Summary
Bu protokol, kromojenik immünhistokimya ve ImageJ kullanılarak glioblastoma hasta rezeksiyonlarında tümör mikro çevre bileşenlerini nicel olarak tanımlamak için geliştirildi.
Abstract
Tümör mikro ortamındaki artan ilgiyle, ölümcül ve en invaziv beyin kanseri olan glioblastomun hasta örnekleri içindeki mikro çevre bileşenlerini spesifik olarak belirlemek için bir yöntem geliştirdik. Kantitatif yöntemler hastalıklı dokuları doğru bir biçimde tanımlamak için yararlı değildir, aynı zamanda potansiyel olarak daha doğru prognoz, teşhis ve doku mühendisliğindeki sistemlerin ve replasmanların geliştirilmesine katkıda bulunabilirler. Glioblastomada, mikroglia ve astrositler gibi glial hücreler, patoloğun derecelendirmesine dayalı zayıf prognoz ile bağımsız olarak ilişkilendirilmiştir. Bununla birlikte, bu hücrelerin ve diğer glial hücre bileşenlerinin durumu nicel olarak iyi tanımlanmamıştır. Bu, bu glial hücreleri işaretleyen büyük süreçler nedeniyle zor olabilir. Dahası, histolojik analizlerin çoğu, genel doku örneğine veya yalnızca tümör hacmine odaklanır; zira bölgeleri esas alan kantifikasyonları tasvir ederÇok heterojen dokuda. Burada, glioblastoma hastalarından tümör rezeksiyonlarının tümör hacmi ve komşu bölgelerindeki glial hücrelerin popülasyonlarının tanımlanması ve nicel olarak analiz edilmesi için bir yöntem açıklanmaktadır. Hastanın tümör rezeksiyonlarında glial hücre popülasyonlarını ve ImageJ'de kromojenik immünohistokimya kullandık ve her glial popülasyon için boyama yüzdesini analiz ettik. Bu tekniklerle, glioma tümör mikro ortamının bölgeleri boyunca glial hücreleri daha iyi tarif edebiliyoruz.
Introduction
En yaygın ve malign beyin kanseri olan Glioblastoma (GBM), birincil tümör hacminden çevreleyen sağlıklı beyin parankimine 1 , 2 oranlarında dağılmış istila ile karakterizedir. Bu dağınık istila, tümörün tamamen kesilmesini zorlaştırır ve tedaviden sonra kalan istilacı kanser hücreleri, kaçınılmaz nüksetmenin en yaygın nedenidir 2 , 3 , 4 . Daha önce, diffüz glioma hücre invazyonunu inhibe ederek terapötik açıdan faydalı 5 bulduk, ancak GBM istilasına katkıda bulunan kompleks mekanizmalar hakkında çok az şey biliniyordu. Tümör mikro ortamı veya kanseri çevreleyen doku, çoklu kanserlerde tümörlerin ilerlemesinde rol oynadı 6 , 7 . Glioblastoma tümör mikro ortamı, pEkstraselüler matriks, çözünür faktörler ve biyofiziksel faktörlerin yanı sıra, astrositler, mikroglia ve oligodendrositler gibi çok sayıda glial hücrenin oluşturduğu benzersiz bir şekilde karmaşıktır. Deneysel olarak, astrositler ve mikrogliaların glioma progresyonunu ve istilasını 8 , 9 , 10 arttırdığı gösterilmiştir, ancak doğal insan beyninin mikro ortamındaki tüm glial hücrelerin kompozisyonu bilinmemektedir.
