Name: Wijziging en functionalisering van de Guanidine Group door Tailor-made Voorlopers (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2017-04-27T13:00:00.000+00:00
Duration: 9 min 45 s
Description: Leer een methode voor de synthese van alkyl-gemodificeerde guanidines voor functionele peptiden. Deze techniek is volledig compatibel met SPPS en ondersteunt onderzoek naar gepersonaliseerde geneeskunde en kankerbehandeling.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

playerTrialDesktop

TGK erkent de International Graduate School for Science and Engineering (IGGSE) van de Technische Universität München voor hun financiële steun. HK erkent het Center for Integrated Protein Science München (CIPSM) voor hun steun.

Opmerking: Alle reagentia en oplosmiddelen werden verkregen van commerciële leveranciers en werden gebruikt zonder verdere zuivering. Let op: Neem contact op met alle relevante veiligheidsinformatiebladen (VIB) voor gebruik. Gebruik alle passende veiligheidsuitrusting bij het uitvoeren van chemische synthese (bijvoorbeeld, zuurkast, een veiligheidsbril, handschoenen, laboratoriumjas, full-length broek en dichte schoenen). 1. Synthese van de Guanidinylation Precursors <ol><li> gealkyleerde species <ol><li> gemethyleerde species <ol><li> Ontbinding 1,0 g N, N&#39;-di-Boc-1H-pyrazool-1-carboxamidine (3,2 mmol, 1 eq.) En 1,0 g trifenylfosfine (PPh3, 3,8 mmol, 1,2 eq.) In 10 ml droog tetrahydrofuran (THF) in een 50 ml rondbodem kolf onder een inerte atmosfeer met een rubberen septum bij kamertemperatuur (RT). Voeg 194 pl droog methanol met een injectiespuit (4,8 mmol, 1,5 eq.) En let Het roeren bij RT. </li><li> Afzonderlijk werd een oplossing bereid met 747 pl diisopropylazodicarboxylaat (DIAD, 3,8 mmol, 1,2 eq.) In 2 ml droge THF in een klein glazen flesje. Voeg al roerend de oplossing DIAD in THF druppelsgewijs aan de oplossing van N, N&#39;-di-Boc-1H-pyrazool-1-carboxamidine, PPh3 en methanol met een injectiespuit (15 min). Laat de oplossing gedurende 2 uur roeren bij kamertemperatuur. </li><li> Verwijder het oplosmiddel onder verminderde druk met een rotatieverdamper en los het ruwe product in 1 ml dichloormethaan (DCM). Plaats een flash kolom (2,5 cm x 20 cm) met 100 g silicagel in 10% ethylacetaat (EtOAc) in een pentaanoplossing. Laad het opgeloste ruwe product op de kolom en voeg het oplosmiddel onder druk (1,5 bar). </li><li> Verzamelen van de fracties (oplosmiddelsysteem: isocratisch 10% EtOAc in pentaan), identificeren van de gewenste verbinding vlek met dunnelaagchromatografie (TLC) en verzamelen (Rf = 0,4, EtOAc / pentaan 1: 9, UV). Combineer de gewenstefrakties en verdampt het oplosmiddel onder verminderde druk met een rotatieverdamper om 0,85 g van de titelverbinding als een gele, viskeuze olie (2,6 mmol, 81% opbrengst). Bewaar het verschafte verbinding bij kamertemperatuur verder gebruik. </li></ol></li><li> -Hexylamine gemodificeerde soorten <ol><li> Ontbinding 1,0 g N, N&#39;-di-boc-1H-pyrazool-1-carboxamidine (3,2 mmol, 1,0 eq.), 0,9 g Dde-6-aminohexanol (3,8 mmol, 1,2 eq.) En 1,0 g PPh3 (3,8 mmol, 1,2 eq.) in 10 ml droog THF in een 50 ml rondbodemkolf in een inerte atmosfeer met een rubberen septum bij kamertemperatuur. </li><li> Afzonderlijk werd een oplossing bereid met 747 gl DIAD (3,8 mmol, 1,2 eq.) In 2 ml droge THF in een klein glazen flesje. Voeg al roerend de oplossing DIAD in THF druppelsgewijs aan de oplossing van N, N&#39;-di-Boc-1H-pyrazool-1-carboxamidine, PPh3 en Dde-6-aminohexanol met een injectiespuit (gedurende 15 min) . Laat de oplossing gedurende 2 uur roeren bij kamertemperatuur. </li><li>Verwijder het oplosmiddel onder verminderde druk met een rotatieverdamper en neemt het ruwe product in 1 ml DCM. Plaats een flash kolom (2,5 cm x 20 cm) met 100 g silicagel in een oplossing van pentaan / EtOAc (2: 1). Breng het opgeloste ruwe product op de kolom en voeg oplosmiddel onder druk (1,5 bar). </li><li> Verzamelen van de fracties (oplosmiddelsysteem: isocratisch 2: 1 pentaan / EtOAc), identificeren van de gewenste fracties met TLC en verzamelen (Rf = 0,66, 2: 1 pentaan / EtOAc, UV). Combineer de gewenste fracties en damp het oplosmiddel onder verlaagde druk met een rotatieverdamper om 1,6 g van de titelverbinding als een gele, viskeuze olie (2,8 mmol, 88% opbrengst). Bewaar het verschafte verbinding bij kamertemperatuur verder gebruik. </li></ol></li></ol></li><li> Geacyleerde species (2 reactiestappen) <ol><li> Ontbinding 1,4 g S -methylisothiuronium hemisulfaat (10 mmol, 1,0 eq.) En 2,2 g di (tert-butyl) dicarbonaat (10 mmol, 1,0 eq.) In een heftig roerenring bifasische oplossing van DCM / verz. aq. NaHCO3 en laat het gedurende 24 h roeren bij RT. </li><li> Scheid de lagen in een scheitrechter en extraheer de