Name: Microbiota van attine mierentuinen: visualisatie van een microbieel landschap door scanning elektronenmicroscopie (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2024-10-04T14:50:00.000+00:00
Duration: 7 min
Description: Verken de microbiota in mierentuinen van schimmeltelende mieren met behulp van geoptimaliseerde rasterelektronenmicroscopie. Deze methode onthult biofilmstructuren en ruimtelijke organisatie van micro-organismen.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

<meta charset="utf8"></head><body> SEM-analyse op microschaal van microbiële gemeenschappen in schimmelkwekende mierenculturen

<table><tbody><tr><td>2 mL tube</td><td>Axygen</td><td>MCT-200-C-BRA</td><td>Om monsters te fixeren en te dehydrateren</td></tr><tr><td>Calcium chloride anhydrous</td><td>Merck</td><td>C4901</td><td>CaCl2 anhydrous voor het bereiden van Karnovsky&rsquo;s fixatief</td></tr><tr><td>Critical point dryer</td><td>Leica</td><td>EM CPD 300</td><td>Voor drogen op kritisch punt</td></tr><tr><td>Double Sided Carbon Conductive Tape, 12 mm (W) X 5 M (L)</td><td>Electron Microscopy Sciences</td><td>77819-12</td><td>Voor het bevestigen van monsters</td></tr><tr><td>Entomological forceps</td><td>Geen specifieke leverancier</td><td></td><td>Om tuinmonsters te manipuleren</td></tr><tr><td>Ethyl alcohol (=ethanol), puur (&ge;99,5%)</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>459836</td><td>Voor dehydratatie</td></tr><tr><td>Forceps</td><td>Geen specifieke leverancier</td><td></td><td>Om tuinmonsters te manipuleren</td></tr><tr><td>Glass beaker</td><td>Geen specifieke leverancier</td><td></td><td>Voor dehydratatie</td></tr><tr><td>Glass Petri dish</td><td>Geen specifieke leverancier</td><td></td><td>Om tuinmonsters te manipuleren</td></tr><tr><td>Glass pipette</td><td>Geen specifieke leverancier</td><td></td><td>Om monsters te fixeren en te dehydrateren</td></tr><tr><td>Glutaraldehyde (Aqueous Glutaraldehyde EM Grade 25%)</td><td>Electron Microscopy Sciences</td><td>16220</td><td>Voor het bereiden van Karnovsky&rsquo;s fixatief</td></tr><tr><td>Gold target&nbsp;</td><td>Ted Pella, Inc.</td><td>8071</td><td>Om te sputter coaten met goud</td></tr><tr><td>Hydrochloric acid</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>320331</td><td>Voor het aanpassen van de pH van oplossingen</td></tr><tr><td>Image editor</td><td>Photoshop</td><td>elke versie</td><td>Om afbeeldingen aan te passen</td></tr><tr><td>Paraformaldehyde (Paraformaldehyde 20% Aqueous Solution EM Grade)</td><td>Electron Microscopy Sciences</td><td>15713</td><td>Voor het bereiden van Karnovsky&rsquo;s fixatief</td></tr><tr><td>Propilene recipient</td><td>Geen specifieke leverancier</td><td></td><td>Voor het onderhouden van levende mierenkolonies</td></tr><tr><td>Scanning Electron Microscope</td><td>JEOL&nbsp;</td><td>IT300 SEM</td><td>Voor beeldvorming van monsters&nbsp;</td></tr><tr><td>Sodium cacodylate trihydrate</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>C0250</td><td>Voor het bereiden van natriumcacodylaatbuffer</td></tr><tr><td>Spatula</td><td>Geen specifieke leverancier</td><td></td><td>Om tuinmonsters te manipuleren</td></tr><tr><td>Specimen containers with 15 mm dia. x 10 mm high</td><td>Ted Pella, Inc.</td><td>4591</td><td>Voor drogen op kritisch punt</td></tr><tr><td>Sputter coater</td><td>Baltec&nbsp;</td><td>SCD 050</td><td>Om te coaten met goud</td></tr><tr><td>Stub (Aluminium mount, flat end pin) 12.7 mm x 8 mm&nbsp;</td><td>Electron Microscopy Sciences</td><td>75520</td><td>Voor het bevestigen van monsters</td></tr></tbody></table>

microbiota van attine mierentuinen: visualisatie van een microbieel landschap door scanning elektronenmicroscopie

Microbiota of Attine Ants' Gardens: Visualizing a Microbial Landscape by Scanning Electron Microscopy

Microbiota van attine mierentuinen: visualisatie van een microbieel landschap door scanning elektronenmicroscopie

In macroscale ecosystems, such as rainforests or coral reefs, the spatial localization of organisms is the basis of our understanding of community ...

microbiota-attine-ants-gardens-visualizing-microbial-landscape

Research

JoVE Journal

Biology

Biologie

Deze video illustreert de techniek voor de extractie van DNA van de soorten van microben woonachtig zijn in de termiet einddarm. De voorbereiding van een natte glijbaan berg, wat handig is voor het visualiseren van de darm microbiële gemeenschap wordt ook geïllustreerd, en een rondleiding door het soortenrijke darm-omgeving wordt gegeven.

