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Champignons filamenteux

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Champignons filamenteux sont des organismes eucaryotes multicellulaires souvent trouvés en grand nombre dans le sol, jouant un rôle important dans l’écosystème. Champignons peuvent être isolés, quantifiés et examinés en laboratoire.

Les champignons sont abondants dans les sols de surface et jouent des rôles importants dans le cyclisme nutritif et la décomposition de matière organique et de contaminants. Étant incapables de synthétiser leur propre nourriture ils sont classés comme hétérotrophes aérobies et sont donc ont besoin d’oxygène.

Aux champignons de culture, sols échantillons sont dilués à des concentrations connues dans l’eau stérile, puis ensemencés sur la gélose et incubés. Les colonies fongiques qui en résulte peuvent ensuite être comptés et identifiés.

Cette vidéo illustre les principes qui sous-tendent l’isolement, quantification et identification des champignons filamenteux.

Les sols contiennent généralement des millions de champignons par gramme ; par conséquent, dilutions en série sont utilisées pour préparer des échantillons de sol pour l’analyse. Une quantité donnée de sol est ajoutée à une solution de dispersion. Des parties aliquotes de la suspension sont transférés à une solution de tampon en série jusqu'à ce que la suspension est diluée suffisamment pour permettre des colonies fongiques isolées à se développer.

Ces dilutions sont ensuite ensemencées sur milieux gélosés et incubées. Une fois qu’ils ont formé des colonies fongiques visibles, on peut compter. Comme il est supposé que chaque colonie fongique est dérivé d’un organisme unique, le terme d’unités formant colonies ou CFU, est utilisé pour exprimer le nombre d’organismes calculé par gramme de sol sec.

La plupart des champignons poussent comme des hyphes qui sont longs, ramification des structures qui sont le principal mode de croissance végétative. Les agrégations d’hyphes sont appelées mycélium. Les champignons peuvent également exister comme organismes unicellulaires, avec de la levure étant un exemple bien connu.

Reproduction fongique peut se produire de plusieurs façons. Produisant des hyphes de champignons peuvent se reproduisent asexuellement, en fragmentant les hyphes, ou des tiges avec des spores de semences-like. Champignons unicellulaires peuvent se reproduisent par voie asexuée par bourgeonnement.

Les champignons peuvent également se reproduire sexuellement. C’est moins fréquente que la reproduction asexuelle et se produit habituellement en réponse aux conditions environnementales défavorables. Producteurs des hyphes de champignons, deux hyphes reproducteurs de différentes souches fongiques peuvent fusionner, créant un zygote. Chez les champignons unicellulaires simples, deux cellules souches opposé seront fusible.

Sols fertiles contiennent normalement dans la gamme de 106 « propagules fongiques » par gramme de poids sec. Propagules sont les spores fongiques, hyphes ou fragments d’hyphes. À l’aide de dénombrements cultivables est une technique rapide, peu coûteuse et reproductible pour élucider le contenu fongique. Cependant, résultats peuvent être biaisés par le fait que pas tous les organismes seront culture sur plaques de médias.

Rose-Bengal géloses avec antibiotiques, tels que la streptomycine, sont généralement utilisés pour les cultures fongiques. Parce que les bactéries sont beaucoup plus nombreux que les champignons dans la plupart des sols, le média idéal fongique sélectionnera contre la croissance des bactéries tout en permettant les champignons pour survivre. Colorant rose-Bengal inhibe la croissance de la plupart des bactéries et réduit la taille des colonies fongiques. C’est idéal et empêche la prolifération de plaques fongiques ainsi que contrôler les bactéries.

Maintenant que nous sommes familiers avec les principes qui sous-tendent la mise en culture des champignons filamenteux, examinons un comment cela s’effectue en laboratoire.

Une fois que les échantillons de sol ont été prélevés, apportez-les au laboratoire pour analyse. Tout d’abord, calculer la teneur en humidité du sol. Ajouter de l’eau déionisée pour ramener la teneur en humidité à 15 %.

