A Virtual Machine Platform for Non-Computer Professionals for Using Deep Learning to Classify Biological Sequences of Metagenomic Data

Zhencheng Fang; Hongwei Zhou

doi:10.3791/62250

/

Платформа виртуальных машин для специалистов, не являющихся компьютерами, для использования глубокого обучения для классификации биологических последовательностей метагеномных данных

JoVE Journal
Genetics
Author Produced

A subscription to JoVE is required to view this content. Sign in or start your free trial.

JoVE Journal Genetics

A Virtual Machine Platform for Non-Computer Professionals for Using Deep Learning to Classify Biological Sequences of Metagenomic Data

Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Платформа виртуальных машин для специалистов, не являющихся компьютерами, для использования глубокого обучения для классификации биологических последовательностей метагеномных данных

DOI:

10.3791/62250-v

•

09:34 min

•

September 25, 2021

•

Zhencheng Fang², Hongwei Zhou³

¹Microbiome Medicine Center, Department of Laboratory Medicine, Zhujiang Hospital,Southern Medical University, ²Center for Quantitative Biology,Peking University, ³State Key Laboratory of Organ Failure Research,Southern Medical University

Chapters

00:07Introduction
01:35The Installation of the Virtual Machine
04:11Create Shared Folders and Prepare the Files for the Training Set and Test Set
06:55Digitize the Biological Sequences Using “One‐Shot” Encoding Form
07:27Train and Test the Artificial Neural Network
08:12Result
08:52Conclusion

Summary

Automatic Translation

В этом учебнике описывается простой метод построения алгоритма глубокого обучения для выполнения 2-классовой классификации последовательностей метагеномных данных.

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Роботизированной платформы для высокой пропускной способности выделения протопластов и трансформации

Возмущения Циркулирующие микроРНК при синдроме раздраженного кишечника Обнаружен Использование Multiplexed высокой пропускной способностью экспрессии генов платформы

Метагеномной Анализ силос

Использование GFP-меченый TMEM184A Построить подтверждения гепарин Receptor идентичности

Протоколы для сборки ДНК ДНК C-Brick с использованием Cpf1

Надежные ДНК изоляции и высокопроизводительного секвенирования строительство библиотеки для образцов гербария

ТРИФОСФАТЫ/Cas9-опосредованной целенаправленной интеграции в естественных условиях с помощью стратегию на основе присоединения гомологии опосредованной конец

Информатики анализ последовательности данных из пакетного дрожжи 2-гибрид экраны

Высок объём идентификации генов регулирования последовательностей с использованием следующего поколения последовательности круговой хромосома конформации захвата (4C-seq)

•

•

•