Introduction
Tijdens mitose worden de chromosomen van de gerepliceerde genoom georganiseerd in de cel evenaar tot gelijke verdeling van zusterchromatiden over de nieuw gevormde dochter cellen te waarborgen. Chromosoom positionering en segregatie wordt gemedieerd door hun gehechtheid aan spindle microtubules afkomstig van twee tegengestelde centrosomes. Afgezien van het getrouwe chromosoom distributie, de oriëntatie van de mitotische spoel bepaalt eveneens de celdeling vlak 1. Gecoördineerde oriëntatie van de celdeling is van essentieel belang tijdens de vele stadia van ontwikkeling en voor het weefsel homeostase 2. Specifiek kan geregeld mitotische spoel positionering leiden tot een asymmetrische verdeling van celinhoud of zelfs produceren dochtercellen van verschillende grootte 2. Mitotische spoel assemblage en oriëntatie start in profase en wordt georkestreerd door een complex samenspel tussen samenwerkende en tegenwerken van kracht generatoren 3,4. De optredende krachten bestaan uit both trekken en duwen krachten. Deze komen voort zowel spindel contacten met de cel cortex en vanuit de spil en kan worden gegenereerd door microtubule dynamiek en door moleculaire motoren en cross-linkers (figuur 1).
Duwkrachten kunnen worden gegenereerd wanneer microtubuli groeien tegen rigide structuren zoals de cel cortex. Afhankelijk van de totale weerstand kracht gegenereerd binnen het systeem, kan dit leiden tot een herpositionering van de mitotische spindel (lage krachten) of triggeren microtubule knik of catastrofe (grote krachten) 5-8. De hoeveelheid kracht die kan worden opgewekt door op afhankelijk van microtubuli lengte, omdat lengte bepaalt in grote mate van microtubule-knik 9. Bovendien kan microtubules afkomstig van de ene centrosome duwen tegen elkaar centrosome, een mechanisme dat is voorgesteld om centrosoom scheiding rijden vroege profase 3,10.
in addition te duwen krachten die ontstaan door groeiende microtubuli, microtubule eindigt in contact brengen van de cel cortex kan ook bemiddelen trekkrachten 11. Onderzoeken van meerdere laboratoria hebben aangetoond dat de beheerste activiteit van de corticale kracht generatoren nodig voor de asymmetrische positionering van mitotische spoelen in vivo 1. Essentieel voor deze trekkrachten is-cortex gelokaliseerd cytoplasmatisch dyneine (hierna "dynein '), een min-end gerichte microtubule eiwit motor 8,12,13. Bijvoorbeeld in gist, laterale corticale interacties van dynein de crotubulusrooster resultaat motor-afhankelijke microtubule glijden langs de 14 cortex. Echter, corticale trekkrachten worden opgewekt door het vermogen van dynein end-on aanhangsels samen te depolymeriseren microtubuli 8. De energie van microtubule krimp kan leiden tot krachten die over het algemeen een orde van grootte hoger (~ 50 pN (referentienummer 15 16)). End-on attachment van corticale dynein te depolymeriseren microtubuli stimuleert spindel positionering in gist 17 en C. 13 elegans. Of beide afhankelijk van de motor te schuiven en microtubule depolymerisatie gedreven corticale trekkrachten kunnen samenwerken of elkaar uitsluiten in vivo is op dit moment onbekend.
Naast de microtubule duwkrachten en dyneine gemedieerd corticale trekkrachten, wordt centrosome positionering gecontroleerd vanuit de mitotische spindel door tal van andere eiwitten. Kinesine-5 motoren bijvoorbeeld bestaan tetrameren die verknopen antiparallel interpolaire microtubules, resulterend in het genereren van uitgaande schuifkrachten 18-20. Leden van het kinesine-5 motor familie zijn vereist voor centrosoom scheiding en bipolaire spileenheid in alle eukaryoten bestudeerd, met uitzondering van C. elegans (besproken in referentie 21).
Bovendien worden diffundeerbare vernettingsmiddelen van de ASE1 / PRC1 familie ook bekend lokaliseren overlappende gebieden van microtubule interpolaire microtubuli in vivo en in vitro 22-27. De krachten die ontstaan door ASE1 aangedreven expansie van de overlappende microtubule-gebied zijn groot genoeg om kinesine-14 gemedieerde schuifkrachten tegenwicht in vitro 28,29. In de cel wordt ASE1 / PRC1 nodig voor stabiele vorming van microtubule overlappende gebieden in de spindel Midzone 25-27,30, wat suggereert dat de krachten die door diffundeerbare vernettingsmiddelen aanzienlijk kunnen bijdragen tot spil organisatie. Tenslotte krachten uit de mitotische chromatine en kinetochoren beïnvloeden mitotische spoel montage en positionering via verschillende wegen 3. Aangezien deze componenten niet tot de reconstitutie assays beschreven, worden deze niet in detail besproken.
jove_content "> Verschillende theorieën bestaan over de manier waarop de verschillende moleculaire componenten en krachten hierboven beschreven werken in assemblage van de spoel en positionering, maar we zijn nog ver verwijderd van een kwantitatief begrip. Naast experimenten in levende cellen, in vitro experimenten met gezuiverde componenten zorgen voor een krachtige route om dit doel te bereiken. Hier presenteren we een visuele gids een aangepaste en uitgebreide versie van de onlangs gepubliceerde methoden (Roth et al. 31), waarin elementaire spindels worden gereconstitueerd in water-in-olie-emulsie druppeltjes, beginnend met een minimaal aantal onderdelen. met microfluïdische technieken, worden bolvormige druppeltjes gegenereerd met afmetingen die vergelijkbaar mitotische cellen. Binnen deze druppeltjes, kunnen gezuiverd centrosomes en tubuline worden gecombineerd om microtubuli aster dynamica te bestuderen, krachtgeneratie en aster-aster interacties. By invoering van corticale (zoals dynein) en inter-polaire (zoals kinesine-5 / ASE1) force-generatoren, wereconstitueren steeds complexer spindel-achtige structuren die beginnen met de in vivo situatie lijken.Protocol
1. Bereiding van Microfluidics Chips
OPMERKING: Bij bottom-up onderzoek spileenheid worden bolvormige water-in-olie-emulsie druppeltjes gebruikt. Deze zijn waterige microdruppels gescheiden van de omringende oliefase door een monolaag van fosfolipiden en surfactant. Deze emulsie-druppels worden geproduceerd binnen microfluïdische polydimethylsiloxaan (PDMS) chips. Veranderingen in kanaal geometrie en stroomsnelheden kunnen worden gebruikt voor het afstemmen druppelgrootte. In de microfluïdische ontwerpen beschreven worden gegenereerd druppels met een diameter van ongeveer 15 um tot de geometrische opsluiting van een zoogdiercel mitotische cel nabootsen.
