Bizim deney HIV pozitif hastaların periferik kan translocating bakteri türlerinin bir sıralama analizi gerçekleştirmek için nasıl gösterecektir.
Sağlıklı bir gastrointestinal sistem, humoral ve hücresel mukozal bağışıklık sistemi 1,2 gelişimini etkileyen komensal mikropların çok çeşitli fizyolojik tarafından kolonize.
Mikrobiyota bağışıklık sistemini güçlü bir mukozal bariyeri ile karşı korumalıdır. Enfeksiyonlar ve antibiyotikler normal gastrointestinal sistem bariyer ve yerleşik bakteri kompozisyonu, olası bağışıklık anormallikleri 3 sonuç değiştirmek için bilinmektedir.
HIV, sistemik immün aktivasyon 4-7 katkıda lipopolisakkarid ve bakteriyel DNA parçaları gibi bakteriyel bioproducts, sistemik dolaşıma mukozal bağışıklık ve kaçak ilerici yetmezliği olan gastrointestinal bariyer ihlali neden olur . Mikrobiyal translokasyon, HIV / AIDS immünopatogenezi ve tedavisi 4,8 yanıt alakalıdır .
Biz, HIV ile enfekte olan hastaların periferik kan translocating bakteriler bileşimi karakterize etmek amaçlanmıştır. Amacımız takip etmek, bir sıralama analizi ile takip panbacteric 16S ribosomial gen için PCR kurdu.
Kısaca, hem de HIV ile enfekte ve sağlıklı kişilerde tam kan kullanılır. Sağlıklı bireyler normal bağırsak homeostazı mevcut olduğu göz önüne alındığında, bu hastalarda mikroflora hiçbir translokasyon bekleniyor. Venipunktür ve plazma ayırma ile tam kan toplama, DNA plazmasından elde edilen ve gen 9 ribosomial panbacteric 16S için geniş bir PCR reaksiyonu gerçekleştirmek için kullanılır. Takiben PCR ürün arıtma, klonlama ve sıralama analizleri yapılmaktadır.
The authors have nothing to disclose.
Gianni Scimone video yapma ile mükemmel destek için minnettar.
Name of Reagent | Company | Catalogue Number | Comments (optional) |
---|---|---|---|
Easty-DNA Kit | Invitrogen | K 180001 | |
Chloroform | Sigma-Aldrich | C2432 | |
Ethanol | Sigma-Aldrich | E7203 | |
UltraPure Waer | Invitrogen | 10977049 | |
Lysozyme | Fluka | 62970 | 10 μg/mL in Distillated Water |
AmpliTaq Gold | Applied Biosystem | 26478701 | |
Microcon 100 | Millipore | 42413 | |
PCR primers | Invitrogen | ||
Agarose | Eppendorf | C1343 | |
DNA ladder | Invitrogen | 15628019 | |
Purelink PCR micro kit | Invitrogen | K310050 | |
LB Agar, powder | Invitrogen | 22700025 | |
Bactoagar | Invitrogen | ||
Ampicillin | Invitrogen | 11593027 | 10 mg/mL in Distillated Water |
X-gal | Invitrogen | 15520034 | 40mg/mL in DMF |
IPTG | Invitrogen | 15529019 | 100mM in Distillated water |
Topo TA cloning kit | Invitrogen | K450002 | |
Purelink Quick Plasmid Miniprep kit | Invitrogen | K210010 | |
Big dye | Applied Biosystem | 4337455 | |
DyeEx 2.0 spin kit | Qiagen | 63204 |