Waiting
Login processing...

Trial ends in Request Full Access Tell Your Colleague About Jove
Click here for the English version

Chemistry

Çocuklar hastalık biyomarker keşif için derlemeden nefes

Published: February 14, 2019 doi: 10.3791/59217

Summary

Bu iletişim kuralı nefes örnekleri çocuklardan edinimi için basit bir yöntem açıklanır. Kısaca, karma hava örnekleri jelleştirici tüpler önce gaz kromatografi-kütle spektrometresi analiz öncesi yoğunlaşmıştır. Nefes biyolojik bulaşıcı ve bulaşıcı olmayan hastalıkların bu nefes toplama yöntemi kullanılarak belirlenebilir.

Abstract

Nefes toplama ve analiz uçucu biyolojik sıtma, tüberküloz, akciğer kanseri ve karaciğer hastalığı. gibi bulaşıcı ve bulaşıcı olmayan hastalıkların bir dizi keşfetmek için kullanılabilir Bu iletişim kuralı nefes çocuklarda örnekleme ve nefes örnekleri gaz kromatografi-kütle spektrometresi (GC-MS) ile daha fazla çözümleme için sabitleme bir tekrarlanabilir yöntemler açıklanmıştır. Bu yöntem nefes örnekleri 4-15 yaş arası çocuklardan daha fazla kimyasal analiz edinimi için standart bir protokol oluşturmak için hedeftir. İlk olarak, nefes 3 L torbasına bağlı 2-yollu vana bağlı bir karton ağızlık kullanarak örneklenir. Nefes analitler sonra bir termal desorpsiyon tüp transfer ve analiz kadar 4-5 ° C'de depolanan. Bu teknik daha önce çocukların başarılı nefes biyomarker tanımlama için sıtma ile nefes yakalamak için kullanılmıştır. Daha sonra başarıyla bu teknik için ek Pediatrik tabur uyguladınız. Bu yöntemin avantajı bu (Pediatrik nüfus belirli değerinin) hasta kısmında en az işbirliği gerektirir, bir kısa toplama süresi vardır, eğitimli personel gerektirmez ve taşınabilir ekipman ile yapılabilir olmasıdır Kaynak sınırlı alan ayarları.

Introduction

Biyolojik klinik olarak tanımlanabilir hastalık katkıda normal ve patolojik biyolojik süreçleri hakkında değerli bilgiler yol açabilir. Son zamanlarda, nefes tenler değerlendirme hastalık durumlarında, enfeksiyon, metabolik bozukluklar ve kanser 1de dahil olmak üzere çeşitli biyolojik olarak artan ilgi olmuştur. Dışarı solunan nefes ölçülebilir düzeyde uçucu organik bileşikler (VOC), yarı uçucu organik bileşikler ve microbially türetilen malzeme (örneğin, bakteri ve virüs nükleik asitler) içerir. Dışarı solunan nefes analiz merkezi olmayan invaziv bir sağlık sorunu ve/veya çevresel pozlama durumunu bir anlayış kazanmak için hedeftir. Toplama ve faiz bileşenlerinin bağlı olarak dışarı solunan nefes analiz etmek için çeşitli yöntemler vardır. Şu anda sonuçlarının karşılaştırmalı analizi çalışmaları arasında olmak zordur hiçbir standart dışarı solunan nefes toplama yöntemi yoktur. Örnekleme yordamı nefes analizleri, aşağı akım sonucunu üzerinde önemli bir etkisi gibi nefes koleksiyonu yordamlar standartlaştırılması, önemlidir.

Birçok çalışma içinde geç solunum nefes örnekleme istihdam2,3' tür. Bu örnekleme tercihen hava nefes döngüsü sonunda yakalamak için dışarı solunan nefes ("dead space"), ilk bölümünü atarak içerir. Bu strateji avantajı o eksojen VOC (örneğin, çevresel UOB'ler), düzeyleri en aza indirir endojen, hastanın özel UOB'ler zenginleştirici olduğunu. Bu yöntem tek bir nefes örnek toplama önce soluk verme ilk birkaç saniye dışarıda bırakır. Diğer araştırmacılar örnekleme sona erme4,5önceden tanımlanmış bir aşaması sırasında etkinleştirmek için bir basınç sensörü istihdam. Basınç sensörleri karmaşık mühendislik gerektirdiğinden, bu alternatif yöntemi bir adanmış ve oldukça pahalı örnekleme aygıtı gerektirir.