Daha önce, mikro çevre bileşenleri, glioblastoma mikro ortamının hücresel bileşenlerini nicel olarak analiz ederek ve analizlerimizi orantısal bir tehlike modeli 11 içine dahil ederek, hastanın hayatta kalmasını öngörebildiğini gösterdi. Burada, glioblastoma hastasından tümör rezeksiyonlarının tümör hacmi ve komşu bölgelerindeki glial hücrelerin popülasyonlarının tanımlanması için nicel analiz metodunu açıklıyoruzs. Glial hücre popülasyonlarını tanımlamak için kromojenik immünohistokimya ve her glial popülasyon için boyamanın yüzde kapsama oranını analiz etmek için ImageJ kullanılmıştır. Kapsam yüzdesinin değerlendirilmesi, özellikle kanser hücreleriyle etkileşimlerden etkilenen hücrelerin morfolojik farklılıklarını belirlemek için basit bir ölçüm oluşturur. Histopatolojik boyamanın nicelleştirilmesi için yapılan önceki çalışmalar, hematoksilin ve eozin 12 veya Masson's trikrom 13 gibi standart boyayı antikor esaslı immünhistokimyasal boyanmanın özgüllüğünden yararlanmayan boyayı kullanır. Metodumuz, kompleks glioblastoma mikro ortamını aydınlatmak için kullanmayı düşündüğümüz, glioblastoma hasta tümör rezeksiyonlarında glial popülasyonları doğrudan ölçmek için geliştirilmiştir.
Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.
Protocol
Bu protokol, bloke edilmiş klinik hasta örnekleri için normal olduğu gibi, formalin-sabit parafin gömülü (FFPE) numunelerdeki hücresel bileşenleri tanımlar. Parafin gömülmesi, hücresel ve doku morfolojisinin en iyi şekilde korunmasına ve bölümlerin daha uzun ömürlü olmasına olanak tanır. Bu analiz için kullanılan örneklere Virginia Üniversitesi Biyorepository ve Doku Araştırma Tesisi aracılığıyla erişilmiştir. Hasta numuneleri, 2010 ve 2013 yılları arasında Virginia Üniversitesi'nde tümör rezeksiyonlarını tamamlayan ve glioblastoma (astrositom, DSÖ grade IV) kesin bir teşhisine dayanan bir nöropatolog tarafından seçildi ve bu analizden önce tanımlanmadı 11 .
1. FFPE Örneği Deparafinizasyon ve Rehidrasyon
NOT: Protokolün bu kısmı FFPE örneklerine özeldir. Parafin gömülü numuneler, bu analiz için hücresel ve t korunmasından dolayı daha yararlı olabilirkenMorfoloji yayınlarken, bu analiz donmuş bölümlerle de yapılabilir. Dondurulmuş kesitler kullanılıyorsa bu bölüm atlanabilir ve direkt olarak kromojenik immünohistokimyaya geçebilir.
- Ksinilen, ksilen,% 100 etanol,% 100 etanol,% 95 etanol,% 95 etanol,% 70 etanol, Deiyonize su, Deiyonize su
2. Antijen Geri Alma
NOT: Protokolün bu kısmı, FFPE numunelerinin formalin fiksasyonu sırasında oluşan metilen köprülerini kırmak ve bağlamak için antikorlar için antijen alanlarını ortaya çıkarmak için gereklidir.
- Damıtılmış suda üreticinin tavsiyesi üzerine Tris bazlı yüksek pH antijen maskesini çözündürünüz.
- Bir mikrodalga kullanarak ısı aracılı antijen alımını gerçekleştirin. Isı aracılı geri alımın diğer biçimleri (basınçlı ocak, sebze buharı veya kaynar su gibi) de yeterli olacaktır.
- Seyreltilmiş maskelenmeyen çözeltiyi, mühürlenmemiş bir mikrodalgaya tabi tutulabilirliğe ilave edindamar. Kayıkları tekneye yerleştirin. Slaytları mikrodalga fırına yerleştirin.
- Yüksek güçlü, 20 dk kaynatın. Buharlaşma için sıvı seviyelerini izleyin ve gerekirse damıtılmış su ile doldurun.
- Numunelerin, çözeltide oda sıcaklığında 1 saat bekletilmesine izin verin.
3. Kromojenik İmmünohistokimya
- Örneği örtmek için gereken reaktif hacmini en aza indirgemek için hidrofobik bir kalem ile doku örneğini ana hatlarıyla çizin.
