Name: Mezoskopik Tüm Hücreli Beyin Haritalama İçin Taramalı Elektron Mikroskopi Uyumlu Optik Görüntüleme Yöntemi (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2026-02-20T13:10:00.000+00:00
Duration: 9 min 40 s
Description: Öğrenin, OMLIT ile mezoskopik ölçekte beyin dokularındaki tüm hücreleri önyargısız görüntüleme yöntemini. Tarama elektron mikroskopisi ile entegre edilen bu teknik, sinirbilim araştırmalarında kapsamlı bağlantı haritaları oluşturur.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

<ol><li>Economo, M. N., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+platform+for+brain-wide+imaging+and+reconstruction+of+individual+neurons%5BTitle%5D)+AND+%22eLife%22%5BJournal%5D)">A platform for brain-wide imaging and reconstruction of individual neurons.</a> eLife. 5, e10566(2016).</li>
<li>Gong, H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Continuously+tracing+brain-wide+long-distance+axonal+projections+in+mice+at+a+one-micron+voxel+resolution%5BTitle%5D)+AND+%22Neuroimage%22%5BJournal%5D)">Continuously tracing brain-wide long-distance axonal projections in mice at a one-micron voxel resolution.</a> Neuroimage. 74, 87-98 (2013).</li>
<li>Zheng, T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Visualization+of+brain+circuits+using+two-photon+fluorescence+micro-optical+sectioning+tomography%5BTitle%5D)+AND+%22Opt+Express%22%5BJournal%5D)">Visualization of brain circuits using two-photon fluorescence micro-optical sectioning tomography.</a> Opt Express. 21 (8), 9839(2013).</li>
<li>Lin, R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Cell-type-specific+and+projection-specific+brain-wide+reconstruction+of+single+neurons%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Methods%22%5BJournal%5D)">Cell-type-specific and projection-specific brain-wide reconstruction of single neurons.</a> Nat Methods. 15 (12), 1033-1036 (2018).</li>
<li>Wang, H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Scalable+volumetric+imaging+for+ultrahigh-speed+brain+mapping+at+synaptic+resolution%5BTitle%5D)+AND+%22Natl+Sci+Rev%22%5BJournal%5D)">Scalable volumetric imaging for ultrahigh-speed brain mapping at synaptic resolution.</a> Natl Sci Rev. 6 (5), 982-992 (2019).</li>
<li>Yao, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((High-speed+label-free+functional+photoacoustic+microscopy+of+mouse+brain+in+action%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Methods%22%5BJournal%5D)">High-speed label-free functional photoacoustic microscopy of mouse brain in action.</a> Nat Methods. 12 (5), 407-410 (2015).</li>
<li>Li, X., Kang, L., Zhang, Y., Wong, T. T. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((High-speed+label-free+ultraviolet+photoacoustic+microscopy+for+histology-like+imaging+of+unprocessed+biological+tissues%5BTitle%5D)+AND+%22Opt+Lett%22%5BJournal%5D)">High-speed label-free ultraviolet photoacoustic microscopy for histology-like imaging of unprocessed biological tissues.</a> Opt Lett. 45 (19), 5401(2020).</li>
<li>Kut, C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Detection+of+human+brain+cancer+infiltration+ex+vivo+and+in+vivo+using+quantitative+optical+coherence+tomography%5BTitle%5D)+AND+%22Sci+Transl+Med%22%5BJournal%5D)">Detection of human brain cancer infiltration ex vivo and in vivo using quantitative optical coherence tomography.</a> Sci Transl Med. 7 (292), (2015).</li>
<li>Hu, C., Popescu, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Quantitative+phase+imaging+%28QPI%29+in+neuroscience%5BTitle%5D)+AND+%22IEEE+J+Sel+Top+Quantum+Electron%22%5BJournal%5D)">Quantitative phase imaging (QPI) in neuroscience.</a> IEEE J Sel Top Quantum Electron. 25 (1), 1-9 (2019).</li>
<li>Denk, W., Horstmann, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Serial+block-face+scanning+electron+microscopy+to+reconstruct+three-dimensional+tissue+nanostructure%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+Biol%22%5BJournal%5D)">Serial block-face scanning electron microscopy to reconstruct three-dimensional tissue nanostructure.</a> PLoS Biol. 2 (11), e329(2004).</li>
<li>Titze, B., Genoud, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Volume+scanning+electron+microscopy+for+imaging+biological+ultrastructure%5BTitle%5D)+AND+%22Biol+Cell%22%5BJournal%5D)">Volume scanning electron microscopy for imaging biological ultrastructure.</a> Biol Cell. 108 (11), 307-323 (2016).</li>
<li>Heymann, E. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Scent+marking+strategies+of+new+world+primates%5BTitle%5D)+AND+%22Am+J+Primatol%22%5BJournal%5D)">Scent marking strategies of new world primates.</a> Am J Primatol. 68 (6), 650-661 (2006).</li>
<li>Echlin, M. P., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Recent+developments+in+femtosecond+laser-enabled+TriBeam+systems%5BTitle%5D)+AND+%22JOM%22%5BJournal%5D)">Recent developments in femtosecond laser-enabled TriBeam systems.</a> JOM. 73 (12), 4258-4269 (2021).</li>
<li>Randolph, S., Geurts, R., Wang, J., Winiarski, B., Rue, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Femtosecond+laser-enabled+TriBeam+as+a+platform+for+analysis+of+thermally-+and+charge-sensitive+materials%5BTitle%5D)+AND+%22Microsc+Microanal%22%5BJournal%5D)">Femtosecond laser-enabled TriBeam as a platform for analysis of thermally- and charge-sensitive materials.</a> Microsc Microanal. 25 (S2), 352-353 (2019).</li>