Pediatrik nefes örnekleme özellikle zor olabilir. Küçük çocuklar için "dead space" hava gönüllü soluk verme iletişim kuralları ile işbirliği açamayabilirsiniz bir anahtar husustur. Bu nedenle, çocuklar karışık solunum nefes almak daha kolaydır. Ancak, karışık solunum nefes örnekleri ile büyük bir ihtar çevre ve malzeme bulaşma riskinin olduğunu. Bu nedenle, Pediatrik koleksiyonu fizibilite alanında sürüş bir husustur.

Buna ek olarak, toplama yöntemleri, nefes örnekleri depolanmasını da örnek kalite etkileyebilir. Yüksek nem nefes exhalate ve uçucu organik nefes bileşikler olun nefes örnekleri için depolama6,7ile ilgili sorunlar özellikle duyarlı Ultra düşük konsantrasyonlarda (parça başına trilyon). Proton transferi tepki-kütle spektrometresi (PTR-MS) gibi gerçek zamanlı teknikleri potansiyelini rağmen GC-MS analiz nefes örnekleri için altın standart kalır. GC-MS analiz nefes örnekleri çevrimdışı bir teknik olduğu için termal desorpsiyon (TD) tüpler, katı faz mikro-ekstraksiyon ve iğne tuzak aygıtları gibi yöntemleri öncesi konsantrasyonu ile birleştiğinde. Öncesi konsantrasyonu önce nefes örnekleri polimer çanta8' geçici olarak depolanması gerekir. Polimer çanta onların orta fiyat, nispeten iyi dayanıklılık ve yeniden kullanılabilirliği nedeniyle popülerdir. Çantaları tekrar kullanılabilir olsa da, zaman ve çaba verimli temizlik7,8sağlamak için gereklidir. Her belirli torbası türü aynı zamanda kalite kontrolü, yeniden kullanılabilirliği ve kurtarma için ampirik olarak kararlı ve standart yordamlar gerektirir.

Çünkü onlar çok sayıda tenler yakalamak ve özelleştirilebilir TD tüpler nefes öncesi konsantrasyonu için yaygın olarak kullanılır. TD tüpler ambalaj için kullanılır emici malzeme belirli uygulamalar ve ilgi belirli hedef tenler için adapte olabilir. TD tüpler önemli ölçüde nefes biyomarker çalışmaları, özellikle uzak alan siteleri kolaylığı geliştirmek, TD güvenli bir şekilde tüpler çünkü nefes tenler en az iki haftadır depolamak ve taşıma3için kolaydır.

Bir çaba Pediatrik nefes koleksiyonu biyomarker keşif için standart hale getirmek için burada nefes genç çocuklar toplamak için basit bir yöntem açıklanmaktadır. Uygulanan protokoller temsilcisi sonuçlarını göstermek için de-tanımlanan veri çocuk (8-17 yaş) bir devam kohort sunulmaktadır değerlendirme için alkolsüz yağ asidi karaciğer hastalığı (NAFLD) geçiyor. Tam sonuçlar ve analiz bu çalışmanın sonraki yayınında rapor edilecektir. Bu çalışmada, uygulama bizim iletişim kuralı göstermek için veri alt kümesini rapor. Kısacası, çocuklar normalde ağızlık bir polimer torbaya nefes için "bir balon üfleme sanki." talimat verilen İşlem 2 - 4 kez 1 L nefes toplanan kadar yinelenir. Örnek sonra TD tüp içine transfer ve GC-MS analiz önce 5 ° C'de depolanan.

Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.

Protocol

Çalışma kurumsal İnceleme Kurulu, Washington Üniversitesi Tıp Fakültesi tarafından (#201709030) onayladı. Aydınlatılmış onam bir ebeveyn veya vasi dahil çalışmada önce üzerinden elde edildi. Şekil 2 fotoğraflarda yazılı bilinçli ebeveyn izni ile yayınlanmıştır.