- Fotomasker ontwerp en Mold Fabrication
- Ontwerp een fotomasker met drie inlaatkanalen 31. Inlaatkanaal 1 aansluit op de water-fase, die de inhoud druppel (zie hoofdstuk 3 "Bereiding basic microtubuli asters") bevat. Inlaatkanaal 2 verbindt met de olie-fase (zie paragraaf 2.1 "Lipide / olie-phase voorbereiding "). Gebruik inlaatkanaal 3 tot emulsie-druppels met extra lipide / olie-fase verdunnen voor observatie (optioneel) (Figuur 2a-b).
Opmerking: Alle inlaatkanalen volgt een stof-filter (een doolhof van kanalen 2 pm) te controleren stof PDMS deeltjes en (eiwit) aggregaten en om te voorkomen dat het blokkeren van de microkanalen (figuur 2d). Kanalen zijn 75 micrometer breed en de lipide / olie-fase en waterfase ontmoeten op een 12,5 micrometer breed kruising waar emulsie-druppels (figuur 2c) zal vormen. - Bestel en afgedrukt fotomaskers te verkrijgen over een film substraat, met een negatieve polariteit (het fotomasker wordt donker met transparante ontworpen structuren).
- Ontwerp een fotomasker met drie inlaatkanalen 31. Inlaatkanaal 1 aansluit op de water-fase, die de inhoud druppel (zie hoofdstuk 3 "Bereiding basic microtubuli asters") bevat. Inlaatkanaal 2 verbindt met de olie-fase (zie paragraaf 2.1 "Lipide / olie-phase voorbereiding "). Gebruik inlaatkanaal 3 tot emulsie-druppels met extra lipide / olie-fase verdunnen voor observatie (optioneel) (Figuur 2a-b).
- Mold Fabrication
- Fabriceren mallen door spin-coating SU-8 3025 fotoresist op een 4 inch silicium wafer met behulp van een spin-coater (500 rpm, 10 sec, gevolgd door 1800 rpm, 45 sec) in een clean-room omgeving.
- Expose de SU-8 bekledesiliciumwafel door het fotomasker. Ontwikkelen van wafers volgens de instructies van de fabrikant om kanalen van ~ 40 micrometer dik te maken.
- Het maken van een microfluïdische chip
- Meng 10 delen PDMS pre-polymeer met 1 deel verharder (totaal ~ 40 gr) in een boot-achtige schip met behulp van een plastic spatel. Plaats PDMS met bootachtige vaartuig in een vacuümkamer gedurende ~ 30 minuten. om luchtbellen te verwijderen. Wikkel aluminiumfolie rond de vorm om een kop met ~ 1 cm opstaande randen vormen.
- Giet de PDMS (~ 75% van het totale volume) in de mal, laat in een vacuümkamer voor een ~ 30 min. (Luchtbellen te verwijderen) en harden gedurende 1 uur bij 100 ° C in een oven.
- Spin-coat resterende PDMS op glasplaatjes (5 sec bij 200 rpm, gevolgd door 30 sec bij 4000 rpm) gevolgd door uitharden gedurende 1 uur bij 100 ° C. Verwijder stof uit glasplaatjes met perslucht / N2 -Flow, reiniging vooraf is niet nodig.
OPMERKING: De PDMS beklede glasplaatjes kan zowel voor microfluidic chip en stroming-cel productie (zie ook 2.2). - Voorzichtig strip de PDMS af van de mal met behulp van een scheermesje en perforeren (0,5 mm voor inlaten, 0,75 mm voor outlet) .Corona behandelen de microfluïdische chip en een PDMS gecoate glasplaatje met een klinisch corona oppervlak behandelaar enkele seconden .
- Plaats de microfluïdische chip op het glaasje (kanalen naar beneden) en bak de chips o / n bij 100 ° C (Figuur 3a). Bewaar microfluïdische chips voor enkele maanden in een stofvrije omgeving.
2. microfluïdische Setup
OPMERKING: Water-in-olie-emulsie druppeltjes worden gegenereerd met een microfluïdische opstelling en de microfluïdische chips hierboven beschreven. De samenstelling van het lipide / oliefase kan worden gevarieerd afhankelijk van de experimentele eisen. -Olie opgelost lipiden een monolaag op het water-olie-interface met hun polaire kop-groepen die met het water in te vormen. Om eiwitten targeten(Bijv dynein) naar de druppel grens geringe hoeveelheden biotinyl-fosfatidylethanolamine (biotinyl-PE) lipiden worden toegevoegd. Hierdoor kan de werving van gebiotinyleerd dynein (zie paragraaf 4.1 "Dynein richten naar de druppel cortex") via streptavidine gemedieerde multimerizatie. Druppels worden gestabiliseerd door toevoeging van een oppervlakteactieve stof en opgeslagen in PDMS gecoate stroomcellen.
- Lipide / olie-fase Voorbereiding
- Mix-chloroform opgelost 1,2-dioleoyl- sn-glycero-3-fosfo-L-serine (DOPS) en biotinyl-PE lipiden in een 4: 1 molaire verhouding in een glazen buis met behulp van glazen pipetten (uitgebreid pipetten met chloroform gespoeld voor gebruiken). Bereid een totaal van ~ 250 ug lipiden, waardoor een lipide concentratie van ~ 0,5 mg / ml.
- Droog het lipide mengsel met N2 -Flow en vervolgens in een vacuümkamer gedurende ~ 1 uur voorzichtig. Los de gedroogde lipiden in minerale olie en 2,5% oppervlakteactieve stof tot 0,5 mg / ml (merk ~ 500 pi).
- Plaats de lipide / olie-monster in eenultrasoon bad en ultrasone trillingen gedurende 30 minuten. bij 40 kHz tot de lipiden volledig op te lossen.
- Flow-cell Voorbereiding
- Spin-coat PDMS (zie ook sectie 1.3) op dekglaasjes (5 sec bij 200 rpm, gevolgd door 30 sec bij 4000 rpm) en objectglaasjes (5 sec bij 100 rpm, gevolgd door 30 sec 1500 tpm) teneinde de homogene laag deponeren PDMS.
LET OP: Voor een optimale beeldkwaliteit, zorg ervoor om dekking bril te gebruiken met een dikte die overeenkomt met de microscoop doelstelling. In dit geval: 1,5 (~ 0,17 mm). - Genezen van de PDMS-gecoate dekglaasjes en glasplaatjes gedurende 1 uur bij 100 ° C in een oven. Voeg stroom-cellen door nauwe spatiëring (~ 2 mm) dunne plakjes laboratorium afsluitfilm (~ 3 mm breed) op de PDMS-beklede glazen objectglaasjes. Bewaard in een stofvrije omgeving, kunnen kanalen die niet zijn gebruikt worden gebruikt op andere momenten.