<li>Horstmann, H., Körber, C., Sätzler, K., Aydin, D., Kuner, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Serial+section+scanning+electron+microscopy+%28S3EM%29+on+silicon+wafers+for+ultra-structural+volume+imaging+of+cells+and+tissues%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+One%22%5BJournal%5D)">Serial section scanning electron microscopy (S3EM) on silicon wafers for ultra-structural volume imaging of cells and tissues.</a> PLoS One. 7 (4), e35172(2012).</li>
<li>Hayworth, K. J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Imaging+ATUM+ultrathin+section+libraries+with+WaferMapper%3A+A+multi-scale+approach+to+EM+reconstruction+of+neural+circuits%5BTitle%5D)+AND+%22Front+Neural+Circuits%22%5BJournal%5D)">Imaging ATUM ultrathin section libraries with WaferMapper: A multi-scale approach to EM reconstruction of neural circuits.</a> Front Neural Circuits. 8, 68(2014).</li>
<li>Schalek, R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Development+of+high-throughput%2C+high-resolution+3D+reconstruction+of+large-volume+biological+tissue+using+automated+tape+collection+ultramicrotomy+and+scanning+electron+microscopy%5BTitle%5D)+AND+%22Microsc+Microanal%22%5BJournal%5D)">Development of high-throughput, high-resolution 3D reconstruction of large-volume biological tissue using automated tape collection ultramicrotomy and scanning electron microscopy.</a> Microsc Microanal. 17 (S2), 966-967 (2011).</li>
<li>Kasthuri, N., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Saturated+reconstruction+of+a+volume+of+neocortex%5BTitle%5D)+AND+%22Cell%22%5BJournal%5D)">Saturated reconstruction of a volume of neocortex.</a> Cell. 162 (3), 648-661 (2015).</li>
<li>Fu, Z., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((mEosEM+withstands+osmium+staining+and+Epon+embedding+for+super-resolution+CLEM%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Methods%22%5BJournal%5D)">mEosEM withstands osmium staining and Epon embedding for super-resolution CLEM.</a> Nat Methods. 17 (1), 55-58 (2020).</li>
<li>Fan, H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Optical+multilayer+interference+tomography+compatible+with+tape-based+serial+SEM+for+mesoscale+neuroanatomy%5BTitle%5D)+AND+%22ACS+Photonics%22%5BJournal%5D)">Optical multilayer interference tomography compatible with tape-based serial SEM for mesoscale neuroanatomy.</a> ACS Photonics. 9 (1), 25-33 (2022).</li>
<li>Hua, Y., Laserstein, P., Helmstaedter, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Large-volume+en-bloc+staining+for+electron+microscopy-based+connectomics%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Commun%22%5BJournal%5D)">Large-volume en-bloc staining for electron microscopy-based connectomics.</a> Nat Commun. 6 (1), 7923(2015).</li>
<li>Berger, D. R., Seung, H. S., Lichtman, J. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((VAST+%28volume+annotation+and+segmentation+tool%29%3A+Efficient+manual+and+semi-automatic+labeling+of+large+3D+image+stacks%5BTitle%5D)+AND+%22Front+Neural+Circuits%22%5BJournal%5D)">VAST (volume annotation and segmentation tool): Efficient manual and semi-automatic labeling of large 3D image stacks.</a> Front Neural Circuits. 12, 88(2018).</li>
<li>Shannon, C. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+mathematical+theory+of+communication%5BTitle%5D)+AND+%22Bell+Syst+Tech+J%22%5BJournal%5D)">A mathematical theory of communication.</a> Bell Syst Tech J. 27 (3), 379-423 (1948).</li>
<li>Tsai, D. -Y., Lee, Y., Matsuyama, E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Information+entropy+measure+for+evaluation+of+image+quality%5BTitle%5D)+AND+%22J+Digit+Imaging%22%5BJournal%5D)">Information entropy measure for evaluation of image quality.</a> J Digit Imaging. 21 (3), 338-347 (2008).</li>
<li>Wang, T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+convenient+all-cell+optical+imaging+method+compatible+with+serial+SEM+for+brain+mapping%5BTitle%5D)+AND+%22Brain+Sci%22%5BJournal%5D)">A convenient all-cell optical imaging method compatible with serial SEM for brain mapping.</a> Brain Sci. 13 (5), 711(2023).</li>
<li>Kuwajima, M., Mendenhall, J. M., Harris, K. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Large-volume+reconstruction+of+brain+tissue+from+high-resolution+serial+section+images+acquired+by+SEM-based+scanning+transmission+electron+microscopy%5BTitle%5D)+AND+%22Methods+Mol+Biol%22%5BJournal%5D)">Large-volume reconstruction of brain tissue from high-resolution serial section images acquired by SEM-based scanning transmission electron microscopy.</a> Methods Mol Biol. 950, 253-273 (2013).</li>
<li>Kislinger, G., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((ATUM-Tomo%3A+A+multi-scale+approach+to+cellular+ultrastructure+by+combined+volume+scanning+electron+microscopy+and+electron+tomography%5BTitle%5D)+AND+%22eLife%22%5BJournal%5D)">ATUM-Tomo: A multi-scale approach to cellular ultrastructure by combined volume scanning electron microscopy and electron tomography.</a> eLife. 13, e90565(2024).</li>
<li>Böhm, T., Felfer, P., Thiele, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+modular+and+automated+serial+section+collection+system+for+ultramicrotomy+and+subsequent+imaging%5BTitle%5D)+AND+%22Microsc+Microanal%22%5BJournal%5D)">A modular and automated serial section collection system for ultramicrotomy and subsequent imaging.</a> Microsc Microanal. 29 (1), 212-218 (2023).</li>
<li>Wacker, I. U., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Multimodal+hierarchical+imaging+of+serial+sections+for+finding+specific+cellular+targets+within+large+volumes%5BTitle%5D)+AND+%22J+Vis+Exp%22%5BJournal%5D)">Multimodal hierarchical imaging of serial sections for finding specific cellular targets within large volumes.</a> J Vis Exp. (133), e57059(2018).</li>
</ol>