NOT: Doku numunelerini sulu tutun ve lekelenme etkinliğini etkileyeceği için kurumasına izin vermeyin. - Doku örneğini örtmek için yeterli permeabilizasyon solüsyonu (Tris-tamponlu salin (TBS) +% 0.01 Triton-X) pipetleyin (tipik olarak yaklaşık 100 - 200 μL).
- Çözümü çıkarıp atın ve adım 3.2'yi tekrarlayın.
- Örnekleri engelleme çözeltisi (% 2.5 at serum + permeabilization çözüm) oda sıcaklığında inkübe edin.
- Seyreltilmiş primer antikorlarla gece boyunca 4 ºC'de örnekleri inkübe edinEngelleme çözümünde.
NOT: Burada kullanılan tüm birincil antikorlar 1: 200'de seyreltilir, ancak en iyi seyreltiler imalatçının tavsiyesi ile başlayan seri seyreltmeler kullanılarak belirlenebilir. Bu protokolde kullanılan antikorlar hakkında ayrıntılı bilgi 11 yayınlanmıştır. - Birincil antikorları, birincil antikor konakçı hayvana karşılık gelen bir yaban turbu peroksidaz polimer reaktifi kullanarak, üretici protokolünü izleyerek tespit edin.
- Doku numunesini örtmek için 5 dakika yeterli inkübasyon solüsyonu pipetleyin ve inkübe edin.
- Çözümü çıkarın ve atın ve Adım 3.7'yi tekrarlayın.
- 15 dakika boyunca 1 x TBS,% 0.3 H2O 2 slaytlar inkübe edin.
- Bir peroksidaz diaminobenzidin (DAB) substrat ile istenilen leke yoğunluğuna ulaşılıncaya kadar 2-10 dakika örnekler geliştirin.
- Hematoksilen gibi hücre çekirdeğini üreticinin protokolünü izleyerek tanımlamak için leke örnekleri hazırlayın.
- Örnekleri% 100 oranında kurutunEtanol ve ksilen.
- Örnekleri montaj malzemeleri ile kalıcı olarak monte edin.
4. İlgi Alanı Tanımlama Bölgeleri
- Yüksek çözünürlüklü görüntülere sahip parlak alan mikroskobu altında görüntü slaytları.
NOT: Görüntüleme hücresel bileşenlerini en az 20x çözünürlükte kullanın. - Fotoğraf makinesini doku örnekleri boyunca belirli bölgelere taşıyın.
- Niceleme için resimleri TIFF dosyaları olarak kaydedin.
5. Görüntü Analizi
- Yüzde kapsama alanının miktarını belirlemek için ImageJ'de resim açın.
- Hematoksilenle boyalı çekirdeğin mor rengini çıkarmak için Eşik Renk eklentisini kullanın.
- Görüntüyü 8 bit'e dönüştürün.
- Karanlık arka plan olmadan eşik ekleyin.
- 17 önceden yüklenmiş ImageJ eşik filtrelerinden ( örn. MaxEntropy) birini kullanarak işlem görüntüsü, böylece yalnızca DAB lekeli kısımları eşiğe dahil edilir.
NOT: Minimize eden en iyi ön yüklemeli eşik filtresini seçinArka plan boyamanın dahil edilmesi. Bu, lekelenme kalitesine ve antikorun spesifitesine bağlı olabilir. Her hasta örneğindeki tüm teknik çoğaltmalar için aynı eşiği kullanın. - Eşik uygula.
- Eşikli görüntünün yüzde alanını ölçün.
- Her örnek içindeki birden çok bölge için yüzde yüzdelik kapsam.
Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.