1. nefes örnekleyici derleme

  1. Tek kullanımlık eldiven kullanarak, karton bir ağızlık nefes örnekleyici için tamamlayıcı Şekil 1' de gösterildiği gibi ekleyin. Büyük çaplı boru kısa bir süre nefes sampler, diğer uç için Tamamlayıcı Şekil 1' de gösterildiği gibi ekleyin. Yeni boru her hasta için kullanın.
  2. Nefes bağlayıcı çanta vana ile tüp takın. Bkz. Şekil 1 nefes örnekleyici ve bağlı çanta fotoğrafı için.
  3. Tırtıllı kelebek vidasını saat yönünün tersine Vana kilidini açmak için uygun giriş tarafında açmak ve örnekleme için uygun giriş açmak için aşağı, kök çanta Vana itmek.
  4. Vana açık, Tırtıllı kelebek vidasını saat yönünde uygun giriş tarafında çevirerek kilitleyin.
  5. Mavi kapak nefes örnekleyici üzerinde açık olduğundan emin olun (bağlayıcı ile paralel).
  6. Hasta kimliği, tarih ve saat polimer çanta etiketini yazın.
  7. Koşul TD jelleştirici tüp nefes koleksiyonu kullanmadan önce yordamları (bireysel üreticilerin mevcut) önerilir. Kap ve nefes toplama eserler en aza indirmek için önce 4-5 ° c termal desorpsiyon tüpler depolamak.

2. nefes koleksiyonu

  1. Nefes soluk çocuk için bir gösteri (bir çanta) nefes örnekleyiciyi kullanarak gerçekleştirin. Sanki "ne zaman"bir balon kadar üfleme yapmak ve onlar rahat olabildiğince uzağa nefes devam onlar nefes ki çocuk için açıklamak. Dudakların arasında karton ağızlık koymak ve olabildiğince uzağa verin.
  2. Çocuk bir çanta için bağlı yeni bir nefes örnekleyici sağlamak ve gösteri olduğu gibi nefes Şekil 2' de gösterildiği gibi isteyin.
  3. En kısa zamanda çocuk nefes tamamladı nefes örnekleyici cihazın üzerindeki mavi Vanayı kapat. Vana önce ek egzoz gerektiği gibi yeniden açın.
  4. Toplanan nefes en az 1 litre kadar 2.2 ve 2.3 tekrarlayın. Sağlıklı bir çocuk için bu 2 egzoz, alabilir ve bir hasta ya da genç çocuk 2 – 4 egzoz için. Nefes 1 litre minimum analitik gereksinimi var. Çanta etiketinde kaç nefes hastadan toplanmıştır unutmayın. Çanta nefes farklı birimleri içeren bir fotoğraf için bkz: ek Şekil 2 .
  5. Önce nefes örnekleyici çantasından ayırma, saat yönünün tersine çevirerek uygun giriş tarafında Tırtıllı kelebek vidasını gevşetin emin olun ve kök Vana yakın giriş uyan kadar itin. Açık ve kapalı konumda çanta kapak fotoğrafı için Tamamlayıcı şekil 3 bakın.
  6. Tırtıllı kelebek vidasını saat yönünde uygun giriş tarafında kapatarak kapalı çanta Vana kilitleyin.
  7. Nefes örnekleyici çantasından bağlantısını kesin.
  8. Ağızlık elden ve farklı bir hasta ile kullanmak önce temizlik için nefes örnekleyici bir kenara.

