Summary
Une méthode simple est décrit pour l'induction de la transition épithélio mésenchymateuse (EMT) dans une variété de types de cellules. Méthodes d'analyse de cellules dans les Etats EMT par immunocytochimie sont inclus.
Abstract
Épithéliales de transition mésenchymateuses (EMT) est essentiel pour la morphogenèse correcte au cours du développement. Une mauvaise régulation de ce processus a été impliqué comme un événement clé dans la fibrose et la progression des cancers à un état métastatique. Comprendre les processus qui sous-tendent EMT est impératif pour le diagnostic précoce et le contrôle clinique de ces états pathologiques. Fiable induction de EMT in vitro est un outil utile pour la découverte de médicaments, ainsi que d'identifier des signatures d'expression génique communes à des fins de diagnostic. Ici, nous démontrons une méthode simple pour l'induction de l'EMT dans une variété de types de cellules. Méthodes d'analyse de cellules pré-et post-EMT induction par immunocytochimie sont également inclus. En outre, nous démontrons l'efficacité de cette méthode à travers l'analyse de réseau à base d'anticorps et des essais de migration / invasion.
Introduction
Épithéliales de transition mésenchymateuses (EMT) est le processus par lequel une cellule épithéliale polarisée subit une série de changements résultant dans une cellule très mobiles fibroblaste mésenchymateuses. Ce processus se produit, en partie, par des changements d'expression génique et de la dégradation des jonctions adhérentes, ce qui entraîne une plus grande capacité à migrer et à envahir. Physiologiquement, EMT joue un rôle important au cours du développement embryonnaire et la cicatrisation des plaies. Perte de contrôle adéquat sur EMT peut conduire à la fibrose et les métastases des cancers 1,2.
La réduction de la E-cadhérine à la surface des cellules épithéliales est une étape critique dans la progression d'une cellule dans EMT 3,4. La E-cadhérine est une protéine transmembranaire à passage unique qui interagit directement avec les protéines de cadhérine sur les cellules adjacentes. En plus de son rôle dans l'adhésion cellulaire, la E-cadhérine influences de signalisation cellulaire par l'intermédiaire d'interactions entre la queue cytoplasmique de la E-cadhérine unda variété de protéines régulatrices, notamment β-caténine. β-caténine joue un rôle dans la stabilisation des jonctions adhérentes. Au cours de la signalisation Wnt canonique, β-caténine est libéré de la E-cadhérine et de translocation vers le noyau où elle agit comme un facteur de transcription en aval dans la voie Wnt 3,4,5. Dans le noyau, β-caténine a été démontré que l'augmentation de la transcription de plusieurs facteurs liés à l'EMT-torsion notamment, Slug, la fibronectine, et une variété de métalloprotéases matricielles 3,6.
En plus de Wnt, la signalisation du TGF-β a été montré à jouer un rôle important dans l'induction EMT fois au cours du développement normal et dans les Etats malades 7,8,9. TGF-β est impliqué dans l'EMT qui se produit pendant la formation du voile du palais et dans le cœur en développement 10. Il a également été impliquée dans la fibrose et à la progression du cancer à métastases 7.
La procédure décrite ici provides induction uniforme des EMT dans une variété de types de cellules, sans la nécessité d'une manipulation génétique. Cette procédure utilise un cocktail de la E-cadhérine, sFRP-1, et Dkk-1 anticorps bloquants et Wnt-5a et protéines recombinantes TGF-β1. Ce cocktail est conçu pour bloquer E-cadhérine sur la base d'adhérence tout en améliorant Wnt et la signalisation du TGF-β. La capacité de robuste EMT induction est essentiel pour la compréhension de la biologie de ce processus et comment le manipuler à des fins thérapeutiques. Marqueurs communs actuels de EMT, la E-cadhérine (downregulated dans EMT) et la vimentine (régulés à la hausse dans EMT), peuvent être trouvés co-exprimé dans les cancers et donc ne fournissent pas les meilleurs marqueurs de diagnostic de cellules métastatiques potentiels 12. Fait important, l'analyse d'une variété de types de cellules qui ont subi EMT est utile de développer des signatures d'expression des gènes communs qui peuvent être utilisés à des fins diagnostiques dans le cancer et la fibrose 11. En outre, des études récentes ont démontré que EMT peut jouer un rôle dans la formation des cellules souches cancéreuses, ce qui suggère que les cellules qui ont subi EMT peuvent être utiles pour le criblage de médicaments pour identifier des composés qui peuvent cibler ces cellules 13.
