM로 세 번 세척하여 수지가 들어있는 반응 용기에 불활성 분위기를 다시 소개 그러면 심장과 아르곤 라인을 첨부합니다. 정화 및 무수 DCM에서 한두 ML를 추가하고 아르곤 라인 버블러가 상승하기 시작 때까지 선박 배수 30 초 동안 저어 놓아 혈관을 씻는다. 최소 한번 더이 작업을 수행합니다. </li><li> 불꽃 건조 시험에서 DMF : 비스 - 아미노산 (3eq)와 2시 1분 DCM 2 ML 1 - 히드록시-7-azabenzotriazole (HOAt, 136.11 g / 몰, 18eq)의 245 밀리그램을 기능화 0.15 M의 용액을 준비한다 아르곤 분위기 하에서 튜브. diisopropylcarbodiimide 47 μL (DIC, 156.6 ML / 몰, 3eq)을 추가하고 90 분간 저어. </li><li> 수지에 666 μL 무수 DMF 35 μL DIPEA를 (174.19 ML / 몰, 2eq) 추가 5 분 동안 저어 수 있습니다. </li><li> 주사기를 통해 반응 용기에 미리 활성화된 비스 - 아미노산 솔루션을 전송하고 하룻밤 휘몰아 수 있습니다. </li><li> 반응 혼합물을 분출과 무수 DCM로 두 번 씻어 하의<html> 아르곤. </li><li> diketopiperazine의 폐쇄를 홍보하려면 1시 1분 DCM의 4 ML에 HOAt (136.11 g / 몰, 10eq) 및 DIC (156.6 ML / 몰, 10eq)의 0.25 M 용액 추가 DMF하고 아르곤 아래로 휘몰아 수 1 시간 정도. </li><li> 심장을 제거하고 반응 혼합물을 드레인. DCM (5 배)와 DMF (5 배)와 수지 씻으십시오. 원하는 경우 섹션 10.2에서 논의된 &quot;chloranil 테스트&quot;를 수행합니다. </li></ol> 5. Boc / tBu 방지 작용 비스 - 아미노산의 Deprotection <ol><li> 반응 용기에 triisopropylsilane (도움말 참조)하고 1 시간 정도 저어 수 : 95:5 trifluororacetic 산 (TFA)의 솔루션이 ML을 추가합니다. 배수하고 다시 한 번 과정을 반복 DCM (5 배)로 약 30 초 동안 수지 씻는다. </li><li> DCM (5 배) 후 DMF (5 배)와 수지 씻으십시오. 그리고 DCM (5 배)하고 다시 DMF를 (5 배) 씻어 DMF에 DIPEA의 5 % V / V 솔루션으로 두 번 세척하여 수지를 무력화. 원하는 경우 섹션 10.2에서 논의된 &quot;chloranil 테스트&quot;를 수행합니다. </li></ol>비스 - 펩타이드 타겟으로 합성하기 원하는대로 르 &quot;&gt; 6. 반복 4 단계와 5. 7. 비스 - 펩타이드의 Prolidine 엔드 Functionalizing <ol><li> 성장 비스 - 펩타이드의 prolidine 엔드는 diketopiperazine를 통해 독립적으로 또는 함께 acylated 수 있습니다. 또한이 부분이 무료로 아미노산을 affording, 후자를 죽습 수있는 보호 남아있을 수 있습니다. 원하는 경우, 커플링 효율을 평가하기 위해 섹션 10.2에 나와 &quot;chloranil 테스트&quot;를 수행합니다. </li></ol> 8. 비스 - 펩타이드의 제사기 엔드 Fmoc 및 Acylation의 Deprotection <ol><li> 20 분 동안 DMF의 20 % 피페리딘의 2mL 솔루션이 추가되고 반응이 혼합됩니다. DMF (5 배)와 수지를 분출과 씻고 나서 다시 한 번 과정을 반복합니다. </li><li> DCM (5 배) 후 DMF (5 배)와 수지 씻으십시오. </li><li> MG 2 114과 N-methylpyrrolidone 2 ML (NMP)에 아미노산 (3eq)의 0.15 M 용액을 준비한다 - (7 아자 1H-benzotriazole-1-yl) -1,1,3,3-tetramethyluronium hexafluorophosphate<html> (HATU, 380.2 g / 몰, 3eq)와 104.5 μL DIPEA (174.19 ML / 몰, 6eq)와 잘 섞는다. 반응 용기에 넣고 6 시간 동안 저어 수 있습니다. </li><li> DCM (5 배) 후 DMF (5 배)와 수지 씻으십시오. </li></ol> 9. 수지에서 아미노산과 다니엘를 묶고있는 수지에서 Boc 그룹 제거 <ol><li> 반응 용기에 DCM 솔루션과 30 분간 볶음 수 : 1:1 TFA 2 ML을 추가합니다. DCM (5 배)와 수지를 분출과 씻고 나서 다시 한 번 과정을 반복합니다. </li><li> 그리고 DCM (5 배) DMF (5 배)와 30 초 수지를 씻어 및 드레인. </li><li> 무수 DMF의 10 % DIPEA의 솔루션이 ML을 추가하고 24~48시간 저어 수 있습니다. </li><li> 미리 무게 둥근 바닥 플라스크에 반응 혼합물을 수집합니다. LC-MS의 약병에 THF의 450 μL에이 용액의 30 μL를 전송 및 분석을 위해 제출합니다. DMF의 추가 aliquots으로 수지를 씻어하고 둥근 바닥 플라스크에 수집 후 vacuo에서 용매 제거합니다. </li></ol>&quot;dflinebreak&gt; 10. 