waterfase driemaal met DCM. Combineer de organische fasen, drogen met Na 2 SO 4, en verwijder het oplosmiddel onder verminderde druk met een rotatieverdamper. Neem het ruwe product in 1 ml hexaan. </li><li> Plaats een flash kolom (2,5 cm x 20 cm) met 100 g silicagel in een oplossing van 4: 1 hexaan / EtOAc. Laad het opgeloste ruwe product op de kolom. Voeg het oplosmiddel onder druk. Identificeer de gewenste fracties met TLC (oplosmiddelsysteem: 4: 1 isocratisch hexaan / EtOAc (detectie UV: 254 nm) en verzamelen (Rf = 0,30). </li><li> Combineer de gewenste fracties en damp het oplosmiddel onder verlaagde druk met een rotatieverdamper om 1,1 g van de titelverbinding als een gele, viskeuze olie (5,8 mmol, 58% opbrengst). Bewaar het reagens N - (tert-butoxycarbonyl) - S -methylisothiourea bij kamertemperatuur verder gebruik. </li><li> Los 250 mg N - (tert-butoxycarbonyl) - S-methylisothioureum (1,3 mmol, 1,0 eq.) In 10 ml droge N, N-dimethylformamide (DMF) in een 50 ml rondbodemkolf in een inerte atmosfeer bij RT. Voeg 440 ui N, N-diisopropylethylamine (DIPEA) (2,6 mmol, 2 eq.) Via een spuit. Voeg al roerend 245 ul van AC2O (5,2 mmol, 4,0 eq.) Druppelsgewijs via een spuit en laat het 1 uur roeren bij KT. </li><li> Voeg een overmaat methanol (2 ml) aan het mengsel toegevoegd met een spuit en laat het roer 15 minuten bij kamertemperatuur. Verwijder het oplosmiddel onder verminderde druk met een rotatieverdamper. Neem het ruwe product in 1 ml DCM. </li><li> Plaats een flash kolom (2,5 cm x 20 cm) met 60 g silica in een oplossing van 3: 1 hexaan / EtOAc 3: 1. Breng het opgeloste ruwe product aan de kolom. Voeg oplosmiddel (3: 1 hexaan / EtOAc) en druk (1,5 bar). Identificeer de gewenste fracties met TLC (3: 1 hexaan / EtOAc, UV: 220 nm) en colLECT hen (Rf = 0,62). </li><li> Combineer de gewenste fracties en damp het oplosmiddel onder verlaagde druk met een rotatieverdamper tot 210 mg van de gewenste verbinding als een witte vaste stof (0,9 mmol, 70% opbrengst). Bewaar de verbinding bij kamertemperatuur verder gebruik. </li></ol></li></ol> 2. Synthese van cyclische peptideprecursors <ol><li> Laden en aftopping TCP hars <ol><li> Voeg 1,00 g 2-chlortriyl chloride (CTC) hars (0,9 mmol / g) en 320 mg Fmoc-Gly-OH (1,2 eq.) In een kunststof 20 ml spuit met een frit. Bereid een oplossing van 313 pl DIPEA (2 eq.) In 5 ml droge DCM toevoegen aan de spuit. Laten roteren gedurende 1 uur bij kamertemperatuur met behulp van een draai-eenheid. </li><li> Bereid ondertussen een 2 ml oplossing van 5: 1 methanol / DIPEA (v / v; afdekken oplossing). Voeg de aftopping oplossing aan de spuit en laat hem te draaien voor nog eens 15 min. Spoel de hars met DCM (5x) en DMF (3x). </li></ol></li><li> On-hars Fmoc ontscherming<ol><li> Behandel de harsgebonden Fmoc-Gly met 20% piperidine in DMF gedurende 10 min en vervolgens gedurende 5 minuten. Spoel de hars met DMF (3x). </li></ol></li><li> On-hars koppelen van Fmoc-Orn (Dde) -OH <ol><li> Voeg 934 mg Fmoc-L-Orn (Dde) -OH (2 eq.), 684 mg 1- [bis (dimethylamino) methyleen] -1H-1,2,3-triazolo [4,5-b] pyridinium 3-oxide (HATU) (2 eq.) en 245 mg 1- hydroxy-7-azabenzotriazool (HOAt) (2 eq.) in een klein glazen flesje en oplossen in 5 ml DMF. Voeg 814 ul van DIPEA. </li><li> Voeg deze oplossing toe aan de Fmoc-bescherming verwijderd, gewassen en harsgebonden Gly en laat roteren gedurende 1 uur. Spoel de hars met DMF (3x). </li></ol></li><li> On-hars Fmoc ontscherming <ol><li> Behandel de harsgebonden Fmoc-Orn (Dde) -Gly met 20% piperidine in DMF gedurende 10 min en vervolgens gedurende 5 minuten. Spoel de hars met DMF (3x). </li></ol></li><li> On-hars koppelen van Fmoc-Val-OH <ol><li> Voeg 610 mg Fmoc-Val-OH (2 eq.), 684 mg HATU (2 eq.) En 245 mg HOAt (2 eq.) In een klein glazen flesje en oplossen in 5 ml DMF. Voeg 814 ul van DIPEA. </li><li> Voeg deze oplossing toe aan de Fmoc-bescherming verwijderd, gewassen en harsgebonden Orn (Dde) -Gly en laat roteren gedurende 1 uur. </li></ol></li><li> On-hars Fmoc ontscherming <ol><li> Behandel de harsgebonden Fmoc-Val-Orn (Dde) -Gly met 20% piperidine in DMF gedurende 10 min en vervolgens gedurende 5 minuten. Spoel de hars met DMF (3x). </li></ol></li><li> On-hars N- methylatie <ol><li> Spoel de hars met DCM (3x). Oplossen 887 mg 2-nitrobenzenesulfonylchloride (o -NBS-Cl, 4 eq.) In DCM en voeg 1,2 ml 2,4,6-collidine (10 eq.). </li><li> Voeg de oplossing van het harsgebonden peptide en laat het incubeer gedurende 20 minuten bij kamertemperatuur. </li><li> Spoel de hars met CH 2CI 2 (3x) en THF (5x). Bereid een oplossing met 1,18 g PPh3 (5 eq.) En 365 pl methanol in THF. Voeg deze oplossing toe aan deinjectiespuit. </li><li> Bereid een oplossing met 883 gl DIAD in 2 ml THF toevoegen aan de spuit. Laat het incubeer