تحليل عالي الإنتاجية لبيانات الخرائط البصرية باستخدام الخريطة الكهربائية

ويتوسع استخدام تكنولوجيات الخرائط المتعددة الصفائف والبصرية في البحوث القلبية. ومع ذلك ، ما هو موجود حاليا هو قوية ، عالية الإنتاجية برمجيات مفتوحة المصدر لتحليل البيانات الكهربائية. هذا هو السبب في أننا قد وضعت برامج جديدة تسمى ElectroMap لمساعدة الباحثين في تحليلها.

ElectroMap يتضمن أساليب جديدة وانشأة لتحليل بيانات رسم خرائط القلب التي يمكن الحصول عليها من أي نوع باستخدام كاميرات مختلفة متعددة ، وصبغات فلورية مختلفة متعددة ، وطرائق اقتناء مختلفة بما في ذلك الخرائط البصرية وأنظمة صفيف متعدد الأقطاب. بالإضافة إلى قياس معلمات AP القياسية مثل مدة الإجراء المحتملة، المقايسة موصل، والمورفولوجيا، ElectroMap تمكن التحليل وقياس النشاط. ابدأ بتنزيل جميع الملفات من أحدث إصدار شفرة مصدري لـ ElectroMap من مستودع GitHub.

فك ضغط المحتويات التي تم تنزيلها إلى موقع مرغوب فيه. فتح MATLAB وانتقل إلى موقع المجلد الذي يستضيف شفرة مصدر ElectroMap. ثم افتح ملف electromap.

m واضغط تشغيل في محرر لبدء واجهة المستخدم ElectroMap. بعد ذلك، لتحميل الصورة، اضغط على مجلد تحديد وانتقل إلى موقع ملف البيانات أو الملفات التي سيتم تحليلها. حدد الملف الذي سيتم تحميله من داخل الواجهة واضغط على صور التحميل.

بمجرد تحميل، سوف تظهر الإطار الأول و مخطط أحمر سوف تشير إلى العتبة التلقائية للصورة. إذا رغبت في ذلك، قم بتعديل هذا إلى عتبة استناداً إلى سعة الدورة الزمنية للإشارة عن طريق تغيير الخيار في الصورة للقائمة المنسدلة العتبة. لاحظ أنه بمجرد تحديد العتبة، يتم تطبيقها بعد ذلك على رصة الصورة بأكملها.

إذا رغبت في ذلك، قم بتغيير خيار العتبة إلى يدوي الذي سيقوم بتنشيط المنزلق لضبط عتبة الصورة يدويًا. بالإضافة إلى ذلك، حدد منطقة مخصصة من الفائدة للتحليل عن طريق تحديد خانات الاختيار المناسبة تحت خيارات الحد. لاحظ أن الخيارات المتقدمة لتحديد منطقة الاهتمام مثل عدد المناطق متوفرة من اختيار ROI من القائمة العلوية.

بمجرد تطبيق عتبة مناسبة، اضغط على الصور العملية لتطبيق المعالجة. عند هذه النقطة، تأكد من أن إعدادات الكاميرا الصحيحة قد تم إدخالها لمعدل الإطار وحجم الكيلوهرتزس والبكسل في ميكرومترات وخيارات معالجة الإشارة مثل الإطار الزمني للإطار الزمني للإطار الزمني، والتصفية المكانية، والزمانية. بعد معالجة الملف، تفقد القمم في متوسط إشارة الأنسجة التي تحمل علامة الدوائر الحمراء.

تجزئة الإشارة استنادًا إلى القمم المكتشفة. اضغط على إشارة الجزء. إذا رغبت في ذلك، وتطبيق التجزئة المخصصة للإشارة عن طريق التكبير في وقت الفائدة واختيار إشارة الجزء.

بعد معالجة الصور، سيصبح زر خرائط الإنتاج نشطًا. اضغط على خرائط لإنتاج لتطبيق مدة العمل المحتملة، وقت التنشيط، سرعة التشغيل، وتحليل نسبة الإشارة إلى الضوضاء. حدد الشرائح المطلوبة من مربع القائمة لتطبيق التحليل على كل منها.