Protocol
Une. L'induction de l'EMT
- Des milieux de culture chaud à 37 ° C dans un bain d'eau. Le milieu de culture utilisé est le même que les supports utilisés pour la culture standard de vos cellules d'intérêt. Par exemple, la ligne de poumon de cellules de carcinome humain A549 est cultivé en F12 de Kaighn supplémenté avec 10% de sérum bovin fœtal et de la glutamine 2 mM.
- Récolte de cellules d'intérêt en utilisant une solution de dissociation (par exemple TrypLE Express).
- Suspendre les cellules dans un milieu de culture préchauffé dans un tube de 15 ml conique.
- Centrifuger la suspension de cellules à 400 xg pendant 5 min.
- Retirez délicatement le surnageant en le versant dans un conteneur à déchets.
- Suspendre le culot cellulaire dans un milieu de culture préchauffé.
- Compter les cellules viables à l'aide au bleu Trypan. Suppression d'un échantillon de la suspension cellulaire et diluer dans 0,4% solution bleu Trypan. Placer 10 ml de l'échantillon dilué sur un hémocytomètre et compter les cellules viables (cellules qui ne se transforment pas en bleu). Utilisez le nombre de cellules pour déterminer la cellule densité dans votre solution.
- cellules de plaque sur la culture de tissus traités plaques ou flacons de 0,9 à 1,0 x 10 4 cellules par cm 2. Par exemple, 0,5 x 10 6 cellules étalées dans une plaque de 100 mm dans des milieux de culture contenant 1X Supplément EMT induisant Media (6 ml de milieu par plaque de 100 mm).
- Cellules plaqué Culture dans un C / 5% de CO 2 incubateur à 37 °. Surveillance de la morphologie des cellules quotidien.
- Trois jours après l'étalement, retirer le support et la remplacer par un milieu de culture préchauffé frais contenant Supplément 1X EMT induisant des médias. Continuer de culture dans un rapport C / 5% de CO 2 incubateur à 37 °.
- Cinq jours après l'étalement, les cellules sont prêtes pour l'analyse. La morphologie cellulaire est visualisé par microscopie optique inversé.
2. Analyse de l'expression des protéines par immunocytochimie
- Préparer des lamelles stériles de 12 mm pour une plaque de 24 puits en plaçant des lamelles dans une boîte de Pétri contenant 95% d'éthanol. Retirez délicatement les lamelles dans de l'éthanol nousment une aiguille et pince courbe et flamme stériliser. Placez lamelle stérile dans un puits d'une plaque de 24 puits. Répéter l'opération avec les lamelles restantes.
- Préparer la suspension cellulaire comme décrit dans la section 1.1 à 1.7.
- Plate 1,6 x 10 4 cellules / puits dans 0,5 ml de milieu de culture préchauffé contenant Supplément 1X EMT induisant des médias.
- Développer et nourrir les cellules comme décrit dans les sections 1.9 à 1.11.
- Cinq jours après l'étalement, retirer le support et fixer les cellules avec 300 pl / puits de 4% de paraformaldéhyde dans 1X tampon phosphate salin (PBS) pendant 20 min à température ambiante.
- Retirer fixateur et rincer les cellules 2x avec du PBS 1X, 500 pl / puits.
- Incuber les cellules dans 400 ul / puits de tampon de blocage (PBS 1X contenant 1% d'albumine de sérum bovin (BSA), 10% de sérum d'âne normal, et 0,3% de Triton X-100) pendant 1 h à température ambiante.
