Summary
Den roterande utöva kvantifiering systemet (REQS) kan inducera övning i Drosophila melanogaster genom rotation samtidigt samtidigt mäta mängden aktivitet som utförs av djuren. Här presenterar vi en punkt för punkt protokollet beskriver hur att mäta aktiviteten djur upplever roterande motion behandlingar med REQS.
Abstract
Drosophila melanogaster är en ny modellorganism för studier i motion biologi. Hittills har två huvudsakliga motion system, har Power Tower och motionsredskap beskrivits. En metod för att mäta mängden ytterligare djurens aktivitet induceras genom motion behandling har dock saknats. Den roterande utöva kvantifiering systemet (REQS) fyller detta behov, som ger ett mått på djurens aktivitet för djur upplever roterande motion. Detta protokoll Detaljer hur du använder REQS för att bedöma djurens aktivitet under roterande träning och illustrerar vilken typ av data som kan genereras. Här visar vi hur REQS används för att mäta kön - och stamspecifika skillnader i motion induced aktivitet. REQS kan också användas för att utvärdera effekterna av olika andra experimentella parametrar såsom ålder, kost eller befolkningens storlek på motion induced aktivitet. Dessutom, kan det användas för att jämföra effekten av olika övning utbildning protokoll. Ännu viktigare, ger det en möjlighet att standardisera motion behandlingar mellan stammar, vilket gör att forskaren att uppnå lika mängder aktivitet mellan grupperna om det behövs. Således REQS är en anmärkningsvärd ny resurs för motion biologer arbetar med Drosophila modell systemet och kompletterar befintliga motion system.
Introduction
Nyligen har forskare börjat använda bananflugan Drosophila melanogaster för att studera motion biologi. D. melanogaster har varit genetiskt modellsystem för över 100 år1,2. Drosophila forskning har dock gjort bidrag inte bara genetik, utan även en mängd andra discipliner, inbegripet neurobiologi, beteendemässiga biologi och fysiologi3. I 2009, den Power Tower, var den första träningsmaskin för Drosophila beskrivs4. Den Power Tower utnyttjar djurens negativa geotaxis svar. När störd, Drosophila tenderar att flytta till toppen av sin inhägnad. Detta svar är väl etablerad och är grunden för den populära ”RING” (snabb iterativ negativa Geotaxis5) analysmetod som används för att uppskatta klättringsförmåga och/eller fysisk kondition i Drosophila. Den Power Tower använder en mekanisk arm ansluten till en motorenheten upprepade gånger lyfta en uppsättning djur inom deras höljen av flera inches och släppa dem tillbaka till marken för att framkalla negativa geotaxis svaret (Tinkerhess et al. 20126 ge en video som illustrerar användningen av Power tornet). Långvarig behandling på Power tornet därmed ökar mängden fysisk aktivitet (kör eller flyger) djuren utföra jämfört med kontrollgrupp djur och över tid leder till förbättrad prestanda i RING-analysen för fysisk kondition4. Således, detta arbete visat möjligheten att använda Drosophila som modell för motion biologi.
För att expandera repertoaren av verktyg tillgängliga för Drosophila motion forskning, i 2016, beskrivs Mendez och kollegor en andra Drosophila träningsmaskin, motionsredskap7. Liknar den Power Tower, motionsredskap utnyttjar Drosophila negativa geotaxis svar. Dock induceras detta svar genom fortsatt rotation av de animaliska kapslingarna, snarare än genom att lyfta och släppa dem i den Power Tower. Induktion metoden är skonsammare och möjliggör en mer uthållighet orienterade motionsprogram som undviker någon fysiskt trauma som kan uppstå under övningen i Power Tower (se Katzenberger, R. J. et al. 20138 för effekterna av upprepad fysisk trauma på Drosophila hälsa). Liknar den Power Tower4, motion behandling av djur på motionsredskap leder till en mängd fysiologiska reaktioner, inklusive förändringar i fysisk kondition, triglyceridnivåer och kropp vikt7. Således finns två kompletterande metoder för Drosophila biologer studera motion.