Les récipients d’une pellicule plastique et fixer avec une bande de caoutchouc pour limiter l’évaporation. Percer le film plusieurs fois afin de permettre l’aération.

Peser l’échantillon de sol et le récipient et le dossier. Incuber à température ambiante pendant une semaine permettre la croissance des champignons naturels.

Peser les échantillons de sol et le récipient et noter le poids. Calculer la perte de poids en raison de la perte d’humidité au cours de la semaine. Ajouter de l’eau sur le sol, pour ramener le poids à la valeur d’origine.

Ajouter 10 g de terre humide dans 95 mL d’eau distillée et mélanger soigneusement. Il s’agit de la dilution 10-1 10 g de sol ayant un volume de 5 mL environ. Effectuer quatre série de dilutions de 1 mL dans des flans 9 mL avec de l’eau de cette solution mère.

Ensuite, recueillir huit boîtes de gélose de Rose-Bengal-streptomycine stériles. Deux des plaques, ajouter 0,1 mL de la dilution tube 10-2et répartis sur la surface de la gélose à l’aide d’un épandeur de verre flamme ethanol stérilisé. Parce qu’une quantité de 0,1 mL est plaquée, ce qui rend l' efficace dilution 10-3.

Ces incuber dans un placard sombre à température ambiante, pendant une semaine.

Après une semaine, compter les colonies distinctes dans chaque assiette. Plaques avec 10 à 20 colonies fongiques devraient être comptées. Notez et décrire les traits distinctifs des plaques ou colonies.

Prendre une lame de microscope de verre propre et déposer une goutte de lactophénol montage fluide dans le centre. À l’aide de pinces pour éviter toute contamination, coupez une bande de ruban adhésif transparent cellophane environ 3 cm de long. Si nécessaire, utilisez une aiguille dissection pour libérer le ruban de la pince.

Appliquez le côté adhésif du ruban adhésif sur la surface d’une colonie de champignon sporulant, prenant soin d’éviter une pression excessive. Ensuite, appliquez le côté adhésif du ruban avec échantillon de spore au liquide de montage sur la lame de verre. Frottez doucement la bande avec un instrument lisse et plat pour enlever les bulles d’air.

Examiner le montage de bande en vertu d’un objectif de grande puissant.

Les champignons peuvent être identifiés au microscope par l’examen des organes de fructification et spores. Une clé d’identification de champignons peut faciliter ce processus. Les types de champignons communs observés incluent Penicillium et Aspergillus.

En utilisant les plaques, les champignons peuvent être énumérées en utilisant la même technique qu’avec l’énumération bactérienne.

Identification et de culture de champignons sont utile pour diverses applications scientifiques.

Industries comme les pâtes et papiers produisant des installations peuvent utiliser des champignons filamenteux à dégrader le bois dans leur processus de fabrication de la pâte, dans une technique appelée biodésintégration. Les champignons tels que de la pourriture blanche peuvent dégrader copeaux efficacement, conduisant à une diminution de nécessité pour l’utilisation de la mise en pâte chimique ou mécanique.

Champignons peuvent également servir à briser d’autres matières, y compris certains types de plastiques biodégradables. Cela peut être utile pour des applications agricoles ou jardinage, où paillis biodégradable peuvent être utilisées pour créer des barrières temporaires à la croissance des plantes indésirables.

Les champignons sont également producteurs d’antibiotiques, composés qui a révolutionné la médecine au XXe siècle et continuent d’être une défense de première ligne dans l’infection aujourd'hui. La pénicilline, un antibiotique couramment, a été isolée des communes champignons filamenteux Penicillium rubens. Jusqu'à ce jour, les champignons filamenteux sont encore isolées et étudiés dans la recherche de nouveaux antibiotiques.

Vous avez juste regardé introduction de JoVE de champignons filamenteux. Vous devez maintenant comprendre comment la culture de champignons filamenteux du sol, comment les quantifier et comment identifier les types de champignons communément trouvés dans le sol. Merci de regarder !

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