gedurende 15 minuten. Spoel de hars met THF (5x) en met DMF (5x). </li></ol></li><li> o -ns ontscherming <ol><li> Bereid een oplossing met 570 ui mercaptoethanol (10,0 eq.) En 672 pl diazabicycloundecen (DBU) in 2 ml DMF. Voeg deze oplossing toe aan de spuit en laat het incubeer gedurende 5 min. </li><li> Herhaal de ontschermingsstap en daarna wassen van de hars met DMF (5x). </li></ol></li><li> On-hars koppeling van Fmoc-D-Phe-OH <ol><li> Voeg 697 mg Fmoc-D-Phe-OH (2 eq.), 684 mg HATU (2 eq.) En 245 mg HOAt (2 eq.) In een klein glazen flesje en oplossen in 5 ml DMF . Voeg 814 ul van DIPEA. </li><li> Voeg deze oplossing toe aan de Fmoc-bescherming verwijderd, gewassen en aan hars gebonden peptide en laat roteren gedurende 1 uur. </li></ol></li><li> On-hars Fmoc ontscherming <ol><li> Behandel het hars-bound peptide met 20% piperidine in DMF gedurende 10 min en vervolgens gedurende 5 minuten. Spoel de hars met DMF (3x). </li></ol></li><li> On-hars koppelen van Fmoc-Asp (OtBu) -OH <ol><li> Voeg 741 mg Fmoc-Asp (OtBu) -OH (2 eq.), 684 mg HATU (2 eq.) En 245 mg HOAt (2 eq.) In een klein glazen flesje en oplossen in 5 mL DMF. Voeg 814 ul van DIPEA. </li><li> Voeg deze oplossing toe aan de Fmoc-bescherming verwijderd, gewassen en aan hars gebonden peptide en laat roteren gedurende 1 uur. </li></ol></li><li> Splitsing van het lineaire peptide van de hars <ol><li> Spoel de hars met DCM (3x) en daarna bereiden 10 ml van een oplossing van hexafluorisopropanol (HFIP) in DCM (1: 4, v / v). </li><li> Voeg de oplossing aan de hars en laat het draaien gedurende 15 minuten. Verzamelen van de oplossing in een rondbodemkolf. Herhaal de splitsing en damp het oplosmiddel met een rotatieverdamper. </li></ol></li><li> Cyclisatie van het lineaire peptide <ol><li> dissolve 384 mg NaHCO3 (5,0 eq.) en 582 pl van difenylfosforylazide (DPPA) (3,0 eq.) in 50 ml DMF toevoegen aan het ruwe product. Laat het overnacht roeren of totdat geen lineaire peptide wordt waargenomen met ESI-MS (10 h) 17. </li><li> Onder verminderde druk verlagen van het oplosmiddel tot een klein volume met een rotatieverdamper. Bereid een verzadigde oplossing van NaCl (zoutoplossing). Met een Pasteur pipet het gecycliseerde peptide druppelsgewijs aan 40 ml verzadigde waterige oplossing van NaCl in een centrifugebuis. </li><li> Centrifugeer de suspensie (5000 x g, 5 min) en was het neerslag door middel van HPLC-kwaliteit water (2x). Lyofiliseren het product. </li></ol></li></ol> 3. Guanidinylation en Deprotectie in Solution <ol><li> Guanidinylation met de op maat gemaakte voorlopers <ol><li> Lossen een kleine hoeveelheid (bijvoorbeeld 25 mg) van de orthogonaal ontschermde cyclisch peptide in een klein volume DMF (bijvoorbeeld 2 mL). Voeg 2 eq. de guanidinylation precursor en 2 eq. DIPEA aan de oplossing en laat het 2 uur roeren bij kamertemperatuur. </li><li> De voortgang van de reactie met HPLC-MS. Nadat de reactie is voltooid, verwijdert het oplosmiddel opnieuw oplossen guanidinylated het cyclische peptide in acetonitril en uitvoeren semi- preparatieve HPLC zuivering 16. </li></ol></li><li> Verwijdering van zure labiele zijketen-beschermende groepen <ol><li> Bereid 2 ml van een oplossing van trifluorazijnzuur (TFA), water en triisopropylsilaan (TIPS) (95 / 2,5 / 2,5; v / v / v). Voeg deze oplossing toe aan het gezuiverde product in een klein glazen flesje en laten roeren bij kamertemperatuur gedurende tenminste 1 uur. Echter de volledige ontscherming met ESI-MS 17. </li><li> Damp het oplosmiddel onder verminderde druk tot een klein volume. Bereid ijskoude ether en voeg 10 ml in een 50 ml centrifugebuis. Precipiteren de ontschermde peptide in ijskoude ether met een Pasteur pipet toe te voegendruppelsgewijs toegevoegd. Centrifugeer de suspensie (5000 x g, 5 min) om een ​​pellet te verkrijgen. </li><li> Spoel het neerslag met ijskoude ether en centrifugeer deze (5000 x g, 5 min, 2 x). Los het product op in 2 ml HPLC kwaliteit water en zuiveren met semi-preparatieve HPLC 16. </li></ol></li></ol> 4. analytische gegevens en parameters voor de zuivering <ol><li> Analytische HPLC-ESI-MS <ol><li> Uitvoeren van analytische HPLC-ESI-MS met een LCQ massaspectrometer onder toepassing van een C18 kolom (12 nm poriegrootte, 3-um deeltjesgrootte, 125 mm x 2,1 mm) of een C8 kolom (20 nm poriegrootte 5 urn deeltjesgrootte maat 250 mm x 2,1 mm), met H2O (0,1% v / v mierenzuur) / acetonitril (0,1% v / v mierenzuur) als elutiemiddelen. </li></ol></li><li> Semi-preparatieve HPLC <ol><li> Uitvoeren van semi-preparatieve HPLC met een preparatieve HPLC instrument met een ODS-A-kolom (20 x 250 mm, 5 pm), een stroomsnelheid van 8 ml / minuut, en lineaire gradiëntenH2O (0,1% v / v TFA) en acetonitril (0,1% v / v TFA). </li></ol></li></ol>

