PCRの目的は、ポリメラーゼ連鎖反応によって 遺伝子配列を増幅することです。この例では、目的の遺伝子が精製DNAから 増幅されます。増幅を行うためには、ポリメラーゼが新しいDNAを合成するために必要となります。目的の遺伝子と相同性を共有する,一本鎖DNAの短い断片であるプライマーも 必要となります。最後に、デオキシヌクレオチド三リン酸(dNTP)という単一ヌクレオチドを用いて新しい鎖を作ります。PCRの最初のステップは、DNAを変性させる 混合物を加熱することです。次に反応物を冷却し、そしてプライマーをそれらの相同領域にアニーリングさせます。一度結合すると、反応は ポリメラーゼにとって最適な温度に加熱される。次いでポリメラーゼは プライマーDNA複合体を認識し,溶液中のdNTPを用いて 新しい鎖の合成を開始します。次いで反応物を加熱し、このように 2回目のサイクルが進行します。3回目のサイクルのあとには,遺伝子のコピーは合計8個です。4回目の後は16個です。5回目の後は32個です。コピー数は指数関数的に増え続けます。30サイクル後には、10億以上のコピーがあります。