비스 - 펩타이드의 정제 <ol><li> HPLC의 유리병에 삽입 디메틸 sulfoxide (100-250 μL) 및 전송의 최소 금액 비스 - 펩타이드 원유를 해산. 세미 prepitive HPLC 시스템 (휴렛 패커드 1100 시리즈)의 autosampler에 장소 인서트는 엑스 테라를 몰았어 초등학교 MS C18 5 μm의 7.8x150 밀리미터 칼럼과 100 μL 주입 루프가 장착되어. </li><li> 274 NM에서 모니터링을하면서 삼십분 동안 0.1 % 개미의 산성과 함께 물에 5~95%의 acetonitrile의 그라디언트 프로그램을 사용하여 샘​​플의 여러 50 μL 주입을 수행합니다. 미리 무게 일회용 원심 튜브에 제품 피크를 수집하고 lyophilizer를 사용하여 건조 동결.주의는 일반적으로 관찰되고 분석 LCMS에 비해 피크 유지 시간에 약간의 변화로 처음 실행으로 연결됩니다. </li></ol> 11. 평가 방법 <ol><li> 메틸 레드 테스트 7: 일회용 피펫을 통해 건조 수지 ~ 1 밀리그램을 제거 4 ML 반응 용기에 린스. 500 μL 무수 DCM에 20 밀리그램 메틸 레드, 50 μL N, N&#39;-diisopropylcarbodiimide (DIC), 5 MG 4-dimethylaminopyridine (DMAP)의 솔루션을 추가하고 5-10 분 동안 저어 수 있습니다. 분출과 여과물가 무색 될 때까지 DCM와 수지를 씻는다. 긍정적인 징후가 주황색이나 빨간색이 남아있는 수지 비즈입니다. </li><li> CHLORANIL TEST를 12 : 전송 ~ 일회용 피펫을 통해 작은 유리병에 건조 수지 1 밀리그램. 0.8 밀리미터 DMF 용액에서 chloranil 및 DMF 용액에 2 % 아세트 알데히드 모두 3 방울을 추가하고 5-10분 동안 실내 온도에 앉아 보자. 긍정적인 징후가 보라색 / 청색 터닝 수지 비즈입니다. </li><li> 활성 트랩 테스트 : 합성하는 동안 활성 화합물은 액체 크로마 토그래피 - 질량 분석법 (LC-MS) pyrrolidine 50 μL를 포함 유리병에 활성 솔루션의 소량 (5-10 μL)를 전송하여 평가 할 수 있습니다. 몇 초 동안 손으로 믹스 (soluti에 tetrahydrofuran (THF)의 450 μL로 희석와 LC-MS 분석에 제출 후) 노란색 수있게됩니다. </li><li> 분석 LC-MS : 최종 제품 및 활성 중간체는 워터스 엑스 테라를 몰았어 MS C18 3.5 μm의이 장착된 HP 1200 시리즈 LC-MS 시스템을 사용하여 평가받을 수있는 4.6 mm X 150mm 칼럼과 물에 5-95%의 acetonitrile의 기울기 시스템 삼십분 이상 0.1 % 개미의 산성으로. </li></ol> 12. 대표 결과 두 원유의 예 (그림 4)와 정화는 (그림 5) LCMS의 흔적이 제공됩니다. 약 10 %의 정제 수율은 위에서 설명한 방법을 사용하여 예상된다. <img alt="그림 1" src="/files/ftp_upload/4112/4112fig1.jpg" /> 그림 1. 고상 합성에 대한 실험 설정의 다이어그램. <img alt="그림 2" src="/files/ftp_upload/4112/4112fig2.jpg" /> 그림 2.비스 - 아미노산 / BIS-펩티드의 관련 명명법. <img alt="그림 3" src="/files/ftp_upload/4112/4112fig3.jpg" /> 그림 3. 전체 합성 제도. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/4112/4112fig3large.jpg" target="_blank">큰 그림을 보려면 여기를 누르십시오</a> . <img alt="그림 4A" src="/files/ftp_upload/4112/4112fig4a.jpg" /> 그림 4A. 274 NM에서 조잡 제품의 HPLC 추적. <img alt="그림 4B" src="/files/ftp_upload/4112/4112fig4b.jpg" /> 그림 4B. 조잡 제품 피크의 MS 스펙트럼. <img alt="그림 5A" src="/files/ftp_upload/4112/4112fig5a.jpg" /> 그림 5A. 274 NM에서 제품을 죄를 씻고의 HPLC 추적. <img alt="그림 5B" src="/files/ftp_upload/4112/4112fig5b.jpg" /> 정화 Produc의 그림 5B. MS 스펙트럼t 피크.