En begränsning av både Power Tower och motionsredskap är oförmågan att mäta mängden aktivitet induceras av motion behandling. Analys av videoinspelningar tas från motionsredskap visade att det fanns betydande skillnader mellan de olika Drosophila-stammarna i hur de svarar på den motion behandling7. Specifikt, stammar studerade skilde sig i hur mycket ytterligare aktivitet som djuren utförs när stimuleras7. Denna observation föranlett oss att utveckla ett tredje motion system, den roterande utöva kvantifiering systemet (REQS), som tillåter oss att mäta djurens aktivitet under rotation-inducerad motion9. REQS använder tredjeparts en kommersiellt tillgänglig aktivitetsövervakning enhet som är installerad på en roterande arm för att stimulera motion genom rotation i motionsredskap. Inledande arbete med REQS bekräftar att genetiskt olika Drosophila stammar — och könen - kan har betydligt olika svar på den roterande stimuleringen och därmed mängden motion induced är inte identiska bland olika genotyper9 . Således gör REQS nu Drosophila biologer att mäta mängden motion som induceras av behandling, öppna en mängd ny forskning avenyerna i fältet övning.
Här beskriver vi i detalj hur du använder REQS för kvantifiering av roterande motion. REQS inducerar roterande motion och mäter samtidigt aktivitetsnivåer av de djur som behandlas. REQS är kunna rymma en mängd olika träningsprogram, allt från enkelt 2 h kontinuerlig motion regim visat här till komplexare intervall bildning metoderna som beskrivs av Mendez och kollegor7och stimulering kan justeras via Rotationshastighet (mellan ca 1-13 varv per minut). Beroende på aktiviteten övervaka enheten används för att producera REQS, är denna metod anpassningsbar till analysen av enstaka flugor eller stora populationer av djur. På grund av denna mångsidighet ger REQS Drosophila forskare med en mängd möjligheter att studera, till exempel, olika motion regimes, kost interventioner eller inverkan av befolkningstäthet.
Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.
Protocol
REQS består av Drosophila Aktivitetskontroll (källa information, se Tabell för material) monterad på en roterande arm som styrs av en motorenheten (figur 1). Aktivitetskontroll avgör hur ofta i ett visst tidsintervall matrisen med laserstrålar dissekera mitten av assay röret störs. För detaljerade ritningar och en djupgående karakterisering, se vår tidigare publikation9. Medan våra system använder LAM25H enheten, kan REQS ändras för att rymma andra Drosophila Activity Monitor-enheter samt.
1. Testa installationen av REQS
- Belastningstest flyger in preparatet glasrör av anesthetizing djuren med CO2 eller andra vald metod för hantering, flytta dem till tomma rören och tak rören.
- Infoga utjämnade glasrör preparatet i spåren av aktiviteten övervaka enheten. Secure rören med hjälp av gummi O-ringar (17-18 gauge) och/eller gummiband på båda sidor av enheten för att se till att rören flytta inte under rotation:
- Glida en O-ring över provrör och placera o-ringen nära mittpunkten av röret. Infoga provrör i ett fack av Aktivitetskontroll från framsidan och centrera den.
- Flytta o-ringen som behövs och se till att när provrör är centrerad, är o-ringen gled så nära aktiviteten övervaka enheten som möjligt. Fixa provrör i plats av glider en andra O-ring över glasröret från tillbaka, flyttar igen o-ringen så nära aktiviteten övervaka enheten som möjligt.
- Inleda rotation av REQS genom att vrida strömbrytaren på framsidan av enheten. Justera rotationshastighet med ratten på framsidan av enheten på önskad hastighet (4 rpm (varv per minut) i det här exemplet).
Obs: Rotationshastigheten i detta exempel valdes för att matcha en tidigare publicerad studie7. Eftersom olika rotationshastigheter kommer att resultera i olika djurs aktivitetsnivåer, inleds en ny studie, kan optimering av rotationshastighet för specifika experimental set-up (genotyp, längden på övning skjutningen, osv.) vara nödvändigt.