3. nefes transfer termal desorpsiyon tüpler için

  1. TD tüp buzdolabından çıkarın. Uzun süreli depolama kapaklar kapatma/sürdürdük üretici tarafından sağlanan tüp aracını kullanarak jelleştirici tüp kaldırın.
  2. Yivli sonuna TD jelleştirici tüp boru kullanarak örnekleme çanta eklemek. Not tüp yönelimi önemli, TD tüpler yivli sondan başlayarak yalnızca bir yönde, akan hava almak tasarlanmıştır. TD için çantasından nefes transferini nefes koleksiyonu 1 saat içinde yapılması gerektiğini unutmayın.
  3. Bir pompa bağlı tüp TD tüp diğer ucunu bağlayın.
  4. Pompa açmak ve 100 mL/dk 10 min için çalışacak şekilde ayarlayın.
  5. Çanta üzerinde vana giriş uyan tarafında Tırtıllı kelebek vidasını saat yönünün tersine çevirerek açmak ve Vana kök açık giriş uyan aşağı itin. Bu nefes transfer bir pompa kullanarak bir TD jelleştirici tüp içine gösteren ek Şekil 4, gösterilmiştir.
  6. Koleksiyon 10 dakika sonra durur pompa başlatın.
  7. TD jelleştirici tüpü çıkarması ve kapaklar kapatma/sürdürdük tüp aracını kullanarak her iki ucu üzerine sıkın. Uzun süreli depolama kapaklar sıkıca bir sızıntı geçirmez sızdırmazlık sağlamak için sıkılır gerekir.
  8. Bir etiket tüp kullanılan belirtmek için bir kap ucuna yerleştirin. Etikette, hasta çalışma kimliği (ID) numarası ve tarihi gösterir.
  9. Tüp küçük bir yeniden yapışmalı plastik torbaya koyun. 4-5 ° C'de jelleştirici tüp depolamak Nefes kalan çantadan basın ve çanta atın. Kayıt hasta çalışma kimliği, TD tüp seri numarası, koleksiyon gün, zaman nefes koleksiyonunun, zaman nefes transfer ve gıda alımı (zaman önce nefes koleksiyonu ve tüketilen yemek Gıda alımının).

4. ortam havası koleksiyonu

  1. Hastanın çevre ortam havası örneklerinde hemen nefes toplandıktan sonra toplamak.
    1. Çantayı pompa çıkış bağlantı noktasına kablo kanalları, kullanarak ek Şekil 5' te gösterildiği gibi bağlayın.
    2. Çanta Vana kök açık giriş uyan örnekleme için aşağı itin.
    3. Vana açık yan tarafındaki giriş uyan Tırtıllı kelebek vidasını saat yönünde çevirerek kilitleyin.
  2. Pompa açmak ve 100 mL/dk 12 dk için çalışacak şekilde ayarlayın. Pompa ortam havası 1200 mL toplayacaktır.
  3. İstenen birimin topladıktan sonra saat yönünün tersine çevirerek uygun giriş tarafında Tırtıllı kelebek vidasını gevşetin ve kök Vana yakın giriş uyan kadar itin.
  4. Giriş uyan tarafında Tırtıllı kelebek vidasını saat yönünde çevirerek kapalı çanta Vana kilitleyin.
  5. Pompa çantasından bağlantısını kesin.
  6. Bölüm 3 olduğu gibi aynı adımları izleyin. Tek fark UOB'ler aktarılır, bu ortam havası değil bu nefes olduğunu.

5. örnek ve veri analizi

Not: Nefes ve hava örnekleri analiz için koşullar olmuştur daha önce açıklanan9.

  1. Toplanan verileri çözümlemek ve bileşikleri chromatograms içinde algılamak. Tipik yazılım programları bulmak ve enstrüman (Şekil 3A) tarafından algılanan tüm bileşenleri tanımlamak için kullanın. Örneğin, bileşikler belirlemek için deconvolution özelliğini kullanın. 80 saklama pencere boyutu faktörü kullanarak veriye filtre uygulamak, kitle heights filtreler ≥100 sayar ve mutlak bölge filtre ≥500 sayar.
  2. Kimlik bileşikleri kimyasal standartlarına nefes ve hava örnekleri kullanın. Temel iyon pik alanı izopren ve β-pinene (Şekil 4) gibi ilgi bileşiklerin ayıklamak ve nefes ve hava tenler düzeyleri karşılaştırın.

Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.

