Andreas Gnirke Broad Institute of Harvard and Massachusetts Institute of Technology Biography Publications Institution JoVE Articles Andreas Gnirke has not added a biography. If you are Andreas Gnirke and would like to personalize this page please email our Author Liaison for assistance. Publications Génomique Variation De La Distribution Et L'Inter-échantillon De Non-CpG Méthylation Travers Types De Cellules Humaines PLoS Genetics. Dec, 2011 | Pubmed ID: 22174693 Sélection D'hybrides De Séquençage Des Génomes De Pathogène Provenant D'échantillons Cliniques Genome Biology. 2011 | Pubmed ID: 21835008 Assemblée Du Transcriptome De RNA-Seq Données Sans Un Génome De Référence Nature Biotechnology. Jul, 2011 | Pubmed ID: 21572440 Marquage Métabolique De L'ARN Dévoile Les Principes De La Dynamique De Production Et De La Dégradation RNA Dans Les Cellules De Mammifères Nature Biotechnology. May, 2011 | Pubmed ID: 21516085 Préparation Des Bibliothèques De Séquençage De Bisulfite Représentation Réduite Pour Le Profilage De Méthylation De L'échelle Du Génome ADN Nature Protocols. Apr, 2011 | Pubmed ID: 21412275 D'analyser Et De Minimiser Les Biais D'amplification PCR Dans Les Bibliothèques De Séquençage Illumina Genome Biology. 2011 | Pubmed ID: 21338519 Cartes De Référence Des ES Humaines Et De La Variation De Cellules IPS Activer Haut Débit Caractérisation Des Lignées Cellulaires Pluripotentes Cell. Feb, 2011 | Pubmed ID: 21295703 Expression Du Facteur De Reprogrammation Initie Remodelage De La Chromatine Ciblée Généralisée Cell Stem Cell. Jan, 2011 | Pubmed ID: 21211784 Assemblées ébauche De Haute Qualité Des Génomes De Mammifères à Partir De Données De Séquences Massivement Parallèles Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Jan, 2011 | Pubmed ID: 21187386 Comparaison Des Méthodes Basées Sur Le Séquençage De Méthylation De L'ADN Le Profil Et L'identification Des Modifications épigénétiques Monoallelic Nature Biotechnology. Oct, 2010 | Pubmed ID: 20852635 Quantitative Comparison of Genome-wide DNA Methylation Mapping Technologies Nature Biotechnology. Oct, 2010 | Pubmed ID: 20852634 Séquençage De RNA Strand Spécifique Révèle Vaste Réglementées Depuis Longtemps Transcriptions Qui Sont Conservées à Travers Les Espèces De Levures Genome Biology. 2010 | Pubmed ID: 20796282 Analyse Comparative Complète Des Méthodes De Séquençage ARN Brin Spécifiques Nature Methods. Sep, 2010 | Pubmed ID: 20711195 Séquençage Exon Ciblés Par Sélection Dans La Solution Hybride Current Protocols in Human Genetics / Editorial Board, Jonathan L. Haines ... [et Al.]. Jul, 2010 | Pubmed ID: 20582916 Reconstruction Ab Initio De Type Cellulaire Spécifiques Transcriptomes Dans La Souris Révèle L'conservée Multi-exonique Structure De LincRNAs Nature Biotechnology. May, 2010 | Pubmed ID: 20436462 Analyse Intégrative Du Transcriptome Mélanome Genome Research. Apr, 2010 | Pubmed ID: 20179022 L'échelle Du Génome De Cartographie Méthylation De L'ADN D'échantillons Cliniques à Un Seul Nucléotide Résolution Nature Methods. Feb, 2010 | Pubmed ID: 20062050 ZBED6, Un Nouveau Facteur De Transcription Dérivée à Partir D'un Transposon ADN Domestiqué Régule L'expression IGF2 Et La Croissance Musculaire PLoS Biology. Dec, 2009 | Pubmed ID: 20016685 Séquençage De Génération Ciblé D'un Transcriptome Du Cancer Améliore La Détection Des Variantes De Séquence Et De Transcriptions De Fusion Roman Genome Biology. 2009 | Pubmed ID: 19835606 Une Cartographie Détaillée Des Interactions à Longue Portée Révèle Principes Pliants De La Human Genome Science (New York, N.Y.). Oct, 2009 | Pubmed ID: 19815776 ALLPATHS 2: Petits Génomes Assemblés Avec Précision Et Avec Une Forte Continuité De Courtes Lectures Appariés Genome Biology. 