Obs: Det är viktigt att se till att rören är korrekt placerade så att de inte dra längs botten av REQS enheten under rotation. - Testa anslutningen till datainsamlingssystemet medföljer enheten Drosophila Aktivitetskontroll genom att öppna programmet DAMSystem308 och se till att lampan anslutning förblir grönt för flera rotationer. Programvaran kommer att börja inspelning av data till en textfil ”monitorX” (X är antalet enhet om flera bildskärmar används) omedelbart vid initiering. Inspelning frekvens kan justeras på fliken ”Inställningar”; Vi registrerar vanligtvis i 5 min intervaller.
- Undersöka den textfil som genereras av den DAMSystem308 programvaran för att säkerställa att dataanslutningen fungerar korrekt. Problem med anslutningen resultera i utskärningar, tidpunkter där 0 aktivitet registreras för alla positioner i REQS (se Representativa resultat och tabell 2). Om utskärningar uppstår, justera dataanslutningar som leder till roterande telefonjacket, som under rotation, denna anslutning kan bli lös eller vriden. Vi tycker att stabilisera anslutningen med tejp hjälper för att förhindra detta problem.
2. förberedelse av djuren
Obs: Alla djuren var upp och testade under standart villkorar i en inkubator (25 ° C, 60-70% luftfuktighet, 12 h ljus/mörk cykel) den melass/majsmjöl media10.
- Två veckor före planerad experimentet, ställa in injektionsflaskor med kontrollerad djurtäthet att samla de experimentella flugorna från; Vi sätter vanligtvis upp injektionsflaskor med 7 män och 10 kvinnor. Med en frisk lager, från en enda flaskan, kan ca 15 virgin män och 15 kvinnor samlas över en 4 dagars tidsperiod. Justera antalet injektionsflaskor som ställer in baserat på antalet djur som behövs för analysen; en typisk analys i vårt laboratorium ingår 10 uppsättningar av 10 oskuld hanar och honor per genotyp (100 män och 100 kvinnor).
Obs: Icke-oskuld flugor kan användas beroende på den specifika experimentella frågan. Om genomföra långsiktiga experiment med icke-oskuld djur, kan krypande larver störa korrekt aktivitetsövervakning. - Ta bort den överordnade flugor en vecka efter inställning av injektionsflaskorna.
- Börjar på dag 10 efter inställningen upp flaskorna, samla oskuld flugor från injektionsflaskorna och lagra dem separerade efter kön.
- Samla tillräckligt djur för experiment och ålder som dem som behövs, 3 dagar i det här exemplet.
Obs: Vi söva vanligtvis djuren med CO2 för hantering. CO2 är känt för att påverka djurens aktivitetsnivåer för längre tid efter behandlingen (se exempelvis Bartholomew o.a. 201511). Om CO2 effekten stör planerade nedströms analyser eller analyser, använda en annan anestesi metod såsom is anesthetization.
3. datainsamling med REQS
- Söva de djur som ska användas för motion kvantifiering studien med CO2 eller en annan anestesi metod. Dela in dem i grupper som behövs och ladda in grupperna av djur i de tomma glasrör av Aktivitetskontroll; i det här exemplet läses 10 djur i samma ålder per glasrör, med 10 replikat för varje djur typ (kön/genotyp). Se till att observera vilka djur typ läses i varje rör.
Obs: För längre experiment, mat kan ingå i preparatet rören. I det här fallet är det viktigt att maten är säker och inte bli lossnar under rotation. - Ladda glas assay rören in i REQS enheten och säkra dem med gummi O-ringar. Om arbetar med mer än en sex/genotyp, kommer att med hjälp av en randomiserad block-design eller randomisering av positionen för djuren i REQS eliminera alla eventuella position effekter. Randomisering kan uppnås genom att tilldela varje injektionsflaska ett slumptal, till exempel från en webbaserad slumpgenerator (t.ex. https://www.randomizer.org/) eller i ett kalkylblad och sedan beställa injektionsflaskorna baserat på slumptal.
- Placera REQS i inkubatorn att säkerställa konstant temperatur, luftfuktighet och ljus villkor. Kontrollera att både data och ström kablarna är ordentligt anslutna.
- Låt djuren att återhämta sig från anestesi och acklimatisera sig till den nya miljön för 1 h.
- Börja experimentet genom att inleda rotation av REQS på önskad hastighet.