<ol><li>Atherton, E., Sheppard, R. C. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aAtherton%2C+E+%22Solid+Phase+Peptide+Synthesis%3A+A+Practical+Approach%22">Solid Phase Peptide Synthesis: A Practical Approach</a>. , Oxford University Press. (1989).</li>
<li>Brown, Z. Z., Alleva, J., Schafmeister, C. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Solid-Phase+Synthesis+of+Functionalized+Bis-Peptides%5BTitle%5D)+AND+%22Biopolymers%22%5BJournal%5D)">Solid-Phase Synthesis of Functionalized Bis-Peptides.</a> Biopolymers. 96, 578-585 (2010).</li>
<li>Schafmeister, C. E., Brown, Z. Z., Gupta, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Shape-Programmable+Macromolecules%5BTitle%5D)+AND+%22Acc.+Chem.+Res%22%5BJournal%5D)">Shape-Programmable Macromolecules.</a> Acc. Chem. Res. 41, 1387-1398 (2008).</li>
<li>Brown, Z. Z., Schafmeister, C. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Synthesis+of+Hexa-+and+Pentasubstituted+Diketopiperazines+from+Sterically+Hindered+Amino+Acids%5BTitle%5D)+AND+%22Org.+Let%22%5BJournal%5D)">Synthesis of Hexa- and Pentasubstituted Diketopiperazines from Sterically Hindered Amino Acids.</a> Org. Let. 12, 1436-1439 (2010).</li>
<li>Nielson, J., Lyngso, L. O. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Combinatorial+Solid-Phase+Synthesis+of+Balanol+Analogues%5BTitle%5D)+AND+%22Tet.+Lett%22%5BJournal%5D)">Combinatorial Solid-Phase Synthesis of Balanol Analogues.</a> Tet. Lett. 37, 8439-8442 (1996).</li>
<li>Blankemeyer-Menge, B., Nimtz, M., Frank, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((An+Efficient+Method+for+Anchoring+Fmoc-Amino+Acids+to+Hydroxyl-Functionalized+Solid+Supports%5BTitle%5D)+AND+%22Tet.+Lett%22%5BJournal%5D)">An Efficient Method for Anchoring Fmoc-Amino Acids to Hydroxyl-Functionalized Solid Supports.</a> Tet. Lett. 31, 1701-1704 (1990).</li>
<li>Komba, S., Sasaki, S., Machida, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+New+Colorimetric+Test+for+Detection+of+Hydroxyl+Groups+in+Solid-Phase+Synthesis%5BTitle%5D)+AND+%22Tet.+Lett%22%5BJournal%5D)">A New Colorimetric Test for Detection of Hydroxyl Groups in Solid-Phase Synthesis.</a> Tet. Lett. 48, 2075-2078 (2007).</li>
<li>Demner, O., Dijkgraaf, I., Schottelius, M., Wester, H. J., Kessler, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Introduction+of+Functional+Groups+into+Peptides+via+N-Alkylation%5BTitle%5D)+AND+%22Org.+Lett%22%5BJournal%5D)">Introduction of Functional Groups into Peptides via N-Alkylation.</a> Org. Lett. 10, 2015-2018 (2008).</li>
<li>Plas, S. E. V. ander, Van Hoeck, E., Lynen, F., Sandra, P., Madder, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Toward+a+New+SPE+Material+for+EDCs%3A+Fully+Automated+Synthesis+of+a+Library+of+Tripodal+Receptors+Followed+by+Fast+Screening+by+Affinity+LC%5BTitle%5D)+AND+%22Eur.+J.+Org.+Chem%22%5BJournal%5D)">Toward a New SPE Material for EDCs: Fully Automated Synthesis of a Library of Tripodal Receptors Followed by Fast Screening by Affinity LC.</a> Eur. J. Org. Chem. 11, 1796-1805 (2009).</li>
<li>Kaiser, E., Colescot, R. L., Bossinger, C. D., Cook, P. I. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Color+Test+for+Detection+of+Free+Terminal+Amino+Groups+in+Solid-Phase+Synthesis+of+Peptides%5BTitle%5D)+AND+%22Anal.+Biochem%22%5BJournal%5D)">Color Test for Detection of Free Terminal Amino Groups in Solid-Phase Synthesis of Peptides.</a> Anal. Biochem. 34, 595-598 (1970).</li>
<li>Chan, W. C., White, P. D. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aChan%2C+WC+%22Fmoc+Solid+Phase+Peptide+Synthesis%3A+A+Practical+Approach%22">Fmoc Solid Phase Peptide Synthesis: A Practical Approach</a>. , Oxford University Press. (2000).</li>
<li>Vojkovsky, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Detection+of+Secondary+Amines+on+Solid-Phase%5BTitle%5D)+AND+%22Peptide+Research%22%5BJournal%5D)">Detection of Secondary Amines on Solid-Phase.</a> Peptide Research. 71, 236-237 (1995).</li>
</ol>