- Bedek de stroom-cellen met een PDMS-gecoate dekglaasje en afdichting door het smelten van het laboratorium afdichtfilm ~ 1 min. bij 100 ° C Druklicht (Figuur 3c). Sluit het laboratorium afdichting film -Glas-grenzen met valap (figuur 3c). WINKEL stroom-cellen gedurende enkele maanden in een stofvrije omgeving.
- Spin-coat PDMS (zie ook sectie 1.3) op dekglaasjes (5 sec bij 200 rpm, gevolgd door 30 sec bij 4000 rpm) en objectglaasjes (5 sec bij 100 rpm, gevolgd door 30 sec 1500 tpm) teneinde de homogene laag deponeren PDMS.
- PDMS Cup Voorbereiding
- Voor langdurige imaging, maak een PDMS kop, door ponsen van een gat diameter 4 mm in een stuk PDMS (~ 3 mm dik)
- Corona-behandeling van de PDMS slice en een PDMS gecoate dekglas en plaats ze op de top van elkaar. Bak de PDMS cup o / n (bij 100 ° C) (figuur 5a).
- Emulsie-druppel Formation
- Monitor druppelvorming op een omgekeerde bright-field microscoop. Sluit de drukregelaar aan de microfluïdische chip met behulp van PEEK buizen (diameters: 510 micrometer (buiten) en 125 micrometer (innerlijke)) (Figuur 3a). Vul microfluïdische chips volledig met vet / olie-fase van inlaat 2.
- Introduceer MRB80-gebaseerde water-fase (zie hoofdstuk 3 "Bereiding basic microtubule asters4;) van inlaat 1. Controle druppelgrootte-size door het veranderen van lipide / olie-fase en waterfase druk om druppels te creëren ~ 15 micrometer in diameter (figuur 3b).
OPMERKING: Met deze opstelling gebruik ~ 800 mbar voor lipide / olie-fase en -200 mbar de waterfase tot druppeltjes van de gewenste grootte te maken. - Na het verkrijgen van de gewenste druppelgrootte-size en benodigde hoeveelheid (~ 10 ul per monster), het verzamelen van druppels uit het stopcontact kanaal en lading in stroom-cell (volledig vullen de stroming-cel).
- Sluiten de uiteinden van de stroming-cel voorzichtig met valap (onvolledig gesloten stroom-cellen kan leiden tot uitgebreide beweging van de druppels, waardoor het moeilijk beeld hen). Bovendien, de vorming van luchtbellen waardoor druppeltje beweging.
- Spoel de PEEK buizen uitgebreid met isopropanol voor en na gebruik om te proeven kruisbesmetting en verstoppingen te voorkomen.
3. reconstitueren Basic microtubuli Asters
OPMERKING: Druppeltje inhoud kan worden gevarieerd afhankelijk van de experimentele eisen. Alle buffers zijn MRB80 basis (80 mM PIPES, 1 mM EGTA, 4 mM MgCl2 (pH 6,8)), en alle monsters worden bereid op ijs. In het algemeen druppeltjes altijd bevatten centrosomes, componenten die nodig zijn voor microtubule polymerisatie, een zuurstof scavenger-systeem en blokkerend middel (zie paragraaf 3.1). Microtubule force-generatoren en de vereiste co-factoren en doelgerichtheid-factoren kunnen worden opgenomen indien gewenst (zie rubrieken 4.1 en 4.2).
- Algemene instellingen voor aster formatie in emulsie druppeltjes (figuur 3d)
- Bereid glucoseoxidase (20 mg / ml glucose oxidase in 200 mM DTT en 10 mg / ml catalase) mix vooraf en bewaar in kleine porties bij -80 ° C.
- Bereid een blokkerende mix "die κ-caseïne, runderserumalbumine (BSA), Tween-20 en fluorescent dextran (als neutraal markering) (zie tabel 1) vooraf en bewaar in kleine aliquots bij -80 ° C. Voorkom herhaalde vries-dooi cycli. Zorg ervoor dat alle onderdelen worden vers bereid.
- Zuiver centrosomes uit menselijke lymfatische KE37 cellijnen zoals beschreven door Moudjou et al. 32 en bewaar bij -150 ° C in kleine porties.
- Centrosomes ontdooien bij kamertemperatuur en incubeer bij 37 ° C gedurende ~ 20 minuten. voor gebruik om juiste microtubule nucleatie waarborgen.
LET OP: Dit bevordert microtubuli nucleatie tijdens het experiment. - In de tussentijd bereiden 'analysemengsel' gemaakt met tubuline (tl en "donker"), guanosine trifosfaat (GTP), een zuurstof wegvangend systeem (glucose, glucose-oxidase, katalase en 1,4-dithiothreitol (DTT)), moleculaire werking generatoren (bijvoorbeeld microtubule motoren / verknopingsmiddelen), adenosine trifosfaat (ATP) en een ATP-regenererend systeem (fosfoenolpyruvaat (PEP), pyruvaat kinase (PK) en lactaat dehydrogenase (LDH)) op ijs (zie tabel 2).
- Pre-koelenairfuge rotor op ijs. Spin down het monster in de gekoelde airfuge rotor (30 psi gedurende 3 min) .Voeg voorverwarmd centrosomes (optimaliseren van de hoeveelheid centrosomes te streven druppeltjes met 1-2 centrosomes).
- Gebruik de gecombineerde mix emulsie druppeltjes met behulp van de in paragraaf 2.3 beschreven methoden te produceren.
| bestanddeel | voorraadconcentratie | Eindconcentratie (in assay) | Volume | Commentaar |
| Dextran-647nm | 75 uM | 3,75 uM (0,6 uM) | 5 gl | |
| κ-caseïne | 20 mg / ml | 12,5 mg / ml (2 mg / ml) | 62,5 pl | |
| Tween-20 | 5% | 0,375% (0,06%) 7,5 pl | ||
| BSA | 200 mg / ml | 12 mg / ml (1,9 mg / ml) | 6 pl | |
| MRB80 | 19 ul | |||
| 100 pl finale | Store in 2 pi porties |
Tabel 1: Bestanddelen van "Blocking Mix bestanddelen blokkeren mix, die voor de bereiding van spindel-achtige structuren in water-in-olie-emulsie druppeltjes.. Voor een beschrijving, zie hoofdtekst sectie 3 "Bereiding basic microtubule asters". Voor meer informatie over materialen, zie "Materialen Table.