Representative Results

Bizim çalışmada, St. Louis çocuk hastanesinde değerlendirme örnekleri 10 çocuk (8-17 yaş arası) toplanan nefes geçiyor. Nefes örnekleri ve ortam havası örnekleri (n = 10) yukarıda açıklandığı gibi toplanmıştır. Örnekleri gaz kromatografi quadrupole uçuş zaman kütle spektrometresi (GC-QToF-MS) ve termal desorpsiyon, yukarıda açıklanan9olarak kullanarak analiz edildi. Arka plan kirletici çıkarıldıktan sonra uygulanan protokoller 311 uçucu organik bileşikler (VOC) ortalama her karışık dışarı solunan nefes örnekleri vermiştir. Ortalama olarak, önemli ölçüde daha fazla UOB'ler ortam/çevresel kontrollere göre nefes örneklerinde bulunmuştur (311 ± 11,5 190 ± 12.6, karşı p < 0.0001) (Şekil 3A). Nefes ortam havası için karşılaştırıldığında, artan UOB'ler sayısında gözle görülür temsilcisi toplam iyon chromatograms (tikler) (Şekil 3B) karşılaştırarak ayırt edilirler.

Başarılı nefes koleksiyonu kalite kontrol ölçüsü olarak oda hava denetimlere (Şekil 4) iki ortak nefes UOB'ler (izopren ve β-pinene) düzeyleri karşılaştırıldı. β-pinene alt-App düzeyleri (0,59 App)6' bulunur iken yapılır, soluk, en bol UOB'ler normalde milyar başına parçalar (App) düzeyleri (131 App) bulunur. Her iki nefeste bu analitler nefes6birincil kaynağı olarak normal fizyolojik süreçleri gösterir Oda hava mevcut düzeyi düşük ile karşılaştırıldığında sağlıklı yetişkinlerin zenginleştirilmiş iyi kurulmuş bileşiklerdir. İzoprenin (m/z 67) bulundu saklama zaman 2,12 dk. ve β-pinene (m/z 93) saklama bulundu 14.4 dk zaman. Biz izopren bolluk (Şekil 4; ortalama bereket ± SEM 4.2x105 ± 1.0x105 ve 3.9x104 ± 0.9x104 nefes ve hava vardır oda hava denetimlerde Pediatrik nefes örnekte 10 kat daha yüksek olduğunu bulmak sırasıyla, p = 0,0003) ve β-Pinene sergilenen 3 kat daha yüksek bolluk içinde nefes Hava daha (bereket ± SEM 3.0x104 ± 1.3x104 9.1x103 ± 1.6x10 ve3 nefes ve hava için sırasıyla, demek p = 0,007 başarılı nefes koleksiyonu onaylayan). Bu çalışmada elde biyomarker keşif bulguları tam açıklayıcı analiz gelecek yayında rapor edilecektir.

Figure 1
Şekil 1: monte nefes örnekleyici ve çanta dışarı solunan nefes koleksiyonu için. Nefes örnekleyici (ile mavi kapak açık, yani, bağlayıcı ile çift taraflı kırmızı okla gösterilen paralel) ve çanta bağlı kablo kanalları, nefes koleksiyonu için hazır ile. Bu rakam daha büyük bir versiyonunu görüntülemek için buraya tıklayınız.

Figure 2
Resim 2: bir nefes örnekleme torbaya nefes exhaling çocuk. (A)çocuk tutan nefes sampler, nefes verir, ve (B), torbaya nefes örnek sağlar. İzni ile fotoğraf. Bu rakam daha büyük bir versiyonunu görüntülemek için buraya tıklayınız.

Figure 3
Şekil 3: BreathVolatiles ekshale. Her nefeste farklı uçucu bileşikler(a)sayısı örnek Pediatrik konular (n = 10) ve ortam havası denetimleri (n = 10). Görüntülenen anlamına gelir ve standart hata ortalamaya (SEM) vardır. (B) Toplam iyon Kromatograf (TIC) temsilcisi Pediatrik nefes örnekleri karşı hava kontrolü, görselleştirme için. Bu rakam daha büyük bir versiyonunu görüntülemek için buraya tıklayınız.

Figure 4
Şekil 4: iki dışarı solunan nefes tenler zenginliği. Bereket izopren ve β-pinene nefeste örnekleri Pediatrik konular (n = 10) ve oda hava denetimleri (n = 10). Bereket temel iyon en yüksek bölgelere göre sayılabilir. Demek ve SEM gösterilir. Bu rakam daha büyük bir versiyonunu görüntülemek için buraya tıklayınız.