Obs: Ett annat alternativ är att först samla baslinjen aktivitetsdata från djuren före inledandet av rotation, följt av inspelning aktivitetsnivåer som svar på roterande stimulering. - Initiera datainsamling genom att öppna programmet DAMsystem308 (helt enkelt öppna den programvara initierar datainsamlingen). Data skrivs till en textfil på det inställda intervallet (här, 5 min); om det behövs, ändra intervall inställningar i fliken ”Inställningar” (se steg 1.4).
- För att säkerställa att data överförs korrekt till datorn, öppna den textfil som genereras av programvaran DAMsystem308 efter en eller två tidsintervall har passerat och bekräfta att data skrivs till filen. Stänga och åter öppna den här filen om du vill se data från någon ytterligare tidpunkter. Samla in data för den önskade mängden tid; i detta exempel, 2 h.
Obs: Öppna inte inkubatorn under perioden assay som djur är mycket känsliga för störningar och kommer sannolikt att svara med ökad aktivitet. - I slutet av övningen analysen, avsluta datainsamling genom att stänga DAMsystem308 programvaran och sedan stänga av REQS. Ta bort djuren från glas assay rören och rengör rören. Djuren kan flyttas tillbaka till mat injektionsflaskor om upprepade åtgärder vid olika åldrar.
Obs: Om dödsfall inträffar under träning regim, det bör noteras, eftersom närvaron av döda flugor kan påverka aktivitet räknas. Vår erfarenhet med DGRP2 fluglinor12,13, träna 4 rpm för 2 h resulterade inte i några dödsfall, men svagare stammar skulle reagera annorlunda.
4. dataanalys
- Öppna txt-filen heter ”Monitor1” producerad av programvaran DAMSystem308.
- Inspektera datafilen för eventuella problem som kan ha inträffat under dataförvärvet (missade tidpunkter, etc.; (Se tabell 1). Om nödvändigt, censurera filen genom att ta bort datapunkter i början och slutet av inspelningen.
- Med hjälp av statistisk programvara som du väljer (t.ex., R), analysera insamlade data. Skapa beskrivande statistik och genomföra variansanalys (ANOVA) undersöka effekter såsom kön och genotyp, om data är normalfördelade. Om data inte är normalfördelade, använda icke-parametriska metoder, såsom Kruskal-Wallis test, för att jämföra grupper. De specifika analyser som krävs beror på den specifika vetenskapliga frågan och experimentell design.
Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.
Representative Results
Utdata från en individuell körning med REQS är en datatabell som produceras av programvaran DAMSystem308, som skall märkas ”Monitor1.txt” som standard (för ett exempel se kompletterande fil 1). Ett utdrag från sådan tabell visas i tabell 1. Varje kolumn innehåller data från en individuell analys tube, medan raderna innehåller aktiviteten mäts i varje tidsintervall från början av experimentet (överst) till slutet (längst ned). De första tre datapunkterna ska övervakas i händelse av att det finns data utskärningar (såsom dessa ses i tabell 2), i vilket fall kabeln måste justeras.
Figur 2 visar resultaten från ett experiment jämföra fyra genetiskt distinkta Drosophila linjerna (DGRP2 linjer 371, 703, 810 och 89712,13). För varje av de fyra raderna, tio replikera mätningar från grupper av tio oskuld flugor av båda könen samlades som beskrivs i avsnittet protokoll. Från utdatafilen av programvaran DAMSystem308 beräknades ”genomsnittliga aktivitet per 5 min per 10 flugor” genomsnitt aktivitet åtgärder i hela 2 timmar tidsspannet. Detta genomsnitt från varje kolumn således producerar en enda åtgärd för varje test kammare. Tabellen sammanfattning som figur 2 baseras på finns i tabell 3.
Uppgifterna i tabell 3 analyserades av ANOVA, testning för effekterna av genotyp, kön och samspelet mellan kön och genotyp. Som bara effekten av genotyp var signifikant (p < 2 x 10-16), de två könen kombinerades i figuren visas i figur 2. ANOVA upptäckt en stark effekt av genotyp, vilket är uppenbart i grafen. De genomsnittliga motion aktivitetsnivåer mellan alla fyra genotyper skiljer sig avsevärt från varandra (p < 0,05; Tukey's HSD), och således figur 2 illustrerar hur REQS kan användas för att upptäcka en effekt av genotyp på motion aktivitetsnivåer.
