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Chapters
- 00:05Introduction
- 01:13Schneiders Line 2 Plus (S2R+) Drosophila Cell Fixation
- 02:02Lysis
- 03:18Enzymatic Digestion, DNA End Biotinylation, and Ligation
- 04:37Crosslink Reversal and DNA Purification
- 05:33Hi-C Template Quality Evaluation
- 06:26Biotin Removal/End Repair and Size Selection
- 07:49Biotin Pulldown/A-Tailing/Adapter Ligation
- 09:33Results: Representative In-Nucleus Hi-C Analysis
- 11:17Conclusion
Le génome est organisé dans l’espace nucléaire en différentes structures qui peuvent être révélées par les technologies de capture de conformation chromosomique. La méthode Hi-C dans le noyau fournit une collection à l’échelle du génome d’interactions de la chromatine dans les lignées cellulaires de la drosophile, qui génère des cartes de contact qui peuvent être explorées à la résolution de la mégabase au niveau du fragment de restriction.