Tamamlayıcı Şekil 1: nefes örnekleyici. Sol: A) monte nefes örnekleyici: 1) erkek adaptör + 2) iki yönlü küresel vana bağlayıcı + 3) Teflon erkek adaptör. B) karton ağızlık. C) küçük ve büyük çaplı boru. Sağ: nefes örnekleyici ile ağızlık ve tüp takılı. Bu dosyayı indirmek için buraya tıklayınız.

Tamamlayıcı Şekil 2: farklı nefes birimleri. Yukarıda bir örnekleme çanta resimleri tahsil edilecek yaklaşık nefes birimleri görsel bir temsilini hava (1 L, 2 L ve 2.5 L), farklı birimleri ile doldurulur. Bu dosyayı indirmek için buraya tıklayınız.

Tamamlayıcı şekil 3: çanta üzerinde Vana. Sol: kök Vana olduğunu aşağı (çanta Vana açıktır). Giriş uyan tarafında Tırtıllı kelebek vidasını saat yönünde çevirerek kapalı çanta Vana kilitleyin. Çanta nefes koleksiyonu için hazırdır. Sağ: kök Vana kalmış (çanta Vana kapalı). Bu dosyayı indirmek için buraya tıklayınız.

Tamamlayıcı Şekil 4: nefes transfer. Sol: jelleştirici tüp (1) bağlı bir amaçla küçük ve büyük çaplı boru kullanarak çanta ve karşı taraftaki pompa. Sağ: Not yivli ucunda jelleştirici tüp; Yivli son örnekleme çanta doğru işaret etmelidir. Bu dosyayı indirmek için buraya tıklayınız.

Tamamlayıcı Şekil 5: ortam havası koleksiyonu. Sol: pompa ile iki liman: giriş ve çıkış. Çıkış bağlantı noktası örnekleme çanta için eklenir. Giriş bağlantı noktası ortam havası çizmek ve çanta için transfer. Sağ: ortam havası toplama sistemi monte. Bu dosyayı indirmek için buraya tıklayınız.

Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.

Discussion

Nefes araştırma son on yılda önemli ilerlemeye rağmen örnekleme ve nefes gaz tenler analizi için standartlaştırılmış yöntemler tanımsız10kalır. Bu standardizasyon eksikliği başlıca nedeni elde edilen kimyasal çeşitlilik herhangi bir verilen dışarı solunan nefes örnek mevcut üzerinde doğrudan etkisi nefes toplama yöntemleri çeşitliliği oldu. Nefes exhalate son derece çeşitli konsantrasyonlarda6uçucu organik bileşikler geniş bir yelpazede içerir. Bu nedenle, toplama yöntemleri değiştirme hem de belirli bir örnek mevcut olabilir bileşikler çeşitliliği bereket değiştirir.

Nefes gaz şaşırtıcı karmaşık örnektir. Konular sadece bir nefes toplayıcı ağızlık veya analiz önce gaz geçirmez bir kap içine nefes gerekir iken, nefes örnekleme dikkate almalı ve denetim için potansiyel değişken bir numara. Bu çalışmada, belirli, doğrulanan iletişim kuralı nefes gaz örnekleme çocuklarda için ayrıntı. Biz daha önce başarıyla bu protokole febril olarak alanı senaryosunda bir kaynak sınırlı ortamda (Malavi), 4 yaşındaki genç olarak biyomarker için nefes toplama ve analiz boru hatları fizibilite gösteren çocuklar ile hayata geçirdik keşif9. Daha sonra Ayrıca uygulanan ve Protokolümüze nefes örnekleri bir modern Pediatrik Yandal klinik Amerika Birleşik Devletleri'nde değerlendirilmesinde altındaki çocuklardan toplanması için değerlendirilir. Bizim sonuçları gerçek bir "breathprint" belirli bir bireyin sağladığından Pediatrik nefes biyolojik keşfi için karma hava topluluğu kritik, olduğunu göstermektedir. Çünkü dışarı solunan hava (ağız ve burun kemiği) tüm aşamalarında alınan3Ayrıca, karışık ekspiratuar nefes de en basit elde edilebilir, nefes türüdür.