<ol><li>Saczewski, F., Balewski, L. <a target="_blank" href="https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/19780701">Biological activities of guanidine compounds.</a> Exp. Opin. Ther. Patents. 19 (10), 1417-1448 (2009).</li>
<li>Saczewski, F., Balewski, L. <a target="_blank" href="https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23617396">Biological activities of guanidine compounds, 2008-2012 update.</a> Exp. Opin. Ther. Patents. 23 (8), 965-995 (2013).</li>
<li>Wirth, T. H., Davidson, N. <a target="_blank" href="http://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/ja01074a018">Mercury (II) Comlexes of Guanidine and Ammonia, and a general discussion of the Complexing of Mercury (II) by Nitrogen Bases.</a> J. Am. Chem. Soc. 86 (20), 4325-4329 (1964).</li>
<li>Berlinck, R. G., Burtoloso, A. C., Kossuga, M. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+chemistry+and+biology+of+organic+guanidine+derivatives%5BTitle%5D)+AND+%22Nat.+Prod.+Rep%22%5BJournal%5D)">The chemistry and biology of organic guanidine derivatives.</a> Nat. Prod. Rep. 25, 919-954 (2008).</li>
<li>Peterlin-Mašič, L., Kikelj, D. <a target="_blank" href="http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0040402001005075">Arginine mimetics.</a> Tetrahedron. 57 (33), 7073-7105 (2001).</li>
<li>Peterlin-Mašič, L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Arginine+mimetic+structures+in+biologically+active+antagonists+and+inhibitors%5BTitle%5D)+AND+%22Curr.+Med.+Chem%22%5BJournal%5D)">Arginine mimetic structures in biologically active antagonists and inhibitors.</a> Curr. Med. Chem. 13 (30), 3627-3648 (2006).</li>
<li>Hynes, R. O. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Integrins%3A+bidirectional%2C+allosteric+signaling+machines%5BTitle%5D)+AND+%22Cell%22%5BJournal%5D)">Integrins: bidirectional, allosteric signaling machines.</a> Cell. 110 (6), 673-687 (2002).</li>
<li>Liddington, R. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Structural+aspects+of+integrins%5BTitle%5D)+AND+%22Adv.+Exp.+Med.+Biol%22%5BJournal%5D)">Structural aspects of integrins.</a> Adv. Exp. Med. Biol. 819, 111-126 (2014).</li>
<li>Plow, E. F., Haas, T. A., Zhang, L., Loftusi, J., Smith, J. W. <a target="_blank" href="https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/10801897">Ligand binding to integrins.</a> J. Biol. Chem. 275 (29), 21785-21788 (2000).</li>
<li>Kapp, T. G., Fottner, M., Maltsev, O. V., Kessler, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Small+cause%2C+great+impact+-+modification+of+guanidine+group+in+RGD+controls+subtype+selectivity%5BTitle%5D)+AND+%22Angew.+Chem.+Int.+Ed%22%5BJournal%5D)">Small cause, great impact - modification of guanidine group in RGD controls subtype selectivity.</a> Angew. Chem. Int. Ed. 55, 1540-1543 (2016).</li>
<li>Xiong, J. P., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Crystal+structure+of+the+extracellular+segment+of+integrin+alpha+Vbeta3%5BTitle%5D)+AND+%22Science%22%5BJournal%5D)">Crystal structure of the extracellular segment of integrin alpha Vbeta3.</a> Science. 294, 339-345 (2001).</li>
<li>Xiong, J. P., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Crystal+structure+of+the+extracellular+segment+of+integrin+alpha+Vbeta3+in+complex+with+an+Arg-Gly-Asp+ligand%5BTitle%5D)+AND+%22Science%22%5BJournal%5D)">Crystal structure of the extracellular segment of integrin alpha Vbeta3 in complex with an Arg-Gly-Asp ligand.</a> Science. 296 (5565), 151-155 (2002).</li>
<li>Nagae, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Crystal+structure+of+%CE%B15%CE%B21+integrin+ectodomain%3A+atomic+details+of+the+fibronectin+receptor%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Cell+Biol%22%5BJournal%5D)">Crystal structure of α5β1 integrin ectodomain: atomic details of the fibronectin receptor.</a> J. Cell Biol. 197 (1), 131-140 (2012).</li>
<li>Hersel, U., Dahmen, C., Kessler, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((RGD+modified+polymers%3A+biomaterials+for+stimulated+cell+adhesion+and+beyond%5BTitle%5D)+AND+%22Biomaterials%22%5BJournal%5D)">RGD modified polymers: biomaterials for stimulated cell adhesion and beyond.</a> Biomaterials. 24 (24), 4385-4415 (2003).</li>
<li>Auernheimer, J., Dahmen, C., Hersel, U., Bausch, A., Kessler, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Photoswitched+Cell+Adhesion+on+Surfaces+with+RGD+Peptides%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Am.+Chem.+Soc%22%5BJournal%5D)">Photoswitched Cell Adhesion on Surfaces with RGD Peptides.</a> J. Am. Chem. Soc. 127 (46), 16107-16110 (2005).</li>
<li>Corradini, D., Eksteen, E., Eksteen, R., Schoenmakers, P., Miller, N. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aCorradini%2C+D+%22Handbook+of+HPLC%22">Handbook of HPLC</a>. , CRC Press. (2011).</li>
<li>de Hoffmann, E., Stroobant, V. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3ade+Hoffmann%2C+E+%22Mass+Spectrometry%3A+Principles+and+Applications%22">Mass Spectrometry: Principles and Applications</a>. , John Wiley & Sons. (2007).</li>
<li>Frank, A. O., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Conformational+Control+of+Integrin-Subtype+Selectivity+in+isoDGR+Peptide+Motifs%3A+A+Biological+Switch%5BTitle%5D)+AND+%22Angew.+Chem.+Int.+Ed%22%5BJournal%5D)">Conformational Control of Integrin-Subtype Selectivity in isoDGR Peptide Motifs: A Biological Switch.</a> Angew. Chem. Int. Ed. 49 (48), 9278-9281 (2010).</li>
<li>Rossiter, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Selective+substrate-based+inhibitors+of+mammalian+dimethylarginine+dimethylaminohydrolase%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Med.+Chem%22%5BJournal%5D)">Selective substrate-based inhibitors of mammalian dimethylarginine dimethylaminohydrolase.</a> J. Med. Chem. 48 (14), 4670-4678 (2005).</li>
<li>Weiss, S., Keller, M., Bernhardt, G., Buschauer, A., König, B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((N%28G%29-Acyl-argininamides+as+NPY+Y%281%29+receptor+antagonists%3A+Influence+of+structurally+diverse+acyl+substituents+on+stability+and+affinity%5BTitle%5D)+AND+%22Bioorg.+Med.+Chem%22%5BJournal%5D)">N(G)-Acyl-argininamides as NPY Y(1) receptor antagonists: Influence of structurally diverse acyl substituents on stability and affinity.</a> Bioorg. Med. Chem. 18 (17), 6292-6304 (2010).</li>
<li>Hammerschmidt, F., Kvaternik, H., Schweifer, A., Mereiter, K., Aigner, R. M. <a target="_blank" href="https://www.thieme-connect.com/products/ejournals/abstract/10.1055/s-0032-1316789">Improved Synthesis of No-Carrier-Added [*I]MIBG and Its Precursor.</a> Synthesis. 44 (21), 3387-3391 (2012).</li>
</ol>

