Przygotowanie próbki i analiza danych dotyczących ekspresji genów opartych na RNASeq od danio pręgowanego

10.8K wyświetleń

Cytowano 4 razy

11:42 min.

27 października 2017

10.3791/56187-v

27 października 2017

10.8K wyświetleń
 ,  , 

* These authors contributed equally

Ten protokół przedstawia podejście do analizy całego transkryptomu z zarodków danio pręgowanego, larw lub posortowanych komórek. Obejmuje izolację RNA, analizę szlaku danych RNASeq oraz walidację zmian ekspresji genów opartą na qRT-PCR.

Przeglądaj więcej filmów

RNA-seq u rybek danio-ostronicznych

Chapters in this video

0:05

Tytuł

1:04

Pozyskiwanie embrionów poprzez naturalne kojarzenie i wyznaczanie stadium rozwoju embrionów

2:22

Dysocjacja całych embrionów, ekstrakcja RNA i oczyszczanie wysokiej jakości RNA

4:55

Sortowanie genów o różnej ekspresji

7:00

Wyznaczanie wzbogaconych szlaków

7:57

Tworzenie sieci szlaków i wyznaczanie wzbogaconych terminów GO

10:47

Podsumowanie

9:12

Wyniki: Dane ekspresji genomu danio pręgowanego oparte na RNAseq dla zespołu Alströma i zespołu Bardeta-Biedla

Related Videos