관심의 어떠한 충돌 선언 없습니다.

본 발표 합성 방식은 일반적인 고체 상 펩타이드 합성 기술을 사용하여 비스 - 아미노산 빌딩 블록에서 작용 비스 - 펩티드의 합성에 대한 방법을 제공합니다. 트랜스-4-hydroxyproline 3에서 이러한 &quot;Pro4&quot;빌딩 블록의 단량체 합성은 높은 확장성이며 성공적으로 600 mmol (234 G) 규모 (게시되지 않은)에서 hydantoin 단계로 완료되었음을 알려드립니다. 단량체가 손에있다되면 고체 상 기술을 사용하여 반응 직장 업과 중간 purifications에 대한 필요성을 제거하여 현재 솔루션 상 방법론 4보다 비스 - 펩타이드 합성의 더 빠른 방법을 제공합니다. 고체 상 합성의 주요 과제는 더 중간체가 고립되지부터 해결 합성 진보와 문제를 진단하고 있습니다. 이것은 식별 비롯하여 많은 colorimetric 시험의 개발에 앞서있다면 무료로 아민 (카이저 시험 10) 또는 무료 하이드yls (메틸 레드 시험 7) 수지에 노출됩니다. 불행히도, 일반적으로 사용되는 카이저 시험 10 제사기 탄소에 연결된 보조 아민 또는 아민의 거의 독점적인 사용으로 인한 우리의 고체 상 합성에서 일반적으로 적용되지 않습니다. HMBA 수지에 대한 평가를위한 다른 옵션은 히드 라진 11, VIS / UV 1,11에 의해 모니터링 정량 Fmoc 절단으로 nucleophile를 사용하고 포집 및 수신 활성 화합물을 분석하는 테스트 cleavages을 포함합니다. 고체 상 합성의 또 다른 간과할 문제는 운영자가 필요한 합성 단계의 반복적인 성격이다. 이것은 마음과 함께 모든 수동 고체 상 펩타이드 합성을 수행할 때, 저자는 강력하게 스프레드 시트 또는 체크리스트의 사용을 권장합니다. 흔히 α-아미노산에 비해 고체 상 합성을위한 비스 - 펩티드를 사용하는 difficultly은 steric 힌을로 인해 더 어려워 커플링의 가능성을 포함drance, 온 - 수지 diketopiperazine의 폐쇄에 대한 필요성, 그리고 동시 deprotections (Boc / tBu; Cbz / tBu). 또 다른 difficultly 더 전통적인 방법에 비해이 &quot;안전 캐치&quot;방법을 사용하여 수지의 양적 자료를 달성에있다. 염두에두고 이러한 요소의 경우는,이​​ 방법의 더 최적화가 달성하고 현재의 노력이 여기에 제시된 방법을 개선하기 위해 그룹에서 진행 될 수있는 것은 아주 가능하다.