De auteurs hebben niets te onthullen.

De voorloper voor guanidinylation een orthogonaal ontschermd cyclisch peptidederivaat, (c (OrnD (OtBu) Gf (N Me) V)), dat wordt gesynthetiseerd door een standaard protocol van Fmoc vaste-fase peptidesynthese (SPPS). Ornithine werd gebruikt als orthogonaal beschermde derivaat (Fmoc-Orn (Dde) -OH), die met hydrazine kan worden ontschermd in DMF na de cyclisatie van het peptide scaffold. Het peptide precursor wordt gezuiverd door de precipitatie van de verbinding en de daaropvolgende lyofiliserin...

Onder de meest voorkomende farmacofore groepen in natuurlijke liganden is de guanidinegroep, dat betrokken is bij meervoudige interacties 1, 2. Zo dient het als een potentiële viervoudige waterstofdonor in waterstofbinding interacties en is betrokken bij elektrostatische interacties, zoals zoutbruggen of kation-π interacties. In medicinale chemie, wordt deze groep vaak drugs en geneesmiddelkandidaten 4, hoewel zeer vaak guanidine mimetica 5, 6. De reden voor de ontwikkeling van guanidine nabootsers is de verwijdering van de alomtegenwoordige, positief geladen guanidinegroep, en de aanpassing van de lipofiliciteit van het ligand. In peptidische liganden, alleen guanidine-bevattend aminozuur arginine, die daarom vaak in het biologisch actieve gebied van peptidische liganden. Een zeer prominent voorbeeld voor een arginine bevattend ligand familie is de onderfamilie van de RGD-bindende integrines. In het algemeen zijn integrinen zijn een klasse van celadhesie receptoren, die in de loop belangrijke functies aan alle hogere organismen. Sommige van deze functies omvatten celadhesie, migratie en overleving cel. Zo zijn ze ook betrokken bij pathologische indicaties, zoals kanker en fibrose. Integrinen zijn heterodimere transmembraan eiwitten die bestaan ​​uit een α- en β-subeenheid dat integrine 24 bekende subtypen vormen; 8 herkennen het tripeptide Arg-Gly-Asp (RGD =) in hun liganden 7. De bindende gebied zich op het grensvlak tussen beide subtypen in het extracellulaire deel, de zogenaamde integrine kopgroep 8. RGD wordt herkend door twee gemeenschappelijke interacties: de metaalionen-afhankelijke adhesieplaats (MIDAS) gebied, dat zich in de beta-subeenheid en waarbij het carbonzuur in de liganden bindt (side chain of Asp); en guanidine-groep van de liganden, die zich in de alfa-subeenheid. De meeste integrine subtypen promiscue en tenminste een deel van hun natuurlijke extracellulaire matrix (ECM) liganden 9 delen. Daarmee voor de ontwikkeling van kunstmatige integrine liganden, het hoofddoel is, naast een hoge bindingsaffiniteit het subtype selectiviteit. Onlangs waren we in staat om een ​​belangrijk element voor het genereren van subtype-selectieve liganden onthullen: de guanidine-groep. Door verschillende modificaties, biselective liganden voor av en α5-bevattend integrine subtypes kunnen worden omgezet in verbindingen selectief door eenvoudige modificaties van de guanidinegroep, die vervolgens kunnen onderscheiden van de verschillende α-subeenheden 10. In de zak van av, de guanidinegroep interactie zijdelingse via een bidentaat zoutbrug van Asp218 11, 12. Deze interactie ceen eveneens worden waargenomen in α5β1 (hier met Asp227 in α5), maar bovendien wordt een end-on interactie van de guanidinegroep een Gin rest (Gln221) er 13 waargenomen. Zo hebben we wijzigde de guanidinegroep in twee tegengestelde manieren in een geval blokkeert de zijdelingse interactie met de methylering van het N δ guanidine-groep, en in het andere geval met de methylering van de guanidine N ω, blokkeren van het einde-wisselwerkingen. Verrassenderwijs dit kleine modificatie leidde tot een volledige selectiviteit verschuiving van de liganden. In aanvulling op de alkylering werd een nieuwe functionalisering methode geïntroduceerd in deze publicatie. De klassieke werkwijze voor functionalisering dergelijke pentapeptidic ligand via de zijketen conjugatie van een aminozuur niet betrokken bij binding (bijvoorbeeld K c (RGDfK)) 14, 15. Hier,laten