- Incuber dans l'anticorps primaire aux fabricants recommandé concentration dans 400 pl / puits de tampon de blocage pendant 3 heures à la salle température ou une nuit à 4 ° C. Lors de l'utilisation d'un anticorps primaire directement conjugué à un fluorochrome, incuber les échantillons à l'obscurité.
- Laver les cellules trois fois dans 500 pl / puits de PBS 1X contenant 0,1% de BSA pendant 5 minutes à chaque lavage. Lors de l'utilisation d'un anticorps primaire directement conjugué à un fluorochrome, passez directement à l'étape 2.12.
- Incuber les cellules à un anticorps secondaire à la concentration recommandée par le fabricant dans 400 pl / puits de PBS 1X contenant 1% de BSA pendant 1 heure à température ambiante dans l'obscurité.
- Laver les cellules trois fois dans 500 pl / puits de PBS 1X contenant 0,1% de BSA pendant 5 minutes à chaque lavage.
- Si vous le souhaitez, les noyaux avec DAPI contre-colorer.
- Rincer les cellules dans de l'eau déminéralisée et de montage des lamelles face vers le bas sur une lame en utilisant les médias de montage.
Representative Results
. L'EMT induisant des conditions de culture décrites ici fournissent une méthode robuste pour l'induction de l'EMT dans une variété de types de cellules figures 1 et 2 montrent la morphologie et les niveaux d'expression de marqueur de 4 lignes cellulaires humaines: cellules de glioblastome T98G, des cellules HT29 d'adénocarcinome du côlon , des cellules de carcinome du poumon A549 et MCF10A cellules épithéliales mammaires. Les cellules qui ont été traités avec le supplément EMT induisant médias ont changé de morphologie classique épithéliale (Figures 1A - 1D) à un mésenchymateuses, morphologie fusiforme (figures 1E - 1H). Cellules EMT-induites sont apparus moins dense en colonies serrées par rapport aux cellules non induites. Échantillons non induit MCF10A contenues grappes serrées entourées par des cellules plus tassées. Ces grappes serrées étaient la E-cadhérine positif (figure 2D) et ont disparu lors d'un traitement avec l'EMT induisant médias Supplement (figure 2H).
EMT a également été évaluée par la régulation négative de marqueurs épithéliaux et la régulation positive des marqueurs mésenchymateuses. La régulation à la baisse de l'expression de la E-cadhérine est typiquement observée après EMT induction dans des types 3,4 cellulaires différentes La figure 2 montre l'expression de surface de la E-cadhérine dans la majorité des cellules non traitées (figures 2A - 2D; rouge). Par rapport à son absence, après induction EMT (figures 2E - 2H, rouge). Une lignée cellulaire, T98G, s'est révélé avoir un très faible niveau de base de la E-cadhérine avant EMT induction, ce qui a empêché son analyse. La régulation positive du marqueur mésenchymateuses, fibronectine, est également visible après induction avec le supplément EMT induisant Media (Figures 2A - 2D par rapport figures 2E - 2H; vert).
Les niveaux de la E-cadhérine et la fibronectine expression vus par immunocytochimieont en outre été confirmée par Western blot de lysats de cellules totales (Figure 3). Le western blot a confirmé la régulation négative de la E-cadhérine et de la régulation positive de l'expression de la fibronectine vu par immunocytochimie. Les bandes ont été quantifiés par densitométrie et normalisée de GAPDH à déterminer par rapport facteur de variation suivant EMT induction. Niveaux E-cadhérine ont été réduits de 6,4 et 3,4 fois en A549 et les cellules MCF10A, respectivement. niveaux de la fibronectine ont été augmenté de 4,6, 4,1, et 2,3 fois dans T98G, A549, et les cellules MCF10A, respectivement. Bien que le transfert de western ne montre pas de réduction significative des niveaux de protéine E-cadhérine dans les cellules HT29 à induction post-EMT, les résultats d'immunocytochimie démontrent une réduction de l'expression de surface de la E-cadhérine (Figure 2B par rapport à 2F), qui est incapable de se distinguer en Western blot de lysats de cellules totales.