<table border="1"><tr><td> 이름 </td><td> 회사 </td><td> 카탈로그 번호 </td><td> 댓글 </td></tr><tr><td> HMBA 암을 수지 </td><td> NovaBiochem </td><td> 855,018 </td><td></td></tr><tr><td> MSNT </td><td> NovaBiochem </td><td> 851,011 </td><td></td></tr><tr><td> NMI </td><td> 시그마 - 올드 리치 </td><td> 336,092 </td><td> 유독, 부식 </td></tr><tr><td> DCM </td><td> 시그마 - 올드 리치 </td><td> <a href="http://www.sigmaaldrich.com/catalog/ProductDetail.do?lang=en&amp;N4=D65100%7CSIAL&amp;N5=SEARCH_CONCAT_PNO%7CBRAND_KEY&amp;F=SPEC" target="_blank">D65100</a> </td><td> 발암성 </td></tr><tr><td> 무수 DCM </td><td> Acros </td><td> 34,846 </td><td> 발암성 </td></tr><tr><td> 아세트산의 33 % 브롬화 수소 (HBr) </td><td> 시그마 - 올드 리치 </td><td> 248,630 </td><td> 유독, Corrosive, 가스 때 열려 </td></tr><tr><td> DIPEA </td><td> 시그마 - 올드 리치 </td><td> 387,6​​49 </td><td> 부식, 독성, 가연성 </td></tr><tr><td> DMF </td><td> 피셔 과학 </td><td> AC27960 </td><td> 독성, 가연성 </td></tr><tr><td> 무수 DMF </td><td> Acros </td><td> 34,843 </td><td> 독성, 가연성 </td></tr><tr><td> HOAt </td><td> GenScript </td><td> C01568 </td><td></td></tr><tr><td> DIC </td><td> Acros </td><td> BP590 </td><td> 부식, 독성, 가연성 </td></tr><tr><td> TFA </td><td> 시그마 - 올드 리치 </td><td> T6508 </td><td> 유독, 부식 </td></tr><tr><td> 팁 </td><td> Acros </td><td> 21,492 </td><td> 독성, 가연성 </td></tr><tr><td> 피페리딘 </td><td> 시그마 - 올드 리치 </td><td> 104,094 </td><td> 부식, 독성, 가연성 </td></tr><tr><td> HATU </td><td> GenScript </td><td> C01566 </td><td&gt; 독성 </td></tr><tr><td> NMP </td><td> Acros </td><td> 36,438 </td><td> 유독한 </td></tr><tr><td> DMAP </td><td> NovaBiochem </td><td> 851,055 </td><td> 유독한 </td></tr><tr><td> 메틸 레드 </td><td> 시그마 - 올드 리치 </td><td> 250,198 </td><td></td></tr><tr><td> THF </td><td> 시그마 - 올드 리치 </td><td> 401,757 </td><td> 성형 가연성, 독성, 과산화수소 </td></tr><tr><td> Pyrrolidine </td><td> 시그마 - 올드 리치 </td><td> P73803 </td><td> 부식, 독성, 가연성 </td></tr><tr><td> 디메틸 Sulfoxide </td><td> 어부 </td><td> D1281 </td><td></td></tr><tr><td> SPPS 반응 선박 </td><td> 은혜 </td><td> 211,108 </td><td></td></tr><tr><td> LCMS </td><td> 애질런트 </td><td> 1200 시리즈 </td><td></td></tr><tr><td> 세미 초등학교 LC </td><td> 휴렛 팩커드 </td><td> 1100 시리즈 </td><td></td></tr><tR&gt; <td> Lyophilizer </td><td> Labconco </td><td> 7,934,027 </td><td></td></tr><tr><td> Rotovapor </td><td> Buchi </td><td> R-210 시리즈 </td><td></td></tr><tr><td> 아르곤 </td><td> Airgas </td><td> AR PP300CT </td><td></td></tr></table>

기능화 비스 - 펩타이드의 고상 합성은 방법론 &quot;을 안전 잡아라&quot;사용

Solid Phase Synthesis of a Functionalized Bis-Peptide Using "Safety Catch" Methodology

1962 년, RB Merrifield 효율적으로 펩티드를 합성하는 새로운 경로로 고체 상 펩타이드 합성을 사용하여 첫 번째 절차를 발간했습니다. 이 기술은 빠른 시간과 노동 모두에서 자사의 솔루션 상 전임자 이상의 유리임이 밝혀졌다. 고체 지원의 성격에 관한 개선, 보호 그룹은 고용과 지난 50 년 동안 고용 커플링 방법은 Merrifield의 ​​원래 시스템의 유용성을 증가하고있다. 오늘날 Boc 기반 보호 및베이스 / nucleophile cleavable 수지 전략이나 Fmoc 기반 보호 및 산성 cleavable 수지 전략의 사용은 가장 일반적으로 펩티드 1의 합성에 사용되며, RC 셰퍼드에 의해 개척. Merrifield의 탄탄한 지원 전략에 의해 영감을, 우리는 여기에서 설명하는 작용 비스 - 펩티드 2의 조립 Boc / tert-부틸 고체 상 합성 전략을 개발했습니다. t에 비해 고체 상 합성에의 이용O 용액 상 방법론은 Merrifield 1 설명된대로 시간과 노동을 모두에만 유리한 것이 아니라, 또한 비스 - 펩타이드 라이브러리의 합성에 매우 쉽게이 있습니다. 우리가 여기서 발휘하는 합성은 두 단계로 diketopiperazine 형성에 의한 수지의 비스 - 펩타이드 작용을 공개하는 메커니즘을 &quot;안전 잡는 &#39;사용하는 최종 절단 단계를 포함합니다. 비스 - 펩티드는 종류와 입체 monomeric 단위의 각각의 단량체 사이의 연결에 의해 제어 예측하고 designable 방법으로 기능을 배치할 수있는 비스 - 아미노산의 강성, spiro-래더 oligomers입니다. 각 비스 - 아미노산 두 개의 아미노산 (α-아민과 카르복실산) 3,4를 포함 stereochemically 순수한 주기적 발판이다. 저희 연구실은 현재 촉매 작용, 단백질 - 단백질 상호 작용과 N을 포함하여 분야의 다양한 기능에 걸쳐 비스 - 펩티드의 가능성을 조사하고 있습니다anomaterials.