<table><tbody><tr><td>Yapışkan bant</td><td>3M</td><td>B5005094008</td><td>Çift taraflı yapıştırıcı</td></tr><tr><td>Atomik Kuvvet Mikroskobu</td><td>Bruker</td><td>Boyut İkonu</td><td></td></tr><tr><td>Otomatik ultra ince kesitli toplama sistemi&nbsp;</td><td>Lehua</td><td>AutoCUTS II</td><td></td></tr><tr><td>İletken yapışkan bant</td><td>Ted Pella</td><td>FP16084-8</td><td></td></tr><tr><td>Dektak Stylus Profilers</td><td>Bruker</td><td>DektakXT</td><td></td></tr><tr><td>Kesitleme için elmas bıçak</td><td>Diatom</td><td>DUJ3530</td><td>Diatome Jumbo bıçağı</td></tr><tr><td>Kırpma için elmas bıçak</td><td>Diatom</td><td>DTB90</td><td>Cam bıçak</td></tr><tr><td>Elektron mikroskobu</td><td>Zeiss</td><td>MultiSEM505</td><td>Alternatif: GeminiSEM 300, Zeiss</td></tr><tr><td>FIJI (v1.54p, 64-bit)&nbsp;</td><td>Açık kaynak</td><td>https://fiji.sc</td><td></td></tr><tr><td>Cam kesme bıçağı</td><td>Kendi Yapımı</td><td></td><td></td></tr><tr><td>Kurşun Sitrat</td><td>Leica</td><td>T534/2</td><td></td></tr><tr><td>Işık mikroskobu</td><td>Olympus&nbsp;</td><td>VS200</td><td>Alternatif: Axio Imager. A2 Vario, Zeiss</td></tr><tr><td>Işık mikroskobu&nbsp;</td><td>Zeiss</td><td>&nbsp; Axio Imager.A2 Vario</td><td></td></tr><tr><td>Plazma temizleyici</td><td>Yidon Teknolojileri</td><td>Hydro-S4</td><td>Alternatifler: Ted Pella Pelco veya diğer tezgah üstü plazma temizleyici</td></tr><tr><td>Polimer bant</td><td>Melton</td><td>Kapton</td><td>Şirketin web sitesi artık erişilebilir değildir. Araştırmacıların yerel olarak bulunan KAPTON kasetlerini denemelerini öneriyoruz.</td></tr><tr><td>Polimer bant</td><td>Teijin</td><td>PET</td><td>https://www.teijin.com/</td></tr><tr><td>Polimer bant</td><td>Teijin</td><td>D-50</td><td>https://www.teijin.com/</td></tr><tr><td>Silikon wafer</td><td>Saichi</td><td>912303</td><td>Waferin bir tarafı parlatılmış.</td></tr><tr><td>Sputter Coater&nbsp;</td><td>Leica</td><td>ACE600</td><td>Alternatif: Çift kafalı Sputter, Yujie</td></tr><tr><td>Ultramikrotom</td><td>Leica</td><td>UC7</td><td>Alternatif: RMC PT-PC</td></tr><tr><td>Uranylasetat</td><td>EMS</td><td>22400</td><td></td></tr><tr><td>VAST (v1.5.0, 64-bit)</td><td>Howard Hughes Tıp Enstitüsü</td><td>https://software.dvid.io/vast/</td><td>VAST A1:D32Lite, büyük 3D mikroskopik veri setlerinin manuel notasyonu ve segmentasyonu için ücretsiz bir araçtır.</td></tr><tr><td>ZEN yazılımı (v3.2, 64-bit)</td><td>Zeiss</td><td>https://www.zeiss.com/microscopy/zh/products/software/zeiss-zen.html</td><td></td></tr></tbody></table>

