Интеллектуальный анализ наборов данных по пространственной транскриптомике с помощью DeepSpaceDB

1.5K просмотров

10:16 мин.

5 сентября 2025 г.

1.5K просмотров

Nupura Prabhune¹^,² , Yilin Du¹^,³ , Afeefa Zainab⁴ , Satoru Ebihara³ , Shinji Takeoka² , Shinpei Kawaoka¹^,⁵ , Alexis Vandenbon⁴^,⁶

¹Department of Integrative Bioanalytics, Institute of Development, Aging and Cancer, Tohoku University, ²Department of Life Science and Medical Bioscience, Graduate School of Advanced Science and Engineering, Waseda University, ³Department of Rehabilitation Medicine, Tohoku University Graduate School of Medicine, ⁴Institute for Life and Medical Sciences, Kyoto University, ⁵Inter-Organ Communication Research Team, Institute for Life and Medical Sciences, Kyoto University, ⁶Institute for Liberal Arts and Sciences, Kyoto University

В этой статье представлен протокол использования DeepSpaceDB, динамической интерактивной базы данных для пространственной транскриптомики, предлагающей рабочие процессы анализа и примеры для изучения организации тканей и экспрессии генов, связанных с заболеванием.