we zien dat functionalisering mogelijk door aanpassing van de guanidine - die cruciaal is voor binding - met een acyl- of gealkyleerd linker. De positieve lading die essentieel is voor binding behouden en modellen suggereren dat de langketenige punten uit de bindende pocket, waardoor een ideale mogelijkheid voor de bevestiging van verdere linkers en etiketteeraggregaten (bijvoorbeeld een fluorescent label of een chelator voor moleculaire in beeld brengen). In dit werk concentreren we ons op de voorbereidende stappen voor de modificatie van de guanidinegroep van arginine-bevattende liganden. Dit omvat de synthese van N- ω -methylated species, alsook guanidinen met meer verbindingseenheden. De verschillende modificaties omvatten acylgroepen en alkylgroepen.

<table><tbody><tr><td>N,N&prime;-Di-Boc-1H-pyrazole-1-carboxamidine, 98%&nbsp;</td><td>Sigma Aldrich</td><td>434167&nbsp;ALDRICH</td><td></td></tr><tr><td>Trifenylfosfine, 99%</td><td>Sigma Aldrich</td><td>T84409&nbsp;SIGMA-ALDRICH</td><td></td></tr><tr><td>Tetrahydrofuran, >99,5%</td><td>Carl Roth</td><td>4745</td><td></td></tr><tr><td>Tetrahydrofuran anhydrous, 99,8%</td><td>Carl Roth</td><td>5182</td><td></td></tr><tr><td>Methanol anhydrous, 99,8%</td><td>Sigma Aldrich</td><td>322415&nbsp;SIGMA-ALDRICH</td><td></td></tr><tr><td>Diisopropyl azodicarboxylaat, 98%</td><td>Sigma Aldrich</td><td>225541&nbsp;ALDRICH</td><td></td></tr><tr><td>Dichloormethaan, voor synthese, 99,5%</td><td>Carl Roth</td><td>8424</td><td></td></tr><tr><td>Silica gel voor flitschromatografie</td><td>Sigma Aldrich</td><td>60738&nbsp;SIGMA-ALDRICH</td><td></td></tr><tr><td>n-Pentaan, 99%</td><td>Carl Roth</td><td>8720</td><td></td></tr><tr><td>n-Hexaan, 99%</td><td>Carl Roth</td><td>CP47</td><td></td></tr><tr><td>Ethylacetaat, 99,5%</td><td>Carl Roth</td><td>7338</td><td></td></tr><tr><td>Aminohexanol, 95%</td><td>Sigma Aldrich</td><td>A56353&nbsp;ALDRICH</td><td></td></tr><tr><td>S-Methylisothioureum hemisulfaat, 98%</td><td>Sigma Aldrich</td><td>M84445 ALDRICH</td><td></td></tr><tr><td>Di-tert-butyl dicarbonaat, 99%</td><td>Sigma Aldrich</td><td>205249&nbsp;ALDRICH</td><td></td></tr><tr><td>N,N-Dimethylformamide, 99,8%</td><td>Carl Roth</td><td>A529</td><td></td></tr><tr><td>N,N-Diisopropylethylamine, 99,5%</td><td>Carl Roth</td><td>2474</td><td></td></tr><tr><td>Acetanhydriet, 99%</td><td>Carl Roth</td><td>4483</td><td></td></tr><tr><td>Chloretryylhars</td><td>Carbolution</td><td>CC11006</td><td></td></tr><tr><td>Fmoc-Gly-OH, 98%</td><td>Carbolution</td><td>CC05014</td><td></td></tr><tr><td>Piperidine, 99%</td><td>Sigma Aldrich</td><td>104094&nbsp;SIGMA-ALDRICH</td><td></td></tr><tr><td>Fmoc-Orn(Dde)-OH</td><td>Iris-Biotech</td><td>FAA1502</td><td></td></tr><tr><td>HATU, 99%</td><td>Carbolution</td><td>CC01011</td><td></td></tr><tr><td>HOAt, 99%</td><td>Carbolution</td><td>CC01004</td><td></td></tr><tr><td>Fmoc-Val-OH</td><td>Carbolution</td><td>CC05028</td><td></td></tr><tr><td>2-Nitrobenzeensulfonylchloride, 97%</td><td>Sigma Aldrich</td><td>N11507&nbsp;ALDRICH</td><td></td></tr><tr><td>2,4,6-Collidine, 99%</td><td>Sigma Aldrich</td><td>27690&nbsp;SIGMA-ALDRICH</td><td></td></tr><tr><td>Mercaptoethanol, 99%&nbsp;</td><td>Sigma Aldrich</td><td>M6250&nbsp;ALDRICH</td><td></td></tr><tr><td>Diazabicycloundeceen, 98%</td><td>Sigma Aldrich</td><td>139009&nbsp;ALDRICH</td><td></td></tr><tr><td>Fmoc-D-Phe-OH, 98%</td><td>Sigma Aldrich</td><td>47378&nbsp;ALDRICH</td><td></td></tr><tr><td>Fmoc-Asp(OtBu)-OH, 98%</td><td>Carbolution</td><td>CC05008</td><td></td></tr><tr><td>Hexafluorisopropanol</td><td>Carbolution</td><td>CC03056</td><td></td></tr><tr><td>Difenylfosforylazide, 97%</td><td>Sigma Aldrich</td><td>178756&nbsp;ALDRICH</td><td></td></tr><tr><td>TFA, 99,9%</td><td>Carl Roth</td><td>P088</td><td></td></tr><tr><td>Triisopropylsilaan, 98%</td><td>Sigma Aldrich</td><td>233781&nbsp;ALDRICH</td><td></td></tr><tr><td>Acetonitril, HPLC-kwaliteit</td><td>Carl Roth</td><td>HN44</td><td></td></tr></tbody></table>