Representative Results
Bu analiz için, tümör rezeksiyonlarımızda iki bölgenin (esas olarak diffüz istilalı kanser hücreli sağlıklı dokudan oluşan primer tümör hacmi ve komşu bölgeler), hematoksilin ve eozin boyalı hastada nöropatologların işbirliği yaptığı tespit edildi ( Şekil 1A , 1B ) örnekleri. Her hasta örneği içinde, astrositler ( Şekil 1C ), mikroglia ( Şekil 1D ) ve oligodendrositler ( Şekil 1E ) için kromojenik immünhistokimya vasıtasıyla pozitif boyama tespit edildi. Bu popülasyonlar sırasıyla birincil antikorlar ALDH1L1, Iba1 ve Oligodendrosit Spesifik Protein (OSP1) kullanılarak tespit edildi 11 . Boyanmanın doğru ve pozitif olup olmadığını teyit etmek için, antikor seyreltmelerinin optimizasyonu ve üretici protokolleri ile istişare yapılması önerilir ( Şekil 2 ). Örneğin, negatif bir kontrol için birincil antikor olmayan boyama ( Şekil 2A ), üretici tarafından önerilen ( Şekil 2B ) ve diğer seyreltmeler ( Şekil 2C , 2D ), 1: 200'lük seyreltme ( Şekil 2C ) nedeniyle çökelmeden önce Anti-ALDH1L1 antikoru için arka planı en aza indirgeyerek hücre gövdesinin ve süreçlerin optimal pozitif boyanması.
ImageJ'yi kullanarak, OSP1 + oligodendrosit boyamasının yüzdesel kapsama alanı, sonuçta ilgi bölgelerimizdeki farklılıkları karşılaştırmak üzere nicelendirildi ( Şekil 3A ). Pozitif DAB boyanmayı yalnızca değerlendirebilmek için Eşik Renk eklentisini kullanarak görüntüdeki karşıt lekelenmiş çekirdekleri kaldırdık ( Şekil 3B ). Görüntüyü 8bit'e çevirdikten sonra (Ss = "xfig"> Şekil 3C), daha sonra kalan Pozitif DAB boyamaya MaxEntropy varsayılan eşiğini uyguladık ( Şekil 3D ). Burada, MaxEntropy eşik değerini kullandık çünkü bu varsayılan eşik, arka planı en aza indirirken pozitif lekesini yakaladı ancak ilgi popülasyonunun analizini sağlamak için farklı eşikler kullanılabilir. Görüntüye uygun eşik uygulandıktan sonra ( Şekil 3E ), eşik yüzdesi ölçülebilir ( Şekil 3F ) ve birden fazla hasta için karşılaştırma yapılabilir. Burada, ilgilenen bölgenin toplam alanına bağlı olarak, ilgi alanlarının her birindeki 3-5 bölgeyi niceleştirdik ve GraphPad Prism yazılımı ile eşleştirilmiş t-testleri kullanan grupları karşılaştırdık. Ayrıca, GBM analizlerini Protein Atlas veri tabanındaki sağlıklı beyin dokusunda bulunan boyama ile karşılaştırdık ( Şekil 3F ). Bizim önceki bir yayında, genel olarak hastanın hayatta kalma 11 tahmin etmek için bir orantılı tehlike modeli geliştirmek için çok sayıda microenvrionmental bileşen (astrositler, mikroglia, oligodendrositler ve kan damarları) 33 hasta arasında bu analizi kullanılmıştır.
Şekil 1 : Glial Hücreler İçin Tümör Toplu ve Tümör Bitişik Bölgelerinin Karşılaştırılması.
A) Hastadan 63 alınan tam tümör numunesi hematoksilen ve eozin ile dökme ve bitişik bölgeler belirtilerek boyandı. B) Hematoksilen ve eozin boyama, C) ALDH1L1 + astrositler, D) Iba1 + mikrogram ve E) Oligodendrosit Spesifik Protein-1 (OSP1) + oligodendrositler. Ölçek çubuğu = 100 μm. 25fig1large.jpg "target =" _ blank "> Bu rakamın daha büyük bir versiyonunu görmek için lütfen tıklayınız.
Şekil 2 : Anti-ALDH1L1 Antikorunun Örnek Titrasyonu.
A) Negatif kontrol, B) 1:70 üretici tavsiyesi stoktan seyreltme, C) stoktan 1: 200 seyreltme ve D) stoktan 1: 400 seyreltme. 1: 200 seyreltme, hücre gövdesinin optimal pozitif boyanması ve arka planın en aza indirgenmesi ile süreçler nedeniyle boyama ve analiz için kullanıldı. Ölçek çubuğu = 100 μm. Bu rakamın daha büyük bir versiyonunu görmek için lütfen tıklayınız.
