Stereo-seq 를 통한 종에 구애받지 않는 전사체의 포괄적인 공간 프로파일링
1.4K 조회수
•
10:22 분
•
2025년 10월 31일
DOI :10.3791/68619-v
2025년 10월 31일
•1.4K 조회수
Anna K. Casasent*1 , Danielle L. Stolley*1 , Basant T. Gamal*2 , Arnold Dahay2 , Samuel Mok2 , Lidia Rocha3 , Vincent Li3 , Arizona T. Nguyen3 , Boyu Zhang4 , Clay T. Brasuell4 , Erika J. Thompson4 , Thomas Huynh3 , Jared K. Burks1 , Sammy Ferri-Borgogno2
1Department of Hematopoietic Biology and Malignancies, The University of Texas MD Anderson Cancer Center, 2Department of Gynecologic Oncology and Reproductive Medicine, The University of Texas MD Anderson Cancer Center, 3Department of Veterinary Medicine & Surgery, University of Texas MD Anderson Cancer Center, 4Department of Genetics, The University of Texas MD Anderson Cancer Center
* These authors contributed equally
이 기사에서는 조직 구조를 보존하면서 다양한 전사체의 고해상도 매핑을 가능하게 하는 Stereo-seq를 사용하여 포르말린 고정 파라핀 포매 조직 절편에서 숙주, 바이러스, 진균 및 마이크로바이옴 RNA의 포괄적인 공간 전사체 프로파일링을 수행하는 프로토콜을 제시합니다.
Chapters in this video
0:00
Introduction
0:58
Stereo-Seq Random Oligonucleotide Capture Chip (N-Chip) Preparation
3:06
Nuclear Imaging and ssDNA Staining of the FFPE Tissue Sections
5:08
Decrosslinking Process of the Stained FFPE Sections
7:43
Collection of the cDNA Release Mix
8:56
Results
9:36
Conclusion
Related Videos
저작권 © 2026 MyJoVE Corporation. 모든 권리 보유.