Pour mieux évaluer l'état de EMT, marqueur connue supplémentairess pour EMT ont été analysés avant et après-EMT induction. En accord avec les résultats précédents, la E-cadhérine a été régulée à la baisse dans toutes les lignées cellulaires examinées, ce qui indique que EMT a été induite. En outre, les marqueurs mésenchymateuses, vimentine et escargot, ont été régulés à la hausse dans A549, T98G, et les cellules MCF10A après un traitement avec supplément EMT induisant Media (Figure 4). La lignée cellulaire HT29 n'a pas montré d'expression de ces marqueurs mésenchymateuses, avec ou sans induction EMT (données non présentées), ce qui pourrait indiquer que ces cellules utilisent des voies alternatives pour EMT induction.
Bien que le TGF-β est suffisante pour induire EMT dans certains contextes 7,8,9 cellule, d'autres types de cellules ne répondent pas à la seule addition de TGF-β 14. MCF7 cellules de cancer du sein humaines PANC-1 et des cellules de carcinome pancréatique humain sont tous deux signalés ne pas répondre à la signalisation du TGF-14 seul β. Pour déterminer si les deux lignes pourraient subir EMT dans vitro, les cellules ont été cultivées en présence du supplément EMT induisant des médias. Les cellules ont été stimulées avec du TGF-β1 recombinant seul, à la concentration dans le supplément EMT induisant des médias. Ces cellules conservent leur morphologie épithéliale, composée de colonies serrées de cellules (données non présentées) et les niveaux E-cadhérine surface ont été similaires à ceux observés dans les cellules témoins (figures 5C et 5D contre les figures 5A et 5B). En revanche, les cellules stimulées par le supplément EMT induisant médias ont montré une diminution drastique des niveaux E-cadhérine surface (figures 5E et 5F). Ces cellules ont également obtenu une morphologie plus mésenchymateuses, les cellules sont devenues moins compact et plus broche-like (données non présentées). Ces résultats démontrent que la méthode EMT induire décrit ici est capable de promouvoir l'expression EMT morphologie et des changements des marqueurs dans les cellules en général résistants à TGF-β-iEMT nduced.
En plus des changements dans l'expression des marqueurs, une autre caractéristique des cellules mésenchymateuses est leur capacité à migrer et envahir. Migration et l'invasion des cellules cultivées avec ou sans le supplément EMT induisant des médias ont été analysées en utilisant le 96 et BME invasion cellulaire dosage selon les instructions du fabricant. Brièvement, les cellules ont été ensemencées sur des plaques à 96 puits (50 000 cellules / puits) contenant des inserts de filtres avec 8,0 um pores. Après 48 h, la migration a été évaluée par calcéine AM coloration des cellules qui avaient migré à travers le filtre. Chaque échantillon a été testé en trois exemplaires deux fois avec des résultats similaires. Des résultats représentatifs de l'une expérience sont présentés sur la figure 6A. Augmentation statistiquement significative (valeur p <0,003) dans la migration cellulaire ont été observés avec les deux A549 et PANC-1 cellules après induction EMT. Pour évaluer la capacité de ces cellules à envahir (c.-à migrer à travers la matrice extracellulaire), le même essai a étéeffectuée avec un filtre de l'extrait revêtu membrane basale. EMT-induite des cellules ont montré une (valeur P <0,001) augmentation statistiquement significative des capacités d'invasion par rapport aux cellules non traitées comme on le voit sur la figure 6B.