Jpg "/>
Şekil 3 : Oligodendrositler için ImageJ Analizi ve Alan Kapsamının Tayini.
A) Hastanın Orijinal OSP1 + boyaması 52. B) Threshold_Colour eklentisini kullanarak mor çekirdeğin çıkarılması. C) 8bit'e dönüştürme. D) Zemin boyanmayı en aza indirgemek için MaxEntropi eşiği yakalanır ve E) uygulanır. F) OSP1 + kapsama alanı için, beş hasta örneğindeki bitişik ve yığın bölgeler ile Protein Atlası aracılığıyla sağlıklı beyin dokusu karşılaştırması. *** p <0.001, **** p <0.0001, eşleştirilmiş t-testleri ile. Ölçek çubuğu = 100 μm. Bu rakamın daha büyük bir versiyonunu görmek için lütfen tıklayınız.
Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.
Discussion
Burada önerilen yöntemimiz, geleneksel kromojenik immünhistokimyayla boyanan histolojik örneklerin analizinde niceliksel bir yaklaşımdır. Bu tür analizler için güncel metodoloji, bağımsız patologlar tarafından derecelendirilen benzer boyama protokollerini içerir. Bu yöntem güvenilir olmuştur, ancak birçok uygulama için, tümör ile ilişkili heterojenliği daha iyi anlamak ve in vitro çalışmalar için tümörlerin doğru yeniden özetlenmesi gibi, hücresel makyajın daha kesin bir şekilde anlaşılması gerekir.
Bu protokol, beyin tümörü mikro çevre içindeki glial hücrelerin kütlesel olarak analiz edilmesi için basit bir teknik göstermektedir. Bu teknik yaygın olarak adapte edilebilir ve meme veya pankreatik gibi tümör rezeksiyonlarının sahip olabileceği diğer kanamaların yanı sıra kan damarları, kemokinler ve diğerleri gibi mikro ortamın birçok bileşenini tanımlamak için genişletilebilirBüyük parenkimal bölgeleri. Dahası, bu teknik hücre şekillerini değerlendirmek için hücrelerin sayımları ve çevresi gibi diğer ölçümlerin yanı sıra daha karmaşık morfoloji sonuçları izotropi, kümeleme, yönlendirme ve daha fazlasını elde etmek için uyarlanabilir. Bu teknikler ayrıca boyama ve miktar yöntemleri herhangi bir beyin analizler için sağlıklı dokunun eden temsili protein Atlas miktar gösterildiği gibi, kullanılabilir ve epileptik beyin dokusu 11 ile önceden yayınlanmış karşılaştırma olması ile, kanser bunlarla sınırlı değildir.
Bu protokol dahilinde kritik adımlar, uygun inkübasyon ve kromojenik sekonder gelişimdir. Kromojenik boya fazla gelişmemesine dikkat edilmelidir. Bu, pozitif boyama ve arka plan arasındaki ayırımı zorlaştırır. Geliştirme süresi, kullanılan substrat reaktifine ve birincil antikorun afinitesine bağlı olarak değişir. Parlak alan kullanıyoruzArka plan boyamayı en aza indirirken en iyi boyayı sağlamak için gelişimi izlemek için mikroskopi. Boyama sonrasında, analiz esnasında uygun eşikleme, arka planın pozitif boyanmasından farklılaşmasına yardımcı olabilir. Bu yöntem için büyük bir kısıtlama, aynı doku örneği içinde kromojenik boyama gelişiminin kullanımı nedeniyle birden fazla bileşeni lekelememesidir. İmmunofloresan analizi benzer bir şekilde yapılabilir, ancak bu yöntemde tartışılan araçların modifikasyonunu gerektirir.