HMBA 수지에서 절단 절차를 &quot;안전 잡는 &#39;활용하는 작용 비스 - 펩티드 trimer의 효율적인 고체 상 펩타이드 합성이 설명되어 있습니다.

1962년, R.B. Merrifield는 펩타이드를 효율적으로 합성하는 새로운 경로로 고상 펩타이드 합성법을 이용한 최초의 절차를 발표했습니다. 이...

다음 실험의 전반적인 목표는 고상 합성 기술을 사용하여 기능화된 BSP 펩타이드를 합성하는 것입니다. 이는 보호된 BIS 아미노산을 하이드록시에틸 벤조산 수지에 결합시킴으로써 이루어집니다. 그 후 기능화된 bis 아미노산을 부착하기 위해 심층 보호 결합 사이클을 반복하며, 이 과정을 통해 BIS 펩타이드를 연장하고 원하는 기능성을 구현합니다.마지막으로, DI Keto pyrazine 형성을 통해 수지에서 BIS 펩타이드를 절단하기 위해 첫 번째 bis 아미노산을 알파 아미노산으로 수식합니다. 액체 크로마토그래피 질량 분석법(liquid chromatography mass spectrometry analysis) 분석 결과, 양호한 조순도와 약 10%의 일관된 분리 수율로 기능화된 BSP 펩타이드가 성공적으로 합성되었음을 확인하였습니다. BIS 펩타이드는 고체 수지 상에서 조립되므로 용액 내 반응보다 조작이 더 쉽고 여과를 통해 부산물을 용이하게 제거할 수 있어, 이 기술은 bis 펩타이드의 병렬 및 라이브러리 합성에까지 응용될 수 있습니다.많은 단계에서 모든 반응이 최대한 완결에 가깝게 진행되도록 하기 위해 필요한 중요한 세부 사항들이 많아 습득하기 어렵기 때문에, 이 방법의 시각적 시연이 매우 중요합니다. 고상 합성과에서는 중간체를 정제할 방법이 없습니다. 따라서 깨끗한 최종 생성물을 얻기 위해서는 모든 반응이 가능한 한 최대한 진행되어야 합니다.단계가 반복적인 특성을 가지고 있으므로, 혼동을 피하기 위해 실험 절차 체크리스트를 작성하는 것을 권장합니다. 본 프로토콜은 첫 번째 BSP 펩타이드의 로딩, 첫 번째 BSP 펩타이드의 보호 및 동시에 진행되는 레진 캡핑으로 시작합니다. 먼저 8 mL 반응 용기에 H-M-B-A-A 레진 114 mg을 정밀하게 달아 넣고 마그네틱 스터 바를 추가하여 첫 번째 BSP 펩타이드 로딩을 시작하십시오.고무 격막(septum)으로 용기 상단을 밀봉하고 Argon으로 튜브를 최소 5분 동안 퍼지합니다. 그동안 서면 프로토콜에 기술된 대로 활성화된 BIS 아미노산 용액을 준비합니다. 이 영상과 함께, 주입기를 사용하여 용액을 반응 용기에 옮기고 Argon 분위기 하에서 하룻밤 동안 교반한 후 다음 날 격막을 제거하고 반응 혼합물을 배출합니다.수지에 약 2 mL의 클로로메탄을 첨가하여 세척합니다. 30초에서 1분 동안 교반한 후 배수합니다. 이 과정을 DCM으로 4회 반복한 다음, 디메틸포름아미드로 수지를 5회 세척합니다.첫 번째 bis 아미노산의 보호기를 제거하고 동시에 수지 캡핑을 수행하기 위해, 33% hydrogen bromide(acetic acid 및 DCM 용액) 2 mL를 반응 용기에 천천히 첨가합니다. 15분 동안 교반한 후, DCM으로 수지를 다섯 번 세척하고 배수합니다. 이 D 보호 제거 과정을 한 번 더 반복합니다.다음으로, 수지를 DCM으로 5회 세척한 후 DMF로 5회 세척하고, DMF 내 5% volume, volume D-I-P-E-A 용액으로 2회 세척하여 수지를 중화합니다. 그 후 DCM으로 5회, DMF로 5회 다시 세척합니다. 이제 보호된 기능성 비스 아미노산의 커플링을 수행할 수 있습니다.먼저, 무수 DCM으로 세 번 세척하여 수지가 포함된 반응 용기에 불활성 분위기를 다시 도입합니다. 그 다음, 세푿(septum)과 아르곤 라인을 연결하여 퍼지하고, 무수 DCM 1~2 mL를 첨가한 뒤 30초 동안 교반하여 용기를 세척합니다. 이후 아르곤 라인의 버블러가 상승하기 시작할 때까지 용기의 액체를 배출합니다.이 과정을 최소 한 번 더 반복하십시오. 다음으로, 아르곤 분위기 하의 화염 건조된 시험관에 기능화된 비스아미노산 용액을 준비합니다. 47 µL의 DIC를 첨가하고 90분 동안 교반하십시오.그 다음, 666 µL의 무수 DMF에 D-I-P-E-A 35 µL를 혼합하여 레진에 첨가하고 5분 동안 더 교반합니다. 주사기를 사용하여 미리 활성화된 BIS 아미노산 용액을 용기에 옮기고 다음 날까지 하룻밤 동안 교반합니다. 반응 혼합물을 배출하고 아르곤 분위기 하에서 무수 DCM으로 2회 세척합니다.본 절차에서 중요한 단계는 bis 아미노산 커플링입니다. di keto piperazine의 고리 폐쇄를 확실히 하기 위해, 추가 활성화제를 사용하여 반응 시간을 늘립니다. di keto pyrazine의 폐쇄를 촉진하려면, HOAT 및 DIC 용액을 첨가하고 아르곤 기체 하에서 1시간 동안 교반하십시오.다음으로, 격막(septum)을 제거하고 반응 혼합물을 배출합니다. 수지를 DCM으로 5회, DMF로 5회 세척합니다. 이 섹션에서는 기능화된 BIS 아미노산의 심층 보호, Fmoc의 심층 보호 및 첫 번째 BIS 아미노산의 아실화(acylation) 과정을 다룹니다.보호된 기능성 비스 아미노산의 심층 보호를 수행하려면, TFA와 TIPS 혼합 용액 2 mL를 반응 용기에 천천히 가하고 1시간 동안 교반합니다. 