| bestanddeel | Stock concentration | eindconcentratie | Volume | Commentaar |
| Het blokkeren mix | 1,6 pl | |||
| tubulin | 500 uM | 30 uM | 0,6 pl | |
| Tubuline-488/561 | 50 uM | 3 uM | 0,6 pl | |
| GTP | 50 mM | 5 mM | 1,0 gl | |
| Dynein-TMR | 178 nM | 30 nM | 1,7 pl | |
| streptavidine | 5 mg / ml | 200 nM | 0,4 pl | Voor corticale Dynein alleen |
| Kinesine-5 | 1,6 mM | 80 nM | 0,5 pl | |
| ATP | 25 mM | 1 mM | 0,4 pl | Bij motoren alleen |
| FUT | 0,5 M | 25,6 mmol | 0,5 pl | Bij motoren alleen |
| PK / LDH | 800 U / 1100 U | 23 U / 32 U | 0,3 pl | Bij motoren alleen |
| ASE1-GFP | 400 nM | 80 nM | 2,0 pl | |
| Glucose | 2,5 M | 50 mM | 0,3 pl | Laatste stap |
| Glucose-oxidase | 50x | 1.0x | 0,3 pl | Laatste stap |
| MRB80 | X | |||
| 9 ul uiteindelijke |
Tabel 2: Bestanddelen van 'Assay Mix'. materialen tabel.
4. De invoering van Spileenheid-factoren
Opmerking: In de hier beschreven assays, een groen fluorescerend eiwit (GFP) gemerkte afgeknotte versie van S. dynein cerevisiae werd gebruikt dat kunstmatig wordt gedimeriseerd via een amino-eindstandige glutathion S-transferase (GST) -tag 33. Dit eiwit wordt gezuiverd met een affiniteit tag die twee kopieën van de proteïne A IgG-bindend domein bevat. De variant die hier gebruikt wordt gemerkt met een tetramethylrhodamine (TMR) label op de carboxy-eindstandige en het N-terminale SNAP-tag wordt gebruikt om de gezuiverde eiwitten biotinyleren. Voor construct details, zie Roth et al 31.; voor de zuivering meer informatie, zie Reck-Peterson et al. 33. GFP-biotine dyneine-TMR kan worden gericht op de druppel-cortex door de vorming van biotine-streptavidine complexen die dynein aan biotinyl-PE lipiden (figuur 3e) verbinden.
- Dynein Targeting naar het Droplet Cortex
- GFP omvatten biotine dyneine-TMR in het "assay mix '(zie tabel 2) bij een uiteindelijke druppel-concentratie van 30 nM. Omvatten streptavidine in 'testmengsel "(zie tabel 2) bij een uiteindelijke druppel-concentratie van 200 nM.
LET OP: Dynein hangt af van ATP-hydrolyse voor de stapsgewijze beweging op microtubules. Derhalve omvatten ATP en een ATP-regenererend systeem (met PEP en PK / LDH) in de "assay mix '(zie tabel 2).
LET OP: Recombinant full-length S. pombe GFP-Cut7 (kinesine-5) werd vriendelijk verschaft door de Diez lab (Center for Molecular Bioengineering, Technische Universität Dresden, Dresden, Duitsland), te zien. Recombinant full-length histidine-tag S. pombe GFP-ASE1 werd vriendelijk verschaft door de Jansons lab (Wageningen University, Wageningen, Nederland) en toegevoegd aan het "analysemengsel bij concentraties 80 nM.
- GFP omvatten biotine dyneine-TMR in het "assay mix '(zie tabel 2) bij een uiteindelijke druppel-concentratie van 30 nM. Omvatten streptavidine in 'testmengsel "(zie tabel 2) bij een uiteindelijke druppel-concentratie van 200 nM.
5. Imaging
OPMERKING: Tijdens het experiment kan microtubule groei worden geregeld door het veranderen van de temperatuur. Bij de keuze van beeldvormende voorwaarden compromissen moeten worden gemaakt tussen hoge beeldkwaliteit en de mogelijkheid om spileenheid gedurende lange perioden te volgen. Om de kinetiek van de vorming van spindel onder verschillende omstandigheden te vergelijken, kunnen druppels met verschillende inhoud worden gemengd en afgebeeld in dezelfde stroom kanaal.
- Basic Imaging Settings
- Afbeelding in een temperatuur-gecontroleerde omgeving met behulp van een kast. Visualiseren individuele microtubules ~ na 30 minuten bij 26 ° C. Terwijl beeldvorming, bevorderen microtubule-groei door de temperatuur tot -30 ° C.
LET OP: De sHieronder nstellingen zijn specifiek voor onze microscoop setup en kan variëren met verschillende systemen en verschillende besturingssoftware. Alle van de hier beschreven assays worden afgebeeld op een gemotoriseerde omgekeerde systeem met een draaiende schijf confocale hoofd en bediend met behulp van beeldbewerkingssoftware zoals Andor iQ 3.1. Verkrijgen van alle afbeeldingen met een 100x olie-immersie objectief en EMCCD camera. - Stel excitatie lasers 488, 561 en 641 nm tot ongeveer ~ 10% intensiteit. Ga naar de 'overname' panel, klikt u op de 'AOTF' tab en schuif laser intensiteiten tot 10%. Klik op 'Record' om de instellingen op te slaan.
- Voor z -projections, neem stapels met 1 micrometer intervallen (~ 20 beelden / druppel). Ga naar de belangrijkste 'camera' panel, klik op 'bewerken z' en stel 'Z stap' tot 1,0. Klik op 'Next' om de instellingen op te slaan.
- Stel maximale lineaire EM-winst door te klikken op de tab 'camera' in de 'overname' paneel en schuif de EM gain bar tot 300. belichting in te stellenDe tijden 200 msec in dezelfde tab. Klik op 'Record' om de instellingen op te slaan.
- Afbeelding in een temperatuur-gecontroleerde omgeving met behulp van een kast. Visualiseren individuele microtubules ~ na 30 minuten bij 26 ° C. Terwijl beeldvorming, bevorderen microtubule-groei door de temperatuur tot -30 ° C.
- live-Imaging
- Voor live imaging, met behulp van de software bediening maken z -projections om de 2 min. voor de duur van 1-2 uur door het verminderen van de belichtingstijden tot ~ 100 msec. (zoals in 5.1.4) en verhogen z -intervals tot 2 pm (zoals in 5.1.3). Stel de tijdreeks in het belangrijkste 'camera' panel, klikt u op 'repeat t' en ingesteld op 2 min. intervallen voor een totale tijd van 120 min.
- Voor live assays gebruikt een PDMS kop in plaats van een regelmatige cellen zodat de druppeltjes zo onbeweeglijk mogelijk.