Glioblastoma özgü olarak, hasta numunelerini analiz etmek için kullanılan bazı belirteçler ve hücresel lekeler vardır. Bunlara, IDH1 14 , 15 , EGFRvIII 16 , 17 , mikrogram ve makrofajlar 18 , 19 için CD11b ve CD45 yanı sıra prognostik belirteçler dahildir. Metodumuz bu tür analizi genişletirGlioblastomadaki tümör mikro ortamının çoğunlukla gözden kaçan bir bileşeni olan hücresel mikro çevre. Araştırmalar, 20 , 21 , 22 tümörlerinde mikroglia varlığı ve yoğunluğunun yanı sıra astrositlerin 9 , 23 , 24 katkılarını inceledi. Burada beyin tümörü mikro ortamındaki tüm glia - astrositler, mikroglia ve oligodendrositleri inceleyen ve tümörün bitişik veya invaziv bölgelerini tümör hacminden ayıran bir protokol geliştirdik. Buradaki işaretleyiciler genellikle bu tümörlerde tanımlandı. Bunu yaparak, hasta durumunu daha doğru bir şekilde değerlendirebileceğimize inanıyoruz, çünkü hasta içi heterojenliği belirledik ve önceki yayınımızda bu yerlerin analizinin ve istatistiksel modellere dahil edilmesinin her iki konumdan da daha öngörülemez sonuçlar verdiğini gösterdi.Ne veya genel numuneler 11 . Dahası, glioblastoma invazyonu o kadar yaygındır ki, 1 , 2'nin tamamen kesilmesini zorlaştırıyor, komşu bölgedeki dokunun, rezeksiyon sonrasında geride kalan invaziv dokuyu daha fazla temsil ettiğini ve kaçınılmaz nükse katkıda bulunduğuna inanıyoruz. Bu nedenle, bitişik bölgelerin daha iyi anlaşılması, glioblastoma hastalarında terapiden önce rezeke edilen, geleneksel olarak incelenen toplu dokunun aksine, hastalık tekrarlaması ve hasta tedavi planlaması hakkında daha fazla bilgi verebilir.
Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.
Disclosures
Yok.
Acknowledgments
Yazarlar Dr Dr teşekkür ederim. Fahad Bafakih ve Jim Mandell, hasta numunelerinin edinilmesi ve tanımlanması için Garrett F. Beeghly, Biyorepository ve Doku Araştırma Tesisi, Kardiyovasküler Araştırma Merkezi Histoloji Çekirdeği ve Virginia Üniversitesindeki Biyomoleküler Analiz Merkezi ile yardımda bulunmak için yardım ettiler. Örnek alma, immünohistokimya ve görüntüleme.
Materials
| Name | Company | Catalog Number | Comments |
| Xylene | Fisher Chemical | X3P | |
| Ethanol | |||
| High pH antigen unmasking solution | Vector Labs | H-3301 | |
| TBS | |||
| Triton-X | Amresco | 9002-93-1 | |
| Horse serum | |||
| Anti-ALDH1L1 | abcam | ab56777 | |
| Anti-Iba1 | abcam | ab5076 | |
| Anti-Oligodendrocyte Specific Protein1 | abcam | ab53041 | |
| ImmPRESS anti-goat | Vector Labs | MP-7405 | |
| ImmPRESS Universal (anti-mouse/rabbit) | Vector Labs | MP-7500 | |
| Hydrogen peroxide | Sigma Aldrich | 216763 | |
| ImmPACT DAB substrate | Vector Labs | SK-4105 | |
| Hematoxylin counterstain | ThermoScientific | 72404 | |
| Histochoice Mounting Media | Amresco | H157-475 | |
| Aperio Scanscope | Leica Biosystems | ||
| Image Scanscope | Leica Biosystems | ||
| Super HT PAP Pen | Research Products International | 195506 |
References
- Claes, A., Idema, A. J., Wesseling, P. Diffuse glioma growth: a guerilla war. Acta Neuropathol. 114 (5), 443-458 (2007).
- Holland, E. C. Glioblastoma multiforme: the terminator. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 97 (12), 6242-6244 (2000).
- Wild-Bode, C., Weller, M., Rimner, A., Dichgans, J., Wick, W. Sublethal Irradiation Promotes Migration and Invasiveness of Glioma Cells. Cancer Res. 61 (6), (2001).