용액을 배출한 후 레진을 DCM으로 약 30초 동안 세척하고 다시 배출하며, 이 DCM 세척 과정을 5회 반복합니다. 그다음 A-D-C-M-D-M-F 세척 순서에 따라 레진 세척 전체 과정을 반복합니다. DMF 내의 5% v/v D-I-P-E-A 용액으로 두 번 세척하여 레진을 중화합니다.그 다음 D-C-M-D-M-F 세척을 한 번 더 수행합니다. 이 단계부터 BIS 펩타이드를 다른 기능화된 bis 아미노산으로 연장하거나, 선도 질소 카복실산에 기능기를 도입하거나, 또는 두 가지 모두를 수행할 수 있습니다. FM 그룹을 제거하려면 DMF에 20% piperidine을 녹인 용액 2 mL를 첨가하고 20분 동안 반응물을 혼합합니다.DMF로 수지를 다섯 번 배출하고 세척합니다. 수지를 추가로 세척한 후 이 과정을 한 번 더 반복합니다. 마지막 단계로 준비된 아미노산 용액을 반응 용기에 넣고 6시간 동안 교반하여 첫 번째 bis 아미노산을 분리합니다.레진을 DCM으로 5회, DMF로 5회 세척합니다. 본 프로토콜의 마지막 단계는 레진 결합 아미노산에서 Bach 그룹을 제거하고 레진으로부터 절단하는 과정을 포함합니다. 먼저, 1:1 비율의 TFA-DCM 용액 2 mL를 반응 용기에 넣고 30분 동안 교반합니다.레진을 DCM으로 5회 배수 및 세척하십시오. 그런 다음 이 과정을 한 번 더 반복하십시오. DCM으로 5회, DMF로 5회, 각각 30초 동안 레진을 세척 및 배수하십시오.다음으로, 무수 DMF에 10%D-I-P-E-A가 포함된 용액 2 mL를 첨가하고 24~48시간 동안 교반합니다. 마지막으로, 반응 혼합물을 미리 무게를 잰 둥근 바닥 플라스크에 수집합니다. 이 용액 30 µL를 lc MS 바이알에 담긴 450 µL의 Tetra Hydro FU로 옮겨 분석을 의뢰합니다.DMF를 추가로 분주하여 수지를 세척하고 라운드 플라스크에 수집합니다. 합성 과정 전반에 걸쳐 수지 상의 화학적 변환을 모니터링하기 위해 다음 방법들을 사용할 수 있습니다. 유리 히드록실기를 검출하려면, 먼저 일회용 피펫을 사용하여 약 1mg의 건조 수지를 취한 후 메틸 레드 테스트를 수행합니다.4 mL 반응 용기에 옮겨 헹굽니다. 본문에 설명된 대로 조제한 메틸 레드 용액을 첨가하고 5~10분 동안 교반합니다. DCM으로 레진을 5회 배수 및 세척합니다. 오렌지색 또는 빨간색 레진 비드는 유리 히드록실기의 존재를 나타냅니다.이 테스트는 첫 번째 bis 아미노산 로딩 및 레진 캡핑 단계를 평가하는 데 사용할 수 있습니다. 2차 아민을 검출하려면 일회용 피펫을 사용하여 약 1mg의 건조 레진을 작은 바이알에 옮겨 chloral 테스트를 수행하십시오. DMF 용액에 녹인 0.8mM chloral과 DMF 용액에 녹인 2% 산성 알데하이드를 각각 세 방울씩 첨가합니다.실온에서 5~10분 동안 방치합니다. 이 경우, 수지 비드의 색상이 파란색 또는 보라색으로 변하는 것은 수지에 결합된 화합물에 유리 2차 아민이 존재함을 나타냅니다. 활성화 효율을 확인하기 위해 활성화 트랩 테스트를 수행합니다. 합성 중 활성화된 화합물은 활성화 용액 5~10 µL를 50 µL의 olaine이 담긴 액체 크로마토그래피-질량 분석법(LC-MS) 바이알에 옮긴 후 수동으로 혼합하여 평가할 수 있습니다.수 초 동안 용액이 노란색으로 변해야 하며, 이후 450 µL의 tetra hydro uran으로 희석하여 lc MS 분석에 제출합니다. 최종 생성물과 활성화된 중간체는 C 18 역상 컬럼과 0.1% formic acid가 포함된 물-acetyl nitrile 용매 시스템이 장착된 LCM S 시스템을 사용하여 평가할 수 있습니다. 이 L-C-M-S-U-V 트레이스는 조생성물의 우수한 순도에 대한 예를 보여줍니다.21.3분에 나타난 스펙트럼의 주요 피크는 예상되는 생성물 질량과 일치하는 마스크를 갖는 것으로 확인되었습니다. 이는 조생성물의 질량 분석 스펙트럼에서 시각화할 수 있으며, 여기서 피크는 해당 질량과 나트륨 이온의 질량이 합쳐진 주요 피크뿐만 아니라, 해당 질량에서 IV DDE 보호기 질량을 뺀 주요 피크를 나타냅니다. 여기에는 21.3분에서 매우 순수한 생성물을 보여주는 정제된 스펙트럼의 LCMS UV 트레이스와, 이 정제된 트라이머 피크의 정체를 확인해 주는 질량 분석 스펙트럼이 제시되어 있습니다.이 영상을 시청한 후, 여러분은 기능화된 bis 펩타이드를 합성하기 위해 고상 합성법을 사용하는 방법에 대해 충분히 이해하게 될 것입니다. 이 기술은 연구자들이 bis 펩타이드 분야에서 단백질-단백질 상호작용 및 촉매 작용에 대한 응용 분야를 탐구할 수 있는 길을 열어주었습니다. 숙달된 후 적절하게 수행한다면, 이 기술을 통해 4~5일 만에 기능화된 bis 펩타이드 삼량체를 합성할 수 있습니다.본 절차를 수행할 때, 비드를 반응 용액 및 세척 용액에 계속 침전시켜 두는 것이 중요합니다. 입체 화학이나 다른 기능기가 단백질 결합 또는 촉매 활성에 미치는 영향과 같은 추가적인 의문점을 해결하기 위해 병렬 합성 또는 라이브러리 합성과 같은 다른 방법들을 수행할 수 있습니다. 유기 시약을 사용하는 작업은 매우 위험할 수 있으므로, 본 절차를 수행할 때는 항상 적절한 개인 보호 장구 착용 및 흄 후드 사용과 같은 예방 조치를 취해야 함을 잊지 마십시오.