L'induction robuste de EMT est utile pour l'analyse des changements d'expression des gènes et la signalisation qui ont lieu dans ces cellules. L'analyse de la matrice à base d'anticorps en utilisant des lysats de cellules à la fois traitées et non traitées est une méthode pour analyser les niveaux d'une variété de molécules d'expression dans un seul échantillon. A titre d'exemple, nous avons analysé les niveaux de membres de la famille MAPK phosphorylée dans des lysats de non-induite et EMT induite cellules MCF7 et A549 en utilisant le kit de tableau du protéome humain Profiler Phospho-MAPK. La matrice a été exécutée deux fois à partir de traitements EMT-induction indépendantes avec des résultats similaires. Figure 7 montre les données représentatives d'une matrice. Les deux types de cellules présentaient une augmentation de la phosphorylation de la protéine CREB (S133), ERK1 (T2 02/Y204), et ERK2 (T185/Y187) dans des cellules EMT-induites comparées à des témoins. Les différences dans les événements de signalisation ont été observées entre les deux types cellulaires aussi bien. Les cellules A549 ont montré une augmentation de la GSK-3 β (S9) la phosphorylation, alors que les cellules MCF7 ont montré une augmentation p70S6K (T421/S424) phosphorylation.
Figure 1. Mésenchymateuses morphologie induction après stimulation par le supplément EMT induisant Media (A - D). Morphologie épithéliale dans les types cellulaires quatre indiquée ci-dessous 5 jours de culture dans des milieux de culture standard sans supplément EMT induisant Media (E - H). Morphologie mésenchymateuses dans le quatre types de cellules indiqué cultivées avec le supplément EMT induisant des médias pendant 5 jours.
Figure 2. La régulation négative de l'expression du marqueur épithélial et la régulation positive de l'expression du marqueur mésenchymateux dans des cellules EMT-induits. Cellules ont été colorées par immunofluorescence pour détecter l'expression du marqueur épithélial, la E-cadhérine (rouge), et le marqueur mésenchymateux, la fibronectine (vert). (A - D) des cellules cultivées sans supplément EMT induisant des médias pendant 5 jours de contrôle (E - H.) Les cellules cultivées avec le supplément EMT induisant des médias pendant 5 jours. Toutes les cellules sont DAPI (bleu).
Figure 3. Confirmation de l'expression du marqueur épithélial et mésenchymateuses avec un Western blot . alysis Western blot de lysats totaux de cellules de types cellulaires quatre indiqué, traité avec (EMT) ou sans (-) le supplément EMT induisant des médias pendant 5 jours. Bandes pour la E-cadhérine, la fibronectine, et le contrôle GAPDH de chargement sont indiquées sur la gauche. Le marqueur de taille est indiquée sur la droite.
Figure 4. La régulation positive des marqueurs mésenchymateux, la vimentine et Snail dans les cellules EMT-induits. Cellules ont été colorées par immunofluorescence multicolore pour détecter l'expression du marqueur épithélial, la E-cadhérine (gris), et les marqueurs mésenchymateux, la vimentine (vert) et d'escargot (rouge) Les cellules témoins cultivées sans le supplément EMT induisant des médias pendant 5 jours. - (C A). (D - F) Les cellules cultivées avec le supplément EMT induisant des médias pendant 5 jours.
Figure 5. L'induction de l'EMT dans des cellules non sensibles au TGF-β1. (A et B) Les cellules cultivées avec le milieu seul pendant 5 jours. (C et D) Les cellules cultivées dans un milieu contenant 10 ng / ml de TGF-β1 pendant 5 jours. (E et F) les cellules cultivées en supplément EMT induisant des médias pendant 5 jours. Toutes les cellules sont colorées pour l'expression E-cadhérine (rouge) et DAPI (bleu).
Figure 6. Cellules induite EMT-ont augmenté les capacités de migration et d'invasion. A. Nombre moyen de cellules qui ont migré à travers un filtre de pores de 8 pm après incubation pendant 48 heures. B. Effectif moyen decellules qui étaient capables d'envahir à travers un filtre à pores de 8 um revêtue d'un extrait de la membrane basale après une incubation de 48 h. Les barres d'erreur indiquent l'écart-type sur trois puits.
Base-Anticorps Figure 7. Tableau analyse de l'expression des EMT induction. Lysats de A549 (A et C) et MCF7 (B et D) des cellules en culture avec ou sans supplément EMT induisant des médias ont été utilisés pour l'analyse de réseau en utilisant le kit de tableau du protéome humain Profiler Phospho-MAPK. Spots mis en évidence dans A et B ont ensuite été quantifiés par densitométrie. Les comparaisons des lysats à EMT-induites non induits sont présentés dans les graphiques à barres correspondant ci-dessous (C et D). Cliquez ici pour agrandir la figure </ A>.