Figur 1: REQS. Visas i det här fotot används REQS i detta förfarande. Aktiviteten övervaka enheten (A) roterar runt sin horisontella axel som drivs av en roterande arm (B). Rotationshastigheten är justerbar via en uppringd (C), och driften av maskinen styrs av en strömbrytare (D). Infällt (E) visar en närbild av dataanslutningen mellan aktiviteten övervaka enheten och roterande telefonjacket. Klicka här för att se en större version av denna siffra.
Figur 2: jämförelse av utöva verksamhet mätt som REQS i fyra olika DGRP stammar. X-axeln: djurs genotyp. Y-axeln: djurens aktivitet mätt med beam korsningar per 10 djur per 5 min. A: DGRP2 linje 897; B: DGRP2 linje 810; C: DGRP2 linje 703; D: DGRP2 linje 371. Grafen visas här kombinerar data från män och kvinnor, som sågs ingen betydande kön effekt för dessa specifika rader (ANOVA; p = 0,557). Det finns dock en stark genotyp effekt (ANOVA; p < 2 x 10-16), och alla individuella jämförelser mellan de fyra genotyperna är mycket betydande (Tukey's HSD; p < 0,05). Black diamond: genotyp medelvärde; svart linje: +/-en SD (standardavvikelse). Klicka här för att se en större version av denna siffra.
| Tid | Activity(1) | Activity(2) | Activity(3) | Activity(4) | Restbetaaktiviteten(5) |
| 12:25:00 | 21 | 86 | 48 | 32 | 76 |
| 12:30:00 | 31 | 55 | 58 | 74 | 119 |
| 12:35:00 | 27 | 45 | 47 | 80 | 125 |
| 12:40:00 | 28 | 55 | 34 | 83 | 91 |
| 12:45:00 | 36 | 56 | 45 | 67 | 103 |
Tabell 1: exempel utdata av korrekta uppgifter från programvaran DAMSystem308. Varje ”Activity(#)” kolumn representerar en injektionsflaska med 10 flugor, med aktivitet registreras med 5 minuters mellanrum.
| Tid | Activity(1) | Activity(2) | Activity(3) | Activity(4) | Restbetaaktiviteten(5) | Fel? |
| 12:00:00 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | Ja |
| 12:05:00 | 98 | 1 | 36 | 0 | 8 | Nej |
| 12:10:00 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | Ja |
| 12:15:00 | 88 | 24 | 44 | 1 | 9 | Nej |
| 12:20:00 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | Ja |
| 12:25:00 | 106 | 51 | 41 | 0 | 15 | Nej |
Tabell 2: Exempel utdata av felaktig data med paketförluster från programvaran DamSystem308. Varje kolumn representerar en injektionsflaska med 10 flugor, med aktivitet registreras med 5 minuters mellanrum. Rader 12:00:00, 12:10:00 och 12:20:00 visar ”0” aktivitetsinspelningar över alla kolumner, som indikerar ett problem med anslutningen till (fel? ”yes” i den sista kolumnen).
Tabell 3: exempeldata används för att generera Figur 2. Vänligen klicka här för att hämta den här filen.
Kompletterande fil 1: Obearbetade utdatafilen som produceras av DAMSystem308 programvara. Kolumn 1 registrerar den tid punktnummer. Kolumn 2 poster datum för experimentet, och kolumn 3 poster tiden varje tidpunkt registreras. Kolumnerna 4-10 som inte används, och kolumnerna 11-42 representerar inspelningar från de 32 platser av Aktivitetskontroll. Vänligen klicka här för att hämta den här filen.
Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.
