Perfil espacial abrangente de transcriptomas agnósticos de espécies via Stereo-seq

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10:22 min.

31 de outubro de 2025

10.3791/68619-v

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Este artigo apresenta um protocolo para realizar um perfil transcriptômico espacial abrangente do RNA do hospedeiro, viral, fúngico e microbioma a partir de seções de tecido embebidas em parafina fixadas em formalina usando Stereo-seq, que permite o mapeamento de alta resolução de diversos transcriptomas, preservando a arquitetura do tecido.

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ômica Espacial

Chapters in this video

0:00

Introdução

0:58

Preparação do Chip de Captura de Oligonucleotídeos Aleatórios Stereo-Seq (N-Chip)

3:06

Imagens Nucleares e Coloração de ssDNA de Secções de Tecido FFPE

5:08

Processo de Desreticulação de Secções FFPE Coloridas

7:43

Coleta da Mistura de Liberação de cDNA

8:56

Resultados

9:36

Conclusão

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