Alanda ve özellikle konular bu-ebilmek var olmak zor-e doğru kontrol için diyet, vücut ısısı ve/veya koku veya belirli bir konuya göre krem kullanımı gibi ortak kaynaklanan akut hasta olduğunda. Bu faktörler nefes düzeyleri ve kalitesi üzerinde derin bir etkisi olabilir. Bu nedenle, biz müfettişler sadece nefes toplama ve transferi jelleştirici tüpler için zamanını kaydetmek, ama da için diyet (örneğin, 24 saatlik diyet hatırlama), gargara kullanımı ve ilaç kullanımı, gibi ek hastaya özgü faktörler Not tavsiye Özellikle bu potansiyel confounders etkileri için biyomarker keşif ve aşağı akım analizleri sırasında değerlendirin.

Ortam havadan inhale bileşikler de nefes biyomarker bulma çabaları için bir meydan okuma oluşturabilecek dışarı solunan nefes bileşimi etkileyebilir. Bu nedenle, çözümleme ve ortam havası topluluğu dışarı solunan nefes tenler kökeni ile ilgili önemli bilgiler verimli bir kritik kontrol olduğunu. Örneğin, ortam havası uçucu profiller uçucu belirli bir nefes, nefes Hava11çevreleyen kıyasla daha yüksek veya düşük bol bol olup kurmak için kullanılmaktadır. Belirli nefes bileşik böylece gösterirken düşük konsantrasyon nefes bu bileşik çevreden elde edildi konsantrasyon ortam havası, bir nefes yüksek ise (örneğin, endojen kökenli) vücudun içinde türetilen kabul edilir (örneğin, eksojen kökenli). Uçucu bolluk içinde nefes ortam havası karşı karşılaştırarak ayrıca nefes koleksiyonu yeterli olup olmadığı için önemli bir pozitif kontrol olarak hizmet vermektedir. Bizim temsilcisi verileri (Şekil 4) gösterildiği gibi uçucu bileşik izopren endojen kökenlidir ve nefes örneklerinde konsantrasyonlarda bulunması gereken > 10 kat olan ortam hava6.

Öyle ki desenler gibi makine öğrenimi ve çok değişkenli istatistiksel teknikler kullanılarak belirlenebilir biyomarker bulma için uçucu profiller bireylerin ilgi koşullarla eşleşen sağlıklı kontrol kişiler için karşılaştırılmak gerekir analizleri12. Burada anlatılan nefes toplama yöntemi patolojik devletler geniş bir uygulanabilir; Tek gereksinim çocuk nefes ile gönüllü olarak örnekleme işbirliği yapabiliyor olmasıdır. Çünkü nefes testi kolayca tekrarlanan, non-invaziv, ve biyolojik maddeler arteryel konsantrasyonları en benzer biçimde yansıtan, bakım noktası klinik kullanım için test uygulanması için büyük söz sahibidir.

Gelecekteki çalışma nefes koleksiyonunda genç bebek ve çocuklarda (< 4 yıl yaş), gelişimsel olarak komutunda nefes edemiyoruz için yeni yöntemler geliştirilmesi üzerinde durulacak.

Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.

Disclosures

Yazarlar ifşa gerek yok.

Acknowledgments

Biz çocuklar ve ailelerinin katıldığı bu çalışmada St Louis Çocuk Hastanesi için minnettarlığımızı ifade. Bayan Stacy Postma ve Bayan Janet Sokolich benzersiz çabaları sırasında nefes koleksiyonu anıyoruz. Bu eser St. Louis Çocuk Hastanesi Vakfı tarafından desteklenmektedir.