wijziging en functionalisering van de guanidine group door tailor-made voorlopers

Modification and Functionalization of the Guanidine Group by Tailor-made Precursors

De guanidine groep is een van de belangrijkste farmacofore groepen in medicinale chemie. De enige aminozuren die een guanidine groep van arginine. In dit artikel wordt een eenvoudige werkwijze voor de modificatie van de guanidinegroep in peptidische liganden voorzien, een voorbeeld van RGD bindende integrine liganden. Recent werd aangetoond dat het sterke modificatie van de guanidinegroep in deze liganden maakt de selectieve modulatie van het subtype (bijvoorbeeld tussen de subtypes av en α5). Bovendien is een voorheen onbekende strategie voor de functionalisering via de guanidine groep werd aangetoond, en de synthetische benadering wordt beoordeeld in dit document. De beschreven modificaties omvatten eindstandig (N ω) gealkyleerd en geacyleerd guanidinegroepen. Voor de synthese worden op maat precursor moleculen gesynthetiseerd, die vervolgens worden onderworpen aan een reactie met een orthogonaal ontschermd amine om de pre overdragen-gemodificeerde guanidinegroep. Voor de bereiding van gealkyleerde guanidinen, precursors basis van N worden N&#39;-di-Boc-1H-pyrazool-1-carboxamidine gebruikt geacyleerde verbindingen, de voorloper gekozen dat een overeenkomstige geacyleerde derivaat van N-Boc-S synthetiseren - methylisothioureum, die in één of twee stappen reacties worden verkregen.

Het cyclische peptide precursor werd gesynthetiseerd als een lineair peptide gecycliseerd en orthogonaal Dde-bescherming ontdaan. Na de precipitatie werd de zuiverheid van de verbinding geanalyseerd met HPLC-MS (figuur 1). De voortgang van de reactie te volgen, werd een HPLC-analyse uitgevoerd na de 2-uur reactietijd (figuur 2). Voor grotere resten op de guanidinegroep, de reactietijd van 2 uu...

Een protocol voor de synthese van met alkyl gemodificeerde guanidinen gebaseerd op het gebruik van de overeenkomstige precursors gepresenteerd.

Wijziging en functionalisering van de Guanidine Group door Tailor-made Voorlopers

The guanidine group is one of the most important pharmacophoric groups in medicinal chemistry. The only amino acid carrying a guanidine group is arginine. ...

Het algemene doel van deze procedure is om een gemakkelijke synthetische toegang te bieden tot guanidine-gefunctionaliseerde peptiden. Deze methode kan helpen bij het beantwoorden van belangrijke vragen op het gebied van spierpeptidechemie, zoals de ontwikkeling van integrine-liganden of GPCR-liganden. Het grote voordeel van deze techniek is dat het een gemakkelijke, synthetische toegang biedt tot gefunctionaliseerde guanidines, volledig compatibel met SPPS.De technologie zal vooral waardevol zijn voor tactiele moleculen omdat de functionele groepen, die worden gemodificeerd, meestal verslechterende biomoleculen zijn. In ons geval streven we naar moleculen die kunnen worden gebruikt voor moleculaire beeldvorming van specifieke eigenschappen van individuele kankers en voor hun specifieke behandeling; een belangrijke kwestie voor gepersonaliseerde geneeskunde. Om deze specifieke procedure te beginnen, voeg je een gram boc-pyrazol carboxamidine en een gram PPh3 toe aan een 50 milliliter ronde bodemkolf.Voeg vervolgens 10 milliliter gedroogd THF toe aan een 50 milliliter ronde bodemkolf in een inerte atmosfeer via een rubberen septum. Voeg met een spuit 194 microliters droog methanol t

modification-functionalization-guanidine-group-tailor-made

Research

JoVE Journal

Biochemistry

Biochemie

De efficiënte solid-phase peptide synthese van een gefunctionaliseerde bis-peptide trimeer gebruik te maken van een "veiligheidspal" decollete procedure vanaf HMBA hars wordt beschreven.