mezoskopik tüm hücreli beyin haritalama İçin taramalı elektron mikroskopi uyumlu optik görüntüleme yöntemi

A Scanning Electron Microscopy-Compatible Optical Imaging Method for Mesoscopic All-Cell Brain Mapping

Mezoskopik Tüm Hücreli Beyin Haritalama İçin Taramalı Elektron Mikroskopi Uyumlu Optik Görüntüleme Yöntemi

Understanding the structural and functional relationships within complex neural networks in the brain requires the construction of brain atlases that ...

a-scanning-electron-microscopy-compatible-optical-imaging-method-for

Research

JoVE Journal

Neuroscience

Sinirbilim

Bu protokol, taramalı elektron mikroskobu, reçine gömülü beyin dokusu, odaklanmış iyon demeti üç boyutlu olarak hazırlanmış ve yansıması nasıl açıklamaktadır.

Odaklı İyon Işın Freze ve Beyin Dokusu Taramalı Elektron Mikroskobu

Burada yarı kalın beyin dilimleri görüntü floresan işaretli hücrelerin hızlı ve basit bir yöntem açıklanmaktadır. Sabitleme, dilimleme, beyin dokusu ve optik temizleme standart epifluorescent veya konfokal görüntüleme, sağlam sinir dokusu içinde bireysel hücreleri ve nöral ağların görselleştirmek için nasıl kullanılabileceğini açıklar.

Yarı Kalın Beyin Slices Yüksek Çözünürlük Floresans Görüntüleme Hızlı Bir Yaklaşım

Kaynak: Mukherjee, K., et. al. Beyin Mitokondrilerinin Seri Blok Yüz Taramalı Elektron Mikroskobu Kullanılarak Analizi. J. Vis. Uzm.  (2016)Bu video hazırlığı göstermektedir,  Mitokondriyal üst yapıyı görselleştirmek için bir seri blok yüz taramalı elektron mikroskobu (SBFSEM) kullanarak fare beyin dokusunun görüntülenmesi ve analizi, aksonal ve dendritik nöronal bölmelerdeki morfolojilerinin ve uzamsal dağılımlarının hassas bir şekilde haritalanmasını sağlar.

