Journal
/
Genetics
/
פלטפורמת מכונה וירטואלית לאנשי מקצוע שאינם אנשי מחשב לשימוש בלמידה עמוקה כדי לסווג רצפים ביולוגיים של נתונים מטגנומיים
JoVE Journal
Genetics
Author Produced
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Genetics
A Virtual Machine Platform for Non-Computer Professionals for Using Deep Learning to Classify Biological Sequences of Metagenomic Data
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

פלטפורמת מכונה וירטואלית לאנשי מקצוע שאינם אנשי מחשב לשימוש בלמידה עמוקה כדי לסווג רצפים ביולוגיים של נתונים מטגנומיים

DOI:
10.3791/62250-v

•

09:34 min

•

September 25, 2021

•

,
1Microbiome Medicine Center, Department of Laboratory Medicine, Zhujiang Hospital,Southern Medical University, 2Center for Quantitative Biology,Peking University, 3State Key Laboratory of Organ Failure Research,Southern Medical University

Chapters

  • 00:07Introduction
  • 01:35The Installation of the Virtual Machine
  • 04:11Create Shared Folders and Prepare the Files for the Training Set and Test Set
  • 06:55Digitize the Biological Sequences Using “One‐Shot” Encoding Form
  • 07:27Train and Test the Artificial Neural Network
  • 08:12Result
  • 08:52Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

מדריך זה מתאר שיטה פשוטה לבניית אלגוריתם למידה עמוקה לביצוע סיווג רצף של 2 מחלקות של נתונים מטגנומיים.

Tags

Virtual MachineDeep LearningBiological Sequence ClassificationMetagenomic DataSpecies ClassificationGene Function ClassificationHost ClassificationDeep Learning FrameworkSequence ClassificationVirtualBoxUbuntu

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

פלטפורמה רובוטית עבור תפוקה גבוהה בידוד פרוטופלאסט וההשנאה

הפרעות של במחזור miRNAs ב תסמונת מעי רגיז זוהו באמצעות פלטפורמת ביטוי גני תפוקה הגבוהה Multiplexed

Metagenomic ניתוח של תחמיץ

באמצעות TMEM184A GFP-tagged לבנות לתעודה המעידה על הפרין קולטן זהות

פרוטוקולים עבור C- לבנים DNA הרכבה רגילה באמצעות Cpf1

DNA חזקים בידוד ובנייה ספריית רצף תפוקה גבוהה עבור דגימות עשבייה

CRISPR/Cas9-מתווכת אינטגרציה יישוב In Vivo באמצעות אסטרטגיה מבוסס על הצטרפות סוף בתיווך הומולוגיה

Informatic ניתוח של נתוני רצף אצווה שמרים 2-היברידית המסכים

זיהוי תפוקה גבוהה של ג'ין רצפים תקינה באמצעות רצף הדור הבא של כרומוזום מעגלי קונפורמציה ללכוד (4C-seq)

מסך משתיק קול עמוק רצף-בסיוע, ספונטני ב ביקוע שמרים שמר הביקוע

Read Article