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라이브 현미경 및 오픈 소스 소프트웨어를 사용하여 아스퍼길러스 니둘란스 성장률의 정량적 분석
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JoVE Journal Biology
Quantitative Analysis of Aspergillus nidulans Growth Rate using Live Microscopy and Open-Source Software

라이브 현미경 및 오픈 소스 소프트웨어를 사용하여 아스퍼길러스 니둘란스 성장률의 정량적 분석

Full Text
4,228 Views
11:30 min
July 24, 2021

DOI: 10.3791/62778-v

Alexandros Athanasopoulos1,2, Ada Biratsi1, Christos Gournas1, Vicky Sophianopoulou1

1Microbial Molecular Genetics Laboratory, Institute of Biosciences and Applications,National Centre for Scientific Research, Demokritos (NCSRD), 2Light Microscopy Unit, Institute of Biosciences and Applications,National Centre for Scientific Research, Demokritos (NCSRD)

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Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

Overview

This study presents a label-free live imaging protocol utilizing transmitted light microscopy techniques to examine growth kinetics of the filamentous fungus A. nidulans in both submerged cultures and solid media. The method enhances sensitivity compared to traditional colony diameter measurements and provides insights into the dynamics of fungal growth responses.

Key Study Components

Research Area

  • Fungal growth dynamics
  • Microscopy techniques
  • Quantitative analysis of growth

Background

  • Traditional methods measure colony growth in agar dishes, lacking sensitivity.
  • Time-lapse microscopy allows single-cell growth assessments.
  • The approach aims to elucidate molecular mechanisms underlying growth responses.

Methods Used

  • Transmitted light microscopy
  • A. nidulans as a model organism
  • Image acquisition using imageJ Fiji software

Main Results

  • Successful image capture and analysis of A. nidulans across various growth stages.
  • Quantitative tracking of hyphal tip growth illustrates growth dynamics.
  • Results provide a more accurate understanding of fungal growth mechanisms.

Conclusions

  • The study demonstrates a reliable imaging protocol for analyzing fungal growth.
  • The method's sensitivity contributes to improved research in mycology and growth responses.

Frequently Asked Questions

What is the main advantage of the proposed imaging protocol?
It allows for label-free, sensitive tracking of growth kinetics in filamentous fungi, surpassing traditional methods in accuracy.
Which organism is utilized in this study?
A. nidulans, a model filamentous fungus, is the focus of this research.
What technologies are employed in the imaging process?
The protocol utilizes transmitted light microscopy and software for image processing and analysis.
How does the protocol enhance traditional growth measurement methods?
By providing fine-scale measurements of individual cell growth dynamics rather than relying on colony diameters.
What are the implications of this research for mycology?
This study contributes to a greater understanding of fungal growth mechanisms and responses to environmental factors.
What software is recommended for processing the acquired images?
ImageJ Fiji software is recommended for visualizing and analyzing microscopy images.
What growth conditions are suggested for A. nidulans?
The study suggests growing A. nidulans in controlled temperatures, typically around 30 degrees Celsius.

우리는 침수 된 문화와 고체 미디어 모두에서 필라멘트 곰팡이 A. nidulans의 성장 운동학을 캡처, 분석 및 정량화하기 위해 전송 된 빛 현미경 기술을 사용하여 라벨이없는 라이브 이미징 프로토콜을 제시합니다. 이 프로토콜은 형광 현미경 검사법과 함께 사용할 수 있습니다.

이 비디오에서는 전송된 경현미경 기술을 사용하여 모델 곰팡이 아스퍼질러스 니둘란스의 이미지를 캡처하는 라벨 무료 라이브 이미징 프로토콜을 설명합니다. 우리는 액체와 고체 매체 모두에서 아스퍼 길러스 니둘란의 성장 운동학을 분석하고 정량화하기 위해이 이미지를 사용합니다. 이 프로토콜을 시각적으로 표현하면 사용자가 이미지 캡처 및 현미경 이미지 처리의 중요한 단계에 익숙해질 수 있습니다.

필라멘트 곰팡이 성장을 측정하는 데 사용되는 일반적인 방법은 영양 천을 함유 한 페트리 접시에 두 개의 접종 곰팡이 포자가 며칠 후 개발 식민지의 직경을 측정하는 것입니다. 그러나, 이 방법은 미세한 성장 차이를 정량화하기에 충분히 민감하지 않습니다. 따라서 시간 경과 현미경 검사를 이용한 단일 세포 측정이 개발되었다.

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