- Tuettenberg, J., et al. Recurrence pattern in glioblastoma multiforme patients treated with anti-angiogenic chemotherapy. J. Cancer Res. Clin. Oncol. 135 (9), 1239-1244 (2009).
- Munson, J. M., et al. Anti-invasive adjuvant therapy with imipramine blue enhances chemotherapeutic efficacy against glioma. Sci. Transl. Med. 4 (127), 127ra36 (2012).
- Correia, A. L., Bissell, M. J. The tumor microenvironment is a dominant force in multidrug resistance. Drug Resist. Updat. 15 (1-2), 39-49 (2012).
- Rubin, J. B. Only in congenial soil: the microenvironment in brain tumorigenesis. Brain Pathol. 19 (1), 144-149 (2009).
- Bettinger, I., Thanos, S., Paulus, W. Microglia promote glioma migration. Acta Neuropathol. 103 (4), 351-355 (2002).
- Le, D. M., et al. Exploitation of astrocytes by glioma cells to facilitate invasiveness: a mechanism involving matrix metalloproteinase-2 and the urokinase-type plasminogen activator-plasmin cascade. J. Neurosci. 23 (10), 4034-4043 (2003).
- Ye, X., et al. Tumor-associated microglia/macrophages enhance the invasion of glioma stem-like cells via TGF-β1 signaling pathway. J. Immunol. 189, 444-453 (2012).
- Yuan, J. X., Bafakih, F. F., Mandell, J. W., Horton, B. J., Munson, J. M. Quantitative Analysis of the Cellular Microenvironment of Glioblastoma to Develop Predictive Statistical Models of Overall Survival. J. Neuropathol. Exp. Neurol. , (2016).
- Yuan, Y., et al. Quantitative Image Analysis of Cellular Heterogeneity in Breast Tumors Complements Genomic Profiling. Sci. Transl. Med. 4 (157), (2012).
- Yi, E. S., et al. Distribution of Obstructive Intimal Lesions and Their Cellular Phenotypes in Chronic Pulmonary Hypertension. Am. J. Respir. Crit. Care Med. 162 (4), 1577-1586 (2000).
- Turcan, S., et al. IDH1 mutation is sufficient to establish the glioma hypermethylator phenotype. Nature. 483 (7390), 479-483 (2012).
- Songtao, Q., et al. IDH mutations predict longer survival and response to temozolomide in secondary glioblastoma. Cancer Sci. 103 (2), 269-273 (2012).
- Shinojima, N., et al. Prognostic Value of Epidermal Growth Factor Receptor in Patients with Glioblastoma Multiforme. Cancer Res. 63, 6962-6970 (2003).
- Karpel-Massler, G., Schmidt, U., Unterberg, A., Halatsch, M. E. Therapeutic inhibition of the epidermal growth factor receptor in high-grade gliomas: where do we stand? Mol. Cancer Res. 7 (7), 1000-1012 (2009).
- Badie, B., Schartner, J. Role of microglia in glioma biology. Microsc. Res. Tech. 54 (2), 106-113 (2001).
- Watters, J. J., Schartner, J. M., Badie, B. Microglia function in brain tumors. J. Neurosci. Res. 81 (3), 447-455 (2005).
- Alves, T. R., et al. Glioblastoma cells: A heterogeneous and fatal tumor interacting with the parenchyma. Life Sci. 89 (15), 532-539 (2011).
- Hambardzumyan, D., Gutmann, D. H., Kettenmann, H. The role of microglia and macrophages in glioma maintenance and progression. Nat. Neurosci. 19 (1), 20-27 (2015).
- Zhai, H., Heppner, F. L., Tsirka, S. E. Microglia/macrophages promote glioma progression. Glia. 59 (3), 472-485 (2011).
- Placone, A. L., Quiñones-Hinojosa, A., Searson, P. C. The role of astrocytes in the progression of brain cancer: complicating the picture of the tumor microenvironment. Tumor Biol. 37 (1), 61-69 (2016).
- Rath, B. H., et al. Astrocytes Enhance the Invasion Potential of Glioblastoma Stem-Like Cells. PLoS One. 8 (1), e54752 (2013).