Discussion
Som de representativa resultat illustrera, är REQS exakt mäta aktiviteten att utöva Drosophila. REQS är flexibelt och tillåter forskare att ta itu med en mängd frågeställningar relaterade till motion biologi eller motion interventioner. Det finns två kritiska steg i protokollet att belysa. Först är det viktigt att testa installationen av REQS att se till att överföring av data från REQS till DAMSystem308 fungerar korrekt. Om inte korrekt inställd, datakabeln kan bli trassligt under rotationen, och ibland anslutningen mellan REQS och DAMSystem308 är störd vid roterande anslutning på grund av slitage (även med nästan daglig användning av REQS, vi har haft att Byt ut kontakten en gång i två år). Det är klokt att hålla reservdelar i handen. Andra är konsekvens av miljöparametrar viktig för framgången av experimenten. Drosophila är mycket känsliga för buller eller vibrationer, och det är därför viktigt att experimentet inte störs under datainsamling. Således, helst experiment körs i en dedikerad inkubator som inte nås under en experimentell kör. Uppmärksamhet åt dessa två kritiska steg kommer att se till att högkvalitativa data samlas in från REQS.
Samtidigt som vi visar här hur REQS kan användas för att mäta djurens aktivitet under en 2-timmars kontinuerlig motion behandling från grupper av djur, är REQS flexibel i tid och intensitet av träning kan justeras för en mängd motion behandlingar. Dessutom, beroende på aktiviteten övervaka enheten används, kan det ändras för att mäta aktivitet från enstaka flugor eller mycket stora populationer av djur. REQS kan dessutom användas för att testa design och optimering av motion regimes. Det kan också användas för att mäta effekterna av ytterligare variabler, såsom tid av dagen, djurens ålder, diet, befolkningens storlek eller missbruksbehandling på inducerade aktivitet och motion svaren. Beroende på den exakta experiment, dvs längd motionsprogram och timing, kan REQS också användas att störa de naturliga sömnmönster av Drosophila. Dessa exempel illustrerar mångsidiga natur REQS och vissa potentiella användningsområden i Drosophila forskning. Andra små djurförsök samhällen kan också vara intresserad av att anpassa REQS för sina syften, därmed bredda nyttan av detta nya verktyg.
För närvarande är en begränsning av REQS det begränsade antalet prover som kan bearbetas vid en given tidpunkt, som styrs av aktiviteten övervakare används, som assay högst 32 prover. Medan användningen av flera REQS enheter är möjligt, att tillåta REQS användas för storskaliga genetiska skärmar eller liknande program, skulle utveckling av en högre genomströmning version av REQS vara perfekt.
På grund av dess förmåga att mäta aktivitet inducerad på ett identiskt sätt till motionsredskap, REQS kan användas i kombination med den motionsredskap, vilket möjliggör något högre genomströmning (48 prover kan bearbetas på en gång). Motion-protokoll kan optimeras med hjälp av REQS och sedan genomföras på motionsredskap för fortsatta studier. Således kan de motionsredskap och REQS användas kompletterande som behövs för specifika studiedesigner.
REQS är ett viktigt steg framåt i Drosophila motion forskning som gör det möjligt för kvantifiering av inducerad aktiviteten. Att ha en maskin som samtidigt kan inducera motion och åtgärd denna övning var en tydlig behöver i Drosophila utöva fält, som en tysk grupp av forskare utvecklats oberoende en mycket liknande enhet, kallas ”swing båt”, använder som också en aktivitet övervaka för att mäta aktivitet under träning som induceras av rotation14. Den ”swing båt” använder inte kompletta rotationer, men istället svänger aktiviteten övervaka enheten tillbaka och tillbaka cirka 30 grader runt en rotationsaxel. Således, den ”swing båt”, som REQS, använder rotation ständigt framkalla negativa geotaxis svar och ökar djurens aktivitet. REQS och ”swing båt” komplettera befintliga video-spårningsmetoder används till assay Drosophila efter stimulering, till exempel i Drosophila upphetsning Tracking system (DART)15. Både REQS och ”gunga båten” förbättra system som DART, som spåra aktivitet endast efter upphörande av stimulans. Således, den REQS och ”swing båt” är viktiga nya verktyg för forskare i fältet Drosophila övning, som kan användas tillsammans med de befintliga motionsredskap och Power Tower-enheterna.
Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.
Disclosures
Författarna har något att avslöja.