Discussion
Les méthodes précédentes pour EMT induction ont généralement utilisé stimulation TGF-β ou de la modification génétique. Bien que le TGF-β seul a été représenté pour induire EMT dans certains types cellulaires, il a maintenant été démontré que le TGF-β est nécessaire pour EMT, mais elle n'est pas suffisante dans tous les types cellulaires 6,14. Utilisation de la modification génétique pour EMT induction prend du temps et de main-d'œuvre. La méthode décrite ici utilise une combinaison de facteurs, y compris, la E-cadhérine anti-humain, sFRP-1 anti-humain, DKK-1 anti-humain, Wnt-5a humaine recombinante, et TGF-β1 humain recombinant pour induire de manière fiable EMT. Cette combinaison de facteurs est conçu pour bloquer l'adhésion sur la base E-cadhérine, une étape cruciale pour EMT induction 4, et d'améliorer la signalisation Wnt en ajoutant la protéine Wnt-5a ainsi que l'utilisation des anticorps bloquant les inhibiteurs de Wnt, sFRP-1 et Dkk -1. Wnt et la signalisation du TGF-β se sont révélés agir dans une boucle autocrine pour induire et maintenir la stat des cellules mésenchymateusese 6. Cette méthode permet d'éviter l'induction d'une manipulation génétique et est plus efficace que d'utiliser le TGF-β seuls. Fait important, nous sommes en mesure d'observer l'induction de l'EMT dans des types cellulaires, y compris les cellules MCF7 et des cellules PANC-1, qui ont été précédemment montré non seulement de répondre à la stimulation de TGF-β (figure 5) 14.
Les cellules traitées avec le Supplément spectacle EMT induisant Media morphologie fusiforme moins compact et augmenté (figure 1). En outre, il existe une diminution de l'expression de surface E-cadhérine concurrente avec une augmentation de l'expression de la fibronectine, qui sont caractéristiques d'EMT (figures 2 et 3). Marqueurs mésenchymateuses supplémentaires tels que des escargots et vimentine sont également régulés à la hausse dans les cellules induites EMT que par rapport aux témoins non induites (figure 4). Migration et l'invasion des capacités accrus sont les principales caractéristiques fonctionnelles des cellules mésenchymateuses. Dans in vitro (Figure 6).
Cette méthode simple pour EMT induction est utile pour l'étude de la signalisation EMT comme démontré à l'aide des données d'expression de matrice d'anticorps présentés dans la figure 7. Différents types de cellules peuvent être comparées pré-et post-EMT induction pour obtenir les signatures d'expression communs associés à EMT, comme l'augmentation de la CREB phosphorylée et ERK1 / 2 vu dans les deux cellules MCF7 et induit EMT-A549. S133 phosphorylation de CREB et stimule la liaison de l'ADN a été montré à agir en aval de TGF-β1 induit par EMT-15. ERK1 / 2 phosphorylation a également été montré à agir en aval de TGF-β1 induit par EMT-16. Les différences dans les voies de signalisation entre les différents types de cellules peuvent aussi être élucidées comme on le voit avec l'augmentation de la GSK-3β phosphorylation dans les cellules A549 par rapport p70S6K phosphorylation in MCF7. GSK-3β phosphorylation sur la serine 9 diminue elle fonction, et GSK-3β a été montré pour inhiber le facteur de transcription pro-EMT, Snail 17. En revanche, p70S6K induit une activité d'escargot et sa phosphorylation est associée à l'activation de cette protéine 18.
Dans l'ensemble, l'induction simple et fiable de EMT, en particulier dans les cellules précédemment indiquées ne pas répondre uniquement à TGF-β, est utile pour comprendre la biologie des EMT, l'identification des signatures d'expression communs pour une utilisation en tant que marqueurs pronostiques, et le développement et l'évaluation de nouveaux traitements pour le cancer et les maladies fibrotiques.