- Gecombineerde beeldvorming van 2 Voorwaarden
- Produceren druppeltjes gebruik microfluïdische en slaan op een PDMS gecoat glasplaatje op ijs. Dit voorkomt microtubule kiemvorming tot de tweede set van druppels is gevormd. Voordat de productie van de tweede set van druppels, spoel de PEEK buizen en microfluïdische chip metMRB80 en volledig vullen microfluïdische chip met de lipide / olie-fase.
- Genereer druppeltjes met en zonder fluorescent dextran (of via dextran met verschillende golflengte fluoroforen) om onderscheid te maken tussen druppeltjes met verschillende kleuren. Na het produceren van de tweede partij van de druppels, meng de druppels door pipetteren en laden in een enkele stroom-cell / PDMS-cup.
- Image Analysis.
- Analyseren van beelden met behulp van Fiji (open source software online beschikbaar) 34.
- Voor live-testen, om te zetten in stapels hyperstacks behulp van 'image' - 'hyperstacks' - 'stack naar HyperStack'. Stel de juiste aantal z-plakjes en termijnen.
- Om 'beeld' naar z-projecties te maken, kies - 'stacks' - 'z-project'. Kies 'max intensiteit' projectie.
- Voor 3D-reconstructies, eerst naar 'image' - 'eigenschappen' en stel de juiste pixel, pixel hoogte, voxel diepte en frame intervallen. Klik op 'OK'. Kies 'image' - 'stacks' - '3D-project', controleer dan de 'interpoleren' en klik op 'OK'.
Representative Results
De in de vorige delen methoden is het mogelijk de reconstructie van de spil-achtige structuren met toenemende complexiteit met behulp van de geometrische opsluiting van water-in-olie-emulsie druppels. Dit deel beschrijft representatieve resultaten die kwalitatief demonstreren het vermogen van deze assays.
Tijdens mitose, wanneer de bipolaire spil gemonteerd, cellen afronden tot bolletjes vormen met een diameter van ongeveer 15 urn, zoals gemeten voor menselijke cellen. Dit karakteristieke mitotische cel vorm zorgt voor een geometrische grens die zowel beperkt u en regisseert spindel formaat en de richting 35,36. Microfluïdische technieken zorgen voor een niveau van geometrische opsluiting dat precies lijkt op de situatie waargenomen in levende cellen en daarom maakt het bottom-up reconstructie van mitotische spindels in vitro.
(figuur 4a, linkerpaneel). Na ongeveer 20-30 min, de eerste microtubules zichtbaar en centrosome diffusie beperkt wordt als microtubuli groeien tegen de cortex in alle richtingen. Asters met microtubuli van tussenstuk (ongeveer 50% van de druppel diameter) kan (sterisch) elkaar afstoten andere, met microtubuli duwen tegen elkaar, de andere centrosomes en de cortex. Dit leidt tot een typische 'bipolaire' spindel-achtige regeling met de twee centrosomes tegenover elkaar (figuur 4a, middelste paneel). Wanneer microtubuli groeien meer dan ~ 50% van de druppel-diameter, krijgt de centrosomes verder geduwd om tegengestelde grenzen van de druppel, met microtubuli groeien langs de druppel cortex (figuur 4a, rechter paneel). Het is belangrijk op te merken dat microtubule groei in deze testen zijn zeer gevoelig voor de temperatuur en tubuline-concentraties. Deze parameters zullen dus sterk van invloed op de tijd waarin nucleatie voor het eerst wordt waargenomen en bij steady-state aster posities worden bereikt.
In cellen, worden corticale trekkrachten opgewekt door de vorming van dragende bevestigingen tussen microtubuli plus-uiteinden en geassocieerde cortex dyneine. In dierlijke cellen, deze associatie afhankelijk van Gai / LGN / NuMA complex dat is gericht op het plasmamembraan via N-terminale myristoylering of Gai 1. In deze reconstructie testen, is de eis van de Gai / LGN / NuMA complex omzeild door rechtstreeks koppelen dynein om gebiotinyleerde lipiden door devorming van biotine-streptavidine-biotine complexen. Deze obligaties zijn relatief stabiel (K D ~ 10 -14 M) 37 en vormen snel (meestal binnen 10 minuten na emulsie druppelvorming, voordat microtubule nucleatie blijkt) (Figuur 4b). In aanwezigheid van de corticale dynein, centrosomes doen vaak een meer centrale positie, terwijl in de afwezigheid van dyneine, centrosomes worden geduwd om weerszijden van de druppel cortex (Figuur 4c). We beredeneren dit is het resultaat van twee effecten, die verhinderen en tegengaan microtubule duwkrachten. (1) Dynein direct microtubulus rampen, waardoor microtubule lengte beperkt en waardoor buitensporige microtubuli knikken, en (2) corticale trekkrachten tot net centrerende krachten op de afzonderlijke asters 8, waarbij de aster aster-afstotende krachten tegenwerken.
De diffundeerbare cross-linker ASE1 induceert forces die de neiging hebben het overlappende gebied van anti-parallelle microtubuli 29 verhogen. In overeenstemming hiermee, in aanwezigheid van ASE1 (en afwezigheid van dynein) centrosomes dicht bij elkaar gevonden ASE1 lokaliseren aan interpolaire microtubuli (figuur 4d) gebundeld. De leden van de kinesine-5 familie rijden centrosome scheiding door te duwen krachten vanuit de as (zie inleiding). In aanwezigheid van Cut7 (het S. pombe kinesine-ortholoog 5) worden geduwd om centrosomes weerszijden van de emulsie druppeltjes, zelfs in aanwezigheid van ASE1 (figuur 4e). Door het combineren van corticale en inter-polaire kracht generatoren, kan de complexiteit verder worden verhoogd in deze experimenten, uiteindelijk leidend tot een beter begrip van bipolaire mitotische spindle assembly. Een gedetailleerde beschrijving van deze kwantitatieve resultaten zullen in de toekomst (Roth et al., Manuscript in voorbereiding).
(Figuur 5c). Dit vergemakkelijkt het onderzoek van zowel steady-state gedrag spileenheid kinetiek. Door het combineren van druppeltjes met verschillende inhoud in hetzelfde monster is bijvoorbeeld mogelijk om direct centrosome positionering en spileenheid kinetiek vergelijken druppeltjes met en zonder corticale kracht generatoren (figuur 5b).
Figuur 1: krachten op de mitotische spoel Verschillende krachtgenererende moleculen werken op microtubuli van de mitotische spindel vorming en positionering spindel bevorderen.. Microtubuli die groeien in de cel cortex genereren van een duwkracht op de centrosome. Corticale dynein (paarse) vangt depolymeriseren van microtubuli en genereert een trekkracht op de centrosomes. Binnen de spindel, Kinesin-5 / Cut7 motor-eiwitten zorgen voor een naar buiten glijden werking op anti-parallelle microtubuli, terwijl cross-linkers van de familie PRC1 / ASE1 genereren een tegengestelde naar buiten schuiven van kracht. Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken .