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정보 베어링 펩토이드의 합성과 시퀀스 지향 동적 공유자 자체 조립

이 프로토콜은 시스테인과 메티오닌 사이의 비스알킬화와 프로파길 설포늄 중심에 의해 유발되는 용이한 티올-인 반응을 통한 고리형 펩타이드의 합성을 제시합니다.

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Ugi 반응 빠르게 화합물의 다양한 라이브러리를 만들 수있는 편리한 방법으로 증명했다. 그것은 아민의 반응, 알데히드, 카르복실산 및 실온에서 메탄올에서 일반적으로 isonitrile을 포함한다. 이 비디오에서는, 우리는 여과 튜브와 메틀러 - 톨레도 MiniMapper 자동 액체 처리기는 시약 및 용매를 제공하기 위해 사용되었습니다 갖춘 48 슬롯 메틀러 - 톨레도 MiniBlock를 활용. 관심의 매개 변수는 농도, 용매 조성과 시약의 일부 초과되었습니다.

병렬 합성 및 자동 액체 처리를 사용하여 Ugi 반응의 최적화

배우세요 고상 합성법을 사용하여 기능화된 비스-펩타이드를 합성하는 방법입니다. HMBA 레진에서 안전 잡아라 클리브지 기법으로 약 10% 수율을 달성하며, 단백질 상호작용 및 촉매 연구에 활용됩니다.

기능화 비스 - 펩타이드의 고상 합성은 방법론 "을 안전 잡아라"사용

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