2009 | Pubmed ID: 19796385 Séquençage Haut Débit Bisulfite Dans Les Génomes De Mammifères Methods (San Diego, Calif.). Jul, 2009 | Pubmed ID: 19442738 Ab Initio, Construction D'un Eucaryote Transcriptome Par Massivement Parallèle Séquençage De L'ADN Messagère Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Mar, 2009 | Pubmed ID: 19208812 Sélection Solution Hybride Avec Ultra-longues Oligonucléotides Pour Le Séquençage Massivement Parallèle Ciblée Nature Biotechnology. Feb, 2009 | Pubmed ID: 19182786 L'effet Maternel, élément Génétique égoïste Medea Est Associé à Un Transposon Tc1 Composite Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Jul, 2008 | Pubmed ID: 18621706 L'échelle Du Génome Cartes Méthylation De L'ADN De Cellules Pluripotentes Et Différencié Nature. Aug, 2008 | Pubmed ID: 18600261 Le Génome De La Modèle Beetle Et Pest Tribolium Castaneum Nature. Apr, 2008 | Pubmed ID: 18362917 Découverte Systématique Des Motifs De Régulation Dans Les Régions Conservées Du Génome Humain, Dont Des Milliers De Sites Insulator CTCF Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Apr, 2007 | Pubmed ID: 17442748 Aperçu à Partir Du Génome De La Biotrophe Fongique Des Plantes Pathogènes Ustilago Maydis Nature. Nov, 2006 | Pubmed ID: 17080091 Bisulfite De Représentation Réduite De Séquençage Pour Comparative Haute Résolution Analyse Méthylation De L'ADN Nucleic Acids Research. 2005 | Pubmed ID: 16224102 Séquence D'ADN Et De L'analyse Du Chromosome Humain 18 Nature. Sep, 2005 | Pubmed ID: 16177791 Évaluation De L'impact Des Données De Séquence Génomique Comparative Sur L'annotation Fonctionnelle Du Génome De La Drosophile Genome Biology. 2002 | Pubmed ID: 12537575 Salut-C: une méthode d'étude de l'architecture tridimensionnelle des génomes. Nynke L. van Berkum*1, Erez Lieberman-Aiden*2,3,4,5, Louise Williams*2, Maxim Imakaev6, Andreas Gnirke2, Leonid A. Mirny3,6, Job Dekker1, Eric S. Lander2,7,8 1Program in Gene Function and Expression, Department of Biochemistry and Molecular Pharmacology, University of Massachusetts Medical School, 2Broad Institute of Harvard and Massachusetts Institute of Technology, 3Division of Health Sciences and Technology, Massachusetts Institute of Technology, 4Program for Evolutionary Dynamics, Department of Organismic and Evolutionary Biology, Department of Mathematics, Harvard University, 5Department of Applied Mathematics, Harvard University, 6Department of Physics, Massachusetts Institute of Technology, 7Department of Systems Biology, Harvard Medical School, 8Department of Biology, Massachusetts Institute of Technology JoVE 1869 Biology
Salut-C: une méthode d'étude de l'architecture tridimensionnelle des génomes. Nynke L. van Berkum*1, Erez Lieberman-Aiden*2,3,4,5, Louise Williams*2, Maxim Imakaev6, Andreas Gnirke2, Leonid A. Mirny3,6, Job Dekker1, Eric S. Lander2,7,8 1Program in Gene Function and Expression, Department of Biochemistry and Molecular Pharmacology, University of Massachusetts Medical School, 2Broad Institute of Harvard and Massachusetts Institute of Technology, 3Division of Health Sciences and Technology, Massachusetts Institute of Technology, 4Program for Evolutionary Dynamics, Department of Organismic and Evolutionary Biology, Department of Mathematics, Harvard University, 5Department of Applied Mathematics, Harvard University, 6Department of Physics, Massachusetts Institute of Technology, 7Department of Systems Biology, Harvard Medical School, 8Department of Biology, Massachusetts Institute of Technology JoVE 1869 Biology