Figuur 2:. Microfluïdische chip design (A) Ontwerp van 4 inch fotomasker met 4 microfluïdische chips. (B) De gedetailleerde weergave van een enkele chip. Chips bevatten één afvoerkanaal en drie inlaatkanalen gevolgd door een stof-filter. Inlaatkanaal 1 bevat de waterfase, kan kanaal 2 het lipide / olie-fase en kanaal 3 worden de gevormde druppels extra lipide / oliefase verdunnen. (C) gedetailleerde weergave van de splitsing waar de lipide / olie-fase (vanuit de bovenste en onderste) voldoet aan de waterfase (die van links). Bij de kruising zullen druppeltjes en stromen naar het uitlaatkanaal rechts. (D) Gedetailleerde weergave van een stof-filter met 2 micrometer kanalen. Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.
Figuur 3:. Methodologie voor water-in-olie emulsie druppelvorming (A) microfluïdische chip en microfluidics slang op een helder-veld microscoop. Zowel de water- en lipide / oliefase buizen zijn verbonden met de chip inlaten 1 en 2 respectievelijk. (B) Beperking van microfluidics chip waar de water- en lipide / olie-fase te voldoen. Door de druk, kunnen druppels maat worden gecontroleerd. (C) Het ontwerpen van PDMS gecoate stroom-cellen. Na het laden van de druppels in de stroom-cel, worden de open einden afgesloten met extra valap. (D) Schematische voorstelling van druppelvorming. Druppels worden gebruikt om centrosomes, tubuline en aanvullende componenten nodig voor mitotische spindle vorming kapselen. (E) Schematische voorstelling van corticale dyneine targeting. Gebiotinyleerd (Bio) dynein is gericht op gebiotinyleerde lipiden door middel van streptavidine (Strp). 
Figuur 4:. Representatieve resultaten van de As-reconstructies met toenemende complexiteit (A) Maximale intensiteit projecties van druppeltjes met twee centrosomes toont voorbeelden van korte, tussenliggende en lange microtubuli. Centrosomes en microtubuli worden zichtbaar gemaakt door de toevoeging van 10% HiLyte-488 gelabeld tubuline. Schaalbalken = 10 urn. (B) Lokalisatie van GFP-biotine dyneine-TMR in afwezigheid (-, links) en met (+, rechts) van streptavidine (Strp). (C) microtubules aster positionering in de afwezigheid (-, links) of aanwezigheid (+, rechts) Corticale GFP-biotine dyneine-TMR. (D) van microtubuli aster (linker paneel, grEen) positionering in de aanwezigheid van ASE1 (middenpaneel rood). (E) van microtubuli aster (linker paneel, groen) positionering in de aanwezigheid van ASE1 en Cut7 (kinesine-5) (middelste paneel, red). Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken. 
Figuur 5: Positionering Imaging Aster Dynamics in vitro (A) Ontwerp van een PDMS beker die druppel beeldvorming toelaat gedurende verschillende uren.. (B) Generation, de opslag en de beeldvorming van druppels (overdraagbare) met verschillende inhoud, geïllustreerd door afwezigheid (links) integratie (rechts) van TL-dextran (Alexa 647). (C) enkel vlak beelden van een 60 min time-lapse (2 min intervallen) genomen van een z-stack (2 urn afstanden) van adroplet met een enkele centrosome. Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.
Discussion
De werkwijzen hier beschreven onderhavige recente inspanningen om te mitotische spoelen reconstitueren in water-in-olie-emulsie druppeltjes. Studeren spileenheid binnen geometrische grenzen biedt tal van voordelen. Belangrijke terugkoppelingsmechanismen bestaan tussen microtubuli van de mitotische spoel en de geometrische beperkingen waarin zij worden geassembleerd. Microtubuli kan genereren duwkrachten als ze groeien in geometrische grenzen, wat kan leiden tot mitotische spindle verplaatsing. Bovendien groeien tot een fysieke barrière kan microtubule rampen induceren. Ook kan spileenheid in een beperkte geometrie leidt tot een geleidelijke uitputting van afzonderlijke componenten, zoals tubuline, waardoor de microtubule groei 36 rechtstreeks beïnvloedt. Dit zijn allemaal essentiële determinanten van spileenheid, die kunnen worden bestudeerd met de hier beschreven bepalingen.
De beschreven testen zijn zeer gevoelig voor kleine concentratie differences van de druppel componenten. Dit geldt voor tubuline, waarbij geringe concentratieverschillen kunnen tot een te laag of te snelle groei van microtubuli. In dit geval microtubule groei kan vaak nog worden gecorrigeerd door de temperatuur tijdens de eerste ~ 30 minuten van het experiment. Mitotische spoel montage en positionering is ook zeer gevoelig voor variaties in de concentratie (corticaal) kracht generators. Dit hangt waarschijnlijk af van de concentratie, zuiverheid en activiteit van de gezuiverde componenten en moet zorgvuldig worden getitreerd voor elk nieuw gezuiverd eiwit.
Bovendien zijn bepaalde compromissen moeten worden gemaakt in imaging instellingen, afhankelijk van de aard van de test. Aanvankelijk hoge niveaus van oplosbare fluorescerende tubuline dimeren bemoeilijken beeld individuele microtubules. Zoals microtubuli langer groeien en oplosbare tubuline langzaam uitgeput, de signaal-ruisverhouding geleidelijk hoger en kan de beeldvorming van individual microtubules. In tegenstelling tot opstellingen met open systemen, de geometrische beperking verhindert de uitwisseling van fluorescerende moleculen en zuurstof scavenger systeemcomponenten binnen een massareservoir, wat resulteert in aanzienlijke bleking. Speciaal voor bewaking spil montage en positionering in de tijd, is het vereist om beeld met lage lichtintensiteiten, zelfs in aanwezigheid van een sterke zuurstofwegvanger systeem.
Deze methoden maken het mogelijk bottom-up reconstructie van vereenvoudigde spindel-achtige structuren in vitro. Naast de genoemde componenten geïntroduceerd zijn vele andere factoren beschreven bipolaire spindle vorming, positionering, oriëntatie, vormen, enz 3 beïnvloeden. Dit systeem kan verder worden uitgebreid naar de afzonderlijke en gecombineerde effect van aanvullende kracht generatoren bestuderen. Belangrijke bijdragen aan spindel formatie die momenteel afwezig in dit systeem zijn de mitotische chromosomen. Mitotische chromatine is aangetoonddirecte vorming spindel door (1) chromokinesins die kan genereren zogenaamde polar-ejectie krachten '3, (2) de vorming van een RanGTP gradiënt door de chromatine gebonden RanGEF RCC1 38, (3) kinetochoren die kunnen communiceren met (depolymeriseren ) microtubules 39 en (4) het chromatine zelf, die kan functioneren als een mechanische veer daartussen tegengestelde microtubuli 40.