Disclosures
R & D Systems, Inc. est une société publique à but lucratif.
La production et le libre accès à cet article est parrainé par R & D Systems, Inc.
Acknowledgments
Les auteurs tiennent à remercier Julia Hatler et Martin Ramsden (R & D Systems) pour une discussion utile et évaluation des manuscrits.
Materials
| Name | Company | Catalog Number | Comments |
| Epithelial cells of interest | We have tested: A431, A549, HT29, T98G, MCF10A, MCF7, and PANC1 | ||
| EMT Inducing Media Supplement | R&D Systems | CCM017 | |
| Recombinant Human TGF-β1 | R&D Systems | 240-B | Used at 10ng/ml |
| Anti-E-Cadherin NL557 conjugated antibody | R&D Systems | NL648R | Used at a 1:10 dilution for immunocytochemistry |
| Anti-E-Cadherin | R&D Systems | MAB1838 | Used at 0.1 μg/ml for western blotting |
| Anti-Fibronectin | R&D Systems | MAB1918 | Used at 10 μg/ml for immunocytochemistry; Used at 0.5 μg/ml for western blotting |
| Anti-GAPDH | R&D Systems | AF5718 | Used at 0.2 μg/ml for western blotting |
| Goat Anti-Mouse NL493 Secondary Antibody | R&D Systems | NL009 | Used at a 1:200 dilution for immunocytochemistry |
| Donkey Anti-Goat HRP Secondary Antibody | R&D Systems | HAF109 | Used at 1:2000 for western blotting |
| Goat Anti-Mouse HRP Secondary Antibody | R&D Systems | HAF007 | Used at 1:2000 for western blotting |
| EMT 3-Color Immunocytochemistry Kit | R&D Systems | SC026 | Used according to the manufacturer’s instructions. This kit contains directly conjugated antibodies against E-cadherin, Vimentin, and Snail. |
| 96 Well BME Cell Invasion Assay | R&D Systems | 3455-096-K | This kit was used according to the manufacturer's recommendations. |
| Proteome Profiler Human Phospho-MAPK Array Kit | R&D Systems | ARY002B | This kit was used according to the manufacturer's recommendations19. |
| Mounting Media | R&D Systems | CTS011 | |
| 0.4% Trypan Blue Solution | Life Technologies | 15350-061 | |
| 1X Phosphate Buffered Saline (PBS) | |||
| 95% Ethanol | |||
| Bovine Serum Albumin | Sigma | A3311 | |
| Normal Donkey Serum | Jackson Labs | 017-000-121 | |
| Triton-X-100 | Roche Molecular Biochemicals | 789-704 | Dilute in 1X PBS to make a 10% stock solution |
| Paraformaldehyde | Sigma | P6148 | Dilute in 1X PBS to a 4% working concentration. |
| DAPI Solution | Sigma | D9542 | Make stock solution at 14.3mM by dissolving in water. Working solution is a 1:5000 dilution of the stock solution in 1X PBS. |
| Fine pointed curved forceps | Thermo-Fisher Scientific | 08-875 | |
| 12 mm coverslips | Carolina Biological | 633009 | |
| Nonfat dry milk | Used at 5% in TBST for blocking in western blotting | ||
| TBST [25mM Tris, pH 7.4, 0.15M NaCl, 0.1% Tween 20] | For western blotting blocking and washing | ||
| PVDF Membrane | For western blotting | ||
| 4-20% SDS-page gel | For western blotting | ||
| ECL substrate | For western blotting | ||
| 15 ml conical tubes | |||
| Plates/flasks, tissue culture treated | |||
| 24-well plates, tissue culture treated | |||
| Pipettes / pipette tips | |||
| Pipet Aid / pipets | |||
| Hemocytometer | |||
| 37 °C Water Bath | |||
| 37 °C/5%CO2 Incubator | |||
| Centrifuge | |||
| Inverted light microscope | |||
| Fluorescence microscope |
References
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