 Nöronal Mitokondrinin Seri Blok Yüz Taramalı Elektron Mikroskobu Kullanılarak Görüntülenmesi

Bu yazıda yüksek çözünürlüklü, floresan etiketli fare beyinleri ince beyin anatomisi ile, yeniden tam deneysel prosedürü açıklar. Açıklanan protokol numune hazırlama ve temizleme, görüntüleme, veri post-processing ve çok ölçekli görselleştirme için montaj örneği içerir.

Eşodaklı Işık Sac Mikroskobu ile Tüm Fare Brain mikron çaplı Çözünürlük Optik Tomografi

Memeli beyin dokusundan mitokondriyal görselleştirme ve analiz zorlu bir iştir. Burada, bu kritik enerji üreten organelin morfolojik ve hacimsel analizi hakkında bilgi edinmek için seri blok yüz taramalı elektron mikroskobundan (SBFSEM) elde edilen üç boyutlu (3D) rekonstrüksiyon analizinin nasıl kullanılabileceğini açıklıyoruz.

Seri Blok-Yüz Taramalı Elektron Mikroskop Kullanarak Beyin Mitokondri Analizi

Bu makalede küçük hayvan beyin mikro-CT görüntüleme, hangi lezyonlar sayılabilir ve tüm beyin bağlamında yüksek hassasiyetle yer alan elektrotlar hazırlamak için basit bir yöntem.

Lezyonlar karakterize ve küçük hayvan beyinlerinde elektrot bulmak için bir mikro-CT-esaslı Yöntem

Bu makalede, iki uzamsal ölçekler köprüleme 3D tarama teknolojisi kullanarak deneysel bir protokol tanıttı: MRG tarafından &gt; 100 μm olarak görüntülenmiş tüm beyin anatomisinin makroskopik uzamsal ölçeği ve nöronal dağılımları kullanarak mikroskobik uzamsal ölçek immunohistokimya boyama ve multielektrot dizi sistemi ve diğer Yöntemler (~ 10 μm).

3D tarama teknolojisi köprüleme mikrodevreler ve Macroscale beyin görüntüleri 3D roman gömme çakışan protokol

Doku transformasyonu ve boyamadaki yeni gelişmeleri eksenel olarak taranmış bir ışık tabakası mikroskobunun geliştirilmesiyle birleştirerek tüm fare kalbinin mezoskopik rekonstrüksiyonu için bir yöntem sunuyoruz.

Tüm Fare Kalbinin Mezoskopik Optik Görüntülenmesi

Protokol, bir doku temizleme yöntemi olan ScaleSF kullanılarak beyin diliminde ayrıntılı bir nöronal görüntüleme yöntemi sağlar. Protokol, beyin dokusu hazırlama, doku berraklaştırma, temizlenmiş dilimlerin işlenmesi ve nöronal yapıların mezoskopikten mikroskobik seviyelere kadar konfokal lazer taramalı mikroskopi görüntülemesini içerir.

Mezoskopikten Mikroskobik Ölçeklere Nöronal Görüntüleme için Bir Doku Temizleme Yöntemi

Mevcut protokol, (SWITCH  - H2O2 - Antijen Reterival - 2,2'-tiyodietanol [TDE]) KISA doku transformasyon tekniğini rutin olarak yüksek verimli bir protokolde ışık tabakası floresan  mikroskobu görüntüleme ile birleştirerek onlarca postmortem insan beyni kesitinin hızlı ve eşzamanlı optik temizleme, çok yönlü etiketleme ve 3D hacimsel rekonstrüksiyonu için adım adım bir prosedür sağlar.

Büyük Ölçekli İnsan Beyni Görüntülemede Işık Tabakası Floresan Mikroskobu için Optik Temizleme ve Etiketleme

Öğrenin, OMLIT ile mezoskopik ölçekte beyin dokularındaki tüm hücreleri önyargısız görüntüleme yöntemini. Tarama elektron mikroskopisi ile entegre edilen bu teknik, sinirbilim araştırmalarında kapsamlı bağlantı haritaları oluşturur.

Mezoskopik Tüm Hücreli Beyin Haritalama İçin Taramalı Elektron Mikroskopi Uyumlu Optik Görüntüleme Yöntemi

Daha fazla video keşfet