Tot slot, het beschreven systeem biedt momenteel beperkte ruimtelijke en temporele controle over de activiteit en de lokalisatie van introduceerde force-generatoren. In cellen, vele spileenheid factoren lokaliseren specifieke compartimenten of zijn actief binnen een beperkte tijd-venster. Een treffend voorbeeld is de activiteit van dyneine, die specifiek aan de postérieure zijde van de C. verrijkt elegans één-cellig stadium embryo asymmetrische Spilpositionering en celdeling bevorderen. In dit systeem zijn we momenteel het verkennen van de mogelijkheid van het nabootsen van een dergelijke temporal en asymmetrische activiteit met behulp van methoden geleend van opto-genetische technieken. Bovendien, zoals het geval is voor C. elegans embryo en cellen met een rigide celwand, veel cellen niet afronden in mitose. De vorm van de geometrische opsluiting zal van wezenlijk belang voor de krachten die op de as 41 hebben. Het zal dus belangrijk zijn om assemblage van de spoel en positionering in niet-sferische druppeltjes reconstrueren zo goed, mogelijk met behulp van meer complexe microfluïdische systemen die het mogelijk maken de vormgeving en opslag van emulsie druppeltjes 42,43. Tenslotte, in weefsels, cel-cel en cel-substraat signalering en bevestiging bieden externe stimuli die kunnen worden omgezet in gericht spiloriëntatie, zoals vaak waargenomen in epitheel cellen en stamcellen. Al deze gespecialiseerde aspecten geen rekening is gehouden in de huidige studie en wellicht toekomstige uitdagingen om te bouwen naar meer in vivo-achtige reconstructies van mitotische spindle assemb biedenly en positionering.
Materials
| Name | Company | Catalog Number | Comments |
| 1. Preparation of microfluidic chips | |||
| Photomask (Photomask on film substrate) | Selba S.A. Switzerland | ||
| SU-8 3025 | MicroChem | ||
| Silicon wafer (4 inch silicon wafer p/Boron <1-0-0>10-20 Ω-cm, 500-550 μm, SSP, with 2 flats) | WRS Materials | 4P0SSP-005 | |
| Spin coater | Polos | SPIN150I | |
| PDMS pre-polymer RVT615 A+B | Lubribond | 9481 | |
| Corona treater | Electro-technic products | BD-20ACV | |
| 2. Microfluidic setup | |||
| Name | Company | Catalog Number | Comments |
| DOPS (1,2-Dioleoyl-sn-glycero-3-phospho-L-serine) | Avanti Polar Lipids | 840035 | |
| Biotinyl PE (1,2-Dipalmitoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine-N-(biotinyl)) | Avanti Polar Lipids | 870285 | |
| Chloroform | Sigma-Aldrich | 650498 | |
| Glass pipets | |||
| Glass tubes | |||
| Vacuum pump | Laboport | KNF | |
| Vacuum chamber | Kartell | Polypropylene Vacuum Desiccator | |
| Mineral oil | Sigma-Aldrich | M5904 | |
| Surfactant (Span80) | Sigma-Aldrich | 85548 | |
| Sonicator | Branson | M2800H | |
| Coverslips | 24 mm x 60 mm, thickness 1.5 | ||
| Glass-slides | 26 mm x 76 mm | ||
| Puncher | Harris Uni-Core | 135840/135841/135843 | |
| Laboratory sealing film | Parafilm | ||
| Valap (Vaseline, lanolin, paraffin wax melted at equal concentrations) | Home made | ||
| Brightfield Microscope | Leica | PMIRB | Any inverted brightfield would suffice |
| Pressure controler | Fluigent | MFCS-FLEX-4C-1000 | |
| PEEK Tubing | Cluzeau Info. Labo, France | ||
| Microfluidics vials (Tubes Micrew 0.5 ml and 1 ml) | VWR, The Netherlands | ||
| 3. Reconstituting spindle formation and positioning | |||
| Name | Company | Catalog Number | Comments |
| Dextran-647 nm (Dextran, Alexa Fluor 647, 10,000 MW, Anionic, Fixable) | Life Technologies | ||
| Tween-20 | Sigma-Aldrich | ||
| BSA - Bovine serum albumin | Sigma-Aldrich | ||
| Glucose (D-(+)-Glucose) | Sigma-Aldrich | G8270 | |
| Glucose-oxidase (Glucose oxidase from Aspergillus niger) | Sigma-Aldrich | G6125 | |
| DTT (DL-dithioltheitol) | Sigma-Aldrich | 646563 | |
| Catalase (Catalase form bovine liver) | Sigma-Aldrich | C9322 | |
| Tubulin (Tubulin from bovine brain) | Cytoskeleton Inc. | ||
| Tubulin-488/561 (HiLyte-488/Rhodamine-labeled tubulin from porcine brain) | Cytoskeleton Inc. | ||
| GTP (Guanosine-'5-triphosphate, sodium salt hydrate) | Sigma-Aldrich | 51120 | |
| κ-casein (κ-casein from bovine serum milk) | Sigma-Aldrich | C0406 | |
| Airfuge (Air-driven ultracentrifuge) | Beckman-Coulter | CLS | |
| 4. Introducing spindle-assembly factors | |||
| Name | Company | Catalog Number | Comments |
| Neutravidin | Sigma-Aldrich | A2666 | |
| ATP (Adenosine-'5-triphosphate, disodium salt hydrate) | Sigma-Aldrich | A9187 | |
| PEP (Phospho(enol)pyruvic acid monosodium salt hydrate ≥97% (enzymatic)) | Sigma-Aldrich | P0564 | |
| PK/LDH -(Pyruvate kinase/lactic dehydrogenase enzymes from rabbit muscle) | Sigma-Aldrich | P0294 |
References
- Kotak, S., Gonczy, P. Mechanisms of spindle positioning: cortical force generators in the limelight. Curr Opin Cell Biol. 25 (6), 741-748 (2013).
- Williams, S. E., Fuchs, E.
- Tanenbaum, M. E., Medema, R. H. Mechanisms of centrosome separation and bipolar spindle assembly. Dev Cell. 19, 797-806 (2010).
- Civelekoglu-Scholey, G., Scholey, J. M. Mitotic force generators and chromosome segregation. Cell Mol Life Sci. 67 (13), 2231-2250 (2010).
- Faivre-Moskalenko, C., Dogterom, M. Dynamics of microtubule asters in microfabricated chambers: the role of catastrophes. Proc Natl Acad Sci U S A. 99 (26), 16788-16793 (2002).