Extraheren van DNA uit de Gut Microben van de Termite (Zootermopsis Angusticollis) en visualiseren Gut microben

Jared Leadbetter verklaart waarom de termiet-darm microbiële gemeenschap is een uitstekend systeem voor het bestuderen van de complexe interacties tussen microben. De symbiotische relatie bestaat tussen de host insecten en lignocellulose-afbrekende darm microben wordt uitgelegd, evenals het industrieel gebruik van deze micro-organismen voor de afbraak van plantaardige biomassa en het genereren van biobrandstoffen.

Het onderzoeken van de microbiële gemeenschap in de Termite einddarm - Interview

Jared Leadbetter neemt ons mee voor een wandeling in de natuur door de diversiteit van het leven woonachtig zijn in de termiet einddarm - een micro-omgeving met daarin 250 verschillende soorten die nergens anders op aarde. Jared blijkt dat de symbiose vertoond door dit systeem is multi-layered en omvat niet alleen een relatie tussen de termiet en zijn darmen inwoners, maar ook betrekking heeft op een complex web van symbiose tussen de darm microben zelf.

Lagen van Symbiose - Het visualiseren van de Termite einddarm microbiële gemeenschap

Hier presenteren we een protocol om ruimtelijk en stoffelijk beoordelen de aanwezigheid van levensvatbare microbiota in de ingewanden van de teek met behulp van een gemodificeerde geheel-mount kruising in situ-aanpak.

Visualisatie van Microbiota in teek lef door geheel-mount In Situ hybridisatie

Dit gestroomlijnde protocol beschrijft een workflow om bacteriën in complexe weefselmonsters te detecteren en in beeld te brengen, van het fixeren van het weefsel tot het kleuren van microben met fluorescerende in situ hybridisatie.

Visualisatie van darmmicrobiota-gastheerinteracties via fluorescentie in situ hybridisatie, lectinekleuring en beeldvorming

Dit protocol laat een eenvoudige single-molecule fluorescentie microscopie technieken voor het visualiseren van DNA-replicatie door individuele replisomes in real time.

Visualiseren van Single-molecule DNA-replicatie met fluorescentiemicroscopie

Cryo elektronenmicroscopen, ofwel Scanning (SEM) of Transmission (TEM), worden op grote schaal gebruikt voor de karakterisering van biologische monsters of andere materialen met een hoog watergehalte 1. Een SEM / focused ion beam (FIB) wordt gebruikt om kenmerken van belang in monsters identificeren en extract een dun, elektron-transparante lamellen overbrenging op een cryo-TEM.

Cryo-elektron microscopie Specimen Voorbereiding door middel van een Focused Ion Beam

De aard van de interactie tussen hematopoietische stamcellen en progenitorcellen (HSPCs) en beenmerg nissen wordt slecht begrepen. Aangepaste hardware wijzigingen en een meerstaps overname protocol maken het gebruik van twee-foton en confocale microscopie beeld ex vivo gemerkte HSPCs geadopteerd in beenmerg gebieden volgen interacties en beweging.

In Vivo 4-dimensionale Tracking van hematopoietische stamcellen en progenitorcellen in volwassen muis calvarial Bone Marrow

De fenestreerde lever sinusoidale endotheelcel is een biologisch belangrijk filtersysteem dat sterk wordt beïnvloed door verschillende ziekten, toxines en fysiologische toestanden. Deze veranderingen hebben een aanzienlijke invloed op de leverfunctie. We beschrijven methoden voor de standaardisatie van de meting van de grootte en het aantal fenestraties in deze cellen.

Een gestandaardiseerde methode voor de analyse van lever sinusoïdale endotheelcellen en hun fenestraties van Scanning Electron Microscopy

Hier wordt een methode getoond voor het visualiseren van de ultrastructuur van de extracellulaire matrix in gedecellulariseerde hartweefsels.

Scanning Electron Microscopy van Gemacereerde Tissue te visualiseren de extracellulaire matrix

Verken de microbiota in mierentuinen van schimmeltelende mieren met behulp van geoptimaliseerde rasterelektronenmicroscopie. Deze methode onthult biofilmstructuren en ruimtelijke organisatie van micro-organismen.

Microbiota van attine mierentuinen: visualisatie van een microbieel landschap door scanning elektronenmicroscopie

Meer video's verkennen