Materials

Name Company Catalog Number Comments
Breath bag  SKC 237-03 These are 3 L bags
Cardboard mouthpiece  A-M systems 161902 0.86" OD, 2.00" L
Large diameter tubing Cole Parmer 95802-11 Silicone Tubing, 1/4"ID x 5/16"OD,
Long-term storage caps  Markes International C-CF010 Brass storage cap ¼" & PTFE ferrule, pk 10
Male adapter Charlotte Pipe 2109 Part 1/3 of breath connector (1/2" Universal part No. 436-005)
Male adapter (made from Teflon) In-house built Part 3/3 of breath connector (1/4" ID x 1/2" MIP). This part was specially machined from rods made from virgin Teflon
Pump SKC 220-1000TC-C Pocket PumpTouch with Charger
Small diameter tubing  Supelco 20533 Teflon tubing  L × O.D. × I.D. 25 ft × 1/4 in. (6.35 mm) × 0.228 in. (5.8 mm) 
Thermal desorption tubes  Markes International C2-CAXX-5314 Tube, inert, TnxTA/Sulficarb, cond/cap, pk 10
Tube capping/uncapping tool Markes International C-CPLOK
Two-way ball valve connector  Homewerks Worldwide VBV-P40-E3B Part 2/3 of breath connector (1/2")

DOWNLOAD MATERIALS LIST

References

  1. Ahmed, W. M., Lawal, O., Nilsen, T. M., Goodacre, R., Fowler, S. J. Exhaled volatile organic compounds of infection: a systematic review. ACS Infectious Diseases. 3 (10), 695-710 (2017).
  2. Berna, A. Z., et al. Analysis of breath specimens for biomarkers of Plasmodium falciparum infection. Journal of Infectious Diseases. 212 (7), 1120-1128 (2015).
  3. Lawal, O., Ahmed, W. M., Nijsen, T. M. E., Goodacre, R., Fowler, S. J. Exhaled breath analysis: a review of 'breath-taking' methods for off-line analysis. Metabolomics. 13 (10), (2017).
  4. Kang, S., Thomas, C. L. P. How long may a breath sample be stored for at-80 degrees C? A study of the stability of volatile organic compounds trapped onto a mixed Tenax:Carbograph trap adsorbent bed from exhaled breath. Journal of Breath Research. 10 (2), (2016).
  5. Basanta, M., et al. Non-invasive metabolomic analysis of breath using differential mobility spectrometry in patients with chronic obstructive pulmonary disease and healthy smokers. Analyst. 135 (2), 315-320 (2010).
  6. Mochalski, P., et al. Blood and breath levels of selected volatile organic compounds in healthy volunteers. Analyst. 138 (7), 2134-2145 (2013).
  7. Mochalski, P., Wzorek, B., Sliwka, I., Amann, A. Suitability of different polymer bags for storage of volatile sulphur compounds relevant to breath analysis. Journal of Chromatography B-Analytical Technologies in the Biomedical and Life Sciences. 877 (3), 189-196 (2009).
  8. Mochalski, P., King, J., Unterkofler, K., Amann, A. Stability of selected volatile breath constituents in Tedlar, Kynar and Flexfilm sampling bags. Analyst. 138 (5), 1405-1418 (2013).
  9. Schaber, C., et al. Breathprinting reveals malaria-associated biomarkers and mosquito attractants. Journal of Infectious Diseases. 217 (10), 1553-1560 (2018).
  10. Herbig, J., Beauchamp, J. Towards standardization in the analysis of breath gas volatiles. Journal of Breath Research. 8 (3), (2014).
  11. Phillips, M., et al. Variation in volatile organic compounds in the breath of normal humans. Journal of Chromatography B. 729 (1-2), 75-88 (1999).
  12. Eckel, S. P., Baumbach, J., Hauschild, A. C. On the importance of statistics in breath analysis-hope or curse? Journal of Breath Research. 8 (1), (2014).

Tags

Kimya sayı: 144 nefes Pediatrik toplama çocuk gaz kromatografi kütle spektrometresi termal desorber tüpler biyomarker hastalıklar
Çocuklar hastalık biyomarker keşif için derlemeden nefes
Play Video
PDF DOI DOWNLOAD MATERIALS LIST

Cite this Article

Berna, A. Z., DeBosch, B., Stoll,More

Berna, A. Z., DeBosch, B., Stoll, J., Odom John, A. R. Breath Collection from Children for Disease Biomarker Discovery. J. Vis. Exp. (144), e59217, doi:10.3791/59217 (2019).

Less
Copy Citation Download Citation Reprints and Permissions
View Video

Get cutting-edge science videos from JoVE sent straight to your inbox every month.

Waiting X
Simple Hit Counter