Acknowledgments
Arbetet stöds av Award nummer P30DK056336 från det nationella institutet för Diabetes och mag och njure sjukdomar genom en pilot bidrag från kost och fetma Research Center vid University of Alabama i Birmingham till NCR.
Materials
| Name | Company | Catalog Number | Comments |
| Drosophila Activity Monitor | Trikinetics | LAM25H | REQS component |
| Telephone Cord Detangler | Uvital | uv20170719 | REQS component |
| Vial closures (flugs) | Genesee Scientific | 49-102 | Drosophila culture supplies |
| Vials | Genesee Scientific | 32-120 | Drosophila culture supplies |
| Drosophila culture netting | Carolina Biological Supply | 173090 | Drosophila culture supplies |
| Cornmeal | Pepsico | 43375 | Drosophila media |
| Molasses | Golden Barrel | BLA-GAL | Drosophila media |
| Agar | Apex Bioresearch | 66-103 | Drosophila media |
| Inactive Dry Yeast | Genesee Scientific | 62-106 | Drosophila media |
| Tegosept | Apex Bioresearch | 20-258 | Drosophila media |
| Propionic acid | Genesee Scientific | 20-271 | Drosophila media |
References
- Rieder, L. E., Larschan, E. N. Wisdom from the fly. Trends Genet. 30 (11), 479-481 (2014).
- Ugur, B., Chen, K., Bellen, H. J. Drosophila tools and assays for the study of human diseases. Dis Model Mech. 9 (3), 235-244 (2016).
- Hales, K. G., Korey, C. A., Larracuente, A. M., Roberts, D. M. Genetics on the fly: A primer on the Drosophila Model System. Genetics. 201 (3), 815-842 (2015).
- Piazza, N., Gosangi, B., Devilla, S., Arking, R., Wessells, R. Exercise-training in young Drosophila melanogaster reduces age-related decline in mobility and cardiac performance. PLoS One. 4 (6), e5886 (2009).
- Gargano, J. W., Martin, I., Bhandari, P., Grotewiel, M. S. Rapid iterative negative geotaxis (RING): a new method for assessing age-related locomotor decline in Drosophila. Exp Gerontol. 40 (5), 386-395 (2005).
- Tinkerhess, M. J., Ginzberg, S., Piazza, N., Wessells, R. J. Endurance training protocol and longitudinal performance assays for Drosophila melanogaster. J Vis Exp. (61), (2012).
- Mendez, S., et al. The TreadWheel: A novel apparatus to measure genetic variation in response to gently induced exercise for Drosophila. PLoS One. 11 (10), e0164706 (2016).
- Katzenberger, R. J., et al. A Drosophila model of closed head traumatic brain injury. Proc Natl Acad Sci U S A. 110 (44), E4152-E4159 (2013).
- Watanabe, L. P., Riddle, N. C. Characterization of the Rotating Exercise Quantification System (REQS), a novel Drosophila exercise quantification apparatus. PLoS One. 12 (10), e0185090 (2017).
- Reed, L. K., et al. Genotype-by-diet interactions drive metabolic phenotype variation in Drosophila melanogaster. Genetics. 185 (3), 1009-1019 (2010).
- Bartholomew, N. R., Burdett, J. M., VandenBrooks, J. M., Quinlan, M. C., Call, G. B. Impaired climbing and flight behaviour in Drosophila melanogaster following carbon dioxide anaesthesia. Sci Rep. 5, 15298 (2015).
- Huang, W., et al. Natural variation in genome architecture among 205 Drosophila melanogaster Genetic Reference Panel lines. Genome Res. 24 (7), 1193-1208 (2014).
- Mackay, T. F., et al. The Drosophila melanogaster Genetic Reference Panel. Nature. 482 (7384), 173-178 (2012).
- Berlandi, J., et al. Swing Boat: Inducing and recording locomotor activity in a Drosophila melanogaster model of Alzheimer's disease. Front Behav Neurosci. 11, 159 (2017).
- Faville, R., Kottler, B., Goodhill, G. J., Shaw, P. J., van Swinderen, B. How deeply does your mutant sleep? Probing arousal to better understand sleep defects in Drosophila. Sci Rep. 5, 8454 (2015).
