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13.6:

Replicazione negli eucarioti

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Replication in Eukaryotes

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– [Istruttore] La maggior parte dei fattori procarioti utilizzati durante la replicazione hanno equivalenti che giocano dei ruoli simili nella duplicazione dell DNA eucariota. Il processo inizia da un origine di replicazione che si lega a un complesso di riconoscimento. L’elicasi è quindi attratto sul posto e separa le stringhe di DNA, generando una bolla con due biforcazioni. Le primasi arrivano e generano i primer dell’RNA e, allo spostarsi delle elicasi, le polimerasi del DNA si allungano con del nuovo DNA. Nei procarioti, le stringhe conduttrici appena formate crescono continuamente, seguendo le biforcazioni. Al contrario, il frammento di Okazaki viene prodotto a partire da frammenti che viaggiano nel verso opposto. A causa di multipli fattori, lo schema del DNA usato per generare la stringa principale in una metà della struttura crea il frammento di Okazaki nell’altra. Curiosamente, varie origini di replicazione esistono nel cromosoma eucariota lineare e la replicazione termina quando le loro sfere associate si uniscono. I primer sono quindi eliminati dagli enzimi, come la RNAse, e sostituiti con del DNA. Successivamente, il DNA ligasi lega ogni segmento. Tuttavia, quando il primer finale sparisce dal frammento di Okazaki, lo spazio rimane vuoto e sarà presente un frammento di DNA non copiato. Per evitare questo fenomeno, un enzima chiamato telomerasi si lega alla regione non copiata e la allunga con una sequenza di DNA non codificata. Le primasi e i DNA polimerasi agiscono su questa zona, creando un “cappello” di telomerasi che impedisce l’eventuale perdita di DNA durante la replicazione. Ecco perché la replicazione del DNA eucariota termina con due molecole di DNA con una stringa “genitore” e una nuova, numerose origini di replicazione e telomeri.

13.6:

Replicazione negli eucarioti

Panoramica

Nelle cellule eucariotiche, la replicazione del DNA è altamente conservata e strettamente regolamentata. I cromosomi lineari multipli devono essere duplicati con alta fedeltà prima della divisione cellulare, quindi ci sono molte proteine che riempiono ruoli specializzati nel processo di replicazione. La replica avviene in tre fasi: avvio, allungamento e terminazione e termina con due serie complete di cromosomi nel nucleo.

Molte proteine orchestrano la replicazione all’Origine

La replicazione eucaotica segue molti degli stessi principi della replicazione del DNA procariotico, ma poiché il genoma è molto più grande e i cromosomi sono lineari piuttosto che circolari, il processo richiede più proteine e ha alcune differenze chiave. La replica avviene contemporaneamente a più origini della replicazione lungo ogni cromosoma. Le proteine dell’iniziatore riconoscono e si legano all’origine, reclutando elicasi per disavvolgere la doppia elica del DNA. Ad ogni punto di origine, si formano due forcelle di replica. La Primasi aggiunge quindi brevi “primer” (iniziatori) di RNA ai singoli filamenti di DNA, che fungono da punto di partenza per la polimerasi del DNA per legare e iniziare a copiare la sequenza. Il DNA può essere sintetizzato solo nella direzione da 5′ a 3′, quindi la replicazione di entrambi i filamenti da una singola forcella di replicazione procede in due direzioni diverse. Il filamento principale è sintetizzato continuamente, mentre il filamento in ritardo è sintetizzato in brevi tratti 100-200 coppie di basi in lunghezza, chiamate frammenti di Okazaki. Una volta completata la maggior parte della replicazione, gli enzimi RNAsi rimuovono i primer dell’RNA e la ligasi del DNA si unisce a qualsiasi lacuna nel nuovo filamento.

Dividere l’operazione di replica tra polimerasi

Il carico di lavoro della copia del DNA negli eucarioti è diviso tra diversi tipi di enzimi di polimerasi del DNA. Le principali famiglie di polimerasi del DNA in tutti gli organismi sono classificate in base alla somiglianza delle loro strutture proteiche e delle sequenze di amminoacidi. Le prime famiglie ad essere scoperte furono definite A, B, C e X, con le famiglie Y e D identificate in seguito. Le polimerasi di famiglia B negli eucarioti includono Pol, che funziona anche come un primase alla forcella di replicazione, e Pol , gli enzimi che fanno la maggior parte del lavoro di replicazione del DNA sui filamenti di testa e in ritardo del modello, rispettivamente. Altre polimerasi del DNA sono responsabili di compiti come la riparazione del danno al DNA, la copia del DNA mitocondriale e dei plastidi e il riempimento di lacune nella sequenza del DNA sul filamento in ritardo dopo la rimozione dei primer dell’RNA.

I telomeri proteggono le estremità dei cromosomi dalla degradazione

Poiché i cromosomi eucarioti sono lineari, sono suscettibili alla degradazione alle estremità. Per proteggere importanti informazioni genetiche dai danni, le estremità dei cromosomi contengono molte ripetizioni non codificanti di DNA ricco di G altamente conservato: i telomeri. Una breve sporgenza a filamento singolo 3′ ad ogni estremità del cromosoma interagisce con proteine specializzate, che stabilizza il cromosoma all’interno del nucleo. A causa del modo in cui il filamento in ritardo viene sintetizzato, una piccola quantità di DNA telomerico non può essere replicata con ogni divisione cellulare. Di conseguenza, i telomeri si accorciano gradualmente nel corso di molti cicli cellulari e possono essere misurati come un marcatore dell’invecchiamento cellulare. Alcune popolazioni di cellule, come le cellule germinali e le cellule staminali, esprimono la telomerasi, un enzima che allunga i telomeri, permettendo alla cellula di subire più cicli cellulari prima che i telomeri si accorciano.

Suggested Reading

Garcia-Diaz, Miguel, and Katarzyna Bebenek. “Multiple functions of DNA polymerases.” Critical Reviews in Plant Sciences 26 (2007): 105-122. [Source]