Vaste fase synthese van een gefunctionaliseerd Bis-Peptide Met behulp van &quot;Veiligheid Catch&quot; Methodologie

Adenovirus deeltjes zijn ontworpen om zowel de onnatuurlijke aminozuur analoog azidohomoalanine of de azido suiker...

Chemoselectieve Wijziging van Viral oppervlakken via bioorthogonal Klik Chemie

Deze video is een snelle, efficiënte methode om poly (ethyleenglycol) methacrylaat illustreren, waardoor keten polymerisaties en hydrogel synthese. Het zal laten zien hoe je methacrylamide functionaliteiten dezelfde wijze te introduceren in peptiden, detail gemeenschappelijke analytische methoden om functionalisering efficiëntie te beoordelen, suggesties voor het oplossen van problemen en geavanceerde aanpassingen, en tonen typische hydrogel karakterisering technieken.

Microgolven Functionalisering van poly (ethyleenglycol) en On-hars Peptiden voor gebruik in Chain Polymerisaties en Hydrogel Vorming

De hierin beschreven protocol heeft tot doel uit te leggen en verkorten de vele obstakels in de weg van de ingewikkelde route die leidt tot gewijzigde nucleosidetrifosfaten. Bijgevolg Dit protocol maakt zowel de synthese van deze geactiveerde bouwstenen en hun beschikbaarheid voor praktische toepassingen.

Nucleosidetrifosfaten - Van Synthese tot biochemische karakterisering

Hier presenteren we een protocol voor directe, vroege guanidinylatiestad die een snelle totale synthese van aminoguanidine-bevattende kleine organische moleculen mogelijk maakt. Een geavanceerd synthetisch intermediair dat werd gebruikt bij de synthese van een bloedstollingsfactor XIa-remmer, werd bereid volgens dit protocol.

Een Direct, Early Stage Guanidinylation protocol voor de synthese van complexe-Aminoguanidine bevattende Natural Products

Een protocol voor de eenvoudige bereiding van 4-gesubstituleerde quinazolinederivaten uit 2-aminobenzofenonen, thioureum en dimethylsulfoxide wordt gepresenteerd.

Facile Bereiding van 4-gesubstitueerde chinazolinederivaten

We presenteren een protocol voor de synthese van RGD-gefunctionaliseerde hydrogels als apparaten voor cel- en geneesmiddelafgifte. De procedure omvat koper gekatalyseerde alkyn-azide cycloadditie (CuAAC) tussen alkyn-gemodificeerde polyacrylzuur (PAA) en een RGD-azide-derivaat. De hydrogels worden gevormd met behulp van microgolf-geassisteerde polycondensatie en hun fysisch-chemische eigenschappen worden onderzocht.

De synthese van RGD-gefunctionaliseerde Hydrogels als een instrument voor therapeutische toepassingen

Representatieve experimentele procedures voor de synthese van N-(2-alkoxyvinyl) sulfonamiden en latere bekering tot phthalan en Fenylethylamine derivaten worden gepresenteerd in detail.

Voorbereiding van N-(2-alkoxyvinyl) sulfonamiden van N- tosyl-1,2,3-triazolen en latere bekering tot gesubstitueerde Phthalans en fenethylaminen

Hier presenteren we protocollen voor de synthese van disaccharide nucleosiden door de regioselectieve O- glycosylatie van ribonucleosides via een tijdelijke bescherming van hun 2', 3'-diol wordt met behulp van een cyclische ester van koppeling. Deze methode is van toepassing op verschillende onbeschermde nucleosiden zoals adenosine, calciumguanosine, cytosinetrifosfaat, uridine, 5-methyluridine en 5-fluorouridine te geven van de corresponderende disaccharide nucleosiden.

Regioselectieve O- glycosylatie van nucleosiden via de tijdelijke 2', 3'-Diol bescherming door een koppeling Ester voor de synthese van Disaccharide nucleosiden

Representatieve experimentele procedures voor de toevoeging van Amine-nuclefielen aan tricarbonyl (tropone) ijzer en daaropvolgende demetallatie van de resulterende complexen worden gedetailleerd gepresenteerd.

Bereiding van 6-aminocyclohepta-2, 4-dien-1-een derivaten via tricarbonyl (tropon) ijzer

Dit protocol beschrijft een methode voor het produceren en evalueren van de antimicrobiële activiteit en cytotoxiciteit van het kationische peptide Mel4 en het peptide-nabootser RK758. Door chemische synthese, recombinante expressie en gestandaardiseerde functionele assays te integreren, biedt het een gestroomlijnde workflow voor de productie en het testen van peptiden en kleinmolecuul-imitaties.

Productie en testen van antimicrobiële peptiden en hun nabootsers

Leer een methode voor de synthese van alkyl-gemodificeerde guanidines voor functionele peptiden. Deze techniek is volledig compatibel met SPPS en ondersteunt onderzoek naar gepersonaliseerde geneeskunde en kankerbehandeling.

Wijziging en functionalisering van de Guanidine Group door Tailor-made Voorlopers

Meer video's verkennen