بعد ذلك، حدد الحصول على معلومات البكسل لمشاهدة عرض مفصل للإشارة من أي بكسل داخل الصورة وقارن بين البيكسلات للإشارة في نفس الوقت من مواقع ستة. للوصول إلى تحليل أكثر تفصيلاً لسرعة الاتّرَة، يُضغط على المُسَلّك. ثم اضغط على متجه واحد لتحليل عملية الاتّ والسلوك باستخدام طريقة متجه واحد حيث يتم حساب المتجه المتدرجة من وقت التعطيل بين نقطتين.

وأخيراً، اضغط على المتجه المحلي لتطبيق طريقة متعددة المتجهات مع الإعدادات المطابقة لتلك من الواجهة الرئيسية. اضغط على منحنى التنشيط لرسم النسبة المئوية للأنسجة تنشيط كدالة من الزمن. لتحديد المعلمات الأخرى باستخدام ElectroMap، حدد أحد التحليلات الأخرى المطلوبة من القائمة المنسدلة أعلى خريطة العرض.

اضغط على تحليل ملف واحد لفتح وحدة مخصصة لمدة عالية الإنتاجية وتحليل الاتّاق لكل قطعة محددة في ملف. قم بإجراء التحليل على الصورة بأكملها أو على مناطق أو نقاط اهتمام محددة. لتصدير البيانات من ElectroMap، اضغط على قيم التصدير لحفظ قيم الخريطة المعروضة حاليًا في واجهة المستخدم الرئيسية.

ثم اضغط على خريطة التصدير لإحضار نافذة منبثقة تحتوي على الخريطة المعروضة حاليًا والتي يمكن حفظها بعد ذلك في مجموعة متنوعة من تنسيقات الصور. إذا رغبت في ذلك، أضف شريط ألوان عن طريق تحديد رمز شريط الألوان. تعيين المقياس عن طريق تحديد تحرير ثم خريطة اللون.

وأخيرا ، اضغط على تفعيل الفيديو لتقديم الرسوم المتحركة من تسلسل التنشيط التي يمكن حفظها كملف GIF المتحركة. وهذا يدل على العمل مورفولوجيا المحتملة من الأذين المورين بالمقارنة مع بطين خنزير غينيا المسجلة باستخدام الأصباغ الحساسة الجهد كما ذكر سابقا. على الرغم من الشكل المتميز لإمكانات العمل واستخدام اثنين من كاميرات رسم الخرائط البصرية منفصلة مع معدلات الإطارات المختلفة وأحجام بكسل، ElectroMap يمكن استخدامها لتحليل بنجاح كل من مجموعات البيانات عن طريق اختيار المعلمات المناسبة.

تطبيق الفرقة متوسط بدلا من أساليب أخرى يمكن أن تحسن SNR من الاتريا اليسار المورين معزولة. ولم يغير تغيير تردد سرعة التواتر من ثلاثة هيرتز إلى 10 هيرتز من الـ APD عندما لا يتم إجراء متوسط طقم، ومع ذلك لوحظ انخفاض متوقع في APD عند سرعة 10 هرتز عند قياسه من متوسط بيانات الفرقة. وعلاوة على ذلك، كان الماوس الذينة اليسرى يسير بخطى في طول دورة 120 ميلي ثانية وطول دورة تم تقصير تدريجيا من قبل 10 مللي ثانية حتى وصلت إلى 50 مللي ثانية.

ElectroMap تلقائيا تحديد سرعة طول دورة و المجموعة متوسط قمم الأنسجة وفقا لذلك. APD والفاصل الانبساطي تقصير. وانخفضت سعة القمم المقيسة بصريا بينما زاد الوقت إلى الذروة.

يوضح هذا البروتوكول كيف يمكنك تثبيت وإعداد الإعدادات في ElectroMap من أجل تحليل سريع لمدة العمل المحتملة ، وسرعة التشغيل ، والتغيرات من الذروة إلى الذروة ، وكذلك كيف يمكنك تحديد متوسط المجموعة من أجل تحسين نسبة الإشارة إلى الضوضاء. نأمل أن الإفراج عن هذا البرنامج المتاح بحرية سوف تساعد الباحثين مع احتياجات التحليل الخاصة بهم ويؤدي إلى بعض الاكتشافات الرئيسية في أبحاث القلب. وسوف نستمر في بناء أي خوارزميات قمنا بتطويرها ونشجع الآخرين لمساعدتنا على زيادة توسيع قدرات ElectroMap.