- Janson, M. E., de Dood, M. E., Dogterom, M. Dynamic instability of microtubules is regulated by force. J Cell Biol. 161 (6), 1029-1034 (2003).
- Laan, L., Husson, J., Munteanu, E. L., Kerssemakers, J. W., Dogterom, M. Force-generation and dynamic instability of microtubule bundles. Proc Natl Acad Sci U S A. 105 (26), 8920-8925 (2008).
- Laan, L., et al. Cortical dynein controls microtubule dynamics to generate pulling forces that position microtubule asters. Cell. 148 (3), 502-514 (2012).
- Dogterom, M., Yurke, B. Measurement of the force-velocity relation for growing microtubules. Science. 278 (5339), 856-860 (1997).
- Cytrynbaum, E. N., Scholey, J. M., Mogilner, A. A force balance model of early spindle pole separation in Drosophila embryos. Biophys J. 84 (2 Pt 1), 757-769 (2003).
- Kozlowski, C., Srayko, M., Nedelec, F. Cortical microtubule contacts position the spindle in C. elegans embryos. Cell. 129 (3), 499-510 (2007).
- Carminati, J. L., Stearns, T. Microtubules orient the mitotic spindle in yeast through dynein-dependent interactions with the cell cortex. J Cell Biol. 138 (3), 629-641 (1997).
- Nguyen-Ngoc, T., Afshar, K., Gonczy, P. Coupling of cortical dynein and G alpha proteins mediates spindle positioning in Caenorhabditis elegans. Nat Cell Biol. 9 (11), 1294-1302 (2007).
- Moore, J. K., Cooper, J. A. Coordinating mitosis with cell polarity: Molecular motors at the cell cortex. Semin Cell Dev Biol. 21 (3), 283-289 (2010).
- Grishchuk, E. L., Molodtsov, M. I., Ataullakhanov, F. I., McIntosh, J. R. Force production by disassembling microtubules. Nature. 438 (7066), 384-388 (2005).
- Toba, S., Watanabe, T. M., Yamaguchi-Okimoto, L., Toyoshima, Y. Y., Higuchi, H. Overlapping hand-over-hand mechanism of single molecular motility of cytoplasmic dynein. Proc Natl Acad Sci U S A. 103 (15), 5741-5745 (2006).
- Ten Hoopen, R., et al. Mechanism for astral microtubule capture by cortical Bud6p priming spindle polarity in S. cerevisiae. Curr Biol. 22 (12), 1075-1083 (2012).
- Kapitein, L. C., et al. The bipolar mitotic kinesin Eg5 moves on both microtubules that it crosslinks. Nature. 435 (7038), 114-118 (2005).
- van den Wildenberg, S. M., et al. The homotetrameric kinesin-5 KLP61F preferentially crosslinks microtubules into antiparallel orientations. Curr Biol. 18 (23), 1860-1864 (2008).
- Kapitein, L. C., et al. Microtubule cross-linking triggers the directional motility of kinesin-5. J Cell Biol. 182 (3), 421-428 (2008).
- Ferenz, N. P., Gable, A., Wadsworth, P.
- Schuyler, S. C., Liu, J. Y., Pellman, D. The molecular function of Ase1p: evidence for a MAP-dependent midzone-specific spindle matrix. Microtubule-associated proteins. J Cell Biol. 160 (4), 517-528 (2003).
- Loiodice, I., et al. Ase1p organizes antiparallel microtubule arrays during interphase and mitosis in fission yeast. Mol Biol Cell. 16 (4), 1756-1768 (2005).
- Kapitein, L. C., et al. Microtubule-driven multimerization recruits ase1p onto overlapping microtubules. Curr Biol. 18 (21), 1713-1717 (2008).
- Janson, M. E., et al. Crosslinkers and motors organize dynamic microtubules to form stable bipolar arrays in fission yeast. Cell. 128 (2), 357-368 (2007).
- Bieling, P., Telley, I. A., Surrey, T. A minimal midzone protein module controls formation and length of antiparallel microtubule overlaps. Cell. 142 (3), 420-432 (2010).
- Mollinari, C., et al. PRC1 is a microtubule binding and bundling protein essential to maintain the mitotic spindle midzone. J Cell Biol. 157 (7), 1175-1186 (2002).
- Braun, M., et al. Adaptive braking by Ase1 prevents overlapping microtubules from sliding completely apart. Nat Cell Biol. 13 (10), 1259-1264 (2011).
- Lansky, Z., et al. Diffusible crosslinkers generate directed forces in microtubule networks. Cell. 160 (6), 1159-1168 (2015).
- Yamashita, A., Sato, M., Fujita, A., Yamamoto, M., Toda, T. The roles of fission yeast ase1 in mitotic cell division, meiotic nuclear oscillation, and cytokinesis checkpoint signaling. Mol Biol Cell. 16 (3), 1378-1395 (2005).
- Roth, S., Laan, L., Dogterom, M.
- Moudjou, M., Bornens, M. Method of centrosome isolation from cultured animal cells. Cell Biology: A laboratory handbook. Celis, J. E. 2, 111-119 (1998).
- Reck-Peterson, S. L., et al. Single-molecule analysis of dynein processivity and stepping behavior. Cell. 126 (2), 335-348 (2006).
- Schindelin, J., et al. Fiji: an open-source platform for biological-image analysis. Nat Methods. 9 (7), 676-682 (2012).
- Lancaster, O. M., et al. Mitotic rounding alters cell geometry to ensure efficient bipolar spindle formation. Dev Cell. 25 (3), 270-283 (2013).
- Good, M. C., Vahey, M. D., Skandarajah, A., Fletcher, D. A., Heald, R. Cytoplasmic volume modulates spindle size during embryogenesis. Science. 342 (6160), 856-860 (2013).
- Green, N. M.
- Moore, W., Zhang, C., Clarke, P. R. Targeting of RCC1 to chromosomes is required for proper mitotic spindle assembly in human cells. Curr Biol. 12 (16), 1442-1447 (2002).
- Akiyoshi, B., et al. Tension directly stabilizes reconstituted kinetochore-microtubule attachments. Nature. 468 (7323), 576-579 (2010).
- Lawrimore, J., et al. DNA loops generate intracentromere tension in mitosis. J Cell Biol. 210 (4), 553-564 (2015).
- Minc, N., Burgess, D., Chang, F. Influence of cell geometry on division-plane positioning. Cell. 144 (3), 414-426 (2011).
- Taberner, N., et al. In vitro systems for the study of microtubule-based cell polarity in fission yeast. Methods Cell Biol. 128, 1-22 (2015).
- Boukellal, H., Selimovic, S., Jia, Y., Cristobal, G., Fraden, S. Simple robust storage of drops and fluids in a microfluidic device. Lab Chip. 9 (2), 331-338 (2009).
